Пентатропептидный повтор
| Пентатропептидный повтор | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | Ппр | ||
| Pfam | PF01535 | ||
| PFAM клан | CL0020 | ||
| InterPro | IPR002885 | ||
| PROSITE | PS51375 | ||
| |||
Пентатропептидный повтор (PPR) представляет собой 35- аминокислотный мотив последовательности . Белки, содержащие пентатропептид-повторные, являются семейством белков, обычно встречающихся в королевстве растений . Они отличаются наличием тандемных мотивов PPR [ 1 ] и из -за относительного отсутствия интронов в генах, кодирующих их. [ 2 ]
Приблизительно 450 таких белков были идентифицированы в геноме Arabidopsis , а еще 477 в геноме риса . [ 3 ] Несмотря на большой размер семейства белков, генетические данные свидетельствуют о том, что между белками PPR у Arabidopsis существует мало или нет избыточности функции . [ 2 ]
Цель белков PPR в настоящее время оспаривается. Было показано, что много тех, кто в арабидопсисе взаимодействует (часто по существу) с митохондриями и другими органеллами [ 2 ] и что они, возможно, участвуют в редактировании РНК . [ 4 ] Однако для этого редактирования требуется много транс -белков, и исследования продолжают изучать, какие белки необходимы. [ 5 ]
Структура PPR была решена. Он складывается в структуру спирали-поворота, аналогичную те, которая обнаружена в тетратропептидном повторении. Несколько повторов белка образуют кольцо вокруг одноцепочечной молекулы РНК в последовательности, напоминающем эффекторы TAL . [ 6 ]
Примеры
[ редактировать ]Человеческие гены, кодирующие белки, содержащие этот повтор, включают:
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Mingler MK, Hingst AM, Clement SL, Yu Le, Reifur L, Koslowsky DJ (ноябрь 2006 г.). «Идентификация пентатропептидных повторных белков у трипаносомы Brucei». Мол Биохимия. Паразитол . 150 (1): 37–45. doi : 10.1016/j.molbiopara.2006.06.006 . PMID 16837079 .
- ^ Jump up to: а беременный в Lurin C, Andrés C, Aubourg S, Bellaoui M, Bitton F, Bruyère C, Caboche M, Debast C, Gualberto J, Hoffmann B, Lecharnny A, Le Ret M, Martin-Magneiette ML, Mireau H, Peeters N, Renou Jp , Szurek B, Taconnat L, Small I (август 2004 г.). «Анализ по всему геному белков с пентатропептидом арабидопсиса выявляет их важную роль в органах биогенеза» . Растительная ячейка . 16 (8): 2089–103. Doi : 10.1105/tpc.104.022236 . PMC 519200 . PMID 15269332 .
- ^ O'toole N, Hattori M, Andres C, Iida K, Lurin C, Schmitz-Linneweber C, Sugita M, Small I (июнь 2008 г.). «Об расширении пентатропептидного семейства генов у растений» . Мол Биол. Эвол . 25 (6): 1120–8. doi : 10.1093/molbev/msn057 . PMID 18343892 .
- ^ Котера Е., Тасака М., Шиканай Т (январь 2005 г.). «Пентатропептидный повторный белок необходим для редактирования РНК в хлоропластах». Природа . 433 (7023): 326–30. Bibcode : 2005natur.433..326K . doi : 10.1038/nature03229 . PMID 15662426 . S2CID 4416316 .
- ^ Возьмите М, Вербитский Д., Зерманн А., Бреннике А (июнь 2010 г.). «Обратный генетический скрининг идентифицирует пять PPR-протеинов E-класса включал в себя редактирование в митохондриях Arabidopsis thaliana » J Biol Chem 285 (35): 27122–2 Doi : 10.1074/jbc.m110.128611 . PMC 2930711 PMID 20566637
- ^ Инь П., Ли К, Ян С., Лю Ю., Лю Дж, Ю. Ф. и др. (Декабрь 2013). «Структурная основа модульного распознавания одноцепочечной РНК белками PPR». Природа . 504 (7478): 168–71. Bibcode : 2013natur.504..168y . doi : 10.1038/nature12651 . PMID 24162847 . S2CID 4471801 .
 | Эта молекулярной биологии статья является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |