Майкл Эйзен
Майкл Эйзен | |
|---|---|
 | |
| Рожденный | Майкл Брюс Эйзен 13 апреля 1967 г. |
| Национальность | Американский |
| Альма-матер | Гарвардский университет ( AB , PhD ) |
| Известный | Публичная научная библиотека (ПЛОС) |
| Награды | Премия Бенджамина Франклина (биоинформатика) (2002) |
| Научная карьера | |
| Поля | |
| Учреждения | Калифорнийский университет, Беркли |
| Диссертация | Структурные исследования белков вируса гриппа А (1996) |
| Докторантура | Дон Крейг Уайли [ нужна ссылка ] |
| Веб-сайт | Михаэлейсен |
Майкл Брюс Эйзен (родился 13 апреля 1967 г.) — американский компьютерный биолог и бывший [2] главный редактор журнала eLife . [3] Он является профессором генетики , геномики и развития в Калифорнийском университете в Беркли . [4] [5] [6] [7] [8] Он является ведущим сторонником научных публикаций в открытом доступе и соучредителем Публичной научной библиотеки (PLOS) . В 2018 году Эйзен выдвинул свою кандидатуру в Сенат США от Калифорнии в качестве независимого кандидата , но не прошел квалификацию для голосования. [9]
Молодость образование и
родились в Бостоне и Эйзен и его брат Джонатан выросли в семье ученых. Их дедушка был рентгеновским кристаллографом , отец Говард Эйзен — врачом, а мать — Лора. [10] биохимик. Они переехали в Бетесду, штат Мэриленд, когда Эйзену было четыре или пять лет. Братья проводили лето на Лонг-Айленде у бабушки и дедушки. Эйзен заявляет, что любил лягушек и саламандр: «У меня даже больше, чем у меня фетиш лягушек, у меня есть фетиш болота. Мне очень нравится бывать в болотах». Он также очень интересовался математикой и был капитаном школьной математической команды. . Эйзен окончил среднюю школу Уолта Уитмена в 1985 году. Собираясь изучать математику в Гарвардском университете, он понял, что там [он может столкнуться] с другими, более блестящими студентами-математиками. Это был момент Умницы Уилла Хантинга , и он решил, что не хочет магистр математики: «Вы не хотите быть Сальери для Моцарта». Во время учебы в Гарварде Эйзен работал над «открытием трехмерных структур белков». Ему показали микроматрицу ДНК , которая научила его «новому способу заниматься биологией». [11]
Эйзен получил докторскую степень по биофизике в Гарвардском университете и степень бакалавра математики (также в Гарварде). [12] Он находился под руководством Дона Крейга Уайли. [13] при изучении вируса гриппа А. белков [14]
Есть вещи, которые действительно очень сложны, и это те проблемы, над которыми вам действительно хочется работать. Не так-то просто отличить невозможную задачу от проблемы, которая действительно очень сложна. Но научиться этому крайне важно. - Чему я научился, работая с Пэтом Брауном ( Patrick O. Brown ) - 2015 г. [13]
После получения докторской степени Эйзен работал научным сотрудником в Стэнфордском университете в лаборатории Дэвида Ботштейна , где он, в частности, разработал метод интерпретации данных об экспрессии генов, полученных с помощью микрочипов. Основополагающая исследовательская публикация, написанная Эйзеном по этому проекту, была процитирована более 16 000 раз. [15]
Бейсбол и биология [ править ]
Когда Эйзен жил в Теннесси, он работал диктором в бейсбольной команде низшей лиги. [12] Колумбийские мулы . Он самопровозглашенный фанатик Red Sox . [11] Он и компьютерный биолог Джеймс Фрейзер записали для iBiology видео о том, как статистика бейсбола повлияла на их исследования. Их аргумент заключается в том, что секвенирование ДНК похоже на подсчет очков в бейсбольном матче, и что многие компьютерные биологи научились думать о научных вычислениях из-за навязчивого интереса к статистике бейсбола. Сравнение статистики конкретного игрока с базой данных других подобных игроков позволяет любителю бейсбола прогнозировать будущие результаты. Эта же система работает с белками и функциями прогнозирования. По мере разработки инструментов, которые собирают и отслеживают всю статистику, касающуюся бейсболистов, технологии будут совершенствоваться вместе с генетикой. И в бейсболе, и в генетике разрабатываются инструменты, уточняющие модели. [16] На лекции в 2015 году Эйзен заявил, что на свой двенадцатый день рождения он получил от дедушки компьютер и следующие пять лет провел, обучаясь программированию, чтобы отслеживать бейсбольную статистику. [13]
Исследования [ править ]
Его академические исследования сосредоточены на эволюции генов регуляции . [17] [18] [19] [20] Несмотря на такое внимание, работа Эйзена исторически охватывала очень разнообразные дисциплины. Например, его 5 наиболее цитируемых статей охватывают широкий круг тем, включая методы иерархической кластеризации , [17] применение к раку молочной железы человека (совместно с Дэвидом Ботштейном и Шарлем Перу), [6] и открытие подтипов опухолей при диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфоме (совместно с Эшем Ализаде и Луи Штаудтом ). [18] Его недавние исследования были посвящены плодовым мухам и дрозофилам. [21] и как они «развиваются из крошечной одноклеточной яйцеклетки во взрослую особь. Он говорит, что они позволяют понять, что происходит с людьми с возрастом». [12] На свои исследования он получает финансирование от Медицинского института Говарда Хьюза . [21]
Гонка в Сенате США 2018 , г.
25 января Эйзен объявил через Twitter о своем намерении баллотироваться в Сенат США от Калифорнии в 2018 году на место сенатора-демократа Дайанны Файнштейн , зарегистрировав в Твиттере псевдоним SenatorPhD . [22] Лозунгом его предвыборной кампании было «Свобода, равенство, реальность». Причины, по которым Эйзен баллотировался в Конгресс, включали его мнение о том, что администрация Трампа не реагирует на изменение климата и другие проблемы, связанные с наукой. Еще одной причиной, по которой Эйзен решил баллотироваться, был его опыт наблюдения за тем, как назначенцы Кабинета министров давали Сенату интервью по вопросам изменения климата. Он подумал: «Было бы очень хорошо, если бы ученые задавали вопросы назначенцам Кабинета, потому что сенаторы, похоже, не понимают суть проблемы и задают неправильные вопросы». [12] Он считает, что для того, чтобы наука была в авангарде разработки политики, «ученым необходимо баллотироваться на посты » . не попали в два финала (это Дайан Файнштейн и Кевин де Леон ). [12]
В течение очень долгого времени ученые наблюдали, как разрушаются политические процессы, и наблюдали, как политики открыто высмеивают науку, игнорируя роль, которую наука играет в нашей повседневной жизни. Ученые сидели здесь и надеялись, что кто-нибудь придет и защитит эти принципы. На мой взгляд, политика должна функционировать аналогично науке. Мы должны попытаться выяснить, что происходит в мире, а затем обсудить, как лучше всего это сделать, чтобы сделать мир лучше. Лучшие инструменты, которые у нас есть для характеристики реальности, — это инструменты наблюдения, которые наука использует постоянно. Слишком большая часть политиков отвергла тот основной принцип, согласно которому ученые живут и дышат все время. [12]
Эйзен выбыл из гонки, когда не смог пройти квалификацию на первичные выборы в июне 2018 года. [23]
eLife и увольнение Редакция
В 2019 году Эйзен был назначен вторым главным редактором научного журнала открытого доступа eLife . Под его руководством журнал отошел от традиционной модели « обзор, затем публикация », вместо этого требуя от авторов представлять препринты редакторов журнала , а затем публиковать обзоры вместе с рукописями, а это означает, что журнал не принимал и не отклонял материалы. [24] Эйзен сказал, что этот шаг был направлен на то, чтобы уменьшить известность издателя и вместо этого сосредоточить внимание на авторах и их работах.
Эйзен был уволен из eLife 23 октября 2023 года после того, как опубликовал в Твиттере статью The Onion с заголовком: «Умирающих жителей Газы раскритиковали за то, что они не использовали последние слова для осуждения ХАМАС». Эйзен сказал: «The Onion говорит с большей смелостью, проницательностью и моральной ясностью, чем руководители всех академических учреждений вместе взятых. Мне бы хотелось, чтобы существовал университет @TheOnion». [25] По крайней мере пятеро редакторов eLife ушли в отставку, а другие ученые заявили, что прекратят участие в мероприятиях eLife в знак солидарности с Эйзеном. Было организовано письмо-петиция в знак протеста против увольнения Эйзена. В петиции, которую подписали более 2000 ученых, академиков и исследователей, говорится, что действия eLife оказывают «сдерживающее воздействие» на свободу выражения мнений в научных кругах. [26]
Пропаганда открытого доступа [ править ]
На протяжении всей своей карьеры он был сторонником « открытой науки », то есть свободного выпуска материальных и интеллектуальных продуктов научных исследований. Он является ведущим сторонником научных публикаций в открытом доступе. [27] [28] [29] и является соучредителем Публичной научной библиотеки (PLOS) и входит в совет PLOS, Академического руководящего и пропагандистского комитета Открытой гуманитарной библиотеки , [30] и является советником Science Commons .
В 2012 году Эйзен начал протестовать против Закона об исследовательских работах в рамках своего призыва обеспечить открытый доступ к информации. [31]
Награды и почести [ править ]
В 2002 году Эйзен был награжден первой премией Бенджамина Франклина в области биоинформатики за работу над PLOS и доступность в открытом доступе своего программного обеспечения для кластерного анализа микрочипов. [32]
Ссылки [ править ]
- ^ Публикации Майкла Эйзена, проиндексированные Google Scholar.
- ^ Сотрудники Science News (24 октября 2023 г.). «Известный редактор журнала уволен за поддержку сатирической статьи о конфликте между Израилем и Хамасом» . Наука . Архивировано из оригинала 24 октября 2023 года . Проверено 24 октября 2023 г.
- ^ «eLife приветствует Майкла Эйзена в качестве главного редактора» . электронная жизнь . 05.03.2019 . Проверено 5 марта 2019 г.
- ^ «Майкл Б. Эйзен, доктор философии» . Медицинский институт Говарда Хьюза . Проверено 23 сентября 2013 г.
- ^ Публикации Майкла Эйзена, индексируемые библиографической базой данных Scopus . (требуется подписка)
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Перу, СМ; Сёрли, Т; Эйзен, МБ; Ван Де Рейн, М; Джеффри, СС; Рис, Калифорния; Поллак-младший; Росс, DT; Джонсен, Х; Экслен, Луизиана; Флюге, О; Пергаменщиков А; Уильямс, К; Чжу, SX; Прибыль, ПЭ; Борресен-Дейл, Алабама; Браун, ПО; Ботштейн, Д. (2000). «Молекулярные портреты опухолей молочной железы человека» . Природа . 406 (6797): 747–52. Бибкод : 2000Natur.406..747P . дои : 10.1038/35021093 . ПМИД 10963602 . S2CID 1280204 .
- ^ Айер, В.Р. (1999). «Программа транскрипции в ответ фибробластов человека на сыворотку». Наука . 283 (5398): 83–7. Бибкод : 1999Sci...283...83I . дои : 10.1126/science.283.5398.83 . ПМИД 9872747 .
- ^ Росс, DT; Шерф, У; Эйзен, МБ; Перу, КМ; Рис, К; Спеллман, П; Айер, В; Джеффри, СС; Ван Де Рейн, М; Уолтем, М; Пергаменщиков А; Ли, Джей Си; Лашкари, Д; Шалон, Д; Майерс, Т.Г.; Вайнштейн, Дж. Н.; Ботштейн, Д; Браун, ПО (2000). «Систематические изменения в моделях экспрессии генов в линиях раковых клеток человека» . Природная генетика . 24 (3): 227–35. дои : 10.1038/73432 . ПМИД 10700174 . S2CID 1135137 .
- ^ Коэн, Джон (27 января 2017 г.). «Вопросы и ответы: Майкл Эйзен претендует на должность первого биолога по мухам в Сенате США» . Наука | АААС . Проверено 13 апреля 2020 г.
- ^ Хорошо, Сьюзен. «УЧЕНЫЙ НИХ СОВЕРШИЛ САМОУБИЙСТВО НА СРЕДЕ БУМАЖНОГО ЗОНДА» . Вашингтон Пост . Проверено 7 февраля 2017 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Механик, Михаил. «Украдите эту исследовательскую работу! (Вы уже заплатили за нее)» . Мать Джонс . Проверено 7 февраля 2017 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с д и ж Кригер, Лиза (04 февраля 2017 г.). «Молекулярный биолог из района залива Майкл Эйзен объявляет о своей кандидатуре в Сенат США» . Сан-Хосе Меркьюри Ньюс . Проверено 7 февраля 2017 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с «Майкл Эйзен: Бейсбол, математика и биология» . Биологическая наука Индии. Архивировано из оригинала 21 декабря 2021 г. Проверено 7 февраля 2017 г.
- ^ Эйзен, Майкл Брюс (1996). Структурные исследования белков вируса гриппа А (кандидатская диссертация). Гарвардский университет. OCLC 48938206 .
- ^ Эйзен, МБ; Спеллман, ПТ; Браун, ПО; Ботштейн, Д. (8 декабря 1998 г.). «Кластерный анализ и отображение закономерностей полногеномной экспрессии» . Proc Natl Acad Sci США . 95 (25): 14863–8. Бибкод : 1998PNAS...9514863E . дои : 10.1073/pnas.95.25.14863 . ПМЦ 24541 . ПМИД 9843981 .
- ^ «Джеймс Фрейзер и Майкл Эйзен: бейсбол встречается с биологией» . Образование . iБиология . Проверено 7 февраля 2017 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Эйзен, М .; Спеллман, П.; Браун, П .; Ботштейн, Д. (1998). «Кластерный анализ и отображение закономерностей полногеномной экспрессии» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (25): 14863–14868. Бибкод : 1998PNAS...9514863E . дои : 10.1073/pnas.95.25.14863 . ПМК 24541 . ПМИД 9843981 .
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Ализаде, А.А.; Эйзен, МБ ; Дэвис, RE; Ма, К.; Лоссос, Исландия; Розенвальд, А.; Болдрик, Дж. К.; Сабет, Х.; Тран, Т.; Ю, Х.; Пауэлл, Дж.И.; Ян, Л.; Марти, GE; Мур, Т.; Хадсон-младший, Дж.; Лу, Л.; Льюис, Д.Б.; Тибширани, Р.; Шерлок, Г.; Чан, туалет; Грейнер, ТК; Вайзенбургер, Д.Д.; Армитидж, Джо; Варнке, Р.; Леви, Р.; Уилсон, В.; Гревер, MR; Берд, Дж. К.; Ботштейн, Д.; Браун, ПО (2000). «Отличные типы диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфомы, выявленные с помощью анализа экспрессии генов». Природа . 403 (6769): 503–511. Бибкод : 2000Natur.403..503A . дои : 10.1038/35000501 . ПМИД 10676951 . S2CID 4382833 .
- ^ Кларк, АГ; и др. (2007). «Эволюция генов и геномов в филогении дрозофилы» . Природа . 450 (7167): 203–18. Бибкод : 2007Natur.450..203C . дои : 10.1038/nature06341 . ПМИД 17994087 .
- ^ Спеллман, ПТ; Шерлок, Г.; Чжан, MQ; Айер, ВР; Андерс, К.; Эйзен, МБ; Браун, ПО; Ботштейн, Д.; Футчер, Б. (1998). «Комплексная идентификация генов, регулирующих клеточный цикл дрожжей Saccharomyces cerevisiae, путем гибридизации микрочипов» . Молекулярная биология клетки . 9 (12): 3273–97. дои : 10.1091/mbc.9.12.3273 . ПМК 25624 . ПМИД 9843569 .
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Хармон, Эми; Фонтан Генри (06 февраля 2017 г.). «В эпоху Трампа ученые демонстрируют признаки политического импульса» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 7 февраля 2017 г.
- ^ Рирдон, Сара (2017). «Генетик подает заявку в Сенат США» . Природа . дои : 10.1038/nature.2017.21381 . S2CID 78431422 . Проверено 7 февраля 2017 г.
- ^ «Майкл Эйзен» . Баллотпедия . Проверено 13 апреля 2020 г.
- ^ Брейнард, Джеффри (20 октября 2022 г.). «Журнал стремится перевернуть научные публикации, только рецензируя, а не принимая рукописи» . Новости науки . Проверено 24 октября 2023 г.
- ^ «Известный редактор журнала уволен за поддержку сатирической статьи о конфликте между Израилем и Хамасом» . Наука . 24 октября 2023 г. Проверено 24 октября 2023 г.
- ^ «Увольнение редактора научного журнала после публикации в Газе вызвало раскол в сфере свободы слова» . Новости Эн-Би-Си . 26 октября 2023 г. Проверено 1 ноября 2023 г.
- ^ Эйзен, Майкл (8 октября 2003 г.). «Публикуй и прославься» . Хранитель . Проверено 23 сентября 2013 г.
- ^ Браун, ПО ; Эйзен, МБ ; Вармус, HE (2003). «Почему PLoS стал издателем» . ПЛОС Биология . 1 (1): Е36. дои : 10.1371/journal.pbio.0000036 . ПМК 212706 . ПМИД 14551926 .
- ^ ПРОВОДНОЙ Персонал. «Награды Wired Rave Awards 2004» . Проводной . ISSN 1059-1028 . Проверено 11 августа 2023 г.
- ^ Ховард, Дженнифер (29 января 2013 г.). «Цель проекта — привнести открытость в гуманитарные науки в стиле PLoS» . Хроника высшего образования . Проверено 19 ноября 2013 г.
- ^ Доббс, Дэвид (6 января 2012 г.). «Конгресс рассматривает возможность платного доступа к науке, за которую вы уже заплатили» . проводной.com . Проверено 12 февраля 2012 г.
- ^ «Премия Бенджамина Франклина — Bioinformatics.org» . www.bioinformatics.org . Проверено 7 февраля 2017 г.
Внешние ссылки [ править ]
- Это НЕ мусор - Личный блог Майкла Эйзена
- Открытое письмо президенту Трампу о замене Фрэнсиса Коллинза на посту директора НИЗ
- Майкл Эйзен (I) в Сенате
| Основатели |  | |
|---|---|---|
| Люди | ||
| Журналы | ||
- 1967 года рождения
- Живые люди
- Американские биологи XXI века
- Американские биоинформатики
- Выпускники Гарвардского колледжа
- Калифорнийский университет, факультет Беркли
- Говард Хьюз Медицинские следователи
- Основатели
- ПЛОС люди
- Американские учёные
- Выпускники Гарвардской высшей школы искусств и наук
- Кандидаты на выборах в Сенат США 2018 г.
- Выпускники средней школы Уолта Уитмена (Мэриленд)
- Лауреаты Президентской премии за заслуги перед учеными и инженерами