УБЭ2Е1

УБЭ2Е1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1XR9, 3BZH, 4JJQ
Идентификаторы
Псевдонимы	UBE2E1 , UBCH6, фермент, конъюгирующий убиквитин E2 E1
Внешние идентификаторы	Опустить : 602916 ; МГИ : 107411 ; Гомологен : 84372 ; Генные карты : UBE2E1 ; OMA : UBE2E1 — ортологи
Номер ЕС	2.3.2.24
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	23,891,640 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 14 (mouse)
End	4,186,974 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	cartilage tissue; ; oral cavity; ; ventricular zone; ; embryo; ; skin of arm; ; superficial temporal artery; ; bronchial epithelial cell; ; mucosa of paranasal sinus; ; pons; ; lower lobe of lung;
	Top expressed in
	otic placode; ; otic vesicle; ; saccule; ; mammillary body; ; ventral tegmental area; ; dorsomedial hypothalamic nucleus; ; arcuate nucleus; ; paraventricular nucleus of hypothalamus; ; nasal epithelium; ; olfactory epithelium;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	transferase activity; nucleotide binding; ISG15 transferase activity; ubiquitin-protein transferase activity; protein binding; ATP binding; ubiquitin conjugating enzyme activity;
Cellular component	cytosol; ubiquitin ligase complex; nucleoplasm; nucleus;
Biological process	histone monoubiquitination; ubiquitin-dependent protein catabolic process; protein polyubiquitination; protein K48-linked ubiquitination; ISG15-protein conjugation; anaphase-promoting complex-dependent catabolic process; histone H2B ubiquitination; protein ubiquitination; regulation of mitotic cell cycle phase transition;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	7324
	22194
	ENSG00000170142
	ENSMUSG00000021774
	P51965
	P52482
	НМ_001202476 ; НМ_003341 ; НМ_182666
	НМ_009455
	НП_001189405 ; НП_003332 ; НП_872607 ; НП_003332.1
	НП_033481
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Убиквитин-конъюгирующий фермент E2 E1 представляет собой белок , который у человека кодируется UBE2E1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Модификация белков убиквитином является важным клеточным механизмом направленной деградации аномальных или короткоживущих белков. В убиквитинировании участвуют как минимум три класса ферментов: ферменты, активирующие убиквитин, или E1, ферменты, конъюгирующие убиквитин, или E2, и убиквитин-белковые лигазы, или E3. Этот ген кодирует члена семейства ферментов, конъюгирующих убиквитин Е2. Для этого гена были обнаружены два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что UBE2E1 взаимодействует с атаксином 1. ^{[ 7 ]} и NEDD4 . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000170142 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021774 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нубер У, Шварц С., Кайзер П., Шнайдер Р., Шеффнер М. (март 1996 г.). «Клонирование человеческих убиквитин-конъюгирующих ферментов UbcH6 и UbcH7 (E2-F1) и характеристика их взаимодействия с E6-AP и RSP5» . Ж. Биол. Хим . 271 (5): 2795–800. дои : 10.1074/jbc.271.5.2795 . ПМИД 8576257 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: UBE2E1, конъюгирующий убиквитин, фермент E2E 1 (гомолог UBC4/5, дрожжи)» .
^ Хонг С., Ли С., Чо С.Г., Кан С. (июнь 2008 г.). «UbcH6 взаимодействует с продуктом гена SCA1 атаксином-1 и убиквитинирует его». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 371 (2): 256–60. дои : 10.1016/j.bbrc.2008.04.066 . ПМИД 18439907 .
^ Анан Т, Нагата Ю, Кога Х, Хонда Ю, Ябуки Н, Миямото С, Кувано А, Мацуда И, Эндо Ф, Сая Х, Накао М (ноябрь 1998 г.). «Человеческая убиквитин-белковая лигаза Nedd4: экспрессия, субклеточная локализация и избирательное взаимодействие с убиквитин-конъюгирующими ферментами». Генные клетки . 3 (11): 751–63. дои : 10.1046/j.1365-2443.1998.00227.x . ПМИД 9990509 . S2CID 1653536 .
^ Малахова О.А., Чжан ДЭ (апрель 2008 г.). «ISG15 ингибирует активность убиквитина E3 Nedd4 и усиливает врожденный противовирусный ответ» . Ж. Биол. Хим . 283 (14): 8783–7. дои : 10.1074/jbc.C800030200 . ПМК 2276364 . ПМИД 18287095 .

Дальнейшее чтение

Пиккарт CM (2001). «Механизмы, лежащие в основе убиквитинирования». Анну. Преподобный Биохим . 70 : 503–33. doi : 10.1146/annurev.biochem.70.1.503 . ПМИД 11395416 .
Чен П., Джонсон П., Соммер Т., Йентш С., Хохштрассер М. (1993). «Множество ферментов, конъюгирующих убиквитин, участвуют в деградации in vivo дрожжевого репрессора MAT альфа 2». Клетка . 74 (2): 357–69. дои : 10.1016/0092-8674(93)90426-Q . ПМИД 8393731 . S2CID 205020910 .
Анан Т., Нагата Ю., Кога Х., Хонда Ю., Ябуки Н., Миямото С., Кувано А., Мацуда И., Эндо Ф., Сая Х., Накао М. (1998). «Человеческая убиквитин-белковая лигаза Nedd4: экспрессия, субклеточная локализация и избирательное взаимодействие с убиквитин-конъюгирующими ферментами». Генные клетки . 3 (11): 751–63. дои : 10.1046/j.1365-2443.1998.00227.x . ПМИД 9990509 . S2CID 1653536 .
Найман Т.А., Матикайнен С., Саренева Т., Юлкунен И., Калккинен Н. (2000). «Анализ протеома показывает, что убиквитин-конъюгирующие ферменты представляют собой новое семейство генов, регулируемых интерфероном-альфа» . Евро. Дж. Биохим . 267 (13): 4011–9. дои : 10.1046/j.1432-1327.2000.01433.x . PMID 10866800 .
Ленк У, Соммер Т (2000). «Убиквитин-опосредованный протеолиз короткоживущего регуляторного белка зависит от его клеточной локализации» . Ж. Биол. Хим . 275 (50): 39403–10. дои : 10.1074/jbc.M006949200 . ПМИД 10991948 .
Принга Э., Мартинес-Ноэль Г., Мюллер У., Харберс К. (2001). «Взаимодействие U-бокс-мотива белка ядерной точки, связанного с безымянным пальцем, с ферментами, конъюгирующими убиквитин» . Ж. Биол. Хим . 276 (22): 19617–23. дои : 10.1074/jbc.M100192200 . ПМИД 11274149 .
Ито К., Адачи С., Иваками Р., Ясуда Х., Муто Ю., Секи Н., Окано Ю. (2001). «Удлиненные по N-концу человеческие ферменты, конъюгирующие убиквитин (E2), опосредуют убиквитинирование белков RING-пальца, ARA54 и RNF8» . Евро. Дж. Биохим . 268 (9): 2725–32. дои : 10.1046/j.1432-1327.2001.02169.x . ПМИД 11322894 .
Ленер Б., Семпл Дж.И., Браун С.Е., Адвокат Д., Кэмпбелл Р.Д., Сандерсон К.М. (2004). «Анализ высокопроизводительной дрожжевой двухгибридной системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области человеческого MHC класса III». Геномика . 83 (1): 153–67. дои : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . ПМИД 14667819 .
Такеучи Т., Ивахара С., Саеки Ю., Сасадзима Х., Ёкосава Х. (2005). «Связь между системой конъюгации убиквитина и системой конъюгации ISG15: конъюгация ISG15 с ферментом убиквитина E2 UbcH6». Дж. Биохим . 138 (6): 711–9. дои : 10.1093/jb/mvi172 . ПМИД 16428300 .

Внешние ссылки

PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для человеческого убиквитин-конъюгирующего фермента E2 E1 (UBE2E1).

статья о гене на хромосоме 3 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000170142 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021774 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8576257-5] Нубер У, Шварц С., Кайзер П., Шнайдер Р., Шеффнер М. (март 1996 г.). «Клонирование человеческих убиквитин-конъюгирующих ферментов UbcH6 и UbcH7 (E2-F1) и характеристика их взаимодействия с E6-AP и RSP5» . Ж. Биол. Хим . 271 (5): 2795–800. дои : 10.1074/jbc.271.5.2795 . ПМИД 8576257 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: UBE2E1, конъюгирующий убиквитин, фермент E2E 1 (гомолог UBC4/5, дрожжи)» .

[pmid18439907-7] Хонг С., Ли С., Чо С.Г., Кан С. (июнь 2008 г.). «UbcH6 взаимодействует с продуктом гена SCA1 атаксином-1 и убиквитинирует его». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 371 (2): 256–60. дои : 10.1016/j.bbrc.2008.04.066 . ПМИД 18439907 .

[pmid9990509-8] Анан Т, Нагата Ю, Кога Х, Хонда Ю, Ябуки Н, Миямото С, Кувано А, Мацуда И, Эндо Ф, Сая Х, Накао М (ноябрь 1998 г.). «Человеческая убиквитин-белковая лигаза Nedd4: экспрессия, субклеточная локализация и избирательное взаимодействие с убиквитин-конъюгирующими ферментами». Генные клетки . 3 (11): 751–63. дои : 10.1046/j.1365-2443.1998.00227.x . ПМИД 9990509 . S2CID 1653536 .

[pmid18287095-9] Малахова О.А., Чжан ДЭ (апрель 2008 г.). «ISG15 ингибирует активность убиквитина E3 Nedd4 и усиливает врожденный противовирусный ответ» . Ж. Биол. Хим . 283 (14): 8783–7. дои : 10.1074/jbc.C800030200 . ПМК 2276364 . ПМИД 18287095 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]