Jump to content

BE2I

BE2I
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы UBE2I , C358B7.1, P18, UBC9, фермент, конъюгирующий убиквитин E2 I
Внешние идентификаторы Опустить : 601661 ; МГИ : 107365 ; Гомологен : 5574 ; Генные карты : UBE2I ; ОМА : UBE2I — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_003345
НМ_194259
НМ_194260
НМ_194261

НМ_001177609
НМ_001177610
НМ_011665
НМ_001357694

RefSeq (белок)

НП_003336
НП_919235
НП_919236
НП_919237

НП_001171080
НП_001171081
НП_035795
НП_001344623

Местоположение (UCSC) Чр 16: 1,31 – 1,33 Мб Чр 17: 25,48 – 25,49 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

SUMO-конъюгирующий фермент UBC9 — это фермент , который у человека кодируется UBE2I геном . [ 5 ] Его также иногда называют «убиквитин-конъюгирующим ферментом E2I» или «белком-переносчиком убиквитина 9», хотя эти названия неточно описывают его функцию.

Выражение

[ редактировать ]

четыре альтернативно сплайсированных варианта транскрипта , кодирующих один и тот же белок . Для этого гена обнаружено [ 6 ]

UBC9 Белок , кодируемый геном UBE2I, представляет собой основной механизм клеточного пути сумойлирования. Сумойлирование — это процесс, при котором малый убиквитиноподобный модификатор (SUMO) ковалентно присоединяется к другим белкам с целью изменения их поведения. Например, сумойилирование может влиять на локализацию белка в клетке, его способность взаимодействовать с другими белками или ДНК .

UBC9 выполняет третий этап жизненного цикла сумойлирования: этап конъюгации. Когда предшественники белка SUMO впервые экспрессируются, они сначала подвергаются стадии созревания, на которой четыре С-концевые аминокислоты удаляются, обнажая диглициновый мотив . На втором этапе активирующий комплекс E1 связывается с SUMO по его ди-глицину и передает его белку E2 Ubc9, где он образует тиоэфирную связь с остатком цистеина внутри каталитического кармана Ubc9. Загруженный Ubc9 теперь готов выполнить сумойлирование различных белков-мишеней (также называемых субстратами ). Он распознает определенный мотив аминокислотных остатков в этих субстратах: большой гидрофобный остаток, за которым следует лизин , за которым следует спейсер, за которым следует кислотный остаток. Этот мотив обычно описывается сокращенно как ΨKxD/E. Центральный лизин мотива узнавания субстрата вставляется в каталитический карман. Там карбоксильный конец диглицина SUMO образует пептидную связь с ε-аминогруппой лизина. Этому процессу может способствовать белок-лигаза Е3.

Процесс сумойлирования обратим. Протеазы SENP могут удалять SUMO из сумойлированных белков, освобождая его для использования в дальнейших реакциях сумойлирования.

Клиническая значимость

[ редактировать ]

Было показано, что белок UBC9, кодируемый геном UBE2I, поражает множество вирусов, включая ВИЧ и ВПЧ. Была выдвинута гипотеза, что эти вирусы захватывают UBC9 для достижения своих целей. [ 7 ]

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что UBE2I взаимодействует с:

Примечания

[ редактировать ]
  1. ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000103275 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015120 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Ватанабэ Т.К., Фудзивара Т., Каваи А., Симидзу Ф., Таками С., Хирано Х., Окуно С., Одзаки К., Такеда С., Симада Ю., Нагата М., Такаити А., Такахаси Е., Накамура Ю., Шин С. (март 1996 г.). «Клонирование, экспрессия и картирование UBE2I, нового гена, кодирующего человеческий гомолог дрожжевых ферментов, конъюгирующих убиквитин, которые имеют решающее значение для регуляции клеточного цикла». Цитогенный клеточный генетик . 72 (1): 86–9. дои : 10.1159/000134169 . ПМИД   8565643 .
  6. ^ «Ген Энтреза: фермент E2I, конъюгирующий убиквитин UBE2I (гомолог UBC9, дрожжи)» .
  7. ^ Варадарай А., Маттошио Д., Чиокка С. (январь 2014 г.). «Фермент SUMO Ubc9 как вирусная мишень». ИУБМБ Жизнь . 66 (1): 27–33. дои : 10.1002/iub.1240 . ПМИД   24395713 . S2CID   42047371 .
  8. ^ Файерштейн Р., Фейерштейн Н. (март 1998 г.). «Ассоциация активирующего транскрипционного фактора 2 (ATF2) с убиквитин-конъюгирующим ферментом hUBC9. Участие пути убиквитин/протеасома в регуляции ATF2 в Т-клетках» . Ж. Биол. Хим . 273 (10): 5892–902. дои : 10.1074/jbc.273.10.5892 . ПМИД   9488727 .
  9. ^ Пукка Х., Аарнисало П., Карвонен У., Палвимо Дж.Дж., Янне О.А. (июль 1999 г.). «Ubc9 взаимодействует с рецептором андрогенов и активирует рецептор-зависимую транскрипцию» . Ж. Биол. Хим . 274 (27): 19441–6. дои : 10.1074/jbc.274.27.19441 . ПМИД   10383460 .
  10. ^ Колдамова Р.П., Лефтеров И.М., ДиСабелла М.Т., Лазо Дж.С. (декабрь 1998 г.). «Эволюционно консервативная цистеиновая протеаза, гидролаза блеомицина человека, связывается с человеческим гомологом убиквитин-конъюгирующего фермента 9». Мол. Фармакол . 54 (6): 954–61. дои : 10.1124/моль.54.6.954 . ПМИД   9855622 .
  11. ^ Jump up to: а б Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД   16189514 . S2CID   4427026 .
  12. ^ Махон О., Бэкман М., Джулин К., Краусс С. (октябрь 2000 г.). «Двугибридная система дрожжей идентифицирует убиквитин-конъюгирующий фермент mUbc9 как потенциального партнера мышиного Dac» . Мех. Дев . 97 (1–2): 3–12. дои : 10.1016/s0925-4773(00)00402-0 . ПМИД   11025202 . S2CID   14154139 .
  13. ^ Линг Ю., Санкпал Ю.Т., Робертсон А.К., МакНелли Дж.Г., Карпова Т., Робертсон К.Д. (2004). «Модификация ДНК-метилтрансферазы 3a (Dnmt3a) de novo с помощью SUMO-1 модулирует ее взаимодействие с деацетилазами гистонов (HDAC) и ее способность подавлять транскрипцию» . Нуклеиновые кислоты Рез . 32 (2): 598–610. дои : 10.1093/nar/gkh195 . ПМЦ   373322 . ПМИД   14752048 .
  14. ^ Кан Э.С., Пак К.В., Чунг Дж.Х. (декабрь 2001 г.). «Dnmt3b, ДНК-метилтрансфераза de novo, взаимодействует с SUMO-1 и Ubc9 через свою N-концевую область и подвергается модификации SUMO-1». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 289 (4): 862–8. дои : 10.1006/bbrc.2001.6057 . ПМИД   11735126 .
  15. ^ Jump up to: а б с Книпшер П., Флото А., Клуг Х., Олсен Дж.В., ван Дейк В.Дж., Фиш А., Джонсон Э.С., Манн М., Сиксма Т.К., Пихлер А. (август 2008 г.). «Сумойлирование Ubc9 регулирует дискриминацию целей СУМО» . Крот. Клетка . 31 (3): 371–82. doi : 10.1016/j.molcel.2008.05.022 . ПМИД   18691969 .
  16. ^ Рю С.В., Че С.К., Ким Э (декабрь 2000 г.). «Взаимодействие Daxx, белка, связывающего Fas, с сентрином и Ubc9». Биохим. Биофиз. Рез. Общий . 279 (1): 6–10. дои : 10.1006/bbrc.2000.3882 . ПМИД   11112409 .
  17. ^ Хан С.Л., Василик Б., Крики-Филипе П., Крики П. (сентябрь 1997 г.). «Модуляция транскрипционной активности ETS-1 с помощью huUBC9, фермента, конъюгирующего убиквитин». Онкоген . 15 (12): 1489–95. дои : 10.1038/sj.onc.1201301 . ПМИД   9333025 . S2CID   26170389 .
  18. ^ Ши Ю, Цзоу М, Фарид Н.Р., Патерсон М.С. (декабрь 2000 г.). «Ассоциация FHIT (хрупкая гистидиновая триада), кандидатного гена-супрессора опухоли, с убиквитин-конъюгирующим ферментом hUBC9» . Биохим. Дж . 352 (2): 443–8. дои : 10.1042/0264-6021:3520443 . ПМК   1221476 . ПМИД   11085938 .
  19. ^ Мингот Дж. М., Костка С., Крафт Р., Хартманн Э., Герлих Д. (июль 2001 г.). «Импортин 13: новый посредник ядерного импорта и экспорта» . ЭМБО Дж . 20 (14): 3685–94. дои : 10.1093/emboj/20.14.3685 . ПМК   125545 . ПМИД   11447110 .
  20. ^ Jump up to: а б Зальцман А, Сирфосс Дж, Марсиро С, Стоун М, Ресснер Р, Манро Р, Фрэнкс С, Д'Алонзо Дж, Ток Б, Джей М, Иващенко Ю (апрель 1998 г.). «hUBC9 связывается с MEKK1 и рецептором TNF-альфа I типа и стимулирует активность NFkappaB» . ФЭБС Летт . 425 (3): 431–5. дои : 10.1016/s0014-5793(98)00287-7 . ПМИД   9563508 . S2CID   84816080 .
  21. ^ Сюй В., Гонг Л., Хаддад М.М., Бишоф О., Кампизи Дж., Йе ET, Медрано Э.Э. (март 2000 г.). «Регуляция уровней белка MITF, связанного с микрофтальмией, путем ассоциации с убиквитин-конъюгирующим ферментом hUBC9». Эксп. Сотовый Res . 255 (2): 135–43. дои : 10.1006/excr.2000.4803 . ПМИД   10694430 .
  22. ^ Jump up to: а б с Шен З., Пардингтон-Пуртимун П.Е., Комо Дж.К., Мойзис Р.К., Чен DJ (октябрь 1996 г.). «Ассоциации UBE2I с белками RAD52, UBL1, p53 и RAD51 в двугибридной системе дрожжей» . Геномика . 37 (2): 183–186. дои : 10.1006/geno.1996.0540 . ПМИД   8921390 .
  23. ^ Jump up to: а б Минти А., Дюмон Икс, Кагад М., Капут Д. (ноябрь 2000 г.). «Ковалентная модификация p73альфа с помощью SUMO-1. Двухгибридный скрининг с помощью p73 идентифицирует новые белки, взаимодействующие с SUMO-1, и мотив взаимодействия SUMO-1» . Ж. Биол. Хим . 275 (46): 36316–23. дои : 10.1074/jbc.M004293200 . ПМИД   10961991 .
  24. ^ Галлахер В.М., Аргентини М., Сьерра В., Бракко Л., Дебуше Л., Консейлер Э. (июнь 1999 г.). «MBP1: новый мутантный белок-партнер, специфичный для p53, с онкогенными свойствами» . Онкоген . 18 (24): 3608–16. дои : 10.1038/sj.onc.1202937 . ПМИД   10380882 .
  25. ^ Бернье-Вилламор В., Сэмпсон Д.А., Матунис М.Д., Лима К.Д. (февраль 2002 г.). «Структурная основа E2-опосредованной конъюгации SUMO, выявленная комплексом между убиквитин-конъюгирующим ферментом Ubc9 и RanGAP1» . Клетка . 108 (3): 345–56. дои : 10.1016/s0092-8674(02)00630-x . ПМИД   11853669 . S2CID   15512250 .
  26. ^ Jump up to: а б Ли Б.Х., Ёсимацу К., Маэда А., Отиаи К., Моримацу М., Араки К., Огино М., Морикава С., Арикава Дж. (декабрь 2003 г.). «Ассоциация нуклеокапсидного белка хантавирусов Seoul и Hantaan с небольшими убиквитиноподобными молекулами, родственными модификатору-1». Вирус Рес . 98 (1): 83–91. doi : 10.1016/j.virusres.2003.09.001 . ПМИД   14609633 .
  27. ^ Сапетшниг А., Ришитор Г., Браун Х., Долл А., Шергаут М., Мельхиор Ф., Суске Г. (октябрь 2002 г.). «Фактор транскрипции Sp3 подавляется посредством модификации SUMO с помощью PIAS1» . ЭМБО Дж . 21 (19): 5206–15. дои : 10.1093/emboj/cdf510 . ПМК   129032 . ПМИД   12356736 .
  28. ^ Кахьо Т., Нисида Т., Ясуда Х. (сентябрь 2001 г.). «Участие PIAS1 в сумойлировании опухолевого супрессора p53» . Мол. Клетка . 8 (3): 713–8. дои : 10.1016/s1097-2765(01)00349-5 . ПМИД   11583632 .
  29. ^ Коваленко О.В., Плаг А.В., Хааф Т., Гонда Д.К., Эшли Т., Уорд Д.К., Рэддинг СМ, Голуб Е.И. (апрель 1996 г.). «Убиквитин-конъюгирующий фермент млекопитающих Ubc9 взаимодействует с рекомбинантным белком Rad51 и локализуется в синаптонемных комплексах» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (7): 2958–63. Бибкод : 1996PNAS...93.2958K . дои : 10.1073/pnas.93.7.2958 . ПМК   39742 . ПМИД   8610150 .
  30. ^ Jump up to: а б с д Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О, Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дьюэл Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 : 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ   1847948 . ПМИД   17353931 .
  31. ^ Чжан Х., Сайто Х., Матунис М.Дж. (сентябрь 2002 г.). «Ферменты пути модификации SUMO локализуются в нитях комплекса ядерных пор» . Мол. Клетка. Биол . 22 (18): 6498–508. дои : 10.1128/mcb.22.18.6498-6508.2002 . ПМК   135644 . ПМИД   12192048 .
  32. ^ Jump up to: а б Тэтэм М.Х., Ким С., Ю Б., Джафрей Э., Сонг Дж., Чжэн Дж., Родригес М.С., Хэй RT, Чен Ю. (август 2003 г.). «Роль N-концевого сайта Ubc9 в связывании и конъюгации SUMO-1, -2 и -3». Биохимия . 42 (33): 9959–69. дои : 10.1021/bi0345283 . ПМИД   12924945 .
  33. ^ Нетцер С., Боландер С.К., Ригер Л., Мюллер С., Кольхазе Дж. (август 2002 г.). «Взаимодействие регулятора развития SALL1 с UBE2I и SUMO-1». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 296 (4): 870–6. дои : 10.1016/s0006-291x(02)02003-x . ПМИД   12200128 .
  34. ^ Хаггинс Г.С., Чин М.Т., Сибинга Н.Е., Ли С.Л., Хабер Э., Ли М.Э. (октябрь 1999 г.). «Характеристика сайтов связывания mUBC9, необходимых для деградации белка E2A» . Ж. Биол. Хим . 274 (40): 28690–6. дои : 10.1074/jbc.274.40.28690 . ПМИД   10497239 .
  35. ^ Мао Ю, Сунь М, Десаи С.Д., Лю Л.Ф. (апрель 2000 г.). «Конъюгация SUMO-1 с топоизомеразой I: возможный ответ на восстановление ДНК, опосредованное топоизомеразой» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (8): 4046–51. Бибкод : 2000PNAS...97.4046M . дои : 10.1073/pnas.080536597 . ЧВК   18143 . ПМИД   10759568 .
  36. ^ Ван ЗЮ, Цю QQ, Зейферт В, Тагучи Т, Теста-младший, Уитмор С.А., Каллен Д.Ф., Уэлш Д., Шенк Т., Деуэль Т.Ф. (октябрь 1996 г.). «Молекулярное клонирование кДНК и хромосомная локализация гена человеческого убиквитин-конъюгирующего фермента 9» . Ж. Биол. Хим . 271 (40): 24811–6. дои : 10.1074/jbc.271.40.24811 . ПМИД   8798754 .
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: d1771479b9046db12284053373ca0d1d__1676616060
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/d1/1d/d1771479b9046db12284053373ca0d1d.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
UBE2I - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)