BE2Z

BE2Z
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	5A4P
Идентификаторы
Псевдонимы	UBE2Z , USE1, HOYS7, фермент, конъюгирующий убиквитин E2 Z
Внешние идентификаторы	Опустить : 611362 ; МГИ : 1343160 ; Гомологен : 11319 ; Генные карты : UBE2Z ; OMA : UBE2Z — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	48,929,056 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	95,956,214 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	islet of Langerhans; ; stromal cell of endometrium; ; cartilage tissue; ; corpus epididymis; ; mucosa of ileum; ; smooth muscle tissue; ; beta cell; ; granulocyte; ; nipple; ; lymph node;
	Top expressed in
	choroid plexus of fourth ventricle; ; corneal stroma; ; saccule; ; ectoderm; ; otic placode; ; otic vesicle; ; Gonadal ridge; ; somite; ; endocardial cushion; ; lactiferous gland;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	transferase activity; nucleotide binding; protein binding; ATP binding; ubiquitin conjugating enzyme activity; ubiquitin protein ligase binding; ubiquitin protein ligase activity; cysteine-type endopeptidase inhibitor activity;
Cellular component	nucleoplasm; cytoplasm; cytosol; nucleus;
Biological process	apoptotic process; protein ubiquitination; positive regulation of apoptotic process; ubiquitin-dependent protein catabolic process; negative regulation of endopeptidase activity; negative regulation of apoptotic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	65264
	268470
	ENSG00000159202
	ENSMUSG00000014349
	Q9H832
	Q3UE37
	НМ_023079
	НМ_172300
	НП_075567
	НП_758504
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фермент, конъюгирующий убиквитин E2 Z (UBE2Z) , также известный как UBA6-специфичный фермент E2 1 (USE1), представляет собой фермент , который у людей кодируется геном UBE2Z на хромосоме 17 . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Он повсеместно экспрессируется во многих тканях и типах клеток. ^{[ 7 ]} UBE2Z представляет собой фермент, конъюгирующий убиквитин E2 , и участвует во второй стадии убиквитинирования белка во время протеолиза . ^{[ 8 ]} Полногеномное ассоциативное исследование (GWAS) показало, что ген UBE2Z связан с хроническим заболеванием почек . ^{[ 9 ]} Ген UBE2Z также содержит один из 27 SNP , связанных с повышенным риском развития ишемической болезни сердца . ^{[ 10 ]}

Структура

Ген

Ген UBE2Z расположен на хромосоме 17 в участке 17q21.32 и содержит 7 экзонов . ^{[ 5 ]} Этот ген производит 2 изоформы путем альтернативного сплайсинга . ^{[ 11 ]} UBE2Z кДНК имеет длину 3054 пары оснований . ^{[ 12 ]}

Белок

Этот белок принадлежит к семейству ферментов, конъюгирующих убиквитин, и является одним из ферментов Е2. ^{[ 11 ]} UBE2Z включает 246 аминокислот , 150 из которых кодируют консервативный домен E2 убиквитинконъюгирующего фермента массой 16–18 кДа фермента (домен UBC), который расположен на N-конце функцию фермента и отвечает за каталитическую . Этот домен UBC имеет относительно негибкую структуру β-листа с фланкирующими спиралями и содержит высококонсервативный остаток цистеина Cys80, который действует как активный центр для образования сложного тиолового эфира с убиквитином. UBE2Z также содержит C-концевое расширение, которое, как предполагается, участвует в связывании субстрата , что характерно для фермента, конъюгирующего убиквитин E2 класса II. ^{[ 12 ]}

Функция

Ген UBE2Z повсеместно экспрессируется в тканях человека, и его экспрессия относительно высока в плаценте , поджелудочной железе , селезенке и яичках . Примечательно, что его экспрессия в раковых тканях намного выше, чем в соответствующих нормальных тканях, особенно при раке почек, лимфатических узлов, толстой кишки и яичников. ^{[ 12 ]} Будучи членом E2 семейства ферментов, конъюгирующих убиквитин , UBE2Z в основном участвует на втором этапе убиквитинирования белка , который является основным компонентом механизма деградации белка. ^{[ 8 ]} В частности, UBE2Z получает убиквитин (Ub) от фермента, активирующего убиквитин (Е1), опосредует перенос Ub от E2 к субстрату прямо или опосредованно с помощью фермента лигазы (E3), который взаимодействует с субстратом и комплексом E2-Ub. . UBE2Z можно было заряжать только с помощью Ub или FAT10 от UBA6 вместо UBA1, что отличает его от других E2. ^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}

Клиническое значение

Исследование генетических вариантов, которые регулируют липидный обмен и определяют предрасположенность к дислипидемии у японцев, показало, что UBE2Z вместе с ZPR1 и интерлейкином-6R может быть важным локусом гипертриглицеридемии. ^{[ 15 ]} Более того, в ходе GWAS среди 2247 японцев было исследовано 29 полиморфизмов, которые ранее были идентифицированы как чувствительные локусы к ишемической болезни сердца, чтобы выявить корреляцию этих локусов с хроническим заболеванием почек. ^{[ 9 ]} Этот метаанализ GWAS с помощью теста хи-квадрат показал, что rs46522 в гене UBE2Z в значительной степени связан с хроническим заболеванием почек. ^{[ 9 ]}

Клинический маркер

Мультилокусное исследование оценки генетического риска, основанное на комбинации 27 локусов, включая ген UBE2Z, выявило лиц с повышенным риском как возникновения, так и рецидивов ишемической болезни сердца, а также увеличило клиническую пользу от терапии статинами. Исследование было основано на групповом исследовании на уровне сообщества (исследование «Диета Мальмё и рак») и четырех дополнительных рандомизированных контролируемых исследованиях когорт первичной профилактики (JUPITER и ASCOT) и когорт вторичной профилактики (CARE и PROVE IT-TIMI 22). ^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000159202 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000014349 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «UBE2Z убиквитин-конъюгирующий фермент E2 Z [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 10 октября.
^ Биалас Дж., Гроеттруп М., Айхем А. (1 января 2015 г.). «Конъюгация убиквитин-активирующего фермента UBE1 с убиквитиноподобным модификатором FAT10 нацелена на его протеасомную деградацию» . ПЛОС ОДИН . 10 (3): e0120329. Бибкод : 2015PLoSO..1020329B . дои : 10.1371/journal.pone.0120329 . ПМК 4359146 . ПМИД 25768649 .
^ «BioGPS – ваша генная портальная система» . biogps.org . Проверено 10 октября 2016 г.
^ Jump up to: ^а ^б Баарендс В.М., Роест Х.П., Гротегоед Дж.А. (май 1999 г.). «Убиквитиновая система в гаметогенезе». Молекулярная и клеточная эндокринология . 151 (1–2): 5–16. дои : 10.1016/s0303-7207(99)00060-x . ПМИД 10411315 . S2CID 8632308 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Хорибе Х., Фудзимаки Т., Огури М., Като К., Мацуока Р., Абэ С., Токоро Ф., Араи М., Нода Т., Ватанабэ С., Ямада Ю. (апрель 2015 г.). «Связь полиморфизма гена рецептора интерлейкина 6 с хронической болезнью почек у японцев». Нефрология . 20 (4): 273–8. дои : 10.1111/nep.12381 . ПМИД 25524550 . S2CID 11292241 .
^ Jump up to: ^а ^б Мега Дж.Л., Ститциел Н.О., Смит Дж.Г., Чесман Д.И., Колфилд М.Дж., Девлин Дж.Дж., Нордио Ф., Хайд КЛ., Кэннон КП, Сакс Ф.М., Поултер Н.Р., Север П.С., Ридкер П.М., Браунвальд Э., Меландер О., Катиресан С., Сабатин М.С. (июнь 2015 г.). «Генетический риск, события ишемической болезни сердца и клиническая польза терапии статинами: анализ исследований первичной и вторичной профилактики» . Ланцет . 385 (9984): 2264–71. дои : 10.1016/S0140-6736(14)61730-X . ПМЦ 4608367 . ПМИД 25748612 .
^ Jump up to: ^а ^б «UBE2Z - убиквитин-конъюгирующий фермент E2 Z - Homo sapiens (человек) - ген и белок UBE2Z» . ЮниПрот . Получено 10 октября.
^ Jump up to: ^а ^б ^с Гу X, Чжао Ф, Чжэн М, Фэй X, Чэнь X, Хуан С, Се Y, Мао Y (сентябрь 2007 г.). «Клонирование и характеристика гена, кодирующего предполагаемый человеческий фермент, конъюгирующий убиквитин E2Z (UBE2Z)». Отчеты по молекулярной биологии . 34 (3): 183–8. дои : 10.1007/s11033-006-9033-7 . ПМИД 17160626 . S2CID 27210618 .
^ Джин Дж., Ли Икс, Гиги С.П., Харпер Дж.В. (июнь 2007 г.). «Двойные системы активации E1 для убиквитина дифференциально регулируют зарядку фермента E2». Природа . 447 (7148): 1135–8. Бибкод : 2007Natur.447.1135J . дои : 10.1038/nature05902 . ПМИД 17597759 . S2CID 4337767 .
^ Айхем А., Пельцер С., Лукасиак С., Калверам Б., Шеппард П.В., Рани Н., Шмидтке Г., Гроеттруп М. (4 мая 2010 г.). «USE1 представляет собой биспецифический фермент, конъюгирующий убиквитин и FAT10, который FAT10 илирует себя в цис-конъюгате» . Природные коммуникации . 1 (2): 13. Бибкод : 2010NatCo...1...13A . дои : 10.1038/ncomms1012 . ПМИД 20975683 .
^ Абэ С., Токоро Ф., Мацуока Р., Араи М., Нода Т., Ватанабэ С., Хорибэ Х., Фудзимаки Т., Огури М., Като К., Минатогути С., Ямада Ю. (октябрь 2015 г.). «Ассоциация генетических вариантов с дислипидемией» . Отчеты о молекулярной медицине . 12 (4): 5429–36. дои : 10.3892/ммр.2015.4081 . ПМИД 26238946 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000159202 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000014349 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[:0-5] Jump up to: ^а ^б «UBE2Z убиквитин-конъюгирующий фермент E2 Z [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 10 октября.

[6] Биалас Дж., Гроеттруп М., Айхем А. (1 января 2015 г.). «Конъюгация убиквитин-активирующего фермента UBE1 с убиквитиноподобным модификатором FAT10 нацелена на его протеасомную деградацию» . ПЛОС ОДИН . 10 (3): e0120329. Бибкод : 2015PLoSO..1020329B . дои : 10.1371/journal.pone.0120329 . ПМК 4359146 . ПМИД 25768649 .

[7] «BioGPS – ваша генная портальная система» . biogps.org . Проверено 10 октября 2016 г.

[pmid10411315-8] Jump up to: ^а ^б Баарендс В.М., Роест Х.П., Гротегоед Дж.А. (май 1999 г.). «Убиквитиновая система в гаметогенезе». Молекулярная и клеточная эндокринология . 151 (1–2): 5–16. дои : 10.1016/s0303-7207(99)00060-x . ПМИД 10411315 . S2CID 8632308 .

[Horibe_2015-9] Jump up to: ^а ^б ^с Хорибе Х., Фудзимаки Т., Огури М., Като К., Мацуока Р., Абэ С., Токоро Ф., Араи М., Нода Т., Ватанабэ С., Ямада Ю. (апрель 2015 г.). «Связь полиморфизма гена рецептора интерлейкина 6 с хронической болезнью почек у японцев». Нефрология . 20 (4): 273–8. дои : 10.1111/nep.12381 . ПМИД 25524550 . S2CID 11292241 .

[ReferenceA-10] Jump up to: ^а ^б Мега Дж.Л., Ститциел Н.О., Смит Дж.Г., Чесман Д.И., Колфилд М.Дж., Девлин Дж.Дж., Нордио Ф., Хайд КЛ., Кэннон КП, Сакс Ф.М., Поултер Н.Р., Север П.С., Ридкер П.М., Браунвальд Э., Меландер О., Катиресан С., Сабатин М.С. (июнь 2015 г.). «Генетический риск, события ишемической болезни сердца и клиническая польза терапии статинами: анализ исследований первичной и вторичной профилактики» . Ланцет . 385 (9984): 2264–71. дои : 10.1016/S0140-6736(14)61730-X . ПМЦ 4608367 . ПМИД 25748612 .

[UniProt-11] Jump up to: ^а ^б «UBE2Z - убиквитин-конъюгирующий фермент E2 Z - Homo sapiens (человек) - ген и белок UBE2Z» . ЮниПрот . Получено 10 октября.

[Gu_2007-12] Jump up to: ^а ^б ^с Гу X, Чжао Ф, Чжэн М, Фэй X, Чэнь X, Хуан С, Се Y, Мао Y (сентябрь 2007 г.). «Клонирование и характеристика гена, кодирующего предполагаемый человеческий фермент, конъюгирующий убиквитин E2Z (UBE2Z)». Отчеты по молекулярной биологии . 34 (3): 183–8. дои : 10.1007/s11033-006-9033-7 . ПМИД 17160626 . S2CID 27210618 .

[pmid17597759-13] Джин Дж., Ли Икс, Гиги С.П., Харпер Дж.В. (июнь 2007 г.). «Двойные системы активации E1 для убиквитина дифференциально регулируют зарядку фермента E2». Природа . 447 (7148): 1135–8. Бибкод : 2007Natur.447.1135J . дои : 10.1038/nature05902 . ПМИД 17597759 . S2CID 4337767 .

[pmid20975683-14] Айхем А., Пельцер С., Лукасиак С., Калверам Б., Шеппард П.В., Рани Н., Шмидтке Г., Гроеттруп М. (4 мая 2010 г.). «USE1 представляет собой биспецифический фермент, конъюгирующий убиквитин и FAT10, который FAT10 илирует себя в цис-конъюгате» . Природные коммуникации . 1 (2): 13. Бибкод : 2010NatCo...1...13A . дои : 10.1038/ncomms1012 . ПМИД 20975683 .

[15] Абэ С., Токоро Ф., Мацуока Р., Араи М., Нода Т., Ватанабэ С., Хорибэ Х., Фудзимаки Т., Огури М., Като К., Минатогути С., Ямада Ю. (октябрь 2015 г.). «Ассоциация генетических вариантов с дислипидемией» . Отчеты о молекулярной медицине . 12 (4): 5429–36. дои : 10.3892/ммр.2015.4081 . ПМИД 26238946 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]