Streptomyces sp. Мирофора
| Streptomyces sp. Мирофора | |
|---|---|
| |
| Зрелый Streptomyces sp myrophorea с пыльными зелеными колониями с концентрическими кольцами из финта | |
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Филум: | |
| Сорт: | |
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | |
| Разновидность: | Streptomyces виды
|
| Разнообразие: | Streptomyces sp. Myrophorea изолирует MCG1
|
Streptomyces sp. Myrophorea, изолят MCG1 - это вид стрептомиков , который происходит от ( этнофармакологического ) народного лечения в городке Тенел Север в Бохо, графство Фермана . [ 1 ] Эта область была ранее занята друидами ( ~ 1500 лет назад) и до этого неолита (~ 3700 лет назад), которые выгравировали близлежащие камни Рейфада . [ 2 ] Streptomyces sp. Myrophorea ингибирует многих видов эспапских патогенов , может расти при высоком pH (10,5) и может переносить относительно высокие уровни радиоактивности. [ 1 ]
Физиология и морфология
[ редактировать ]Streptomyces sp. Myrophorea изолят MCG1 имеет светло -зеленый до белых споров и гифы при культивировании на агаре SFM. [ 1 ]
Колонии Streptomyces sp. Myrophorea имеет отчетливо пыльный вид и производит аромат, похожий на гермалин при созревании. [ 1 ] Эти бактерии производят много споров, приблизительно 0,5-1,0 микрометров по ширине, которые образуются в прямых цепях. [ 1 ]
Экология
[ редактировать ]Streptomyces sp. Мирофора изолят MCG1 был обнаружен в щелочной, богатой видам окружающей среды. Эти бактерии растут с максимальным рН 10,5 и, следовательно, являются щелочными. Бактерии переносят более высокие уровни щелочности, но не процветают. [ 1 ] Streptomyces sp. Myrophorea также может выдержать относительно высокие уровни радиации (до 4 кги. Это может быть связано с базовыми субстратами из известняка и сланца, которые выделяют газовый день . [ 1 ]
Производство антибиотиков
[ редактировать ]Только кластеры синтеза антибиотиков были идентифицированы в Streptomyces sp. Мирофора; Антибиотики фактически произведены на месте, которые еще не идентифицированы. [ 1 ] Streptomyces sp. MCG1 в целом ингибирует как грам -положительную, так и грам -отрицательную бактерии, включая карбапенему устойчивый к ацинетобактер -бауманнии (критический патоген в списке приоритетных патогенов организации Всемирной организации здравоохранения ), ванкомицину , устойчивый к энтерококк , метициллину устойчивый ауреус ( к Полем [ 1 ] [ 3 ] Streptomyces sp. Myrophorea оказывает ограниченное влияние на штаммы Enterococcus faecium и Pseudomonas aeruginosa . [ 1 ]
Щелочная толерантность
[ редактировать ]Streptomyces sp. Myrophorea может быть в состоянии процветать в щелочной среде, потому что она содержит много генов, аналогичных тем, что связаны с щелочной толерантностью у других видов бактерий. [ 4 ] [ 5 ]
Streptomyces sp. Мирофора Список генов щелочной толерантности: [ 1 ]
| Ген | Белок |
|---|---|
| 504 | Щелочный удар белка 23 |
| 6561 | Щелочный удар белка 23 |
| 1049 | Антипортерная субъединица аммония/h+ amhm |
| 2800 | Аспартат/аланин антипортер |
| 2801 | Аспартат/аланин антипортер |
| 6218 | Аспартат/аланин антипортер |
| 3284 | Увеличенный белок внутриклеточного выживания |
| 159 | K+/H+ Antiforter NHAP |
| 3788 | K+/H+ антипортер NHAP2 |
| 1050 | K+/h+ антипортер Яу |
| 2193 | K+/h+ антипортер Яу |
| 1325 | K+ нечувствительный пирофосфатный протонный насос |
| 923 | Белок устойчивости к многочисленным |
| 3240 | Белок устойчивости к многочисленным |
| 3252 | Белок устойчивости к многочисленным |
| 6781 | Белок устойчивости к многочисленным |
| 1282 | Na+/H+ антикортер |
| 4210 | Na+/H+ антипортерская субъединица A |
| 4211 | Na+/H+ антипортер субъединица c |
| 4212 | NA+/H+ антипортер субъединица D |
| 4215 | Уже+/h+ антипортер субъединица g |
| 660 | Na+/(H+или K+) с радостью |
| 3425 | Na+/(H+или K+) с радостью |
| 7210 | Предполагаемый NA+/H+ Обменник |
| 1727 | Натрий, калий, литий и рубидий/H+ антипортер |
In vitro устойчивость к антибиотикам
[ редактировать ]Присутствие генов устойчивости к антибиотикам часто связано с выработкой антибиотиков. [ 6 ] Stretpomyces sp. Myrophorea была зарегистрирована как устойчивая к 28 антибиотикам и чувствительна к восьми антибиотикам в одной серии тестов. Антибиотики были протестированы в концентрациях точек останова, рекомендованных Европейским комитетом по тестированию антимикробной восприимчивости - Eucast, для проверки антимикробной восприимчивости. [ 1 ] [ 7 ]
Антибиотическая чувствительность Streptomyces sp . Myrophorea: [ 1 ] Чувствительность, зарегистрированная как: чувствительность (ы), устойчивые (R) или промежуточные (i).
| Антибиотик | Количество (мкг) | Чувствительность |
|---|---|---|
| Амикацин | 30 | С |
| Ампициллин | 30 | Ведущий |
| Ампициллин + сульбактам | 20 | Ведущий |
| Аугментин | 30 | Ведущий |
| Апломицин | 20 | Ведущий |
| Карбенициллин | 20 | Ведущий |
| Cefepime | 30 | Ведущий |
| Ceftazidime | 10 | Ведущий |
| Ceftibuten | 30 | Ведущий |
| Цефокситин | 30 | Ведущий |
| Цефтриаксон | 30 | Ведущий |
| Cefuroxime | 30 | Ведущий |
| Цефурин | 5 | Ведущий |
| Ципрофлоксацин | 5 | Ведущий |
| Клавуранская кислота | 10 | Ведущий |
| Эртапенем | 10 | Ведущий |
| Эритромицин | 15 | я |
| Гентамицин | 10 | С |
| Имипенем | 10 | Ведущий |
| Канамицин | 20 | Ведущий |
| Linezolid | 10 | я |
| Меропенем | 10 | Ведущий |
| Интерьер | 200 | Ведущий |
| Netil | 10 | С |
| Нитрофурантоин | 100 | Ведущий |
| Новоцин | 5 | Ведущий |
| Piperacillin + Tazobactam | 36 | Ведущий |
| QUINPRISTIN + DALROPRISTIN | 5 | Ведущий |
| Рифампицин | 5 | Ведущий |
| Стрептомицин | 20 | Ведущий |
| Тигециклин | 15 | Ведущий |
| Тетрациклин | 20 | Ведущий |
| Триметоприм + сульфаметоксазол | 25 | Ведущий |
| Ванкомицин | 5 | Ведущий |
Секвенирование всего генома
[ редактировать ]Последовательность генома Streptomyces sp. Myrophorea, изолят MCG1 был отложен в NCBI (Таксидий 2099643), Biosamplecment Number Number SAMN08518548, Биопроектный номер доступа PRJNA433829, Идентификатор представления: Sub3653175 Префикс локуса тега: C4625. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/433829 . [ 1 ] Ссылка на последовательность NCBI Читать архив (SRA) https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra?linkname=biosample_sra&fom_uid=8518548 Копии этих бактерий хранятся в национальной коллекции культур типов (NCTC), Великобритания [ 8 ] и немецкая коллекция микроорганизмов и клеточных культур (DSMZ) GmbH, Германия. [ 9 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час я Дж k л м не Terra, L.; и др. (2018). «Новый щелочный стрептомик ингибирует патогены Eskape» . Границы в микробиологии . 9 : 2458. DOI : 10.3389/fmicb.2018.02458 . PMC 6232825 . PMID 30459722 .
- ^ Эндрю Халпин; Конор Ньюман (2006). Ирландия: Оксфордское археологическое руководство по местам с самых ранних времен до 1600 г. н.э. Издательство Оксфордского университета. п. 8 ISBN 978-0-19-280671-0 .
- ^ «Глобальный приоритетный список устойчивых к антибиотикам бактерий для руководства исследованиями, открытиями и развитием новых антибиотиков» . Всемирная организация здравоохранения.
- ^ Холдсворт, ср; Law, CJ (2013). «Белок с резистентностью с множеством лекарств MDTM добавляет в репертуар антипортеров, участвующих в щелочном гомеостазе pH в Escherichia coli» . BMC Микробиология . 13 : 113. DOI : 10.1186/1471-2180-13-113 . PMC 3668916 . PMID 23701827 .
- ^ Крулвич, Та; Sachs, G.; Padan, E. (2011). «Молекулярные аспекты бактериального зондирования pH и гомеостаза» . Nature Reviews Microbiology . 9 (5): 330–343. doi : 10.1038/nrmicro2549 . PMC 3247762 . PMID 21464825 .
- ^ Nodwell, JR (2007). «Новые связи между устойчивостью к антибиотикам и выработкой антибиотиков» . Журнал бактериологии . 189 (10): 3683–3685. doi : 10.1128/jb.00356-07 . PMC 1913332 . PMID 17384190 .
- ^ «Европейский комитет по тестированию восприимчивости к антимикробным препаратам - Eucast» . Получено 13 октября 2018 года .
- ^ «Национальная коллекция типовых культур (NCTC)» . Общественное здравоохранение Англия . Получено 13 октября 2018 года .
- ^ «Институт Лейбниза DSMZ-German Коллекция микроорганизмов и клеточных культур» . Институт Лейбниза DSMZ-German Коллекция микроорганизмов и Zellkulturen GmbH . Получено 13 октября 2018 года .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Терра, Лучана; Дайсон, Пол Дж.; Хитчингс, Мэтью Д.; Томас, Лиам; Абдельхамид, Аляа; Банат, Ибрагим М.; Gazze, Salvatore A.; Vujaklija, DuThica; Facey, Paul D.; Фрэнсис, Льюис У.; Куинн, Джерри А. (2018). «Новый щелочный стрептомик ингибирует патогены Eskape» . Границы в микробиологии . 9 : 2458. DOI : 10.3389/fmicb.2018.02458 . PMC 6232825 . PMID 30459722 .
- «Streptomyces MCG#1 из Бохо в Северной Ирландии» .
- Терра, Лучана; Дайсон, Пол Дж.; Хитчингс, Мэтью Д.; Томас, Лиам; Абдельхамид, Аляа; Банат, Ибрагим М.; Gazze, Salvatore A.; Vujaklija, DuThica; Facey, Paul D.; Фрэнсис, Льюис У.; Куинн, Джерри А. (2018). «Новый щелочный стрептомик ингибирует патогены Eskape» . Границы в микробиологии . 9 : 2458. DOI : 10.3389/fmicb.2018.02458 . PMC 6232825 . PMID 30459722 .