Гидрамацин-1

Гидрамацин-1 представляет собой тип антимикробного белка . Впервые он был выделен и воспроизведен в 2008 году из клеток пресноводного гидроида гидры . Этот белок длиной всего около 60 аминокислот уникален как по аминокислотной последовательности, так и по третичной структуре , что позволяет отнести его к новому семейству белков — мацинам . Необычная структура белка, скорее всего, является причиной сильных антимикробных свойств этого соединения. ^{[ 1 ]}

Антимикробные тесты показали, что белок оказывает антибактериальное действие как против грамположительных , так и против грамотрицательных бактерий. Эта мощная антибактериальная активность распространилась на известные полирезистентные штаммы патогенных бактерий, таких как Klebsiella oxytoca . Функционально белок заставляет бактериальные клетки слипаться и агрегироваться, изменяя морфологию создаваемых им бактериальных скоплений. Это приводит к нарушению структуры бактериальной мембраны. ^{[ 1 ]}

Гидрамацин-1 был впервые выделен из эпителиальных клеток книдарии Hydra , небольшого (почти микроскопического) пресноводного животного, родственного кораллам , морским анемонам и медузам . ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]} Как и другие представители типа Cnidaria , гидра обладает специализированными защитными эпителиальными клетками, называемыми книдоцитами , которые стреляют токсичными шипами в организмы, с которыми они вступают в физический контакт. В 2008 году немецким исследователям удалось выделить ген , кодирующий производство белка, из генома гидры. Ген был перенесен и клонирован в плазмиду ( Pet32a ), которую вставили в бактерии Escherichia coli , что является стандартным методом репликации белка. изолированы от гораздо более крупного организма. ^{[ 1 ]} Затем трехмерную структуру полученного белка определяли методом ЯМР-спектроскопия и теперь публикуется онлайн в Банке данных белков . ^{[ 6 ]}

Гидрамацин-1 представляет собой одноцепочечный белок, состоящий из шестидесяти аминокислот . Это уникальная комбинация аминокислот на поверхности молекулы, которая придает белку мощные антимикробные свойства. Эта специализированная часть третичной структуры белка, положительно заряженный пояс между двумя гидрофобными (и ионно-инертными) областями, была предложена в качестве триггера влияния белка на агрегацию бактерий. ^{[ 1 ]}

Гидрамацин-1 отличается от любого другого известного в настоящее время антибактериального средства, за исключением двух белков, обнаруженных у пиявок . Исследователи предлагают поместить гидрамацин-1 и белки пиявки в новое семейство белков, называемое мацинами . Белки, наиболее близкие по структуре к мацинам, представляют собой суперсемейство белков, полученных из скорпиона яда , получившее название скорпионных оксинов . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Юнг С., Дингли А.Дж., Огюстин Р., Антон-Эркслебен Ф., Станисак М., Гельхаус С., Гутсманн Т., Хаммер М.Ю., Подшун Р., Бонвин А.М., Лейпп М., Бош Т.К., Гретцингер Дж. (16 января 2009 г.). «Гидрамацин-1, структура и антибактериальная активность белка базальной многоклеточной гидры» . Журнал биологической химии . 284 (3). Американское общество биохимии и молекулярной биологии: 1896–1905. дои : 10.1074/jbc.M804713200 . ПМИД 19019828 .
^ «Гидра» . Интегрированная таксономическая информационная система . Проверено 23 января 2009 г.
^ «Сцифозоа» . Интегрированная таксономическая информационная система . Проверено 23 января 2009 г.
^ «Антозоа» . Интегрированная таксономическая информационная система . Проверено 23 января 2009 г.
^ «Книдария» . Интегрированная таксономическая информационная система . Проверено 23 января 2009 г.
^ «Гидрамацин-1 (2К35)» . Банк данных по белкам . Проверено 23 января 2009 г.
^ «Обнаружено новое семейство антибактериальных средств» . Новости науки . ScienceDaily. 17 января 2009 г. Проверено 17 января 2009 г.

Библиография

Юнг С., Дингли А.Дж., Огюстин Р., Антон-Эркслебен Ф., Станисак М., Гельхаус С., Гутсманн Т., Хаммер М.Ю., Подшун Р., Бонвин А.М., Лейпп М., Бош Т.К., Гретцингер Дж. (16 января 2009 г.). «Гидрамацин-1, структура и антибактериальная активность белка базальной многоклеточной гидры» . Журнал биологической химии . 284 (3). Американское общество биохимии и молекулярной биологии: 1896–1905. дои : 10.1074/jbc.M804713200 . ПМИД 19019828 .

Внешние ссылки

Гидрамацин-1 (2K35) в банке данных белков , включая информацию о последовательности и трехмерной структуре.
Гидрамацин-1 (2К35) в ОСА

[Jung2009-1] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Юнг С., Дингли А.Дж., Огюстин Р., Антон-Эркслебен Ф., Станисак М., Гельхаус С., Гутсманн Т., Хаммер М.Ю., Подшун Р., Бонвин А.М., Лейпп М., Бош Т.К., Гретцингер Дж. (16 января 2009 г.). «Гидрамацин-1, структура и антибактериальная активность белка базальной многоклеточной гидры» . Журнал биологической химии . 284 (3). Американское общество биохимии и молекулярной биологии: 1896–1905. дои : 10.1074/jbc.M804713200 . ПМИД 19019828 .

[ITISHydra-2] «Гидра» . Интегрированная таксономическая информационная система . Проверено 23 января 2009 г.

[ITISScyphozoa-3] «Сцифозоа» . Интегрированная таксономическая информационная система . Проверено 23 января 2009 г.

[ITISAnthozoa-4] «Антозоа» . Интегрированная таксономическая информационная система . Проверено 23 января 2009 г.

[ITISCnidaria-5] «Книдария» . Интегрированная таксономическая информационная система . Проверено 23 января 2009 г.

[PDBHydramacin1-6] «Гидрамацин-1 (2К35)» . Банк данных по белкам . Проверено 23 января 2009 г.

[SD20090117-7] «Обнаружено новое семейство антибактериальных средств» . Новости науки . ScienceDaily. 17 января 2009 г. Проверено 17 января 2009 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]