Подокаликсин
| Подокаликсин | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | ПОДПИСКА | ||
| Пфам | PF06365 | ||
| ИнтерПро | ИПР013836 | ||
| Мембраном | 136 | ||
| |||
Подокаликсин , сиалогликопротеин считается основным компонентом гликокаликса подоцитов клубочка ( . , капсулы Боумена ) в почках [ 1 ] Он является членом семейства CD34 . трансмембранных сиаломуцинов [ 2 ] Он покрывает вторичные ножки подоцитов. Он заряжен отрицательно и, таким образом, действует посредством отталкивания заряда, разделяя соседние отростки стопы, тем самым сохраняя барьер фильтрации мочи открытым. [ 3 ] Эта функция дополнительно подтверждается нокаутными исследованиями на мышах, которые выявили важную роль в морфогенезе подоцитов. [ 4 ] [ 5 ] и роль в открытии сосудистых просветов и регуляции сосудистой проницаемости. [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] Следует отметить, что это единственный известный нокаут сиаломуцина на клеточной поверхности, демонстрирующий летальный фенотип. [ 4 ]
Подокаликсин также активируется при ряде видов рака и часто связан с плохим прогнозом. [ 5 ] [ 9 ] [ 10 ] Подокаликсин важен для нас, поскольку потенциально может обеспечить лучшее понимание развития рака и его агрессивности за счет индуцированной миграции клеток и инвазии в результате взаимодействия с актин-связывающим белком EZR. [ 11 ] Эффекты EZR-зависимых сигнальных событий, среди многих других нарушений сигнала, могут привести к повышению активности других жизненно важных путей раковых клеток. [ 1 ] Сиалилированные , O-гликозилированные гликоформы подокаликсина, экспрессируемые клетками карциномы толстой кишки, обладают активностью связывания L-селектина и Е-селектина , и аффинность связывания может иметь решающее значение для метастатического распространения клеток карциномы толстой кишки. [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] Также было показано, что на клеточном уровне подокаликсин регулирует размер и топологию апикальных клеточных доменов и действует как мощный индуктор образования микроворсинок. [ 15 ]
Подокаликсин также известен как TRA-1-60 и является маркером плюрипотентных стволовых клеток. [ 16 ]
Обсуждение
Было обнаружено, что подокаликсин обладает несколькими событиями трансляционной модификации и, вероятно, еще предстоит открыть. Существуют гликозилированные O-связанные события с аминокислотой серином в положении 144 и два N-связанных события гликозилирования с аспарагином в положениях 193 и 395. Наряду с остатками фосфорилирования в положениях 570 и 596 с серином. В состав трансмембранного белка подокаликсина входят кислотные остатки в положениях 162–192, множество полярных остатков в положениях 200–219, 230–267 и 554–568, а также содержащиеся как основные, так и кислые остатки в положениях 590–605. [ 1 ] [ 17 ]
Установлено, что длина белка составляет 605 аминокислот, а масса составляет около 65 076 дальтон. Структура состоит из топологических доменов в положениях 33–500, являющихся внеклеточными, и положениях 522–605, являющихся цитоплазматическими. Трансмембранный домен имеет спиральную структуру в положениях 501–521. [ 17 ]
Продвижение дальше в нашем понимании этого белка в понимании патологии мутагенеза могло бы оказать огромную помощь биотехнологическим компаниям и медицинской промышленности, равно как и расширение наших текущих знаний обо всех белках, особенно о тех, которые связаны с развитием рака. В настоящее время известны мутации в положениях 97, 118 и 124 во внеклеточной области белка, которые, вероятно, изменяют структуру белка и передачу сигналов трансдукции, не вызывая правильного ответа организма. [ 17 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с Омим – подокаликсиноподобный; субхл
- ^ Нильсен Дж.С., МакНэгни К.М. (2008). «Новые функции семейства CD34». Журнал клеточной науки . 121 (Часть 22): 3682–3692. дои : 10.1242/jcs.037507 . ПМИД 18987355 .
- ^ Гартнер, LP; Хайатт, Струм (2007). Клеточная биология и гистология . Липпинкотт Уильямс и Уилкинс. ISBN 978-0-7817-8577-8 .
- ^ Jump up to: а б Дойоннас Р., Кершоу Д.Б., Дюме С., Меркенс Х., Челлия С., Граф Т., МакНагни К.М. (2001). «Анурия, омфалоцеле и перинатальная летальность у мышей, лишенных родственного Cd34 белка подокаликсина» . Джей Эксп Мед . 194 (1): 13–27. дои : 10.1084/jem.194.1.13 . ПМЦ 2193439 . ПМИД 11435469 .
- ^ Jump up to: а б Нильсен Дж.С., МакНэгни К.М. (2009). «Роль подокаликсина в здоровье и болезни» . J Am Soc Нефрол . 20 (10): 1669–76. дои : 10.1681/ASN.2008070782 . ПМИД 19578008 .
- ^ Кейт, Джессика; Хьюз, Майкл Р.; Зеглински, Мэтью Р.; Чан, Аллен В.; Остерхоф, Сабрина; Скотт, Р. Уайлдер; Эрнаэс, Диана Каналс; Кейт, Алисса; Фогль, А. Уэйн; Берначес, Паскаль; Андерхилл, Т. Майкл; Гранвилл, Дэвид Дж.; Мерфи, Тимоти Х.; Роскелли, Кэлвин Д.; МакНагни, Келли М. (5 марта 2019 г.). «Подокаликсин необходим для поддержания функции гематоэнцефалического барьера во время острого воспаления» . Труды Национальной академии наук . 116 (10): 4518–4527. Бибкод : 2019PNAS..116.4518C . дои : 10.1073/pnas.1814766116 . ПМК 6410846 . ПМИД 30787191 .
- ^ Стиль, Борис; Кучера, Томас; Эглингер, Ян; Хьюз, Майкл Р.; МакНагни, Келли М.; Цукита, Сатико; Дежана, Элизабет; Феррара, Наполеон; Ламмерт, Экхард (октябрь 2009 г.). «Молекулярная основа формирования просвета сосудов в развивающейся аорте мыши» . Развивающая клетка . 17 (4): 505–515. дои : 10.1016/j.devcel.2009.08.011 . ПМИД 19853564 .
- ^ Дебрюин Э.Дж., Хьюз М.Р. и др. (2014). «Подокаликсин регулирует проницаемость сосудов легких мышей, изменяя адгезию эндотелиальных клеток» . ПЛОС ОДИН . 9 (10): е108881. Бибкод : 2014PLoSO...9j8881D . дои : 10.1371/journal.pone.0108881 . ПМЦ 4193771 . ПМИД 25303643 .
- ^ Снайдер, Кимберли А; Хьюз, Майкл Р.; Хедберг, Брэдли; Брэндон, Джилл; Эрнаэс, Диана Каналс; Бергквист, Питер; Круз, Фредерик; По, Кельвин; Грейвс, Марсия Л; Терви, Мишель Э; Нильсен, Джули С; Уилкинс, Джон А; Макколл, Шон Р.; Бэбкук, Джон С; Роскелли, Кэлвин Д.; МакНагни, Келли М. (27 марта 2015 г.). «Подокаликсин усиливает рост и метастазирование опухоли молочной железы и является мишенью для терапии моноклональными антителами» . Исследование рака молочной железы . 17 (1): 46. дои : 10.1186/s13058-015-0562-7 . ПМЦ 4423095 . ПМИД 25887862 .
- ^ Сомасири А., Нильсен Дж.С., Макрецов Н., Маккой М.Л., Прентис Л., Гилкс CB, Чиа С.К., Гельмон К.А., Кершоу Д.Б., Хантсман Д.Г., МакНэгни К.М., Роскелли К.Д. (2004). «Сверхэкспрессия антиадгезинового подокаликсина является независимым предиктором прогрессирования рака молочной железы». Рак Рез . 64 (15): 5068–73. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-04-0240 . hdl : 1807.1/116 . ПМИД 15289306 . S2CID 15399303 .
- ^ «UniProtKB — O00592 (PODXL_HUMAN)» . 2002 . Проверено 1 мая 2022 г.
- ^ Томас С.Н., Шнаар Р.Л., Константинопулос К. (март 2009 г.). «Подокаликсиноподобный белок представляет собой лиганд E-/L-селектина в клетках карциномы толстой кишки: сравнительные биохимические свойства лигандов селектина в клетках хозяина и опухолевых клетках» . Am J Physiol Cell Physiol . 296 (3): C505–13. doi : 10.1152/ajpcell.00472.2008 . ПМК 2660269 . ПМИД 19118161 .
- ^ Константинопулос К., Томас С.Н. (2009). «Раковые клетки в пути: сосудистые взаимодействия опухолевых клеток» . Анну Рев Биомед Инж . 11 : 177–202. doi : 10.1146/annurev-bioeng-061008-124949 . ПМИД 19413512 .
- ^ Томас С.Н., Тонг З., Стебе К.Дж., Константинопулос К. (2009). «Идентификация, характеристика и использование лигандов селектина опухолевых клеток в разработке диагностики рака толстой кишки». Биореология . 46 (3): 207–25. дои : 10.3233/БИР-2009-0534 . ПМИД 19581728 .
- ^ Нильсен Дж.С., Грейвс М.Л., Челлия С., Фогль А.В., Роскелли К.Д., МакНагни К.М. (2007). «Сродственная CD34 молекула подокаликсина является мощным индуктором образования микроворсинок» . ПЛОС ОДИН . 2 (2): е237. Бибкод : 2007PLoSO...2..237N . дои : 10.1371/journal.pone.0000237 . ПМЦ 1796660 . ПМИД 17311105 .
- ^ Шопперле, ВМ; ДеВольф, WC (март 2007 г.). «Маркеры плюрипотентных стволовых клеток человека TRA-1-60 и TRA-1-81 экспрессируются на подокаликсине при эмбриональной карциноме» . Стволовые клетки . 25 (3): 723–30. doi : 10.1634/stemcells.2005-0597 . ПМИД 17124010 . S2CID 25224638 .
- ^ Jump up to: а б с «UniProtKB — Q9NZ53 (PDXL2_HUMAN)» . 2000.