АТУМ
 | Судя по всему, основной автор этой статьи тесно связан с ее предметом. ( февраль 2019 г. ) |
 | |
| Тип компании | Частный |
|---|---|
| Промышленность | Биотехнология |
| Основан | 2003 |
| Основатели | Шридхар Говиндараджан, Клаас Густавссон, Джереми Миншалл, Джон Несс |
| Штаб-квартира | , |
| Продукты | Синтез искусственных генов , белковая инженерия , производство белков , биоинформатика , разработка клеточных линий, транспозазы |
ATUM — американская биотехнологическая компания. ATUM предоставляет инструменты для проектирования и синтеза оптимизированной ДНК , а также производства белка и GMP разработки клеточных линий .
Компания
[ редактировать ]ATUM (ранее DNA2.0 ) была основана в 2003 году в Менло-Парке , Калифорния . Компания является частной [ 1 ] и по-прежнему проводит все исследования, разработки и производство в Калифорнии, в настоящее время на своем предприятии в Ньюарке площадью 50 000 кв. футов. [ 2 ] Компания начиналась и продолжает работать как поставщик генного синтеза и белковой инженерии для научных кругов, правительства, фармацевтической, химической, сельскохозяйственной и биотехнологической промышленности. Синтез генов быстро заменил молекулярное клонирование во многих академических и корпоративных лабораториях, став «литейными мастерскими эпохи биотехнологий», позволяющими изготавливать гены на заказ для биологических исследований. [ 3 ]
ДНК2.0 была представлена на PBS шоу Nova ScienceNow. [ 4 ] чтобы показать, как гены создаются синтетически в лаборатории. В 2008 году компания предоставила некоторые участки ДНК, использованные для создания синтетического бактериального генома . [ 5 ]
Отчеты Дэна Рэзера включили ДНК2.0 в свой выпуск, посвященный синтетической биологии. [ 6 ] и как эта область решает «некоторые из наиболее важных проблем, стоящих перед миром». [ 6 ]
В 2009 году журнал The Scientist назвал кодонов алгоритмы проектирования [ 7 ] (теперь под торговой маркой GeneGPS), разработанный DNA2.0 как одна из «10 лучших инноваций» года в области наук о жизни . [ 8 ] ATUM разработала Electra Vector System, универсальную систему клонирования , которая использует фермент рестрикции типа IIS SapI и ДНК-лигазу T4 в реакции в одной пробирке. [ 9 ] ATUM сделал некоторые молекулярные компоненты, такие как синтетические флуоресцентные белки, доступными в коллекциях частей ДНК с открытым доступом ( BioBricks Foundation ). [ 10 ] Атум является одним из основателей Международного консорциума генного синтеза (IGSC), занимающегося продвижением биобезопасности в индустрии генного синтеза. [ 11 ] [ 12 ] Их более 1200 [ 13 ] опубликованные научные статьи с использованием продуктов и/или услуг DNA2.0, из них 44 [ 14 ] включать в качестве авторов сотрудников компании.
Инструменты исследования
[ редактировать ]- Gene Designer — бесплатный пакет программного обеспечения для биоинформатики . [ 15 ] [ 16 ] Его используют молекулярные биологи для проектирования, [ 17 ] клонировать и проверять генетические последовательности. [ 18 ]
- Бесплатный инструмент для проектирования гРНК с алгоритмами оценки CRISPR .
- DNA ATLAS — это бесплатный инструмент для картирования плазмид, позволяющий отображать такие особенности, как промоторы , маркеры , сайты рестрикции и открытые рамки считывания в любой векторной последовательности ДНК.
- Онлайн-инструментарий для биоинформатики был признан лучшим в Интернете по версии журнала Genetic Engineering News. [ 19 ]
Партнерство
[ редактировать ]- Медицинская школа Перельмана при Пенсильванском университете будет использовать технологию GeneGPS, разработанную ATUM, в первую очередь для поддержки работы Программы генной терапии по разработке вакцины против ВИЧ-1 путем оптимизации экспрессии белка in vivo. [ 20 ] [ 21 ]
- Центр исследования инфекций и иммунитета в Сент-Джордже, Лондонском университете и компания Atum объединились в разработке фармацевтических препаратов на растительной основе. [ 22 ]
- ООО Адимаб. и ATUM создают альянс в области открытия и биопроизводства антител посредством проектирования и создания библиотек антител.
- Cytovance Biologics использует GeneGPS от ATUM как часть своей системы экспрессии Keystone для разработки штаммов микроорганизмов для успешного биопроизводства.
- Компания Archer Daniels Midland ADM . промышленной инженерии ферментов применяет запатентованную технологию белковой инженерии ATUM, ProteinGPS, в процессах [ 23 ]
- ATUM является спонсором BioBuilder, ресурса для практических занятий и информативных анимаций по синтетической биологии для учащихся и учителей средних и старших классов; основана доктором Натали Кулделл из Массачусетского технологического института.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Дуан, Мэри (18 октября 2009 г.). «Синтез генов: для ДНК 2.0 это не штамм» . Бизнес-журнал Кремниевой долины . Сан-Хосе, Калифорния.
- ^ «DNA2.0 строит современное предприятие по биопроизводству в Ньюарке, Калифорния» . MercuryNews.com . Сан-Хосе Меркьюри Ньюс . Проверено 22 марта 2016 г.
- ^ Поллак (12 сентября 2007 г.). «Как вам ваши гены? Биофаббы принимают заказы» . Нью-Йорк Таймс . Нью-Йорк.
- ^ «Искусственная жизнь» . Нова СайенсNow . 18 октября 2005 г. PBS .
- ^ Поллак (24 января 2008 г.). «Ученые делают новый шаг на пути к рукотворной жизни» . Нью-Йорк Таймс . Нью-Йорк.
- ^ Перейти обратно: а б "Передовой" . Отчеты Дэна Рэзера . 30 апреля 2013. AXS TV .
- ^ Уэлч; Говиндараджан; Несс; Вильялобос; Герни; Миншалл; Густавссон (14 сентября 2009 г.). «Параметры проектирования для контроля экспрессии синтетических генов в Escherichia coli» . ПЛОС ОДИН . 4 (9): е7002. дои : 10.1371/journal.pone.0007002 . ПМЦ 2736378 . ПМИД 19759823 .
- ^ «10 лучших инноваций 2009 года». Ученый . 23 (12): 41–52. 1 декабря 2009 г.
- ^ Уитмен; Гор; Несс; Теодору; Миншалл (июнь 2013 г.), «Быстрое клонирование фрагментов генов без рубцов с использованием SapI, ДНК-лигазы T4 и электровекторной системы DNA2.0» (PDF) , NEB Expressions , II : 8
- ^ Ледфорд, Хайди (4 июля 2013 г.). «Биоинженеры смотрят дальше патентов» . Природа . 499 (7456). Macmillan Publishers Limited: 16–17. дои : 10.1038/499016а . ПМИД 23823774 .
- ^ Хайден, Эрика Чек (18 ноября 2009 г.). «Производители генов формируют коалицию безопасности» . Природа . дои : 10.1038/news.2009.1095 .
- ^ «Фирмы, занимающиеся генным синтезом, создают протокол биобезопасности» , Новости генной инженерии и биотехнологии , 18 ноября 2009 г.
- ^ «Поиск в базе данных литературы» . 29 апреля 2016 г.
- ^ «Поиск в базе данных литературы. Аффилиация автора:DNA2.0» . 29 апреля 2016 г.
- ^ Вильялобос, Алан; Несс, Джон Э; Густавссон, Клаас; Миншалл, Джереми; Говиндараджан, Шридхар (2006). «Генный дизайнер: инструмент синтетической биологии для создания искусственных сегментов ДНК» . БМК Биоинформатика . 7 : 285. дои : 10.1186/1471-2105-7-285 . ПМЦ 1523223 . ПМИД 16756672 .
- ^ Вильялобос, Алан; Уэлч, Марк; Миншалл, Джереми (2012). «In Silico Дизайн функциональных конструкций ДНК». Синтез генов . Методы молекулярной биологии. Том. 852. стр. 197–213. дои : 10.1007/978-1-61779-564-0_15 . ISBN 978-1-61779-563-3 . ПМИД 22328435 .
- ^ Уэлч, М; Вильялобос, А; Густафссон, К; Миншалл, Дж (2011). Проектирование генов для успешной экспрессии белков . Методы энзимологии. Том. 498. стр. 43–66. дои : 10.1016/B978-0-12-385120-8.00003-6 . ISBN 9780123851208 . ПМИД 21601673 .
- ^ Танец, Эмбер (1 июля 2012 г.). «Переезд, мать-природа» . Ученый .
- ^ «Лучшее в сети». Новости генной инженерии . 15 апреля 2007 г.
- ^ «Оптимизация экспрессии генов с помощью технологии DNA2.0» . ГЕН . 14 ноября 2012 г.
- ^ МакЭнери, Регина (4 февраля 2013 г.), «Доставка ДНК» , VAX: The Bulletin on AIDS Vaccine Research , 11 (1), заархивировано из оригинала 29 ноября 2014 г. , получено 19 ноября 2014 г.
- ^ Коэн, Брайан (24 декабря 2013 г.). «DNA2.0 объявляет о биофармацевтическом партнерстве с St. George's» . Новости о вакцинах .
- ^ «ADM и DNA2.0 заключают соглашение о доступе и обслуживании технологий белковой инженерии» . Сан-Хосе Меркьюри Ньюс . Сан-Хосе, Калифорния. 17 ноября 2014 г.