Лимфоцистивирус

Лимфоцистивирус
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область :	Вариднавирия
Королевство:	Бэмфордвире
Тип:	Нуклеоцитовирикота
Сорт:	Мегавирицеты
Заказ:	Пимасковирасы
Семья:	Иридовирусиды
Подсемейство:	Альфаиридовирины
Род:	Лимфоцистивирус

Лимфоцистивирусы — род вирусов семейства Iridoviridae . ^{[ 1 ]} Рыбы служат естественными хозяевами. В этом роде четыре вида. ^{[ 1 ]} К заболеваниям, связанным с этим родом, относятся: опухолевидные разрастания на коже. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Хозяева

Лимфоцистивирус — один из шести родов вирусов и один из трех родов этого семейства , вирусного семейства Iridoviridae поражающих костистых рыб , наряду с мегалоцитивирусом и ранавирусом . ^{[ 3 ]} Лимфоцистивирусы поражают более 140 пресноводных и морских видов. ^{[ 4 ]} охватывающий не менее 42 принимающих семей по всему миру, ^{[ 5 ]} вызывая хроническое, самоограничивающееся клиническое заболевание — лимфоцистис . Хотя лимфоцистис не вызывает массовой смертности, как мегалоцитивирусы и ранавирусы, у рыб с лимфоцистисом наблюдаются хорошо заметные папилломоподобные поражения кожи, которые существенно снижают их коммерческую ценность. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} В настоящее время вакцины против вируса лимфоцистиса не существует. ^{[ 6 ]}

Таксономия

Род включает следующие виды: ^{[ 8 ]}

геном ЖКВ

дцДНК Лимфоцистивирусы — это вирусы группы I с геномом . Геном LCDV-1 имеет длину примерно 102,7 тысяч пар оснований (кбп), имеет 195 потенциальных открытых рамок считывания (ORF) и кодирует две ДНК-зависимые РНК-полимеразы субъединицы : ДНК-метилтрансферазу , ДНК-полимеразу , гуанозинтрифосфатфосфогидролазу ( ГТФаза ), геликаза , протеинкиназы , рибонуклеозиддифосфат. редуктаза и белки цинковых пальцев , среди других. ^{[ 9 ]} Геном LCDV-2 похож на геном LCDV-1, но немного меньше, примерно 98 пар оснований (кбп) в длину. ^{[ 10 ]}

Структура

Вирусы рода Lymphocystivirus имеют оболочку, икосаэдрическую и полиэдрическую геометрию и симметрию T = 189–217. Диаметр составляет около 120-350 нм. Геномы линейные, длиной около 100 КБ. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Род	Структура	Симметрия	Капсид	Геномное расположение	Геномная сегментация
Лимфоцистивирус	Многогранник	Т=189-217		Линейный	Однодольный

Жизненный цикл

Лимфоцистивирусы прикрепляются к клетке-хозяину и проникают в нее путем рецептор-опосредованного эндоцитоза, как и другие иридовирусы. ^{[ 11 ]} Вирусные частицы не имеют оболочки и перемещаются в ядро клетки, где репликация ДНК начинается с помощью кодируемой вирусом ДНК-полимеразы . ^{[ 12 ]} Затем вирусная ДНК перемещается в цитоплазму для второго этапа репликации ДНК, что приводит к образованию конкатемеров ДНК . ^{[ 12 ]} Конкатамерная вирусная ДНК впоследствии упаковывается с помощью головного механизма в вирионы. ^{[ 13 ]} Вирусный геном лимфоцистиса циркулярно перестановлен терминально избыточной ДНК . ^{[ 12 ]} Транскрипция с помощью ДНК-матрицы - это метод транскрипции. Рыба служит естественным хозяином. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Род	Сведения о хосте	Тканевой тропизм	Детали входа	Подробности выпуска	Сайт репликации	Монтажный участок	Передача инфекции
Лимфоцистивирус	Рыба	Никто	Эндоцитоз клеточных рецепторов	Лизис; зарождающийся	Ядро	Цитоплазма	Неизвестный

Патогенез

Лимфоцистная болезнь – хроническое заболевание, которое редко приводит к летальному исходу. ^{[ 4 ]} Инфекция вызывает трансформацию и гипертрофию (приблизительно в 1000 раз) клеток дермы с образованием хорошо видимых лимфоцистных узелков, а также трансформацию и гипертрофию клеток соединительной ткани различных внутренних органов. ^{[ 4 ]} Фибробласты и остеобласты конкретно поражаются вирусом. ^{[ 14 ]} Вирусы Lymphocystis нелегко выращивать в культуре клеток . ^{[ 4 ]} наложение ограничений на in vitro эксперименты по молекулярному патогенезу .

Диагностика патологии

Поскольку вирусы лимфоцистис нелегко выращивать в культуре клеток, ^{[ 4 ]} Диагноз основывается на клинических признаках , грубой патологии , гистопатологии , серологии и/или на основе полимеразной цепной реакции (ПЦР) молекулярных анализах .

Грубая патология

Патология лимфоцистис состоит из папилломоподобных поражений кожи, состоящих из сильно гипертрофированных инфицированных клеток-хозяев, встроенных во внеклеточный матрикс, иногда называемых опухолевыми клетками лимфоцистис, которые отчетливо проявляются в виде белых пятен на коже и плавниках инфицированной рыбы. ^{[ 15 ]} В некоторых случаях эти поражения пролиферируют в виде эпителиальных опухолей. ^{[ 16 ]}

Гистопатология

В недавнем сравнении гистопатологии лимфоцист четырех неродственных морских видов поражения , последовательно связанные с лимфоцистами, включали гипертрофированные клетки с нерегулярными ядрами, базофильные цитоплазматические тельца включения , которые положительно окрашивались по реакции Фельгена и Манна , а также , положительные по периодической кислоте-Шиффу (PAS) гиалиновые капсулы . ^{[ 5 ]} Гиалиновые капсулы возникают из внеклеточного матрикса, вырабатываемого инфицированными клетками. ^{[ 14 ]} и состоят из сульфатированных и карбоксилированных гликопротеинов (кислых мукополисахаридов). ^{[ 14 ]} Напротив, форма тела включения, распределение вирусных частиц в цитоплазме и общий вид узелков лимфоцист различались в зависимости от вида. ^{[ 5 ]} Виды, исследованные в этом исследовании, включали белопятнистого фугу ( Arothron hispidus ), японского морского окуня ( Lateolabrax japonicus ), оливковую камбалу ( Paralichthys olivaceus ) и «жалящую рыбу» или черного морского окуня Шлегеля ( Sebastes schegeli ). ^{[ 5 ]}

Серология

Для выявления инфекций LCDV было разработано несколько серологических методов, включая проточную цитометрию , ^{[ 17 ]} иммуноблот , ^{[ 17 ]}^{[ 18 ]} и иммунофлюоресценция . ^{[ 17 ]} Однако молекулярные анализы на основе ПЦР более практичны для большинства применений. ^{[ 6 ]}

Электронная микроскопия

Просвечивающая электронная микроскопия (ПЭМ) инфицированных клеток выявляет цитоплазматические вирусные частицы, обычно имеющие диаметр 198-227 нм. ^{[ 4 ]} (в некоторых случаях до 380 нм) ^{[ 4 ]}^{[ 14 ]} и электронно-плотные вещества в околоядерном пространстве . ^{[ 5 ]}

Молекулярная патология

Доступны опубликованные праймеры и протокол ПЦР для амплификации части MCP LCDV-1. ^{[ 6 ]} Когда диагностический анализ ПЦР сочетается со слот-блоттингом , диагностическая чувствительность увеличивается, что облегчает диагностику бессимптомных инфекций LCDV-1. ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и "Iridoviridae" . ICTV Online (10th) Report .
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.
^ Уиттингтон, Р.Дж.; Беккер, Дж.А.; Деннис, ММ (2010). «Иридовирусные инфекции у рыб - критический обзор с упором на ранавирусы». Журнал болезней рыб . 33 (2): 95–122. Бибкод : 2010JFDis..33...95W . дои : 10.1111/j.1365-2761.2009.01110.x . ПМИД 20050967 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Эссбауэр, С; Ане, В. (2001). «Вирусы низших позвоночных» . Журнал ветеринарной медицины B, Инфекционные заболевания и ветеринарное здравоохранение . 48 (6): 403–475. дои : 10.1046/j.1439-0450.2001.00473.x . ПМЦ 7159363 . ПМИД 11550762 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Шэн, X; Син, Дж; Жан, Вт; Ван, Ю (2007). «Сравнительные исследования гистопатологических особенностей лимфоцистозной болезни у четырех видов морских рыб» . Журнал рыбных наук Китая (5).
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Кано, я; Ферро, П; Алонсо, MC; Бергманн, С.М.; Ромер-Обердорфер, А; Гарсия-Росадо, Э; Кастро, Д; Боррего, Джей-Джей (2006). «Разработка молекулярных методов обнаружения вируса лимфоцистоза у различных видов морских рыб». Журнал прикладной микробиологии . 102 (1): 32–40. дои : 10.1111/j.1365-2672.2006.03066.x . ПМИД 17184317 . S2CID 28026862 .
^ Хоссейн, М; Ким, СР; О, MJ (2007). «Лимфоцистозные заболевания камбалы оливковой Paralichthys olivaceous » . Университетский журнал зоологии, Университет Раджшахи . 26 : 59–62. дои : 10.3329/ujzru.v26i0.700 .
^ «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 22 мая 2021 г.
^ Тидона, Калифорния; Дарай, Дж. (1997). «Полная последовательность ДНК LCDV» . Вирусология . 230 (2): 207–216. дои : 10.1006/виро.1997.8456 . ПМИД 9143276 .
^ ванРегенмортель, MHV; Фоке, СМ; Бишоп, DHL; Карстенс, Э.Б.; Эстес, МК; Лимон, СМ; Манилофф, Дж; Мэйо, Массачусетс; МакГеоч, диджей; Прингл, Чехия; Викнер, РБ (2000). « Таксономия вирусов, седьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов ». Журнал болезней рыб .
^ Итон HE, Ring BA, Brunetti CR (2010). «Геномное разнообразие и филогенетические взаимоотношения в семействе Iridoviridae ». Вирусы. 2:1458-1475. http://www.mdpi.com/1999-4915/2/7/1458/pdf
^ Jump up to: ^а ^б ^с Гурха, Р. (1982). «Репликация ДНК вируса лягушки 3 происходит в две стадии» . Журнал вирусологии . 43 (2): 519–28. doi : 10.1128/JVI.43.2.519-528.1982 . ПМК 256155 . ПМИД 7109033 .
^ Чинчар В.Г., Эссбауэр С., Хе Дж.Г., Хаятт А., Миядзаки Т., Селиги В., Уильямс Т. (2005). «Семейство Iridoviridae 145-162. В Fauquet CM, Mayo MA, Maniloff J, Desselburger U, Ball LA (ред.). Таксономия вирусов, Восьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Academic Press, Сан-Диего, США.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Эссбауэр, С; Фишер, Ю; Бергманн, С; Ане, В. (2004). «Исследование ORF 167L вируса лимфоцистисной болезни ( Iridoviridae )» . Гены вирусов . 28 (1): 19–39. дои : 10.1023/B:VIRU.0000012261.96217.fe . ПМИД 14739649 . S2CID 1148390 .
^ Харикришнан, Р; Ким, MC; Ким, Дж.С.; Баласундарам, К; Хео, М.С. (2010). «Усиление иммунитета химиотерапевтических средств в отношении вируса лимфоцистной болезни (LDV), инфицированного Paralichthys olivaceous». Иммунология рыб и моллюсков . 29 (5): 862–867. Бибкод : 2010FSI....29..862H . дои : 10.1016/j.fsi.2010.07.032 . ПМИД 20688171 .
^ Самалекос, КП (1986). «Анализ структуры вирионов лимфоцистной болезни рыб из опухолей кожи плевронектов». Архив вирусологии . 91 (1–2): 1–10. дои : 10.1007/bf01316723 . ПМИД 3753198 . S2CID 13431588 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Гарсия-Росадо, Э; Кастро, Д; Кано, я; Перес-Прието, СИ; Боррего, Джей-Джей; Боррего, Джей Джей (2002). «Серологические методы обнаружения вируса лимфоцистис у рыб». Водные живые ресурсы . 15 (3): 179–185. Бибкод : 2002AqLR...15..179G . дои : 10.1016/s0990-7440(02)01174-9 . S2CID 85840246 .
^ Кано, я; Алонсо, MC; Гарсия-Росадо, Э; Родригес Сен-Жан, С; Кастро, Д; Боррего, Джей-Джей (2006). «Обнаружение вируса лимфоцистной болезни (LCDV) у бессимптомного культивированного дорады ( Spartus aurata , L) с использованием метода иммуноблоттинга». Ветеринарная микробиология . 113 (1–2): 137–141. дои : 10.1016/j.vetmic.2005.10.024 . ПМИД 16298500 .

Внешние ссылки

ICTV Online (10th) Report : Iridoviridae

[ICTVReport-1] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и "Iridoviridae" . ICTV Online (10th) Report .

[ViralZone-2] Jump up to: ^а ^б ^с «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.

[Whittington-3] Уиттингтон, Р.Дж.; Беккер, Дж.А.; Деннис, ММ (2010). «Иридовирусные инфекции у рыб - критический обзор с упором на ранавирусы». Журнал болезней рыб . 33 (2): 95–122. Бибкод : 2010JFDis..33...95W . дои : 10.1111/j.1365-2761.2009.01110.x . ПМИД 20050967 .

[Essbauer-4] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Эссбауэр, С; Ане, В. (2001). «Вирусы низших позвоночных» . Журнал ветеринарной медицины B, Инфекционные заболевания и ветеринарное здравоохранение . 48 (6): 403–475. дои : 10.1046/j.1439-0450.2001.00473.x . ПМЦ 7159363 . ПМИД 11550762 .

[Sheng-5] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Шэн, X; Син, Дж; Жан, Вт; Ван, Ю (2007). «Сравнительные исследования гистопатологических особенностей лимфоцистозной болезни у четырех видов морских рыб» . Журнал рыбных наук Китая (5).

[Cano-6] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Кано, я; Ферро, П; Алонсо, MC; Бергманн, С.М.; Ромер-Обердорфер, А; Гарсия-Росадо, Э; Кастро, Д; Боррего, Джей-Джей (2006). «Разработка молекулярных методов обнаружения вируса лимфоцистоза у различных видов морских рыб». Журнал прикладной микробиологии . 102 (1): 32–40. дои : 10.1111/j.1365-2672.2006.03066.x . ПМИД 17184317 . S2CID 28026862 .

[Hossain-7] Хоссейн, М; Ким, СР; О, MJ (2007). «Лимфоцистозные заболевания камбалы оливковой Paralichthys olivaceous » . Университетский журнал зоологии, Университет Раджшахи . 26 : 59–62. дои : 10.3329/ujzru.v26i0.700 .

[8] «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 22 мая 2021 г.

[Tidona-9] Тидона, Калифорния; Дарай, Дж. (1997). «Полная последовательность ДНК LCDV» . Вирусология . 230 (2): 207–216. дои : 10.1006/виро.1997.8456 . ПМИД 9143276 .

[vanRegenmortel-10] ванРегенмортель, MHV; Фоке, СМ; Бишоп, DHL; Карстенс, Э.Б.; Эстес, МК; Лимон, СМ; Манилофф, Дж; Мэйо, Массачусетс; МакГеоч, диджей; Прингл, Чехия; Викнер, РБ (2000). « Таксономия вирусов, седьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов ». Журнал болезней рыб .

[11] Итон HE, Ring BA, Brunetti CR (2010). «Геномное разнообразие и филогенетические взаимоотношения в семействе Iridoviridae ». Вирусы. 2:1458-1475. http://www.mdpi.com/1999-4915/2/7/1458/pdf

[Goorha-12] Jump up to: ^а ^б ^с Гурха, Р. (1982). «Репликация ДНК вируса лягушки 3 происходит в две стадии» . Журнал вирусологии . 43 (2): 519–28. doi : 10.1128/JVI.43.2.519-528.1982 . ПМК 256155 . ПМИД 7109033 .

[Chinchar-13] Чинчар В.Г., Эссбауэр С., Хе Дж.Г., Хаятт А., Миядзаки Т., Селиги В., Уильямс Т. (2005). «Семейство Iridoviridae 145-162. В Fauquet CM, Mayo MA, Maniloff J, Desselburger U, Ball LA (ред.). Таксономия вирусов, Восьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Academic Press, Сан-Диего, США.

[Essbauer2-14] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Эссбауэр, С; Фишер, Ю; Бергманн, С; Ане, В. (2004). «Исследование ORF 167L вируса лимфоцистисной болезни ( Iridoviridae )» . Гены вирусов . 28 (1): 19–39. дои : 10.1023/B:VIRU.0000012261.96217.fe . ПМИД 14739649 . S2CID 1148390 .

[Harikrishnan-15] Харикришнан, Р; Ким, MC; Ким, Дж.С.; Баласундарам, К; Хео, М.С. (2010). «Усиление иммунитета химиотерапевтических средств в отношении вируса лимфоцистной болезни (LDV), инфицированного Paralichthys olivaceous». Иммунология рыб и моллюсков . 29 (5): 862–867. Бибкод : 2010FSI....29..862H . дои : 10.1016/j.fsi.2010.07.032 . ПМИД 20688171 .

[Samalecos-16] Самалекос, КП (1986). «Анализ структуры вирионов лимфоцистной болезни рыб из опухолей кожи плевронектов». Архив вирусологии . 91 (1–2): 1–10. дои : 10.1007/bf01316723 . ПМИД 3753198 . S2CID 13431588 .

[Garcia-Rosado-17] Jump up to: ^а ^б ^с Гарсия-Росадо, Э; Кастро, Д; Кано, я; Перес-Прието, СИ; Боррего, Джей-Джей; Боррего, Джей Джей (2002). «Серологические методы обнаружения вируса лимфоцистис у рыб». Водные живые ресурсы . 15 (3): 179–185. Бибкод : 2002AqLR...15..179G . дои : 10.1016/s0990-7440(02)01174-9 . S2CID 85840246 .

[Cano2-18] Кано, я; Алонсо, MC; Гарсия-Росадо, Э; Родригес Сен-Жан, С; Кастро, Д; Боррего, Джей-Джей (2006). «Обнаружение вируса лимфоцистной болезни (LCDV) у бессимптомного культивированного дорады ( Spartus aurata , L) с использованием метода иммуноблоттинга». Ветеринарная микробиология . 113 (1–2): 137–141. дои : 10.1016/j.vetmic.2005.10.024 . ПМИД 16298500 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]