BE2D3

BE2D3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1X23, 2FUH, 3L1Z, 3RPG, 3UGB, 4BVU, 4R8P, 4S3O, 5IFR
Идентификаторы
Псевдонимы	UBE2D3 , E2(17)KB3, UBC4/5, UBCH5C, фермент, конъюгирующий убиквитин E2 D3
Внешние идентификаторы	Опустить : 602963 ; МГИ : 1913355 ; Гомологен : 123914 ; Генные карты : UBE2D3 ; OMA : UBE2D3 — ортологи
Номер ЕС	2.3.2.24
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 4 (human)
End	102,868,896 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	135,468,198 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; sperm; ; Achilles tendon; ; monocyte; ; buccal mucosa cell; ; blood; ; cartilage tissue; ; islet of Langerhans; ; appendix; ; right lung;
	Top expressed in
	genital tubercle; ; seminiferous tubule; ; tail of embryo; ; zygote; ; somite; ; secondary oocyte; ; dermis; ; molar; ; skin of external ear; ; abdominal wall;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	transferase activity; nucleotide binding; protein binding; ATP binding; ubiquitin conjugating enzyme activity; ubiquitin-protein transferase activity;
Cellular component	cytosol; endosome; membrane; plasma membrane; nucleoplasm; endosome membrane; extracellular exosome;
Biological process	positive regulation of protein targeting to mitochondrion; protein polyubiquitination; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; protein monoubiquitination; BMP signaling pathway; cellular response to DNA damage stimulus; protein K11-linked ubiquitination; TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway; protein K48-linked ubiquitination; regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia; DNA repair; protein autoubiquitination; apoptotic process; protein ubiquitination; ubiquitin-dependent protein catabolic process; proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7323
	66105
	ENSG00000109332
	ENSMUSG00000078578
	P61077
	P61079
showНМ_001300795 ; НМ_003340 ; НМ_181886 ; НМ_181887 ; НМ_181888 ;
	NM_181889; NM_181890; NM_181891; NM_181892; NM_181893
	НМ_025356
showНП_001287724 ; НП_003331 ; НП_871615 ; НП_871616 ; НП_871617 ;
	NP_871618; NP_871619; NP_871620; NP_871621; NP_871622
showНП_079632 ; НП_001343523 ; НП_001343524 ; НП_001343525 ; НП_001343526 ;
	NP_001343527
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Убиквитин-конъюгирующий фермент E2 D3 представляет собой белок , который у человека кодируется UBE2D3 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Модификация белков убиквитином является важным клеточным механизмом направленной деградации аномальных или короткоживущих белков. В убиквитинировании участвуют по крайней мере три класса ферментов: ферменты, активирующие убиквитин, или E1, ферменты, конъюгирующие убиквитин, или E2, и убиквитин-белковые лигазы, или E3. Этот ген кодирует члена семейства ферментов, конъюгирующих убиквитин Е2. Этот фермент участвует в убиквитинировании белка-супрессора опухолей p53, который индуцируется убиквитин-белковой лигазой E3. Для этого гена было обнаружено множество вариантов сплайсированного транскрипта, но полноразмерная природа некоторых вариантов не определена. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что UBE2D3 взаимодействует с NEDD4 . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000109332 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000078578 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Дженсен Дж.П., Бейтс П.В., Ян М., Виерстра Р.Д., Вайсман А.М. (декабрь 1995 г.). «Идентификация семейства близкородственных ферментов, конъюгирующих убиквитин человека» . Журнал биологической химии . 270 (51): 30408–14. дои : 10.1074/jbc.270.51.30408 . ПМИД 8530467 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: убиквитин-конъюгирующий фермент E2D 3 UBE2D3 (гомолог UBC4/5, дрожжи)» .
^ Анан Т., Нагата Ю., Кога Х., Хонда Ю., Ябуки Н., Миямото С., Кувано А., Мацуда И., Эндо Ф., Сая Х., Накао М. (ноябрь 1998 г.). «Человеческая убиквитин-белковая лигаза Nedd4: экспрессия, субклеточная локализация и избирательное взаимодействие с убиквитин-конъюгирующими ферментами». Гены в клетки . 3 (11): 751–63. дои : 10.1046/j.1365-2443.1998.00227.x . ПМИД 9990509 . S2CID 1653536 .
^ Ван X, Ши Ю, Ван Дж, Хуан Г, Цзян Икс (сентябрь 2008 г.). «Решающая роль С-конца PTEN в противодействии NEDD4-1-опосредованному убиквитинированию и деградации PTEN». Биохимический журнал . 414 (2): 221–9. дои : 10.1042/BJ20080674 . ПМИД 18498243 .

Дальнейшее чтение

Шеффнер М., Хуибрегце Дж. М., Хоули П. М. (сентябрь 1994 г.). «Идентификация человеческого убиквитин-конъюгирующего фермента, который опосредует E6-AP-зависимое убиквитинирование р53» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (19): 8797–801. Бибкод : 1994PNAS...91.8797S . дои : 10.1073/pnas.91.19.8797 . ПМК 44693 . ПМИД 8090726 .
Рогаков Е.П., Пильч Д.Р., Орр А.Х., Иванова В.С., Боннер В.М. (март 1998 г.). «Двухцепочечные разрывы ДНК индуцируют фосфорилирование гистона H2AX по серину 139» . Журнал биологической химии . 273 (10): 5858–68. дои : 10.1074/jbc.273.10.5858 . ПМИД 9488723 .
Анан Т., Нагата Ю., Кога Х., Хонда Ю., Ябуки Н., Миямото С., Кувано А., Мацуда И., Эндо Ф., Сая Х., Накао М. (ноябрь 1998 г.). «Человеческая убиквитин-белковая лигаза Nedd4: экспрессия, субклеточная локализация и избирательное взаимодействие с убиквитин-конъюгирующими ферментами». Гены в клетки . 3 (11): 751–63. дои : 10.1046/j.1365-2443.1998.00227.x . ПМИД 9990509 . S2CID 1653536 .
Гонен Х., Беркович Б., Ориан А., Каррано А., Такизава С., Яманака К., Пагано М., Иваи К., Чехановер А. (май 1999 г.). «Идентификация белков-переносчиков убиквитина, E2, участвующих в сигнально-индуцированной конъюгации и последующей деградации IkappaBalpha» . Журнал биологической химии . 274 (21): 14823–30. дои : 10.1074/jbc.274.21.14823 . ПМИД 10329681 .
Ориан А., Гонен Х., Беркович Б., Фаджерман И., Эйтан Э., Исраэль А., Меркурио Ф., Иваи К., Шварц А.Л., Чехановер А. (июнь 2000 г.). «Опосредованная SCF(beta)(-TrCP) убиквитинлигазой обработка NF-kappaB p105 требует фосфорилирования его C-конца киназой IkappaB» . Журнал ЭМБО . 19 (11): 2580–91. дои : 10.1093/emboj/19.11.2580 . ПМК 212749 . ПМИД 10835356 .
Коулман К.С., Пегг А.Е. (август 2001 г.). «Аналоги полиаминов ингибируют убиквитинирование спермидин/спермин-N1-ацетилтрансферазы и предотвращают ее нацеливание на протеасому для деградации» . Биохимический журнал . 358 (Часть 1): 137–45. дои : 10.1042/0264-6021:3580137 . ПМК 1222041 . ПМИД 11485561 .
Чен А., Клейман Ф.Е., Мэнли Дж.Л., Оучи Т., Пан ZQ (июнь 2002 г.). «Аутоубиквитинирование убиквитинлигазы BRCA1*BARD1 RING» . Журнал биологической химии . 277 (24): 22085–92. дои : 10.1074/jbc.M201252200 . ПМИД 11927591 .
Обин М., Ли БАЙ, Мейнке Г., Бом А., Ли Р.Х., Годе Р., Хопп Дж.А., Аршавский В.Ю., Уиллардсон Б.М., Тейлор А. (ноябрь 2002 г.). «Убиквитилирование комплекса субъединиц бетагамма трансдуцина. Регулирование фосдуцином» . Журнал биологической химии . 277 (46): 44566–75. дои : 10.1074/jbc.M205308200 . ПМИД 12215439 .
Такеяма К., Агиар Р.К., Гу Л., Хе С., Фриман Г.Дж., Куток Дж.Л., Астер Дж.К., Шипп М.А. (июнь 2003 г.). «БАЛ-связывающий белок BBAP и родственные ему члены семейства Deltex проявляют активность изопептид-лигазы убиквитин-белок» . Журнал биологической химии . 278 (24): 21930–7. дои : 10.1074/jbc.M301157200 . ПМИД 12670957 .
Бржович П.С., Киф Дж.Р., Нисикава Х., Миямото К., Фокс Д., Фукуда М., Охта Т., Клевит Р. (май 2003 г.). «Связывание и распознавание при сборке активного комплекса убиквитин-лигазы BRCA1/BARD1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (10): 5646–51. Бибкод : 2003PNAS..100.5646B . дои : 10.1073/pnas.0836054100 . ПМК 156255 . ПМИД 12732733 .
Тан Э.Д., Ван С.И., Сюн Ю., Гуань К.Л. (сентябрь 2003 г.). «Роль существенного модификатора NF-kappaB/убиквитинирования киназы-гамма IkappaB (NEMO/IKKgamma) в активации киназного комплекса IkappaB фактором-альфа некроза опухоли» . Журнал биологической химии . 278 (39): 37297–305. дои : 10.1074/jbc.M303389200 . ПМИД 12867425 .
Субраманиам В., Ли Х., Вонг М., Китчинг Р., Аттисано Л., Врана Дж., Зубовиц Дж., Бургер А.М., Сет А. (октябрь 2003 г.). «Белок RING-H2 RNF11 сверхэкспрессируется при раке молочной железы и является мишенью лигазы E3 Smurf2» . Британский журнал рака . 89 (8): 1538–44. дои : 10.1038/sj.bjc.6601301 . ПМК 2394340 . ПМИД 14562029 .
Ленер Б., Семпл Дж.И., Браун С.Э., Адвокат Д., Кэмпбелл Р.Д., Сандерсон К.М. (январь 2004 г.). «Анализ высокопроизводительной дрожжевой двухгибридной системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика . 83 (1): 153–67. дои : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . ПМИД 14667819 .
Сэвилл М.К., Спаркс А., Ксиродимас Д.П., Уордроп Дж., Стивенсон Л.Ф., Бурдон Дж.К., Вудс Ю.Л., Лейн Д.П. (октябрь 2004 г.). «Регуляция р53 с помощью убиквитин-конъюгирующих ферментов UbcH5B/C in vivo» . Журнал биологической химии . 279 (40): 42169–81. дои : 10.1074/jbc.M403362200 . ПМИД 15280377 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Ю, Ота Т, Нисикава Т, Ямашита Р, Ямамото Дж, Секинэ М, Цуритани К, Вакагури Х, Исии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ириэ Р, Кушида Н, Ёнеяма Т , Оцука Р, Канда К, Ёкой Т, Кондо Х, Вагацума М, Муракава К, Исида С, Исибаши Т, Такахаси-Фудзи А, Танасе Т, Нагай К, Кикучи Х, Накаи К, Исогай Т, Сугано С (январь 2006 г.) : Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» 16 / . ( 55–65 doi « 10.1101 . PMC 1356129 . . gr.4039406 1) :

Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000109332 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000078578 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8530467-5] Дженсен Дж.П., Бейтс П.В., Ян М., Виерстра Р.Д., Вайсман А.М. (декабрь 1995 г.). «Идентификация семейства близкородственных ферментов, конъюгирующих убиквитин человека» . Журнал биологической химии . 270 (51): 30408–14. дои : 10.1074/jbc.270.51.30408 . ПМИД 8530467 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: убиквитин-конъюгирующий фермент E2D 3 UBE2D3 (гомолог UBC4/5, дрожжи)» .

[pmid9990509-7] Анан Т., Нагата Ю., Кога Х., Хонда Ю., Ябуки Н., Миямото С., Кувано А., Мацуда И., Эндо Ф., Сая Х., Накао М. (ноябрь 1998 г.). «Человеческая убиквитин-белковая лигаза Nedd4: экспрессия, субклеточная локализация и избирательное взаимодействие с убиквитин-конъюгирующими ферментами». Гены в клетки . 3 (11): 751–63. дои : 10.1046/j.1365-2443.1998.00227.x . ПМИД 9990509 . S2CID 1653536 .

[pmid18498243-8] Ван X, Ши Ю, Ван Дж, Хуан Г, Цзян Икс (сентябрь 2008 г.). «Решающая роль С-конца PTEN в противодействии NEDD4-1-опосредованному убиквитинированию и деградации PTEN». Биохимический журнал . 414 (2): 221–9. дои : 10.1042/BJ20080674 . ПМИД 18498243 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]