UTX (ген)

КДМ6А
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3AVR, 3AVS
Идентификаторы
Псевдонимы	KDM6A , KABUK2, UTX, bA386N14.2, лизиндеметилаза 6А
Внешние идентификаторы	Опустить : 300128 ; МГИ : 1095419 ; Гомологен : 7586 ; Генные карты : KDM6A ; ОМА : КДМ6А - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	45,112,779 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	X chromosome (mouse)
End	18,146,175 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; bone marrow cells; ; left ovary; ; monocyte; ; skin of abdomen; ; germinal epithelium; ; ectocervix; ; vagina; ; epithelium of colon; ; skin of leg;
	Top expressed in
	zygote; ; secondary oocyte; ; genital tubercle; ; primary oocyte; ; internal carotid artery; ; tail of embryo; ; lacrimal gland; ; Rostral migratory stream; ; maxillary prominence; ; external carotid artery;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	dioxygenase activity; metal ion binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; identical protein binding; oxidoreductase activity; chromatin DNA binding; histone H3-tri/di-methyl-lysine-27 demethylase activity; histone demethylase activity; chromatin binding; sequence-specific DNA binding;
Cellular component	nucleoplasm; MLL3/4 complex; histone methyltransferase complex; nucleus;
Biological process	respiratory system process; histone H3-K27 demethylation; multicellular organism growth; embryonic organ development; somite rostral/caudal axis specification; heart morphogenesis; in utero embryonic development; heart development; histone H3-K4 methylation; neural tube closure; positive regulation of gene expression; notochord morphogenesis; neural tube development; mesodermal cell differentiation; canonical Wnt signaling pathway; regulation of gene expression; chromatin remodeling; chromatin organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7403
	22289
	ENSG00000147050
	ENSMUSG00000037369
	О15550
	О70546
showНМ_001291415 ; НМ_001291416 ; НМ_001291417 ; НМ_001291418 ; НМ_001291421 ;
	NM_021140
	НМ_009483 ; НМ_001310444
showНП_001278344 ; НП_001278345 ; НП_001278346 ; НП_001278347 ; НП_001278350 ;
	NP_066963
showНП_001297373 ; НП_033509 ; НП_001390300 ; НП_001390301 ; НП_001390302 ;
	NP_001390303; NP_001390304; NP_001390305; NP_001390306; NP_001390307; NP_001390308; NP_001390309; NP_001390310
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Лизин-специфическая деметилаза 6А, также известная как повсеместно транскрибируемый тетратрикопептидный повтор, Х-хромосома ( UTX ), представляет собой белок , который у человека кодируется KDM6A геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Он принадлежит к суперсемейству 2-оксоглутарат (2OG)-зависимых диоксигеназ .

Функция

UTX связан с деметилированием остатков лизина на гистоне , в частности H3K27, что приводит к дерепрессии гена, потенциальному средству регуляции клеточного метаболизма. ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000147050 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037369 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтреза: лизиндеметилаза 6А KDM6A» .
^ Лан Б.Т., Пейдж, округ Колумбия (октябрь 1997 г.). «Функциональная когерентность Y-хромосомы человека». Наука . 278 (5338): 675–80. Бибкод : 1997Sci...278..675L . дои : 10.1126/science.278.5338.675 . ПМИД 9381176 .
^ Гринфилд А., Каррел Л., Пенниси Д., Филипп С., Квадери Н., Сиггерс П., Штайнер К., Тэм П.П., Монако А.П., Уиллард Х.Ф., Купман П. (апрель 1998 г.). «Ген UTX избегает инактивации X у мышей и людей» . Хм. Мол. Жене . 7 (4): 737–42. дои : 10.1093/hmg/7.4.737 . ПМИД 9499428 .
^ Ли М.Г., Вилла Р., Тройер П., Норман Дж., Ян К.П., Рейнберг Д., Дикроче Л., Шихаттар Р. (октябрь 2007 г.). «Деметилирование H3K27 регулирует рекрутирование полисот и убиквитинирование H2A» . Наука 318 (5849): 447–50. Бибкод : 2007Sci...318..447L . дои : 10.1126/science.1149042 . ПМИД 17761849 . S2CID 23883131 .

Дальнейшее чтение

Лан Б.Т., Пейдж, округ Колумбия (1997). «Функциональная когерентность Y-хромосомы человека». Наука . 278 (5338): 675–80. Бибкод : 1997Sci...278..675L . дои : 10.1126/science.278.5338.675 . ПМИД 9381176 .
Гринфилд А., Каррел Л., Пенниси Д. и др. (1998). «Ген UTX избегает инактивации X у мышей и людей» . Хм. Мол. Жене . 7 (4): 737–42. дои : 10.1093/hmg/7.4.737 . ПМИД 9499428 .
Грбавец Д., Ло Р., Лю Ю. и др. (1999). «Члены семейства Groucho/transducin-like Enhancer of Split (TLE) взаимодействуют с ко-репрессором транскрипции дрожжей SSN6 и белками, родственными SSN6 млекопитающих: значение для эволюционной консервации механизмов репрессии транскрипции» . Биохим. Дж . 337 (Часть 1) (Часть 1): 13–7. дои : 10.1042/0264-6021:3370013 . ПМЦ 1219929 . ПМИД 9854018 .
Фореста С., Ферлин А., Моро Э. (2000). «Анализ делеции и экспрессии генов AZFa на Y-хромосоме человека выявил важную роль DBY в мужском бесплодии». Хм. Мол. Жене . 9 (8): 1161–9. дои : 10.1093/hmg/9.8.1161 . PMID 10767340 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Агат Р.Дж., Чой М., Арнольд А.П. (2004). «Половые различия в структуре и экспрессии генов половых хромосом CHD1Z и CHD1W у зебровых амадин» . Мол. Биол. Эвол . 21 (2): 384–96. дои : 10.1093/molbev/msh027 . ПМИД 14660691 .
Колланд Ф., Жак Икс, Труплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека» . Геном Рез . 14 (7): 1324–32. дои : 10.1101/гр.2334104 . ПМК 442148 . ПМИД 15231748 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А. и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши» . Мол. Клетка. Протеомика . 3 (11): 1093–101. дои : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . ПМИД 15345747 .
Джеррард Д.Т., Филатов Д.А. (2005). «Положительный и отрицательный отбор на Y-хромосомах млекопитающих» . Мол. Биол. Эвол . 22 (6): 1423–32. дои : 10.1093/molbev/msi128 . ПМИД 15758204 .
Чо Ю.В., Хонг Т., Хонг С. и др. (2007). «PTIP связывается с MLL3- и MLL4-содержащим комплексом гистона H3 лизин-4-метилтрансферазы» . Ж. Биол. Хим . 282 (28): 20395–406. дои : 10.1074/jbc.M701574200 . ПМЦ 2729684 . ПМИД 17500065 .
Аггер К., Клоос П.А., Кристенсен Дж. и др. (2007). «UTX и JMJD3 представляют собой деметилазы гистонов H3K27, участвующие в регуляции и развитии гена HOX». Природа . 449 (7163): 731–4. Бибкод : 2007Natur.449..731A . дои : 10.1038/nature06145 . ПМИД 17713478 . S2CID 4413812 .
Ли М.Г., Вилла Р., Тройер П. и др. (2007). «Деметилирование H3K27 регулирует рекрутирование полисот и убиквитинирование H2A» . Наука . 318 (5849): 447–50. Бибкод : 2007Sci...318..447L . дои : 10.1126/science.1149042 . ПМИД 17761849 . S2CID 23883131 .
Лан Ф., Бейлисс П.Е., Ринн Дж.Л. и др. (2007). «Деметилаза лизина 27 гистона H3 регулирует заднее развитие животных». Природа . 449 (7163): 689–94. Бибкод : 2007Natur.449..689L . дои : 10.1038/nature06192 . ПМИД 17851529 . S2CID 612144 .
Хонг С., Чо Ю.В., Ю Л.Р. и др. (2008). «Идентификация домена JmjC, содержащего UTX и JMJD3, как деметилазы лизина 27 гистона H3» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 104 (47): 18439–44. Бибкод : 2007PNAS..10418439H . дои : 10.1073/pnas.0707292104 . ПМК 2141795 . ПМИД 18003914 .

Эта статья о гене человека Х-хромосомы и/или связанном с белке незавершена . ним Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000147050 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037369 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Энтреза: лизиндеметилаза 6А KDM6A» .

[pmid9381176-6] Лан Б.Т., Пейдж, округ Колумбия (октябрь 1997 г.). «Функциональная когерентность Y-хромосомы человека». Наука . 278 (5338): 675–80. Бибкод : 1997Sci...278..675L . дои : 10.1126/science.278.5338.675 . ПМИД 9381176 .

[pmid9499428-7] Гринфилд А., Каррел Л., Пенниси Д., Филипп С., Квадери Н., Сиггерс П., Штайнер К., Тэм П.П., Монако А.П., Уиллард Х.Ф., Купман П. (апрель 1998 г.). «Ген UTX избегает инактивации X у мышей и людей» . Хм. Мол. Жене . 7 (4): 737–42. дои : 10.1093/hmg/7.4.737 . ПМИД 9499428 .

[pmid17761849-8] Ли М.Г., Вилла Р., Тройер П., Норман Дж., Ян К.П., Рейнберг Д., Дикроче Л., Шихаттар Р. (октябрь 2007 г.). «Деметилирование H3K27 регулирует рекрутирование полисот и убиквитинирование H2A» . Наука 318 (5849): 447–50. Бибкод : 2007Sci...318..447L . дои : 10.1126/science.1149042 . ПМИД 17761849 . S2CID 23883131 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

v т и Оксидоредуктазы : диоксигеназы , включая стероидные гидроксилазы ( EC 1.14)
1.14.11 : 2-оксоглутарат	Пролилгидроксилаза HIF-пролилгидроксилаза ЭГЛН1 ЭГЛН2 ЭГЛН3 P4HTM Лизилгидроксилаза АлкБ АЛКБХ1 ФТО
1.14.13 : НАДН или НАДФН.	Флавинсодержащая монооксигеназа ФМО1 ФМО2 ФМО3 ФМО4 ФМО5 Синтаза оксида азота НОС1 НОС2 НОС3 Холестерин 7 альфа-гидроксилаза Метанмонооксигеназа 3А4 14α-деметилаза 24-гидроксихолестерин-7α-гидроксилаза
1.14.14 : восстановленный флавин или флавопротеин	19А1 2D6 2Е1
1.14.15 : восстановленный железосерный белок	11Б1 11Б2 11А1
1.14.16 : восстановленный птеридин ( зависит от BH4 )	Фенилаланингидроксилаза Тирозингидроксилаза Триптофангидроксилаза
1.14.17 : восстановленный аскорбат	Дофамин-бета-гидроксилаза
1.14.18-19: other	Tyrosinase Stearoyl-CoA desaturase-1
1.14.99 - miscellaneous	Cyclooxygenase Heme oxygenase (HMOX1) Squalene monooxygenase 17A1 21A2 Ecdysone 20-monooxygenase Deoxyhypusine monooxygenase

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)