УБЭ2М

УБЭ2М
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1TT5, 1Y8X, 2NVU, 3TDU, 3TDZ, 4GAO, 4P5O
Идентификаторы
Псевдонимы	UBE2M , UBC-RS2, UBC12, hUbc12, фермент, конъюгирующий убиквитин E2 M
Внешние идентификаторы	Опустить : 603173 ; МГИ : 108278 ; Гомологен : 2952 ; Генные карты : UBE2M ; ОМА : УБЭ2М - ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	58,558,954 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	12,772,202 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right frontal lobe; ; anterior cingulate cortex; ; prefrontal cortex; ; left testis; ; apex of heart; ; anterior pituitary; ; right testis; ; muscle of thigh; ; amygdala; ; right hemisphere of cerebellum;
	Top expressed in
	superior frontal gyrus; ; muscle of thigh; ; spermatocyte; ; lip; ; spermatid; ; ventricular zone; ; primary visual cortex; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; right kidney; ; yolk sac;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	nucleotide binding; protein binding; ATP binding; ubiquitin protein ligase binding; ubiquitin protein ligase activity; ubiquitin-protein transferase activity; NEDD8 transferase activity; transferase activity;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; nucleoplasm;
Biological process	protein neddylation; positive regulation of neuron apoptotic process; protein ubiquitination; post-translational protein modification;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	9040
	22192
	ENSG00000130725
	ENSMUSG00000005575
	P61081
	P61082
	НМ_003969
	НМ_001168469 ; НМ_001243968 ; НМ_145578
	НП_003960 ; НП_003960.1
	НП_001161941 ; НП_001230897 ; НП_663553
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

NEDD8-конъюгирующий фермент Ubc12 представляет собой белок , который у человека кодируется UBE2M геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Модификация белков убиквитином является важным клеточным механизмом направленного воздействия на аномальные или короткоживущие белки для деградации . В убиквитинировании участвуют как минимум три класса ферментов: ферменты, активирующие убиквитин , или E1, ферменты, конъюгирующие убиквитин , или E2, и убиквитин-белковые лигазы , или E3. Этот ген кодирует члена семейства ферментов, конъюгирующих убиквитин Е2. Кодируемый белок связан с убиквитиноподобным белком NEDD8 , который можно конъюгировать с клеточными белками, такими как Cdc53/кулин. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что UBE2M взаимодействует с NEDD8 . ^{[ 7 ]} ПРКАР1А ^{[ 8 ]} и УБА3 . ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000130725 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000005575 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Осака Ф, Кавасаки Х, Аида Н, Саэки М, Чиба Т, Кавасима С, Танака К, Като С (август 1998 г.). «Новая система лигирования NEDD8 для куллина-4А» . Джинс Дев 12 (15): 2263–8. дои : 10.1101/gad.12.15.2263 . ПМК 317039 . ПМИД 9694792 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: UBE2M, убиквитин-конъюгирующий фермент E2M (гомолог UBC12, дрожжи)» .
^ Гонг Л., Йе ET (апрель 1999 г.). «Идентификация активирующих и конъюгирующих ферментов пути конъюгации NEDD8» . Ж. Биол. Хим . 274 (17). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 12036–42. дои : 10.1074/jbc.274.17.12036 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 10207026 .
^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О, Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дьюэл Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1). Англия: 89. doi : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .
^ Хуанг Д.Т., Пайдар А., Чжуан М., Уодделл М.Б., Холтон Дж.М., Шульман Б.А. (февраль 2005 г.). «Структурная основа рекрутирования Ubc12 с помощью связывающего домена E2 в E1 NEDD8» . Мол. Клетка . 17 (3): 341–50. doi : 10.1016/j.molcel.2004.12.020 . ПМИД 15694336 .

Дальнейшее чтение

Гонг Л., Да ET (1999). «Идентификация активирующих и конъюгирующих ферментов пути конъюгации NEDD8» . Ж. Биол. Хим . 274 (17): 12036–42. дои : 10.1074/jbc.274.17.12036 . ПМИД 10207026 .
Чен Ю, Макфи Д.Л., Хиршберг Дж., Нив Р.Л. (2000). «Белок-связывающий белок-предшественник амилоида APP-BP1 управляет клеточным циклом через контрольную точку SM и вызывает апоптоз в нейронах» . Ж. Биол. Хим . 275 (12): 8929–35. дои : 10.1074/jbc.275.12.8929 . ПМИД 10722740 .
Вада Х., Йе Э.Т., Камитани Т. (2000). «Доминантно-негативный мутант UBC12 секвестрирует NEDD8 и ингибирует конъюгацию NEDD8 in vivo» . Ж. Биол. Хим . 275 (22): 17008–15. дои : 10.1074/jbc.275.22.17008 . ПМИД 10828074 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Томсиг Дж.Л., Снайдер С.Л., Крейц К.Э. (2003). «Идентификация мишеней для передачи сигналов кальция через семейство белков копина. Характеристика спирально-спирального мотива, связывающего копин» . Ж. Биол. Хим . 278 (12): 10048–54. дои : 10.1074/jbc.M212632200 . ПМИД 12522145 .
Хуанг Д.Т., Миллер Д.В., Мэтью Р. и др. (2004). «Уникальное взаимодействие E1–E2, необходимое для оптимальной конъюгации убиквитиноподобного белка NEDD8» . Нат. Структура. Мол. Биол . 11 (10): 927–35. дои : 10.1038/nsmb826 . ПМЦ 2862556 . ПМИД 15361859 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Хуан Д.Т., Пайдар А., Чжуан М. и др. (2005). «Структурная основа рекрутирования Ubc12 с помощью связывающего домена E2 в E1 NEDD8» . Мол. Клетка . 17 (3): 341–50. doi : 10.1016/j.molcel.2004.12.020 . ПМИД 15694336 .
Ли Т., Сантокайт Р., Шен Р.Ф. и др. (2006). «Общий подход к исследованию ферментативных путей и субстратов для убиквитиноподобных модификаторов» . Арх. Биохим. Биофиз . 453 (1): 70–4. дои : 10.1016/j.abb.2006.03.002 . ПМИД 16620772 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000130725 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000005575 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9694792-5] Осака Ф, Кавасаки Х, Аида Н, Саэки М, Чиба Т, Кавасима С, Танака К, Като С (август 1998 г.). «Новая система лигирования NEDD8 для куллина-4А» . Джинс Дев 12 (15): 2263–8. дои : 10.1101/gad.12.15.2263 . ПМК 317039 . ПМИД 9694792 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: UBE2M, убиквитин-конъюгирующий фермент E2M (гомолог UBC12, дрожжи)» .

[pmid10207026-7] Гонг Л., Йе ET (апрель 1999 г.). «Идентификация активирующих и конъюгирующих ферментов пути конъюгации NEDD8» . Ж. Биол. Хим . 274 (17). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 12036–42. дои : 10.1074/jbc.274.17.12036 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 10207026 .

[pmid17353931-8] Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О, Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дьюэл Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1). Англия: 89. doi : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

[pmid15694336-9] Хуанг Д.Т., Пайдар А., Чжуан М., Уодделл М.Б., Холтон Дж.М., Шульман Б.А. (февраль 2005 г.). «Структурная основа рекрутирования Ubc12 с помощью связывающего домена E2 в E1 NEDD8» . Мол. Клетка . 17 (3): 341–50. doi : 10.1016/j.molcel.2004.12.020 . ПМИД 15694336 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]