РАНБП2

РАНБП2
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 1RRP, 1XKE, 1Z5S, 3UIN, 3UIO, 3UIP, 4I9Y, 4L6E, 4LQW, 5CLL, 5CLQ, 2LAS
Идентификаторы
Псевдонимы	RANBP2 , ADANE, ANE1, IIAE3, NUP358, TRP1, TRP2, RAN-связывающий белок 2
Внешние идентификаторы	Опустить : 601181 ; МГИ : 894323 ; Гомологен : 136803 ; GeneCards : RANBP2 ; OMA : RANBP2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 2 (human) Band 2q13 Start 108,719,482 bp End 108,785,809 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 10 (mouse) Band 10 B4|10 29.34 cM Start 58,282,742 bp End 58,330,178 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in endothelial cell sperm mucosa of paranasal sinus Skeletal muscle tissue of rectus abdominis epithelium of nasopharynx tibia visceral pleura superficial temporal artery seminal vesicula germinal epithelium Top expressed in human fetus Gonadal ridge lobe of cerebellum lacrimal gland cerebellar vermis spermatocyte spermatid left lung lobe primitive streak pineal gland More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity metal ion binding ligase activity protein binding RNA binding SUMO transferase activity GTPase activator activity protein-containing complex binding cyclosporin A binding transferase activity Cellular component cytosol nuclear membrane membrane nuclear pore nuclear inclusion body nuclear pore nuclear basket nucleus nuclear envelope lamellae anulatae intracellular membrane-bounded organelle cytoplasm centrosome mitochondrion nuclear pore cytoplasmic filaments cytoplasmic periphery of the nuclear pore complex host cell Biological process mRNA transport viral transcription intracellular transport protein sumoylation protein peptidyl-prolyl isomerization mitotic nuclear membrane disassembly protein folding regulation of cellular response to heat protein transport viral process NLS-bearing protein import into nucleus intracellular transport of virus mRNA export from nucleus tRNA export from nucleus sister chromatid cohesion centrosome localization G1 phase RNA export from nucleus ubiquitin-dependent protein catabolic process spindle organization positive regulation of GTPase activity positive regulation of mitotic centrosome separation response to amphetamine positive regulation of glucokinase activity regulation of gene silencing by miRNA regulation of glycolytic process transport regulation of gluconeogenesis Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 5903 19386 Вместе ENSG00000153201 ENSMUSG00000003226 ЮниПрот P49792 Q9ERU9 RefSeq (мРНК) НМ_006267 НМ_011240 RefSeq (белок) НП_006258 НП_035370 Местоположение (UCSC) Chr 2: 108,72 – 108,79 Мб Чр 10: 58,28 – 58,33 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

RAN-связывающий белок 2 ( RANBP2 ) – это белок , который у человека кодируется RANBP2 геном . Он также известен как нуклеопорин 358 ( Nup358 ), поскольку он является членом семейства нуклеопоринов, составляющих комплекс ядерных пор. RanBP2 имеет массу 358 кДа.

Функция

RAN — небольшой GTP-связывающий белок суперсемейства RAS . Ran GTPase представляет собой главный регуляторный переключатель, который, помимо других функций, контролирует перемещение белков между ядерным и цитоплазматическим отсеками клетки. Ran GTPase контролирует множество клеточных функций посредством взаимодействия с другими белками. Ген RanBP2 кодирует очень большой RAN-связывающий белок, который локализуется в цитоплазматических нитях, исходящих из комплекса ядерных пор . RanBP2/Nup358 представляет собой гигантский каркас и мозаичный циклофилин -родственный нуклеопорин, участвующий в контроле селективных процессов цикла Ran-GTPase . RanBP2 состоит из нескольких доменов. Каждый домен RanBP2 избирательно и напрямую взаимодействует с отдельными белками, такими как Ran GTPase, импортин -бета, экспортин -1/ CRM1 , красный опсин , субъединицы протеасомы , cox11 и изоформы кинезина-1 , KIF5B и KIF5C . Другим партнером RanBP2 является фермент E2 UBC9 . RanBP2 сильно усиливает передачу SUMO1 от UBC9 к целевой SUMO1 SP100 . Еще одной целью SUMOylation является RanGAP , который является белком, активирующим ГТФазу для Ran. SUMO-RanGAP взаимодействует с доменом вблизи карбоксильного конца RanBP2. Эти находки указывают на сумойлирование цитоплазматических филаментов комплекса ядерных пор и указывают на то, что для некоторых субстратов модификация и ядерный импорт являются связанными событиями. Плейотропная (многофункциональная) роль RanBP2 отражает его взаимодействие с множеством партнеров, каждый из которых выполняет различные клеточные или молекулярные функции. Этот ген частично дублирован в кластере генов, который находится в горячей точке рекомбинации на хромосоме 2q человека.

Клиническое значение

Недостаточность RanBP2 напрямую связана с канцерогенезом , анеуплоидией и нейропротекцией фоторецепторных нейронов к световому стрессу и старению. Миссенс-мутации человека в RanBP2 были идентифицированы в его богатом лейцином домене и вызывают аутосомно-доминантную некротизирующую энцефалопатию (ADNE).

Взаимодействия

Было показано, что RANBP2 взаимодействует с KPNB1. и УБЭ2И .

Дальнейшее чтение

• Муравала П., Трипати М.М., Вьяс П., Салунке А., Джозеф Дж. (сентябрь 2009 г.). «Nup358 взаимодействует с APC и играет роль в поляризации клеток». Журнал клеточной науки . 122 (Часть 17): 3113–22. дои : 10.1242/jcs.037523 . ПМИД   19654215 . S2CID   263518890 .
• Феррейра П.А., Хом Дж.Т., Пак В.Л. (сентябрь 1995 г.). «Новые подтипы бычьего циклофилина, специфично экспрессирующиеся в сетчатке» . Журнал биологической химии . 270 (39): 23179–88. дои : 10.1074/jbc.270.39.23179 . ПМИД   7559465 .
• Ёкояма Н., Хаяси Н., Секи Т., Панте Н., Охба Т., Нишии К., Кума К., Хаяшида Т., Мията Т., Аэби У (июль 1995 г.). «Гигантский белок нуклеопор, связывающий Ran/TC4». Природа . 376 (6536): 184–8. Бибкод : 1995Natur.376..184Y . дои : 10.1038/376184a0 . ПМИД   7603572 . S2CID   4304659 .
• Беддоу А.Л., Ричардс С.А., Орем Н.Р., Макара И.Г. (апрель 1995 г.). «Домен, связывающий GTPase Ran/TC4: идентификация путем экспрессионного клонирования и характеристика мотива консервативной последовательности» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (8): 3328–32. Бибкод : 1995PNAS...92.3328B . дои : 10.1073/pnas.92.8.3328 . ПМК   42159 . ПМИД   7724562 .
• Ву Дж., Матунис М.Дж., Кремер Д., Блобель Г., Кутавас Э. (июнь 1995 г.). «Nup358, нуклеопорин, экспонируемый в цитоплазме, с пептидными повторами, сайтами связывания Ran-GTP, цинковыми пальцами, доменом, гомологичным циклофилину А, и богатой лейцином областью» . Журнал биологической химии . 270 (23): 14209–13. дои : 10.1074/jbc.270.23.14209 . ПМИД   7775481 .
• Бишофф Ф.Р., Креббер Х., Смирнова Е, Донг В., Понстингл Х. (февраль 1995 г.). «Совместная активация RanGTPase и ингибирование диссоциации GTP с помощью Ran-GTP-связывающего белка RanBP1» . Журнал ЭМБО . 14 (4): 705–15. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07049.x . ПМЦ   398135 . ПМИД   7882974 .
• Феррейра П.А., Накаяма Т.А., Пак В.Л., Трэвис Г.Х. (октябрь 1996 г.). «Связанный с циклофилином белок RanBP2 действует как шаперон для красного/зеленого опсина». Природа . 383 (6601): 637–40. Бибкод : 1996Natur.383..637F . дои : 10.1038/383637a0 . ПМИД   8857542 . S2CID   4304490 .
• Махаджан Р., Дельфин С., Гуан Т., Джераче Л., Мельхиор Ф. (январь 1997 г.). «Небольшой родственный убиквитину полипептид, участвующий в нацеливании RanGAP1 на белок RanBP2 комплекса ядерных пор» . Клетка . 88 (1): 97–107. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81862-0 . ПМИД   9019411 . S2CID   17819277 .
• Феррейра П.А., Накаяма Т.А., Трэвис Г.Х. (февраль 1997 г.). «Взаимное преобразование изоформ красного опсина с помощью связанного с циклофилином белка-шаперона Ran-связывающего белка 2» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (4): 1556–61. Бибкод : 1997PNAS...94.1556F . дои : 10.1073/pnas.94.4.1556 . ЧВК   19830 . ПМИД   9037092 .
• Ясин Н.Р., Блобель Дж. (апрель 1997 г.). «Клонирование и характеристика кариоферина бета3 человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (9): 4451–6. Бибкод : 1997PNAS...94.4451Y . дои : 10.1073/pnas.94.9.4451 . ПМК   20743 . ПМИД   9114010 .
• Бонифачи Н., Морояну Дж., Раду А., Блобель Г. (май 1997 г.). «Кариоферин бета2 опосредует ядерный импорт белка, связывающего мРНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (10): 5055–60. Бибкод : 1997PNAS...94.5055B . дои : 10.1073/pnas.94.10.5055 . ПМК   24630 . ПМИД   9144189 .
• Креббер Х., Бастианс Х., Хохайзель Дж., Лихтер П., Понстингл Х., Йоос С. (июль 1997 г.). «Локализация гена, кодирующего Ran-связывающий белок RanBP2, на хромосоме человека 2q11-q13 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Геномика . 43 (2): 247–8. дои : 10.1006/geno.1997.4777 . ПМИД   9244446 .
• Дельфин С., Гуан Т., Мельхиор Ф., Джерас Л. (декабрь 1997 г.). «RanGTP нацеливает p97 на RanBP2, нитчатый белок, локализованный на цитоплазматической периферии комплекса ядерных пор» . Молекулярная биология клетки . 8 (12): 2379–90. дои : 10.1091/mbc.8.12.2379 . ПМК   25714 . ПМИД   9398662 .
• Нотванг Х.Г., Ренсинг С., Кюблер М., Денич Д., Брандл Б., Стубанус М., Хааф Т., Курнит Д., Хильдебрандт Ф. (февраль 1998 г.). «Идентификация нового гена, связанного с Ran-связывающим белком 2 (RANBP2L1), и обнаружение кластера генов на хромосоме человека 2q11-q12». Геномика . 47 (3): 383–92. дои : 10.1006/geno.1997.5119 . ПМИД   9480752 .
• Феррейра П.А., Юнфэй С., Шик Д., Ропман Р. (сентябрь 1998 г.). «Циклофилиноподобный домен опосредует ассоциацию Ran-связывающего белка 2 с субъединицами 19S регуляторного комплекса протеасомы» . Журнал биологической химии . 273 (38): 24676–82. дои : 10.1074/jbc.273.38.24676 . hdl : 2066/120835 . ПМИД   9733766 .
• Веттер И.Р., Новак С., Нисимото Т., Кульманн Дж., Виттингхофер А. (март 1999 г.). «Структура Ran-связывающего домена в комплексе с Ran, связанным с аналогом GTP: последствия для ядерного транспорта». Природа . 398 (6722): 39–46. Бибкод : 1999Natur.398...39V . дои : 10.1038/17969 . ПМИД   10078529 . S2CID   4319742 .
• Ясин Н.Р., Блобель Г. (май 1999 г.). «Два различных класса сайтов связывания Ran на нуклеопорине Nup-358» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (10): 5516–21. Бибкод : 1999PNAS...96.5516Y . дои : 10.1073/pnas.96.10.5516 . ПМК   21891 . ПМИД   10318915 .
• Ясин Н.Р., Блобель Дж. (сентябрь 1999 г.). «Гидролиз GTP связывает инициацию и прекращение ядерного импорта нуклеопорина nup358» . Журнал биологической химии . 274 (37): 26493–502. дои : 10.1074/jbc.274.37.26493 . ПМИД   10473610 .
• Сингх Б.Б., Патель Х.Х., Ропман Р., Шик Д., Феррейра П.А. (декабрь 1999 г.). «Домен кластера цинковых пальцев RanBP2 является специфическим местом стыковки для фактора ядерного экспорта, экспортина-1» . Журнал биологической химии . 274 (52): 37370–8. дои : 10.1074/jbc.274.52.37370 . hdl : 2066/120791 . ПМИД   10601307 .
• Бен-Эфраим I, Джерас Л. (январь 2001 г.). «Градиент возрастающего сродства импортина бета к нуклеопоринам на пути ядерного импорта» . Журнал клеточной биологии . 152 (2): 411–7. дои : 10.1083/jcb.152.2.411 . ПМК   2199621 . ПМИД   11266456 .
• Фаузер С., Аслануков А., Ропман Р., Феррейра П.А. (июнь 2001 г.). «Геномная организация, экспрессия и локализация гена мышиного Ran-связывающего белка 2 (RanBP2)». Геном млекопитающих . 12 (6): 406–15. дои : 10.1007/s003350010291 . ПМИД   11353387 . S2CID   9263393 .
• Мавлютов Т.А., Кай Ю, Феррейра П.А. (сентябрь 2002 г.). «Идентификация RanBP2- и кинезин-опосредованных транспортных путей с ограниченной нейрональной и субклеточной локализацией» . Трафик . 3 (9): 630–40. дои : 10.1034/j.1600-0854.2002.30905.x . ПМИД   12191015 . S2CID   26111676 .
• Аслануков А, Бхоумик Р, Гуруджу М, Освальд Дж, Раз Д, Буш Р.А., Севинг П.А., Лу Х, Бок С.Б., Феррейра П.А. (октябрь 2006 г.). «RanBP2 модулирует активность Cox11 и гексокиназы I, а гаплонедостаточность RanBP2 вызывает дефицит метаболизма глюкозы» . ПЛОС Генетика . 2 (10): е177. дои : 10.1371/journal.pgen.0020177 . ПМК   1626108 . ПМИД   17069463 .
• Чо К.И., Цай Ю., Йи Х, Йе А., Аслануков А., Феррейра П.А. (декабрь 2007 г.). «Ассоциация кинезин-связывающего домена RanBP2 с KIF5B и KIF5C определяет локализацию и функцию митохондрий» . Трафик . 8 (12): 1722–35. дои : 10.1111/j.1600-0854.2007.00647.x . ПМИД   17887960 . S2CID   25829308 .
• Йи Х, Фридман Дж.Л., Феррейра П.А. (ноябрь 2007 г.). «Циклофилин-подобный домен Ran-связывающего белка-2 избирательно модулирует активность системы убиквитин-протеасома и биогенез белка» . Журнал биологической химии . 282 (48): 34770–8. дои : 10.1074/jbc.M706903200 . ПМИД   17911097 .
• Давлати М.М., Малуреану Л., Джеганатан К.Б., Као Э., Сустманн С., Тахк С., Шуай К., Гросседл Р., ван Дёрсен Дж.М. (апрель 2008 г.). «Разрешение сестринских центромер требует RanBP2-опосредованного SUMOylation топоизомеразы IIальфа» . Клетка . 133 (1): 103–15. дои : 10.1016/j.cell.2008.01.045 . ПМЦ   2693193 . ПМИД   18394993 .
• Чо КИ, Йи Х, Йе А, Церенсоодол Н, Куадрадо Л, Сирл К, Хао Й, Феррейра П.А. (февраль 2009 г.). «Гаплонедостаточность RanBP2 является нейропротектором против вызванной светом и возрастной дегенерации нейронов фоторецепторов» . Смерть клеток и дифференцировка . 16 (2): 287–97. дои : 10.1038/cdd.2008.153 . ПМК   2626153 . ПМИД   18949001 .
• Чо КИ, Йи Х, Десаи Р., Хэнд А.Р., Хаас А.Л., Феррейра П.А. (май 2009 г.). «RANBP2 является аллостерическим активатором обычного моторного белка кинезина-1, KIF5B, в минимальной бесклеточной системе» . Отчеты ЭМБО . 10 (5): 480–6. дои : 10.1038/embor.2009.29 . ПМЦ   2680871 . ПМИД   19305391 .