Брэндон Гаут
Эта статья может чрезмерно полагаться на источники, слишком тесно связанные с предметом , что потенциально препятствует тому, чтобы статья была проверяемой и нейтральной . ( сентябрь 2023 г. ) |
Брэндон С. Гаут | |
---|---|
Альма-матер | Калифорнийский университет, Беркли Калифорнийский университет, Риверсайд |
Партнер | Ребекка Гаут |
Награды |
|
Научная карьера | |
Поля | |
Учреждения | Калифорнийский университет, Ирвин |
Докторантура | Майкл Т. Клегг |
Известные студенты | Аойф МакЛисахт Адам Эйр-Уокер |
Брэндон Стюарт Гаут — американский биолог-эволюционист и генетик , заслуженный профессор экологии и эволюционной биологии в Калифорнийском университете в Ирвайне . [ 1 ]
Исследования Гаута сосредоточены на эволюции генетических вариаций в популяциях и их влиянии на адаптацию , видообразование и поддержание биоразнообразия, а также на эволюции мобильных элементов и их роли в формировании генетической архитектуры и эпигенетического состояния растений. [ 2 ] [ 3 ]
Образование
[ редактировать ]Гаут получил степень бакалавра в Калифорнийском университете в Беркли в 1985 году и степень доктора философии. Калифорнийского Доктор генетики университета в Риверсайде с 1988 по 1992 год под руководством Майкла Т. Клегга . [ 4 ] До 1995 года он работал постдоком на Университете штата Северная Каролина факультете статистики в под руководством Брюса Вейра, а затем стал доцентом Университета Рутгерса в 1995 году. В 1998 году он переехал в Калифорнийский университет в Ирвине и в 2020 году был назван заслуженным профессором . [ 5 ]
Карьера
[ редактировать ]Гаут был избранным президентом, президентом и бывшим президентом Общества молекулярной биологии и эволюции с 2013 по 2015 год. [ нужна ссылка ] Он является главным редактором журнала «Молекулярная биология и эволюция» . [ 6 ] С 2006 по 2013 год он занимал административные должности в качестве заведующего кафедрой экологии и эволюционной биологии. [ 4 ] и заместитель декана по исследованиям Школы биологических наук с 2017 по 2022 год. [ нужна ссылка ]
Гаут был назван профессором года в Калифорнийском университете в Ирвине в 2008 году, а старшие классы признали его выдающимся профессором. [ 4 ]
Исследовать
[ редактировать ]Ранние работы Гаута предоставили несколько фундаментальных идей о генетическом влиянии одомашнивания на сельскохозяйственные растения; вместе с постдокторантом Адамом Эйр-Уокером он использовал модели, основанные на теории слияния, чтобы установить возникновение генетических узких мест во время одомашнивания кукурузы . [ 7 ] это явление, которое, как теперь полагают, влияет на разнообразие и содержание генома многих важных с точки зрения сельского хозяйства видов. [ 8 ] [ 9 ] Позже он применил эти модели, чтобы начать поиск генов, которые были отобраны в процессе приручения, подсчитав, что около 1200 генов кукурузы (~ 3% локусов) были задействованы в ее приручении. [ 10 ] Эта работа установила основные подходы, которые были применены ко многим одомашненным видам. [ 11 ]
Вместе с Джоном Добли Гаут предоставил первые на основе последовательностей ДНК . оценки времени полиплоидизации растения [ 12 ] [ 13 ] и он внес свой вклад в основные методы, используемые в эволюционных исследованиях, такие как кодонная модель эволюции. [ 14 ] [ 15 ] Позже он охарактеризовал важные эпигенетические явления, показав, что метилирование ДНК мобильных элементов влияет на экспрессию генов в масштабе всего генома и является компонентом селективной нагрузки. [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ] и что генное метилирование у растений эволюционно консервативно. [ 19 ]
Более поздние исследования Гаута были сосредоточены на эволюции генома винограда , оценивая демографическую историю одомашнивания винограда и показывая, что культивируемый виноград обладает множеством вредных мутаций в гетерозиготном состоянии по сравнению с его дикими видами-предшественниками. [ 20 ] вероятно, из-за их истории клонального размножения. [ 21 ] Его лаборатория также идентифицировала локусы, которые могут придавать устойчивость к разрушительной для сельского хозяйства бактерии Xylella fastidiosa . [ 22 ] [ 23 ] [ 24 ]
Гаут использовал экспериментальную эволюцию E. coli , чтобы охарактеризовать степень эпистаза и антагонистической плейотропии в эволюционном процессе . [ 25 ]
Избранные публикации
[ редактировать ]- Муза, СВ; Гаут, Б.С. (сентябрь 1994 г.). «Правдоподобный подход для сравнения показателей синонимичных и несинонимичных нуклеотидных замен с применением к геному хлоропластов» . Молекулярная биология и эволюция . 11 (5): 715–724. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a040152 . ISSN 1537-1719 . ПМИД 7968485 .
- Добли, Джон Ф.; Гаут, Брэндон С.; Смит, Брюс Д. (декабрь 2006 г.). «Молекулярная генетика одомашнивания сельскохозяйственных культур» . Клетка . 127 (7): 1309–1321. дои : 10.1016/j.cell.2006.12.006 . ISSN 0092-8674 . ПМИД 17190597 . S2CID 278993 .
- Гаут, Брэндон С.; Добли, Джон Ф. (24 июня 1997 г.). «Последовательность ДНК доказывает сегментарное аллотетраплоидное происхождение кукурузы» . Труды Национальной академии наук . 94 (13): 6809–6814. Бибкод : 1997PNAS...94.6809G . дои : 10.1073/pnas.94.13.6809 . ISSN 0027-8424 . ПМК 21240 . ПМИД 11038553 .
- Ю, Цзяньмин; Прессуар, Гаэль; Бриггс, Уильям Х.; Вро Би, Ирие; Ямасаки, Масанори; Добли, Джон Ф.; Макмаллен, Майкл Д.; Гаут, Брэндон С.; Нильсен, Далия М.; Холланд, Джеймс Б.; Кресович, Стивен; Баклер, Эдвард С. (февраль 2006 г.). «Единый метод смешанной модели для сопоставления ассоциаций, учитывающий несколько уровней связи» . Природная генетика . 38 (2): 203–208. дои : 10.1038/ng1702 . ISSN 1546-1718 . ПМИД 16380716 . S2CID 8507433 .
- Райт, Стивен И.; Би, Ирие Вро; Шредер, Стив Г.; Ямасаки, Масанори; Добли, Джон Ф.; Макмаллен, Майкл Д.; Гаут, Брэндон С. (27 мая 2005 г.). «Влияние искусственного отбора на геном кукурузы» . Наука . 308 (5726): 1310–1314. дои : 10.1126/science.1107891 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 15919994 . S2CID 25581643 .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Калифорнийский университет в Ирвайне — Система профилей преподавателей» . факультет.uci.edu . Проверено 17 сентября 2023 г.
- ^ «Брэндон Гаут» . ученый.google.com . Проверено 17 сентября 2023 г.
- ^ Поведение, Комитет по исследованиям генного драйва в нечеловеческих организмах: Рекомендации для ответственных; наук, Совет по жизни; Исследования, Отдел Земли и жизни; Национальные академии наук, инженерное дело (28 июля 2016 г.), «Биографические очерки членов комитетов» , Генные драйвы на горизонте: развитие науки, преодоление неопределенности и согласование исследований с общественными ценностями , National Academies Press (США) , получено в 2023 г. -09-17
- ^ Перейти обратно: а б с «В саду эволюции» . Журнал Ученый . Проверено 17 сентября 2023 г.
- ^ «Заслуженный профессор – научный работник» . Проверено 17 сентября 2023 г.
- ^ «О МБЭ» . Academic.oup.com . Проверено 17 сентября 2023 г.
- ^ Эйр-Уокер, Адам; Гаут, Ребекка Л.; Хилтон, Холли; Фельдман, Дон Л.; Гаут, Брэндон С. (14 апреля 1998 г.). «Исследование узкого места, ведущего к одомашниванию кукурузы» . Труды Национальной академии наук . 95 (8) (опубликовано 14 апреля 1998 г.): 4441–4446. Бибкод : 1998PNAS...95.4441E . дои : 10.1073/pnas.95.8.4441 . ISSN 0027-8424 . ПМК 22508 . ПМИД 9539756 .
- ^ Добли, Джон Ф.; Гаут, Брэндон С.; Смит, Брюс Д. (декабрь 2006 г.). «Молекулярная генетика одомашнивания сельскохозяйственных культур» . Клетка . 127 (7): 1309–1321. дои : 10.1016/j.cell.2006.12.006 . ISSN 0092-8674 . ПМИД 17190597 . S2CID 278993 .
- ^ Мейер, Рэйчел С.; Пуруганан, Майкл Д. (декабрь 2013 г.). «Эволюция видов сельскохозяйственных культур: генетика одомашнивания и диверсификации» . Обзоры природы Генетика . 14 (12): 840–852. дои : 10.1038/nrg3605 . ISSN 1471-0064 . ПМИД 24240513 . S2CID 529535 .
- ^ Райт, Стивен И.; Би, Ирие Вро; Шредер, Стив Г.; Ямасаки, Масанори; Добли, Джон Ф.; Макмаллен, Майкл Д.; Гаут, Брэндон С. (27 мая 2005 г.). «Влияние искусственного отбора на геном кукурузы» . Наука . 308 (5726): 1310–1314. дои : 10.1126/science.1107891 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 15919994 . S2CID 25581643 .
- ^ Моррелл, Питер Л.; Баклер, Эдвард С.; Росс-Ибарра, Джеффри (февраль 2012 г.). «Геномика сельскохозяйственных культур: достижения и приложения» . Обзоры природы Генетика . 13 (2): 85–96. дои : 10.1038/nrg3097 . ISSN 1471-0064 . ПМИД 22207165 . S2CID 13358998 .
- ^ Гаут, Брэндон С.; Добли, Джон Ф. (24 июня 1997 г.). «Последовательность ДНК доказывает сегментарное аллотетраплоидное происхождение кукурузы» . Труды Национальной академии наук . 94 (13): 6809–6814. Бибкод : 1997PNAS...94.6809G . дои : 10.1073/pnas.94.13.6809 . ISSN 0027-8424 . ПМК 21240 . ПМИД 11038553 .
- ^ Форс, Аллан; Линч, Майкл; Пикетт, Брайан; Аморес, Ангел; Ян, И-линь; Постлтуэйт, Джон (1999). «Сохранение дубликатов генов посредством дополнительных дегенеративных мутаций» . Генетика . стр. 1531–1545. дои : 10.1093/генетика/151.4.1531 . ПМЦ 1460548 . ПМИД 10101175 . Проверено 17 сентября 2023 г.
- ^ Муза, СВ; Гаут, Б.С. (сентябрь 1994 г.). «Правдоподобный подход для сравнения показателей синонимичных и несинонимичных нуклеотидных замен с применением к геному хлоропластов» . Молекулярная биология и эволюция . 11 (5): 715–724. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a040152 . ISSN 1537-1719 . ПМИД 7968485 .
- ^ Косаковский пруд, Сергей; Фрост, Саймон (2005). «В конце концов, не такие уж и разные: сравнение методов обнаружения выбранных аминокислотных участков» . Молекулярная биология и эволюция . стр. 1208–1222. дои : 10.1093/molbev/msi105 . ПМИД 15703242 . Проверено 17 сентября 2023 г.
- ^ Холлистер, Джесси Д.; Гаут, Брэндон С. (август 2009 г.). «Эпигенетическое замалчивание мобильных элементов: компромисс между уменьшением транспозиции и вредным воздействием на экспрессию соседних генов» . Геномные исследования . 19 (8): 1419–1428. дои : 10.1101/гр.091678.109 . ISSN 1088-9051 . ПМК 2720190 . ПМИД 19478138 .
- ^ Холлистер, Джесси Д.; Смит, Лиза М.; Го, Я-Лонг; Отт, Феликс; Вайгель, Детлеф; Гаут, Брэндон С. (8 февраля 2011 г.). «Мобильные элементы и малые РНК способствуют расхождению экспрессии генов между Arabidopsis thaliana и Arabidopsis lyrata» . Труды Национальной академии наук . 108 (6): 2322–2327. Бибкод : 2011PNAS..108.2322H . дои : 10.1073/pnas.1018222108 . ISSN 0027-8424 . ПМК 3038775 . ПМИД 21252301 .
- ^ Чхве, Джэ Ён; Ли, Ю Чвен Г. (16 июля 2020 г.). «Меч о двух концах: эволюционные последствия эпигенетического молчания мобильных элементов» . ПЛОС Генетика . 16 (7): e1008872. дои : 10.1371/journal.pgen.1008872 . ISSN 1553-7404 . ПМЦ 7365398 . ПМИД 32673310 .
- ^ Такуно, Сёхей; Гаут, Брэндон С. (29 января 2013 г.). «Метилирование тел генов сохраняется у ортологов растений и имеет эволюционные последствия» . Труды Национальной академии наук . 110 (5): 1797–1802. Бибкод : 2013PNAS..110.1797T . дои : 10.1073/pnas.1215380110 . ISSN 0027-8424 . ПМЦ 3562806 . ПМИД 23319627 .
- ^ Чжоу, Юнфэн; Массонне, Мелани; Санджак, Джалеал С.; Канту, Дарио; Гаут, Брэндон С. (31 октября 2017 г.). «Эволюционная геномика одомашнивания винограда (Vitis vinifera ssp. vinifera)» . Труды Национальной академии наук . 114 (44): 11715–11720. Бибкод : 2017PNAS..11411715Z . дои : 10.1073/pnas.1709257114 . ISSN 0027-8424 . ПМК 5676911 . ПМИД 29042518 .
- ^ Хуан, Сюэхуэй; Хуан, Санвэнь; Хан, Бин; Ли, Цзяян (июль 2022 г.). «Интегрированная геномика одомашнивания и селекции сельскохозяйственных культур» . Клетка . 185 (15): 2828–2839. дои : 10.1016/j.cell.2022.04.036 . ISSN 0092-8674 . ПМИД 35643084 . S2CID 249103057 .
- ^ Моралес-Крус, Авраам; Агирре-Лигуори, Жонас; Массонне, Мелани; Минио, Андреа; Закхей, Мирелла; Кошетель, Ной; Уокер, Эндрю; Риаз, Суммайра; Чжоу, Юнфэн; Канту, Дарио; Гаут, Брэндон С. (30 мая 2023 г.). «Мультигенная устойчивость дикого винограда к Xylella fastidiosa (Vitis sps.) и ее последствия в условиях меняющегося климата» . Коммуникационная биология . 6 (1): 580. дои : 10.1038/s42003-023-04938-4 . ISSN 2399-3642 . ПМЦ 10229667 . ПМИД 37253933 .
- ^ Куинтон, Эми М. (15 июня 2023 г.). «Исследование показывает потенциальный прорыв в устойчивости виноградной лозы к болезням» . Калифорнийский университет в Дэвисе . Проверено 17 сентября 2023 г.
- ^ Калифорния, Университет; Ирвин. «Исследование показывает потенциальный прорыв в устойчивости виноградной лозы к болезням» . физ.орг . Проверено 17 сентября 2023 г.
- ^ Батарсе, Тиффани Н; Батарсе, Сара Н; Родригес-Палач, Александра; Гаут, Брэндон С. (май 2023 г.). «Фенотипическая и генотипическая адаптация Escherichia coli к термическому стрессу зависит от генетического фона» . Молекулярная биология и эволюция . 40 (5). дои : 10.1093/molbev/msad108 . ISSN 0737-4038 . ПМЦ 10195153 . ПМИД 37140066 .