Jump to content

Тетратрикопептидный повтор

(Перенаправлено с Тетратрикопептид )
Тетратрикопептидный повтор
Идентификаторы
Символ ТПР_1
Пфам PF00515
Пфам Клан CL0020
ИнтерПро ИПР001440
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 1а17 / СКОПе / СУПФАМ
CDD cd00189
Доступные белковые структуры:
Pfam  structures / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary
PDB1w3bB:89-122 1fchA:522-555 2fbnB:228-261

1p5qB:276-295 1qz2C:276-295 1ihgA:223-256 1iipA:223-256 1elwB:4-37 1wao2:28-61 1a17 :28-61 1elrA:225-258 2c2lC:27-60 1uzsA:114-147 1e96B:71-104 1hh8A:71-104

1wm5A:71-104 1kt0A:351-384 1kt1A:351-384

Тетратрикопептидный повтор ( TPR ) является структурным мотивом . Он состоит из вырожденного из 34 аминокислот, тандемного повтора обнаруженного в самых разных белках . Встречается в тандемных массивах из 3–16 мотивов. [ 1 ] которые образуют каркасы для обеспечения белок-белковых взаимодействий и часто сборки мультибелковых комплексов. Эти альфа-спиралей повторы пары обычно складываются вместе, образуя один линейный соленоидный домен , называемый доменом TPR . Белки с такими доменами включают способствующего анафазе (APC) субъединицы cdc16 , cdc23 и cdc27 комплекса , НАДФН-оксидазы , субъединицу p67-phox , hsp90-связывающие иммунофилины , факторы транскрипции , протеинкиназу R (PKR), основной рецептор пероксисомального матрикса. импорт белка PEX5 , белок аргининметилтрансфераза 9 (PRMT9) и белки импорта митохондрий.

Изображение повтора TPR. Изображение получено с помощью King Software. Идентификатор PDB: 1NA0.

Структура

[ редактировать ]

Структура белка PP5 была первой, которую удалось определить. Структура, раскрытая Дасом и его коллегами с помощью рентгеновской кристаллографии, показала, что мотив последовательности TPR состоит из пары антипараллельных альфа-спиралей. [ 2 ] Структура PP5 содержала 3 тандемных повтора TPR, что показало, что последовательные повторы TPR образуют альфа-спиральную соленоидную структуру.

Типичная структура TPR характеризуется взаимодействием между спиралями A и B первого мотива и спиралью A' следующего TPR. Хотя природа таких взаимодействий может различаться, первые две спирали мотива TPR обычно имеют угол упаковки ~24 градуса в пределах одного мотива. Повторы более чем трех мотивов TPR образуют правостороннюю суперспираль, характеризующуюся как вогнутой, так и выпуклой стороной, из которых вогнутая сторона обычно участвует в связывании лиганда. [ 1 ] [ 3 ]

На этом изображении показаны остатки сигнатур, обычно встречающиеся в мотивах TPR. Изображение было визуализировано с использованием программного обеспечения KING, начиная с PDB 1NA3.

С точки зрения последовательности TPR содержит смесь малых и больших гидрофобных остатков, тем не менее, ни одно из положений не является полностью инвариантным. Однако есть определенные остатки, которые обычно консервативны, включая триптофан 4, лейцин 7, глицин 8, тирозин 11, аланин 20, фенилаланин 24, аланин 27 и пролин 32. Среди этих 8 аланина в положениях 8, 20 и 27, как правило, больше. сохранено. Другие позиции имеют более сильное предпочтение либо к малым, либо к большим, либо к ароматическим аминокислотам, чем к конкретному остатку. Между спиралями сохранение остатков играет более структурную роль, поскольку присутствуют остатки разрыва спирали. Между соседними TPR остатки играют роль как структурного, так и функционального значения. [ 1 ]

TPR-содержащие пептиды

[ редактировать ]

Адаптерный белок Hop опосредует ассоциацию молекулярных шаперонов Hsp70 и Hsp90. Он содержит три повтора 3-TPR, каждый со своей специфичностью связывания пептидов. Известно, что его домен TPR1 распознает C-конец Hsp70, тогда как TPR2 связывается с C-концом Hsp90. Обе С-концевые последовательности заканчиваются мотивом EEVD, а характер взаимодействия является как электростатическим, так и гидрофобным. [ 1 ] [ 4 ]

Белок PEX5 является рецептором PTS1 (пероксисомальный сигнальный трипептид, который направляет белки в пероксисомы). Он взаимодействует с сигналом через мотивы TPR. Большая часть его контактов с С-концевым трипептидом PTS1 находится на вогнутой поверхности TPR 1, 2 и 3. [ 5 ]

Цитозольный фактор нейтрофилов 2

[ редактировать ]

Цитозольный фактор 2 нейтрофилов необходим для комплекса НАДФН-оксидазы, который, в свою очередь, производит супероксиды в ответ на микробную инфекцию. Связывание Rac GTPase является ключевым этапом сборки комплекса, а TPR в единице phox опосредуют сборку мультибелкового комплекса, действуя как каркас связывания. [ 6 ]

Гены человека, кодирующие белки, содержащие этот мотив, включают:

  1. ^ Перейти обратно: а б с д Блатч Г.Л., Лессле М. (ноябрь 1999 г.). «Повтор тетратрикопептида: структурный мотив, опосредующий белок-белковые взаимодействия». Биоэссе . 21 (11): 932–9. doi : 10.1002/(SICI)1521-1878(199911)21:11<932::AID-BIES5>3.0.CO;2-N . ПМИД   10517866 .
  2. ^ Дас А.К., Коэн П.В., Барфорд Д. (март 1998 г.). «Структура тетратрикопептидных повторов протеинфосфатазы 5: значение для TPR-опосредованных белок-белковых взаимодействий» . Журнал ЭМБО . 17 (5): 1192–9. дои : 10.1093/emboj/17.5.1192 . ПМЦ   1170467 . ПМИД   9482716 .
  3. ^ Уилсон К.Г., Каджандер Т., Риган Л. (январь 2005 г.). «Кристаллическая структура NlpI. Прокариотический тетратрикопептидный повторяющийся белок с глобулярной складкой» . Журнал ФЭБС . 272 (1): 166–79. дои : 10.1111/j.1432-1033.2004.04397.x . ПМИД   15634341 .
  4. ^ Шойфлер К., Бринкер А., Буренков Г., Пегораро С., Мородер Л., Бартуник Х., Хартл Ф.У., Моарефи I (апрель 2000 г.). «Структура комплексов домен-пептид TPR: критические элементы сборки мультишаперонной машины Hsp70-Hsp90» . Клетка . 101 (2): 199–210. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80830-2 . ПМИД   10786835 . S2CID   18200460 .
  5. ^ Гатто Г.Дж., Гейсбрехт Б.В., Гулд С.Дж., Берг Дж.М. (декабрь 2000 г.). «Распознавание сигнала-1 пероксисомального нацеливания доменами TPR человеческого PEX5». Структурная биология природы . 7 (12): 1091–5. дои : 10.1038/81930 . ПМИД   11101887 . S2CID   35168630 .
  6. ^ Лапуж К., Смит С.Дж., Уокер П.А., Гамблин С.Дж., Смердон С.Дж., Риттингер К. (октябрь 2000 г.). «Структура TPR-домена p67phox в комплексе с Rac.GTP» . Молекулярная клетка . 6 (4): 899–907. дои : 10.1016/S1097-2765(05)00091-2 . ПМИД   11090627 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 8ef90b292612ac8ae244d60dc265ce4c__1717071180
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/8e/4c/8ef90b292612ac8ae244d60dc265ce4c.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Tetratricopeptide repeat - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)