ВНН1

ВНН1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 4CYF, 4CYG, 4CYY
Идентификаторы
Псевдонимы	VNN1 , HDLCQ8, Tiff66, ванин 1
Внешние идентификаторы	МГИ : 108395 ; Гомологен : 32130 ; Генные карты : VNN1 ; ОМА : VNN1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 6 (human) Band 6q23.2 Start 132,680,849 bp End 132,714,055 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 10 (mouse) Band 10|10 A4 Start 23,770,586 bp End 23,781,241 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in jejunal mucosa duodenum gallbladder liver right lobe of liver pancreatic epithelial cell kidney tubule blood pancreatic ductal cell mucosa of ileum Top expressed in jejunum proximal tubule intestinal villus left lung lobe right kidney renal corpuscle human kidney left lobe of liver Ileal epithelium parotid gland More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in linear amides hydrolase activity pantetheine hydrolase activity Cellular component integral component of membrane membrane anchored component of membrane extracellular region plasma membrane azurophil granule membrane Biological process positive regulation of T cell differentiation in thymus response to oxidative stress nitrogen compound metabolic process acute inflammatory response negative regulation of oxidative stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway innate immune response inflammatory response chronic inflammatory response pantothenate metabolic process neutrophil degranulation cell-cell adhesion Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 8876 22361 Вместе ENSG00000112299 ENSMUSG00000037440 ЮниПрот О95497 Q9Z0K8 RefSeq (мРНК) НМ_004666 НМ_011704 RefSeq (белок) НП_004657 НП_035834 Местоположение (UCSC) Chr 6: 132,68 – 132,71 Мб Чр 10: 23,77 – 23,78 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Пантетеиназа — это фермент , который у человека кодируется VNN1 геном .

Этот генный продукт является членом семейства белков Ванина, которые имеют большое сходство последовательностей друг с другом, а также с биотинидазой . Семейство включает секретируемые и мембраносвязанные белки, некоторые из которых, как сообщается, участвуют в транспортировке гемопоэтических клеток. Биотинидазная активность не была продемонстрирована ни для одного из белков ванина, однако они обладают пантетеиназной активностью, которая может играть роль в реакции на окислительный стресс. Этот белок, как и его мышиный гомолог, вероятно, представляет собой молекулу клеточной поверхности, заякоренную с GPI. Мышиный белок экспрессируется периваскулярными стромальными клетками тимуса и регулирует миграцию предшественников Т-клеток в тимус. Этот ген расположен в непосредственной близости и в той же транскрипционной ориентации, что и два других гена ванина на хромосоме 6q23-q24.

Дальнейшее чтение

• Аурран-Лайонс М., Галланд Ф., Базен Х. и др. (1997). «Ванин-1, новая периваскулярная молекула, связанная с GPI, участвующая в возвращении тимуса» . Иммунитет . 5 (5): 391–405. дои : 10.1016/S1074-7613(00)80496-3 . ПМИД   8934567 .
• Марас Б., Барра Д., Дюпре С., Питари Дж. (1999). «Является ли пантеиназа фактической идентичностью белков ванина-1 мыши и человека?». ФЭБС Летт . 461 (3): 149–52. дои : 10.1016/S0014-5793(99)01439-8 . ПМИД   10567687 . S2CID   25738323 .
• Мартин Ф., Малерг Ф., Питари Дж. и др. (2001). «Гены ванина сгруппированы (человеческий 6q22-24 и мышиный 10A2B1) и кодируют изоформы эктоферментов пантетеиназы». Иммуногенетика . 53 (4): 296–306. дои : 10.1007/s002510100327 . ПМИД   11491533 . S2CID   10763223 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека» . Природа . 425 (6960): 805–11. Бибкод : 2003Natur.425..805M . дои : 10.1038/nature02055 . ПМИД   14574404 .
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД   14702039 .
• Кристиансен Т.З., Банкенборг Дж., Гронборг М. и др. (2005). «Протеомный анализ желчи человека» . Мол. Клетка. Протеомика . 3 (7): 715–28. дои : 10.1074/mcp.M400015-MCP200 . ПМИД   15084671 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Лю Т, Цянь В.Дж., Гриценко М.А. и др. (2006). «Анализ N-гликопротеома плазмы человека методом иммуноаффинного вычитания, химии гидразидов и масс-спектрометрии» . J. Протеом Рез . 4 (6): 2070–80. дои : 10.1021/pr0502065 . ПМК   1850943 . ПМИД   16335952 .
• Мин-Оо Дж., Фортин А., Питари Г. и др. (2007). «Комплексный генетический контроль восприимчивости к малярии: позиционное клонирование локуса Char9» . Дж. Эксп. Мед . 204 (3): 511–24. дои : 10.1084/jem.20061252 . ПМК   2137903 . ПМИД   17312006 .