Bartonegtaviriform
Bartonegtaviriform | |
---|---|
Классификация вирусов ![]() | |
(не вмешательство): | Вирус |
Семья: | Bartogtaviriformidae |
Род: | Bartonegtaviriform |
Разновидность | |
| |
Синонимы | |
Bartonegtaviriform Andersoni
|
Bartonegtaviriform это род вируформ - в семействе Bartogtaviriformidae . Он включает в себя один вид: Bartonegtaviriform Andersoni (Bagta), который является агентом переноса генов , найденным в бактериях рода Bartonella . [ 1 ]
Имя
[ редактировать ]Фамилия, Bartogtaviriformidae , является портманто Барто , факт , , из «хозяина» Bartonella , GTA от агента переноса генов и Viriformidae что это вируформ. [ 2 ]
Название рода, Bartonegtaviriform, представляет собой комбинацию Bartone , из «хозяина» Bartonella , GTA от агента переноса генов и вируформ, факт, что это вируформ. [ 2 ]
Название вида, Андерсон, назван в честь исследователя GTA Берта Андерсона, который впервые обнаружил частицы Bagta. [ 2 ]
Агенты переноса генов
[ редактировать ]GTAS можно рассматривать как форму «одомашненного» пропаха , то есть, предыдующе, полученная из бактериофага генома , но изменяется хозяином для обеспечения адаптивной пользы, и, таким образом, представляют собой одну из многих фаге , наблюдаемых в бактериальных геномах. адаптивных функций, полученных в [ 3 ]
Филогения
[ редактировать ]Анализ геномной последовательности показал, что все бактерии рода Bartonella характеризуются присутствием специфической GTA Bartonella GTA (Bagta), которая не имеет гомологий для ранее описанных систем GTA. Bagta кодируется вверх по течению от происхождения репликации стока (ROR), еще одной консервативной особенности Bartonella Genomes, которая, как было предположительно связано с активностью Bagta. Филогенетический анализ идентифицировал Bagta как ключевое инновации, связанное с адаптивным излучением, которое характеризует эти зоонозные бактериальные патогены. Хотя Bagta не связана напрямую с патогенностью Bartonella, было предложено стимулировать обмен и диверсификацию факторов взаимодействия хозяина в сообществах Bartonella, таких как система секреции IV типа IV ( T4SS ) и его родственные белты Bartonella. Поддержание Bagta, вероятно, обусловлено отбором для повышения вероятности генетического обмена и облегчает адаптацию к специфическим системам защиты хозяина во время инфекции. [ 3 ]
Роль
[ редактировать ]Несмотря на четкие аргументы на основе геномики, указывающие на центральную роль Bagta в биологии Bartonella , прямые экспериментальные доказательства ее активности дефицитны, а молекулярные механизмы, лежащие в основе ее активности и регуляции, остаются неуловимыми. [ 3 ]
Геном
[ редактировать ]Частицы Bagta больше RCGTA и содержат фрагменты ДНК 14 КБ . Хотя эта пропускная способность может в принципе позволить Bagta упаковать и передавать свой кластер GTA 14 КБ, измерения покрытия ДНК показывают уменьшенное покрытие кластера. Считается, что прилегающая область высокого охвата связана с местной репликацией ДНК. [ 4 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Таксономия вируса: выпуск 2022 года» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Март 2023 г. Получено 13 августа 2023 года .
- ^ Jump up to: а беременный в «Предложение 2022.001g.gta_viriforms скачать» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Получено 18 августа 2023 года .
- ^ Jump up to: а беременный в Квебатт М., Кристен М., Хармс А., Кернер Дж., Кристен Б., Дехио С (июнь 2017 г.). «Агент переноса генов способствует развитию в пределах наиболее подходящей субпопуляции бактериального патогена» . Клеточные системы . 4 (6): 611–621.e6. doi : 10.1016/j.cels.2017.05.011 . PMC 5496983 . PMID 28624614 .
- ^ Berglund EC, Frank AC, Calteau A, Vinnere Pettersson O, Granberg F, Eriksson AS, Näslund K, Holmberg M, Lindroos H, Andersson SG (июль 2009 г.). «Репликация стока генов-адаптируемости хозяина связана с агентами переноса генов в геноме инфекции мышей Bartonella Grahamii» . PLOS Genetics . 5 (7): E1000546. doi : 10.1371/journal.pgen.1000546 . PMC 2697382 . PMID 19578403 .