Крис Понтинг
Крис Понтинг | |
---|---|
Рожденный | Кристофер Пол Понтинг |
Национальность | Британский |
Альма-матер |
|
Известный | УМНЫЙ [1] |
Научная карьера | |
Поля | |
Учреждения | Эдинбургский университет |
Диссертация | Структурные исследования плазминогена и родственных ему белков (1992) |
Веб-сайт | www |
Кристофер Пол Понтинг — британский компьютерный биолог , специализирующийся на эволюции и функционировании генов и геномов . В настоящее время он является заведующим кафедрой медицинской биоинформатики в Эдинбургском университете и руководителем группы в отделе генетики человека MRC . Он также является ассоциированным преподавателем Wellcome Trust Sanger Institute , членом Академии медицинских наук, членом Европейской организации молекулярной биологии и членом Королевского общества Эдинбурга . [2] Его исследования сосредоточены на функционировании и эволюции длинных некодирующих РНК, биологии отдельных клеток и геномике заболеваний. [3] [4] [5] [6] [7] [8] Помимо науки, Крис является писателем-любителем и написал неопубликованный научно-фантастический роман о искусственно созданных вирусах. [9]
Образование
[ редактировать ]Получив степень бакалавра искусств и магистра наук по физике в Оксфордском университете и Университете Британской Колумбии соответственно, он вернулся в Оксфорд, получив докторскую степень по биофизике по структурным в 1992 году исследованиям плазминогена . [10] [11]
Исследовать
[ редактировать ]Понтинг участвовал в проекте «Геном человека» . [12] и участвовал в сравнении последовательностей для мышей , [13] крыса , [14] курица, [15] собака, [16] опоссум , [17] и утконос [18] [19] [20] Геномные проекты. Он также использовал сравнительную геномику , чтобы внести непосредственный вклад в понимание структуры хроматина. [21] и генетика многих заболеваний, включая астму , [22] ожирение , [23] болезнь Альцгеймера , [24] пигментный ретинит , [25] мышечные дистрофии , [26] и синдром Айкарди-Гутьера . [27]
Кроме того, его лаборатория является частью DecodeME , генетического исследования по определению потенциальных причин миалгического энцефаломиелита/синдрома хронической усталости (ME/CFS). [28] [9]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Шульц Дж.; Милпец, Ф.; Борк, П. ; Понтинг, К. (1998). «SMART, простой инструмент исследования модульной архитектуры: идентификация сигнальных доменов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (11): 5857–5864. Бибкод : 1998PNAS...95.5857S . дои : 10.1073/pnas.95.11.5857 . ПМК 34487 . ПМИД 9600884 .
- ^ «Профессор Кристофер Пол Понтинг FMedSci FRSE - Королевское общество Эдинбурга» . Королевское общество Эдинбурга . Проверено 14 марта 2018 г.
- ^ Публикации Криса Понтинга , индексируемые библиографической базой данных Scopus . (требуется подписка)
- ^ Симс, Дэвид (2014). «Глубина и охват секвенирования: ключевые аспекты геномного анализа». Обзоры природы Генетика . 15 (2): 121–132. дои : 10.1038/nrg3642 . ПМИД 24434847 . S2CID 13325739 .
- ^ Рэндс, Крис М. (2014). «8,2% генома человека ограничено: различия в скорости оборота между классами функциональных элементов в человеческой линии» . ПЛОС Генетика . 10 (7): e1004525. дои : 10.1371/journal.pgen.1004525 . ПМК 4109858 . ПМИД 25057982 .
- ^ Гиббс, РА; Вайншток, генеральный директор; Мецкер, МЛ; Музный, ДМ; Содергрен, Э.Дж.; Шерер, С; Скотт, Дж; Штеффен, Д; Уорли, КК; Берч, ЧП; Оквуону, Г; Хайнс, С; Льюис, Л; Дерамо, К; Дельгадо, О; Дуган-Роча, С; Майнер, Г; Морган, М; Хоуз, А; Гилл, Р; Целера; Холт, РА; Адамс, доктор медицины; Аманатидес, П.Г.; Баден-Тилсон, Х; Барнстед, М; Чин, С; Эванс, Калифорния; Феррьера, С; и др. (2004). «Последовательность генома коричневой норвежской крысы дает представление об эволюции млекопитающих» . Природа . 428 (6982): 493–521. Бибкод : 2004Natur.428..493G . дои : 10.1038/nature02426 . ПМИД 15057822 .
- ^ 12 геномов дрозофилы, Консорциум; Кларк, АГ; Эйзен, МБ ; Смит, доктор медицинских наук; Бергман, CM; Оливер, Б; Марков, Т.А.; Кауфман, ТК; Келлис, М; Гелбарт, В; Айер, В.Н.; Поллард, Д.А.; Сактон, ТБ; Ларракуэнте, AM; Сингх, Северная Дакота; Абад, Япония; Абт, Д.Н.; Адриан, Б; Агуаде, М; Акаши, Х; Андерсон, WW; Аквадро, CF; Арделл, Д.Х.; Аргуэльо, Р; Артьери, К.Г.; Барбаш, Д.А.; Баркер, Д; Барсанти, П; Баттерхэм, П; и др. (2007). «Эволюция генов и геномов в филогении дрозофилы» . Природа . 450 (7167): 203–18. Бибкод : 2007Natur.450..203C . дои : 10.1038/nature06341 . ПМИД 17994087 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка ) - ^ Малдер, Нью-Джерси; Апвейлер, Р .; Эттвуд, Т.К. Байрох, А ; Баррелл, Д; Бейтман, А ; Биннс, Д; Бисвас, М; Брэдли, П; Борк, П ; Бухер, П; Копли, Р.Р.; Курсель, Э; Дас, У; Дурбин, Р ; Фальке, Л; Флейшманн, В; Гриффитс-Джонс, С; Хафт, Д; Харт, Н.; Хуло, Н; Кан, Д; Канапин А; Крестьяннова М; Лопес, Р; Летунич, я; Лонсдейл, Д; Сильвентойнен, В.; Орчард, ЮВ; Паньи, М.; Паньи, Марко; Пейрук, Д.; Понтинг, КП ; Селенгут, доктор медицинских наук; Слуга, Ф.; Сигрист, CJA; Воган, Р.; Здобнов, Е. М. (2003). «База данных InterPro 2003 года обеспечивает более широкий охват и новые функции» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (1): 315–8. дои : 10.1093/нар/gkg046 . ПМК 165493 . ПМИД 12520011 .
- ^ Jump up to: а б Подкаст CRO по биоинформатике . Эпизод 2, 2020.
- ^ Понтинг, Кристофер Пол (1992). Структурные исследования плазминогена и родственных ему белков (дипломная работа). Оксфордский университет. OCLC 556763136 .
- ^ «Проф. Крис П. Понтинг, бакалавр наук, доктор философии» . Оксфордский университет. Архивировано из оригинала 7 апреля 2014 года.
- ^ Ландер, ES ; Линтон, М.; Биррен, Б.; Нусбаум, К.; Зоди, К.; Болдуин, Дж.; Девон, К.; Дьюар, К.; Дойл, М.; Фитцхью, В.; Функе, Р.; Гейдж, Д.; Харрис, К.; Хифорд, А.; Хауленд, Дж.; Канн, Л.; Лехочки, Дж.; Левин, Р.; Макьюэн, П.; МакКернан, К.; Мелдрим, Дж.; Месиров, Дж. П.; Миранда, К.; Моррис, В.; Нейлор, Дж.; Раймонд, К.; Розетти, М.; Сэйнтс, Р.; Шеридан, А.; и др. (февраль 2001 г.). «Первичное секвенирование и анализ генома человека» . Природа 409 (6822): 860–921. Бибкод : 2001Nature.409..860L . дои : 10.1038/35057062 . hdl : 2027.42/62798 . ISSN 0028-0836 . ПМИД 11237011 .
- ^ Чинвалла, Арканзас; Уотерстон, LL; Линдблад-То, К.Д.; Бирни, Джорджия; Роджерс, Луизиана; Абриль, РС; Агарвал, штат Техас; Агарвала, LW; Эйнскоу, скорая помощь; Александерссон, доктор юридических наук; Ан, ТЛ; Антонаракис, МЫ; Эттвуд, Джо; Берч, Миннесота; Бейли, К.Х.; Барлоу, CS; Бек, TC; Берри, Б.; Биррен, Дж.; Блум, Э.; Борк, Р.Х.; Ботчерби, MC; Брей, РК; Брент, СП; Браун, П.; Браун, Э.; Балт, Б.; Бертон, Т.; Батлер, генеральный директор; и др. (2002). «Первичное секвенирование и сравнительный анализ генома мыши» . Природа . 420 (6915): 520–562. Бибкод : 2002Natur.420..520W . дои : 10.1038/nature01262 . PMID 12466850 .
- ^ Амос, Джонатан (31 марта 2004 г.). «Жизненный код крысы, прочитанный наукой» . Новости Би-би-си . Проверено 19 декабря 2008 г.
- ^ «Курица выдает генетические секреты» . Новости Би-би-си . 9 декабря 2004 года . Проверено 19 декабря 2008 г.
- ^ Линдблад-То, К.; Уэйд, CM; Миккельсен, Т.С.; Карлссон, ЕК; Яффе, Д.Б.; Камаль, М.; Клэмп, М.; Чанг, Дж.Л.; Кулбокас, Э.Дж.; Зоди, MC; Маусели, Э.; Се, X.; Брин, М.; Уэйн, РК; Острандер, Э.А.; Понтинг, КП; Галиберт, Ф.; Смит, доктор медицинских наук; Деджонг, ПиДжей; Киркнесс, Э.; Альварес, П.; Бьяджи, Т.; Брокман, В.; Батлер, Дж.; Чин, CW; Кук, А.; Кафф, Дж.; Дейли, MJ; Декаприо, Д.; и др. (2005). «Последовательность генома, сравнительный анализ и структура гаплотипов домашней собаки» . Природа . 438 (7069): 803–819. Бибкод : 2005Natur.438..803L . дои : 10.1038/nature04338 . ПМИД 16341006 .
- ^ Миккельсен, Т.С.; Уэйкфилд, MJ; Акен, Б.; Амемия, Коннектикут; Чанг, Дж.Л.; Дюк, С.; Гарбер, М.; Джентльс, Эй Джей; Гудштадт, Л.; Хегер, А.; Юрка, Дж.; Камаль, М.; Маусели, Э.; Сирл, SMJ; Шарп, Т.; Бейкер, ML; Батцер, Массачусетс; Бенос, П.В.; Белов, К.; Клэмп, М.; Кук, А.; Кафф, Дж.; Дас, Р.; Давидов, Л.; Дикин, Дж. Э.; Фаззари, MJ; Гласс, Дж. Л.; Грабхерр, М.; Действительно, Дж. М.; и др. (2007). «Геном сумчатого Monodelphis Domestica обнаруживает инновации в некодирующих последовательностях» . Природа . 447 (7141): 167–177. Бибкод : 2007Natur.447..167M . дои : 10.1038/nature05805 . ПМИД 17495919 .
- ^ Уоррен, WC; Хиллиер, LW; Маршалл Грейвс, Дж.А.; Бирни, Э .; Понтинг, Коннектикут ; Грюцнер, Ф.; Белов, К.; Миллер, В.; Кларк, Л.; Чинвалла, Арканзас; Ян, СП; Хегер, А.; Локк, ДП; Митке, П.; Уотерс, Полицейский; Вейрунес, Рузвельт; Фултон, Л.; Фултон, Б.; Грейвс, Т.; Уоллис, Дж.; Пуэнте, XS; Лопес-Отин, К.; Ордоньес, Греция; Эйхлер, Э.Э.; Чен, Л.; Ченг, З.; Дикин, Дж. Э.; Олсоп, А.; Томпсон, К.; и др. (2008). «Анализ генома утконоса выявил уникальные признаки эволюции» . Природа . 453 (7192): 175–183. Бибкод : 2008Natur.453..175W . дои : 10.1038/nature06936 . ПМК 2803040 . ПМИД 18464734 .
- ^ http://www.nature.com/nature/videoarchive/platypusgenome/ Обсуждение генома утконоса.
- ^ Бриггс, Хелен (7 мая 2008 г.). «Разгадан генетический код утконоса» . Новости Би-би-си . Проверено 19 декабря 2008 г.
- ^ Дженувейн, Т.; Эйзенхабер, С.; О'Кэрролл, Ф.; Страл, Д.Н.; Вс, ДР; Шмид, З.В.; Оправиль, М.; Мехтлер, С.; Понтинг, К.; Эллис, CP; Дженувейн, компакт-диск (2000). «Регуляция структуры хроматина сайт-специфическими метилтрансферазами гистона H3». Природа . 406 (6796): 593–599. Бибкод : 2000Natur.406..593R . дои : 10.1038/35020506 . ПМИД 10949293 . S2CID 205008015 .
- ^ Чжан, Ю.; Ливс, Н.И.; Андерсон, Г.Г.; Понтинг, Коннектикут ; Броксхолм, Дж.; Холт, Р.; Эдсер, П.; Бхаттачарья, С.; Данэм, А.; Адкок, ИМ; Пуллейн, Л.; Барнс, ПиДжей; Харпер, Дж.И.; Абекасис, Джорджия; Кардон, Л.; Уайт, М.; Бертон, Дж.; Мэтьюз, Л.; Мотт, Р.; Росс, М.; Кокс, Р.; Моффатт, МФ; Куксон, WOCM (2003). «Позиционное клонирование локуса количественного признака на хромосоме 13q14, который влияет на уровень иммуноглобулина Е и астму». Природная генетика . 34 (2): 181–186. дои : 10.1038/ng1166 . hdl : 10044/1/57392 . ПМИД 12754510 . S2CID 20807679 .
- ^ Геркен, Т.; Жирар, Калифорния; Тунг, Ю.-КЛ; Уэбби, CJ; Саудек, В.; Хьюитсон, Канзас; Эй, ГШ; Макдонаф, Массачусетс; Канлифф, С.; Макнил, Луизиана; Гальвановскис, Ю.; Рорсман, П .; Робинс, П.; Приер, X.; Колл, АП; Ма, М.; Йованович, З.; Фаруки, И.С.; Седжвик, Б.; Баррозу, И.; Линдал, Т .; Понтинг, Коннектикут ; Эшкрофт, FM ; О'Рахилли, С .; Шофилд, CJ (2007). «Ген FTO, связанный с ожирением, кодирует 2-оксоглутарат-зависимую деметилазу нуклеиновых кислот» . Наука . 318 (5855): 1469–1472. Бибкод : 2007Sci...318.1469G . дои : 10.1126/science.1151710 . ПМЦ 2668859 . ПМИД 17991826 .
- ^ Понтинг, Коннектикут ; Хаттон, М.; Нюборг, А.; Бейкер, М.; Янсен, К.; Голде, Т.Э. (2002). «Идентификация нового семейства гомологов пресенилина» . Молекулярная генетика человека . 11 (9): 1037–1044. дои : 10.1093/hmg/11.9.1037 . ПМИД 11978763 .
- ^ Абд Эль-Азиз, ММ; Барраган, И.; О'Дрисколл, Калифорния; Гудштадт, Л.; Пригмор, Э.; Боррего, С.; Мена, М.; Пиерас, Дж.И.; Эль-Ашри, МФ; Сафие, Луизиана; Шах, А.; Читам, Мэн; Картер, Северная Каролина; Чакарова С.; Понтинг, КП; Бхаттачарья, СС; Антиноло, Г. (2008). «EYS, кодирующий ортолог Spacemaker Drosophila, мутирует при аутосомно-рецессивном пигментном ретините» . Природная генетика . 40 (11): 1285–1287. дои : 10.1038/ng.241 . ПМЦ 2719291 . ПМИД 18836446 .
- ^ Диккенс, Нью-Джерси; Битсон, С.; Понтинг, КП (2002). «Кадгериноподобные домены в α-дистрогликане, α/ε-саркогликане, а также дрожжевых и бактериальных белках» . Современная биология . 12 (6): 197–199 р. дои : 10.1016/S0960-9822(02)00748-0 . ПМИД 11909544 . S2CID 15872294 .
- ^ Кроу, Ю.Дж.; Лейтч, А.; Хейворд, Бельгия; Гарнер, А.; Пармар, Р.; Гриффит, Э.; Али, М.; Семпл, К.; Айкарди, Дж.; Бабул-Хирджи, Р.; Бауманн, К.; Бакстер, П.; Бертини, Э.; Чендлер, Кентукки; Читаят, Д.; Горячий.; Дери, К.; Фацци, Э.; Гойзе, Ж.; Кинг, доктор медицины; Клеппер, Дж.; Лакомб, Д.; Ланци, Г.; Лайалл, Х.; Мартинес-Фриас, MAL; Матье, ML; Маккеун, К.; Монье, А.; Оад, Ю.; Куоррелл, Огайо (2006). «Мутации в генах, кодирующих субъединицы рибонуклеазы H2, вызывают синдром Айкарди-Гутьера и имитируют врожденную вирусную инфекцию головного мозга». Природная генетика . 38 (8): 910–916. дои : 10.1038/ng1842 . ПМИД 16845400 . S2CID 8076225 .
- ^ Исследовательская группа Криса Понтинга Отдел исследований генетики человека MRC. Июль 2021.