УБЭ2Н

УБЭ2Н
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1J7D, 2C2V, 3HCT, 3HCU, 3VON, 3W31, 4DHI, 4DHJ, 4DHZ, 4IP3, 4NR3, 4NRG, 4NRI, 4ONL, 4ONM, 4ONN, 4ORH, 4TKP, 5AIT, 5AIU, 4WHV
Идентификаторы
Псевдонимы	УБЭ2Н , ХЭЛ-С-71, УБК13, УБЧБЕН; UBC13, UbcH-ben, UbcH13, фермент, конъюгирующий убиквитин E2 N, UBCHBEN
Внешние идентификаторы	Опустить : 603679 ; МГИ : 1934835 ; Гомологен : 128406 ; Генные карты : UBE2N ; ОМА : UBE2N — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	93,441,947 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	95,381,519 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	left testis; ; right testis; ; sperm; ; ganglionic eminence; ; islet of Langerhans; ; ventricular zone; ; right ventricle; ; pons; ; human penis; ; myocardium;
	Top expressed in
	spermatid; ; spermatocyte; ; ventricular zone; ; tail of embryo; ; esophagus; ; embryo; ; embryo; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; blastocyst; ; yolk sac;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	transferase activity; nucleotide binding; ubiquitin protein ligase activity; ubiquitin binding; protein binding; ATP binding; ubiquitin protein ligase binding; RNA binding; ubiquitin-protein transferase activity; ubiquitin conjugating enzyme activity;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; UBC13-UEV1A complex; ubiquitin ligase complex; nucleoplasm; extracellular exosome; UBC13-MMS2 complex; nucleus; fibrillar center; protein-containing complex;
Biological process	postreplication repair; protein K63-linked ubiquitination; regulation of DNA repair; DNA double-strand break processing; positive regulation of DNA repair; stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; proteolysis; cellular response to DNA damage stimulus; Fc-epsilon receptor signaling pathway; global genome nucleotide-excision repair; positive regulation of histone modification; positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity; protein ubiquitination; regulation of histone ubiquitination; positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; T cell receptor signaling pathway; double-strand break repair via nonhomologous end joining; nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway; histone ubiquitination; DNA repair; double-strand break repair via homologous recombination; JNK cascade; positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; ubiquitin-dependent protein catabolic process; interleukin-1-mediated signaling pathway;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7334
	93765
	ENSG00000177889
	ENSMUSG00000074781
	P61088
	P61089
	НМ_003348
	НМ_080560
	НП_003339
	НП_542127
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Убиквитин-конъюгирующий фермент E2 N представляет собой белок , который у человека кодируется UBE2N геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Модификация белков убиквитином является важным клеточным механизмом направленной деградации аномальных или короткоживущих белков. В убиквитинировании участвуют по крайней мере три класса ферментов: ферменты, активирующие убиквитин, или E1, ферменты, конъюгирующие убиквитин, или E2, и убиквитин-белковые лигазы, или E3. Этот ген кодирует члена семейства ферментов, конъюгирующих убиквитин Е2. Исследования на мышах показывают, что этот белок играет роль в пострепликационной репарации ДНК. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что UBE2N взаимодействует с:

AURKAПРОТИВ ^{[ 7 ]}
HLTF , ^{[ 8 ]}
ТРАФ2 , ^{[ 9 ]}
ТРАФ6 , ^{[ 9 ]} и
УБЭ2В1 . ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000177889 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000074781 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ямагути Т., Ким Н.С., Секине С., Сейно Х., Осака Ф., Ямао Ф., Като С. (февраль 1997 г.). «Клонирование и экспрессия кДНК, кодирующей человеческий убиквитин-конъюгирующий фермент, аналогичный продукту гена без изгиба дрозофилы». Дж. Биохим . 120 (3): 494–97. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021440 . ПМИД 8902611 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: фермент E2N, конъюгирующий убиквитин UBE2N (гомолог UBC13, дрожжи)» .
^ Юарт-Толанд А., Бриассули П., де Конинг Дж.П., Мао Дж.Х., Юань Дж., Чан Ф., Маккарти-Моррог Л., Пондер Б.А., Нагасе Х., Берн Дж., Болл С., Алмейда М., Линардопулос С., Балмейн А. (август 2003 г.) . «Идентификация Stk6 / STK15 как кандидатного гена малопроницаемой опухолевой предрасположенности у мышей и человека». Нат. Жене . 34 (4): 403–12. дои : 10.1038/ng1220 . ПМИД 12881723 . S2CID 29442841 .
^ Унк И, Хайду И, Фатиол К, Гурвиц Дж, Юн Дж. Х., Пракаш Л., Пракаш С., Харачка Л. (март 2008 г.). «Человеческий HLTF действует как убиквитинлигаза для полиубиквитинирования ядерного антигена пролиферирующих клеток» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 105 (10): 3768–73. Бибкод : 2008PNAS..105.3768U . дои : 10.1073/pnas.0800563105 . ПМК 2268824 . ПМИД 18316726 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Дэн Л., Ван С., Спенсер Э., Ян Л., Браун А., Ю Дж., Слотер С., Пиккарт С., Чен З.Дж. (октябрь 2000 г.). «Активация киназного комплекса IkappaB с помощью TRAF6 требует наличия димерного убиквитин-конъюгирующего ферментного комплекса и уникальной полиубиквитиновой цепи» . Клетка . 103 (2): 351–61. дои : 10.1016/s0092-8674(00)00126-4 . ПМИД 11057907 . S2CID 18154645 .

Дальнейшее чтение

Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соареш М.Б. (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геном Рез . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
Хофманн Р.М., Пиккарт К.М. (1999). «Неканонический фермент, кодирующий убиквитин, кодируемый MMS2, участвует в сборке новых полиубиквитиновых цепей для репарации ДНК» . Клетка . 96 (5): 645–53. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80575-9 . ПМИД 10089880 . S2CID 17117789 .
Дэн Л., Ван С., Спенсер Э., Ян Л., Браун А., Ю Дж., Слотер С., Пиккарт С., Чен З.Дж. (2000). «Активация киназного комплекса IkappaB с помощью TRAF6 требует наличия димерного убиквитин-конъюгирующего ферментного комплекса и уникальной полиубиквитиновой цепи» . Клетка . 103 (2): 351–61. дои : 10.1016/S0092-8674(00)00126-4 . ПМИД 11057907 . S2CID 18154645 .
Чан Н.Л., Хилл С.П. (2001). «Определение топологии полиубиквитиновой цепи». Нат. Структура. Биол . 8 (8): 650–2. дои : 10.1038/90337 . ПМИД 11473244 . S2CID 16579945 .
Мораес Т.Ф., Эдвардс Р.А., Маккенна С., Пастушок Л., Сяо В., Гловер Дж.Н., Эллисон М.Дж. (2001). «Кристаллическая структура ферментного комплекса, конъюгирующего убиквитин человека, hMms2-hUbc13». Нат. Структура. Биол . 8 (8): 669–73. дои : 10.1038/90373 . ПМИД 11473255 . S2CID 23504541 .
Эшли С., Пастушок Л., Маккенна С., Эллисон М.Дж., Сяо В. (2002). «Роль мышиного UBC13 в пострепликационной репарации ДНК и убиквитинировании, связанном с Lys63». Джин . 285 (1–2): 183–91. дои : 10.1016/S0378-1119(02)00409-2 . ПМИД 12039045 .
Маккенна С., Мораес Т., Пастушок Л., Птак С., Сяо В., Спиракопулос Л., Эллисон М.Дж. (2003). «Модель связанного с убиквитином комплекса конъюгации убиквитина человека Mms2.Ubc13, основанная на ЯМР. Структурная основа катализа цепи лизина 63» . Ж. Биол. Хим . 278 (15): 13151–8. дои : 10.1074/jbc.M212353200 . ПМИД 12569095 .
Анандасабапати Н., Форд Г.С., Блум Д., Холнесс С., Парагас В., Серуги С., Скрента Х., Холленхорст М., Фатман К.Г., Соареш Л. (2003). «GRAIL: убиквитинлигаза E3, которая ингибирует транскрипцию гена цитокинов, экспрессируется в анергических CD4+ Т-клетках» . Иммунитет . 18 (4): 535–47. дои : 10.1016/S1074-7613(03)00084-0 . ПМИД 12705856 .
Юарт-Толанд А., Бриассули П., де Конинг Дж. П., Мао Дж. Х., Юань Дж., Чан Ф, Маккарти-Моррог Л., Пондер Б. А., Нагасе Х., Берн Дж., Болл С., Алмейда М., Линардопулос С., Балмейн А. (2003). «Идентификация Stk6 / STK15 как кандидатного гена малопроницаемой опухолевой предрасположенности у мышей и человека». Нат. Жене . 34 (4): 403–12. дои : 10.1038/ng1220 . ПМИД 12881723 . S2CID 29442841 .
Ботос Дж., Саммерс М.К., Венере М., Скольник Д.М., Халазонетис Т.Д. (2003). «Белок митотической контрольной точки Chfr взаимодействует с Ubc13-Mms2, образуя Lys63-связанные полиубиквитиновые цепи» . Онкоген . 22 (46): 7101–7. дои : 10.1038/sj.onc.1206831 . ПМИД 14562038 .
Чжоу Х., Вертц И., О'Рурк К., Ульч М., Сешагири С., Эби М., Сяо В., Диксит В.М. (2004). «Bcl10 активирует путь NF-kappaB посредством убиквитинирования NEMO». Природа . 427 (6970): 167–71. Бибкод : 2004Natur.427..167Z . дои : 10.1038/nature02273 . ПМИД 14695475 . S2CID 4429582 .
Сунь Л., Дэн Л., Эа К.К., Ся З.П., Чен З.Дж. (2004). «Убиквитинлигаза TRAF6 и киназа TAK1 опосредуют активацию IKK с помощью BCL10 и MALT1 в Т-лимфоцитах» . Мол. Клетка . 14 (3): 289–301. дои : 10.1016/S1097-2765(04)00236-9 . ПМИД 15125833 .
Колланд Ф., Жак Икс, Труплен В., Мужен С., Гроазело С., Гамбургер А., Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Ж.М. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека» . Геном Рез . 14 (7): 1324–32. дои : 10.1101/гр.2334104 . ПМК 442148 . ПМИД 15231748 .
Пастушок Л., Мораес Т.Ф., Эллисон М.Дж., Сяо В. (2005). «Вставка одного «ключевого» остатка Mms2 в карман Ubc13 определяет специфичность интерфейса человеческого комплекса конъюгации убиквитина Lys63» . Ж. Биол. Хим . 280 (18): 17891–900. дои : 10.1074/jbc.M410469200 . ПМИД 15749714 .
Такеучи Т., Ёкосава Х. (2005). «Модификация Ubc13 ISG15 подавляет его убиквитин-конъюгирующую активность». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 336 (1): 9–13. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.08.034 . ПМИД 16112642 .
Цзоу В, Папов В, Малахова О, Ким КИ, Дао С, Ли Дж, Чжан ДЭ (2005). «Модификация убиквитина E2 Ubc13 ISG15 нарушает его способность образовывать тиоэфирную связь с убиквитином». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 336 (1): 61–8. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.08.038 . ПМИД 16122702 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 12 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000177889 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000074781 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8902611-5] Ямагути Т., Ким Н.С., Секине С., Сейно Х., Осака Ф., Ямао Ф., Като С. (февраль 1997 г.). «Клонирование и экспрессия кДНК, кодирующей человеческий убиквитин-конъюгирующий фермент, аналогичный продукту гена без изгиба дрозофилы». Дж. Биохим . 120 (3): 494–97. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021440 . ПМИД 8902611 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: фермент E2N, конъюгирующий убиквитин UBE2N (гомолог UBC13, дрожжи)» .

[pmid12881723-7] Юарт-Толанд А., Бриассули П., де Конинг Дж.П., Мао Дж.Х., Юань Дж., Чан Ф., Маккарти-Моррог Л., Пондер Б.А., Нагасе Х., Берн Дж., Болл С., Алмейда М., Линардопулос С., Балмейн А. (август 2003 г.) . «Идентификация Stk6 / STK15 как кандидатного гена малопроницаемой опухолевой предрасположенности у мышей и человека». Нат. Жене . 34 (4): 403–12. дои : 10.1038/ng1220 . ПМИД 12881723 . S2CID 29442841 .

[pmid18316726-8] Унк И, Хайду И, Фатиол К, Гурвиц Дж, Юн Дж. Х., Пракаш Л., Пракаш С., Харачка Л. (март 2008 г.). «Человеческий HLTF действует как убиквитинлигаза для полиубиквитинирования ядерного антигена пролиферирующих клеток» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 105 (10): 3768–73. Бибкод : 2008PNAS..105.3768U . дои : 10.1073/pnas.0800563105 . ПМК 2268824 . ПМИД 18316726 .

[pmid11057907-9] Jump up to: ^а ^б ^с Дэн Л., Ван С., Спенсер Э., Ян Л., Браун А., Ю Дж., Слотер С., Пиккарт С., Чен З.Дж. (октябрь 2000 г.). «Активация киназного комплекса IkappaB с помощью TRAF6 требует наличия димерного убиквитин-конъюгирующего ферментного комплекса и уникальной полиубиквитиновой цепи» . Клетка . 103 (2): 351–61. дои : 10.1016/s0092-8674(00)00126-4 . ПМИД 11057907 . S2CID 18154645 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]