Биорепозиторий

Биорепозиторий — это учреждение, которое собирает, каталогизирует и хранит образцы биологического материала для лабораторных исследований. Биорепозитории собирают и хранят образцы животных, растений и других живых организмов. Биорепозитории хранят множество различных типов образцов, включая образцы крови , мочи , тканей , клеток , ДНК , РНК и белков . Если образцы получены от людей, они могут храниться вместе с медицинской информацией вместе с письменным согласием на использование образцов в лабораторных исследованиях. ^{[ 1 ]}

Цель

Целью биохранилища является хранение биологических образцов и связанной с ними информации для будущего использования в исследованиях. Биорепозиторий поддерживает качество образцов своей коллекции и обеспечивает их доступность для научных исследований.

Операции

Четыре основных операции биорепозитория: (i) сбор, (ii) обработка, (iii) хранение или инвентаризация и (iv) распространение биологических образцов.

(i) Сбор или доступ происходит, когда образец поступает в биорепозиторий. Информация об образце вводится в систему управления лабораторной информацией («ЛИМС»), которая отслеживает информацию обо всех образцах в биорепозитории. Типичной информацией, связанной с образцом, будет происхождение образца и время его прибытия в биохранилище.

(ii) Обработка образцов стандартизирована, чтобы свести к минимуму отклонения в результате обращения. Обработка может подготовить образец к долгосрочному хранению. Например, образцы ДНК обрабатываются в солевом буфере (водном растворе) с соответствующим pH, чтобы стабилизировать ДНК для хранения.

(iii) Хранение и инвентаризация — это место, где хранятся все образцы до того, как они будут запрошены по запросу на распространение. Система инвентаризации состоит из ящиков для хранения проб, которые хранятся в морозильных камерах различных типов в зависимости от требований к хранению проб.

(iv) Распределение – это процесс извлечения одного или нескольких образцов из системы инвентаризации биохранилищ.

Стандартные рабочие процедуры

Стандартные операционные процедуры (СОП) играют решающую роль в индустрии биохранилищ. Есть ряд причин, почему они важны:

СОПы уменьшают изменчивость образцов и процессов хранения, предоставляя стандартизированные рекомендации по правильному хранению и уходу. ^{[ 2 ]}
Образцы биообразцов должны максимально напоминать биообразцы в их естественном состоянии. СОПы помогают гарантировать это.
СОПы обеспечивают стандартизированную структуру проведения операций в биохранилище. Они обеспечивают бесперебойную и надежную реализацию процессов на всех этапах производства. ^{[ 3 ]}

Биологические ресурсные центры

ОЭСР выпустила рекомендации по передовой практике для биохранилищ, которые называются центрами биологических ресурсов . ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]} ОЭСР определяет их следующим образом:

«Центры биологических ресурсов являются важной частью инфраструктуры, лежащей в основе биотехнологии. Они состоят из поставщиков услуг и хранилищ живых клеток, геномов организмов и информации, касающейся наследственности и функций биологических систем. BRC содержат коллекции культивируемых организмов (например, микроорганизмы , клетки растений , животных и человека ), их реплицируемые части (например, геномы , плазмиды , вирусы , кДНК ), жизнеспособные, но еще не культивируемые организмы , клетки и ткани , а также базы данных, содержащие молекулярную , физиологическую и структурную информацию, имеющую отношение к этим коллекциям и связанной с ними биоинформатике ». ^{[ 6 ]}

Примеры биохранилищ в США

Репозитории клеточных линий

Хранилище человеческих клеток и данных Национального института неврологических расстройств и инсульта (NINDS) хранит коллекцию клеточных линий для дальнейшего изучения неврологических расстройств. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}
Хранилище стареющих клеток Национального института старения (NIA) облегчает исследования механизмов старения, предоставляя клеточные линии, собранные у субъектов разного возраста. ^{[ 9 ]}^{[ 8 ]}
Хранилище генетических клеток человека Национального института общих медицинских наук (NIGMS) представляет собой коллекцию хорошо изученных клеток человека для использования в биомедицинских исследованиях. ^{[ 10 ]}^{[ 8 ]}

Примеры репозиториев

Биорепозиторий Intermountain Healthcare представляет собой коллекцию из более чем 4,5 миллионов биологических образцов, консервированных в формалине и залитых парафином. ^{[ 11 ]}
Эталонный геном человека Института Дж. Крейга Вентера предоставляет образцы ДНК Дж. Крейга Вентера , чей геном был секвенирован и собран. ^{[ 12 ]}
Программа справочных материалов по генетическому тестированию Центров по контролю и профилактике заболеваний (CDC) (GeT-RM) хранит образцы ДНК для использования в молекулярно-генетическом тестировании. ^{[ 13 ]} Эти образцы взяты из таких заболеваний, как болезнь Хантингтона, муковисцидоз, синдром ломкой Х-хромосомы, альфа-талассемия и синдром Мюнке.

См. также

Ссылки

^ «Словари НЦИ – биорепозиторий» . Национальный институт рака . 2 февраля 2011 г. Проверено 23 сентября 2021 г.
^ «Геномная медицина: Стандартные операционные процедуры биобанкинга (СОП)» . Внутри биобанкинга . 08.12.2015 . Проверено 16 октября 2017 г.
^ «Важность стандартных операционных процедур (SOPS) в биобанкинге» . Биорепозиторий . Проверено 16 октября 2017 г.
^ Смит, Д; Райан, MJ (январь 2008 г.). «Влияние передового опыта ОЭСР на валидацию методов криоконсервации микроорганизмов». Крио письма . 29 (1): 63–72. ПМИД 18392291 .
^ Рекомендации ОЭСР по передовой практике для центров биологических ресурсов
^ Рекомендации ОЭСР BRC
^ «Ресурс для стволовых клеток, включая ИПСК и фибробласты | Репозиторий человеческих клеток и данных NINDS» . nindsgenetics.org . Проверено 20 октября 2021 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с Сивек, Мартина (октябрь 2015 г.). «Обзор биохранилищ - прошлое, настоящее и будущее». Военная медицина . 180 (10С): 57–66. doi : 10.7205/MILMED-D-15-00119 .
^ «НИА» . www.coriell.org . Проверено 20 октября 2021 г.
^ «Репозиторий генетических клеток человека NIGMS» . www.nigms.nih.gov . Проверено 20 октября 2021 г.
^ «О Межгорном биохранилище» . intermountainhealthcare.org . Проверено 20 октября 2021 г.
^ «ХуРеф» . www.coriell.org . Проверено 20 октября 2021 г.
^ «ГеТ-РМ | CDC» . www.cdc.gov . 05.11.2019 . Проверено 20 октября 2021 г.

Внешние ссылки

Список центральных биохранилищ образцов , список активных биобанков и биохранилищ по всему миру.
База данных клинических образцов и хранилище коллекций образцов
Биорепозиторий LIMS , программное решение LIMS для биобанков и биохранилищ.
Глобальный каталог биобанков, банков тканей и биохранилищ
Хранилище образцов Национального института аллергии и инфекционных заболеваний на ВИЧ/СПИД
Международное общество биологических и экологических хранилищ («ISBER»)
ProMedDx BioServices cGMP Биохранилище и биорепозиторий - Консультационное проектирование биорепозитория
Биорепозиторий Cell&Co – первый французский эко-биобанк

[1] «Словари НЦИ – биорепозиторий» . Национальный институт рака . 2 февраля 2011 г. Проверено 23 сентября 2021 г.

[2] «Геномная медицина: Стандартные операционные процедуры биобанкинга (СОП)» . Внутри биобанкинга . 08.12.2015 . Проверено 16 октября 2017 г.

[3] «Важность стандартных операционных процедур (SOPS) в биобанкинге» . Биорепозиторий . Проверено 16 октября 2017 г.

[4] Смит, Д; Райан, MJ (январь 2008 г.). «Влияние передового опыта ОЭСР на валидацию методов криоконсервации микроорганизмов». Крио письма . 29 (1): 63–72. ПМИД 18392291 .

[5] Рекомендации ОЭСР по передовой практике для центров биологических ресурсов

[6] Рекомендации ОЭСР BRC

[7] «Ресурс для стволовых клеток, включая ИПСК и фибробласты | Репозиторий человеческих клеток и данных NINDS» . nindsgenetics.org . Проверено 20 октября 2021 г.

[Siwek2015-8] Jump up to: ^а ^б ^с Сивек, Мартина (октябрь 2015 г.). «Обзор биохранилищ - прошлое, настоящее и будущее». Военная медицина . 180 (10С): 57–66. doi : 10.7205/MILMED-D-15-00119 .

[9] «НИА» . www.coriell.org . Проверено 20 октября 2021 г.

[10] «Репозиторий генетических клеток человека NIGMS» . www.nigms.nih.gov . Проверено 20 октября 2021 г.

[11] «О Межгорном биохранилище» . intermountainhealthcare.org . Проверено 20 октября 2021 г.

[12] «ХуРеф» . www.coriell.org . Проверено 20 октября 2021 г.

[13] «ГеТ-РМ | CDC» . www.cdc.gov . 05.11.2019 . Проверено 20 октября 2021 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]