ФАНКЛ

ФАНКЛ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3ZQS, 4CCG
Идентификаторы
Псевдонимы	FANCL , FAAP43, PHF9, POG, группа комплементации анемии Фанкони L, группа комплементации FA L
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 608111 ; МГИ : 1914280 ; Гомологен : 9987 ; GeneCards : FANCL ; ОМА : FANCL — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	58,241,410 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	26,421,876 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	pituitary gland; ; anterior pituitary; ; Achilles tendon; ; right adrenal cortex; ; corpus callosum; ; left adrenal cortex; ; C1 segment; ; tibia; ; secondary oocyte; ; right uterine tube;
	Top expressed in
	Paneth cell; ; primitive streak; ; abdominal wall; ; mandibular prominence; ; fetal liver hematopoietic progenitor cell; ; epiblast; ; endocardial cushion; ; maxillary prominence; ; interventricular septum; ; fossa;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	ubiquitin-protein transferase activity; protein binding; metal ion binding; ubiquitin protein ligase binding; ubiquitin protein ligase activity; transferase activity;
Cellular component	cytoplasm; nucleus; nuclear envelope; Fanconi anaemia nuclear complex; nucleoplasm; nuclear body; intracellular membrane-bounded organelle;
Biological process	protein ubiquitination; gamete generation; regulation of cell population proliferation; interstrand cross-link repair; protein monoubiquitination; cellular response to DNA damage stimulus; DNA repair;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	55120
	67030
	ENSG00000115392
	ENSMUSG00000004018
	Q9NW38
	Q9CR14
	НМ_001114636 ; НМ_018062 ; НМ_001374615
	НМ_001277273 ; НМ_025923
	НП_001108108 ; НП_060532 ; НП_001361544
	НП_001264202 ; НП_080199
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Убиквитин-белковая лигаза Е3 FANCL представляет собой фермент , который у человека кодируется FANCL геном . ^{[ 5 ]}

Функция

Клинический фенотип мутационных дефектов во всех группах комплементации анемии Фанкони (FA) аналогичен. Этот фенотип характеризуется прогрессирующей недостаточностью костного мозга, предрасположенностью к раку и типичными врожденными дефектами. ^{[ 13 ]} Основным клеточным фенотипом является гиперчувствительность к повреждениям ДНК, особенно к межцепочечным сшивкам ДНК . ^{[ 14 ]} Белки FA взаимодействуют по мультибелковому пути. Межнитевые сшивки ДНК представляют собой весьма вредные повреждения, которые устраняются путем гомологичной рекомбинации, включающей координацию белков FA и гена предрасположенности к раку молочной железы 1 ( BRCA1 ) .

Путь восстановления ДНК при анемии Фанкони (FA) важен для распознавания и восстановления межцепочечных сшивок ДНК (ICL). Критическим этапом на этом пути является моноубиквитинирование FANCD2 с помощью лигазы RING E3 FANCL. FANCL состоит из 3 доменов: домена RING , который взаимодействует с ферментами, конъюгирующими E2 , центрального домена, необходимого для взаимодействия с субстратом, и домена N-концевой E2-подобной складки (ELF), который взаимодействует с FANCB . ^{[ 15 ]} Домен ELF FANCL также необходим для обеспечения нековалентного взаимодействия. между FANCL и убиквитином . Домен ELF необходим для содействия эффективному моноубиквитинированию FANCD2, индуцированному повреждением ДНК, в клетках позвоночных, что указывает на важную функцию FANCB и связывания убиквитина с помощью FANCL in vivo. ^{[ 16 ]}

Ядерный комплекс, содержащий FANCL (а также FANCA , FANCB , FANCC , FANCE , FANCF , FANCG и FANCM ), необходим для активации белка FANCD2 до моноубиквитинированной изоформы. ^{[ 6 ]} В нормальных, немутантных клетках FANCD2 моноубиквинируется в ответ на повреждение ДНК. Активированный белок FANCD2 локализуется совместно с BRCA1 (белком предрасположенности к раку молочной железы) в , индуцированных ионизирующим излучением , и в синаптонемных комплексах мейотических очагах хромосом (см. Рисунок: Рекомбинационная репарация двухцепочечных повреждений).

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000115392 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004018 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтрез: FANCL анемия Фанкони, группа комплементации L» .
^ Перейти обратно: ^а ^б Д'Андреа А.Д. (2010). «Пути восприимчивости при анемии Фанкони и раке молочной железы» . Н. англ. Дж. Мед . 362 (20): 1909–19. дои : 10.1056/NEJMra0809889 . ПМК 3069698 . ПМИД 20484397 .
^ Собек А., Стоун С., Ландэ И., де Грааф Б., Хоатлин М.Э. (2009). «Белок анемии Фанкони FANCM контролируется FANCD2 и путями ATR/ATM» . Ж. Биол. Хим . 284 (38): 25560–8. дои : 10.1074/jbc.M109.007690 . ПМЦ 2757957 . ПМИД 19633289 .
^ Кастильо П., Больоло М., Сюрраллес Дж. (2011). «Координированное действие путей анемии Фанкони и атаксии-телеангиэктазии в ответ на окислительное повреждение». Восстановление ДНК (Амст.) . 10 (5): 518–25. дои : 10.1016/j.dnarep.2011.02.007 . ПМИД 21466974 .
^ Штольц А., Эртыч Н., Бастианс Х (2011). «Опухолевый супрессор CHK2: регулятор реакции на повреждение ДНК и медиатор хромосомной стабильности» . Клин. Рак Рез . 17 (3): 401–5. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-10-1215 . ПМИД 21088254 .
^ Танигучи Т., Гарсия-Игера И., Андреассен П.Р., Грегори Р.К., Громпе М., Д'Андреа А.Д. (2002). «Специфическое для S-фазы взаимодействие белка анемии Фанкони, FANCD2, с BRCA1 и RAD51» . Кровь . 100 (7): 2414–20. дои : 10.1182/кровь-2002-01-0278 . ПМИД 12239151 .
^ Пак JY, Чжан Ф, Андреассен PR (2014). «PALB2: центр сети супрессоров опухолей, участвующих в реакциях на повреждение ДНК» . Биохим. Биофиз. Акта . 1846 (1): 263–75. дои : 10.1016/j.bbcan.2014.06.003 . ПМЦ 4183126 . ПМИД 24998779 .
^ Чун Дж., Бючелмайер Э.С., Пауэлл С.Н. (2013). «Паралоговые комплексы Rad51 BCDX2 и CX3 действуют на разных стадиях BRCA1-BRCA2-зависимого пути гомологичной рекомбинации» . Мол. Клетка. Биол . 33 (2): 387–95. дои : 10.1128/MCB.00465-12 . ПМЦ 3554112 . ПМИД 23149936 .
^ Уолден, Хелен; Динс, Эндрю Дж. (2014). «Путь восстановления ДНК анемии Фанкони: структурное и функциональное понимание сложного расстройства». Ежегодный обзор биофизики . 43 : 257–278. doi : 10.1146/annurev-biophys-051013-022737 . ISSN 1936-1238 . ПМИД 24773018 .
^ Динс, Эндрю Дж.; Уэст, Стивен К. (24 июня 2011 г.). «Восстановление межцепочечных сшивок ДНК и рак» . Обзоры природы. Рак . 11 (7): 467–480. дои : 10.1038/nrc3088 . ISSN 1474-1768 . ПМК 3560328 . ПМИД 21701511 .
^ ван Твест, Сильви; Мерфи, Винсент Дж.; Ходсон, Шарлотта; Тан, Винни; Свуец, Паоло; О'Рурк, Жюльен Дж.; Хейерхорст, Йорг; Крисмани, Уэйн; Динс, Эндрю Дж. (19 января 2017 г.). «Механизм убиквитинирования и деубиквитинирования в пути анемии Фанкони» . Молекулярная клетка . 65 (2): 247–259. дои : 10.1016/j.molcel.2016.11.005 . hdl : 2434/618936 . ISSN 1097-4164 . ПМИД 27986371 .
^ Майлз Дж.А., Фрост М.Г., Кэрролл Э., Роу М.Л., Ховард М.Дж., Сидху А., Чаугул В.К., Альпи А.Ф., Уолден Х (2015). «Путь восстановления ДНК анемии Фанкони регулируется взаимодействием между убиквитином и E2-подобным складчатым доменом FANCL» . Ж. Биол. Хим . 290 (34): 20995–1006. дои : 10.1074/jbc.M115.675835 . ПМЦ 4543658 . ПМИД 26149689 .

Дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Сузуки И., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Агульник А.И., Лу Б, Чжу Ц и др. (2003). «Новый ген Pog необходим для пролиферации первичных зародышевых клеток у мышей и лежит в основе мутации дефицита зародышевых клеток, gcd» . Хм. Мол. Жене . 11 (24): 3047–53. дои : 10.1093/hmg/11.24.3047 . ПМИД 12417526 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Лу Б, епископ CE (2003). «Мышиные GGN1 и GGN3, два специфичных для зародышевых клеток белка из одного гена Ggn, взаимодействуют с мышиным POG и играют роль в сперматогенезе» . Ж. Биол. Хим . 278 (18): 16289–96. дои : 10.1074/jbc.M211023200 . ПМИД 12574169 .
Лу Б, епископ CE (2004). «Позднее начало сперматогенеза и повышение фертильности у мышей с дефицитом POG указывают на то, что POG не необходим для пролиферации сперматогониев» . Биол. Репродукция . 69 (1): 161–8. дои : 10.1095/biolreprod.102.014654 . ПМИД 12606378 .
Митей А.Р., Сечи С., Валлиш М. и др. (2003). «Мультипротеиновый ядерный комплекс соединяет анемию Фанкони и синдром Блума» . Мол. Клетка. Биол . 23 (10): 3417–26. дои : 10.1128/MCB.23.10.3417-3426.2003 . ПМЦ 164758 . ПМИД 12724401 .
Митей А.Р., де Винтер Дж.П., Медхерст А.Л. и др. (2003). «Новая убиквитинлигаза недостаточна при анемии Фанкони». Нат. Жене . 35 (2): 165–70. дои : 10.1038/ng1241 . ПМИД 12973351 . S2CID 10149290 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Митей А.Р., Левитус М., Сюэ Ю. и др. (2004). «Х-сцепленное наследование группы B комплементации анемии Фанкони» . Нат. Жене . 36 (11): 1219–24. дои : 10.1038/ng1458 . ПМИД 15502827 .
Хиллер Л.В., Грейвс Т.А., Фултон Р.С. и др. (2005). «Генерация и аннотация последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека» . Природа . 434 (7034): 724–31. Бибкод : 2005Natur.434..724H . дои : 10.1038/nature03466 . ПМИД 15815621 .
Митей А.Р., Медхерст А.Л., Линг С. и др. (2005). «Человеческий ортолог белка восстановления ДНК архей Hef дефектен в группе M комплементации анемии Фанкони» . Нат. Жене . 37 (9): 958–63. дои : 10.1038/ng1626 . ПМК 2704909 . ПМИД 16116422 .
Гуртан А.М., Штукерт П., Д'Андреа А.Д. (2006). «Повторы WD40 FANCL необходимы для сборки основного комплекса анемии Фанкони» . Ж. Биол. Хим . 281 (16): 10896–905. дои : 10.1074/jbc.M511411200 . ПМИД 16474167 .
Чжан Дж., Ван Х., Линь С.Дж. и др. (2007). «Измененная экспрессия FANCL придает чувствительность к митомицину C в клетках рака легких Calu-6» . Рак Биол. Там . 5 (12): 1632–6. дои : 10.4161/cbt.5.12.3351 . ПМИД 17106252 .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000115392 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004018 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Энтрез: FANCL анемия Фанкони, группа комплементации L» .

[Andrea-6] Перейти обратно: ^а ^б Д'Андреа А.Д. (2010). «Пути восприимчивости при анемии Фанкони и раке молочной железы» . Н. англ. Дж. Мед . 362 (20): 1909–19. дои : 10.1056/NEJMra0809889 . ПМК 3069698 . ПМИД 20484397 .

[pmid19633289-7] Собек А., Стоун С., Ландэ И., де Грааф Б., Хоатлин М.Э. (2009). «Белок анемии Фанкони FANCM контролируется FANCD2 и путями ATR/ATM» . Ж. Биол. Хим . 284 (38): 25560–8. дои : 10.1074/jbc.M109.007690 . ПМЦ 2757957 . ПМИД 19633289 .

[Castillo-8] Кастильо П., Больоло М., Сюрраллес Дж. (2011). «Координированное действие путей анемии Фанкони и атаксии-телеангиэктазии в ответ на окислительное повреждение». Восстановление ДНК (Амст.) . 10 (5): 518–25. дои : 10.1016/j.dnarep.2011.02.007 . ПМИД 21466974 .

[pmid21088254-9] Штольц А., Эртыч Н., Бастианс Х (2011). «Опухолевый супрессор CHK2: регулятор реакции на повреждение ДНК и медиатор хромосомной стабильности» . Клин. Рак Рез . 17 (3): 401–5. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-10-1215 . ПМИД 21088254 .

[pmid12239151-10] Танигучи Т., Гарсия-Игера И., Андреассен П.Р., Грегори Р.К., Громпе М., Д'Андреа А.Д. (2002). «Специфическое для S-фазы взаимодействие белка анемии Фанкони, FANCD2, с BRCA1 и RAD51» . Кровь . 100 (7): 2414–20. дои : 10.1182/кровь-2002-01-0278 . ПМИД 12239151 .

[pmid24998779-11] Пак JY, Чжан Ф, Андреассен PR (2014). «PALB2: центр сети супрессоров опухолей, участвующих в реакциях на повреждение ДНК» . Биохим. Биофиз. Акта . 1846 (1): 263–75. дои : 10.1016/j.bbcan.2014.06.003 . ПМЦ 4183126 . ПМИД 24998779 .

[Chun-12] Чун Дж., Бючелмайер Э.С., Пауэлл С.Н. (2013). «Паралоговые комплексы Rad51 BCDX2 и CX3 действуют на разных стадиях BRCA1-BRCA2-зависимого пути гомологичной рекомбинации» . Мол. Клетка. Биол . 33 (2): 387–95. дои : 10.1128/MCB.00465-12 . ПМЦ 3554112 . ПМИД 23149936 .

[13] Уолден, Хелен; Динс, Эндрю Дж. (2014). «Путь восстановления ДНК анемии Фанкони: структурное и функциональное понимание сложного расстройства». Ежегодный обзор биофизики . 43 : 257–278. doi : 10.1146/annurev-biophys-051013-022737 . ISSN 1936-1238 . ПМИД 24773018 .

[14] Динс, Эндрю Дж.; Уэст, Стивен К. (24 июня 2011 г.). «Восстановление межцепочечных сшивок ДНК и рак» . Обзоры природы. Рак . 11 (7): 467–480. дои : 10.1038/nrc3088 . ISSN 1474-1768 . ПМК 3560328 . ПМИД 21701511 .

[15] ван Твест, Сильви; Мерфи, Винсент Дж.; Ходсон, Шарлотта; Тан, Винни; Свуец, Паоло; О'Рурк, Жюльен Дж.; Хейерхорст, Йорг; Крисмани, Уэйн; Динс, Эндрю Дж. (19 января 2017 г.). «Механизм убиквитинирования и деубиквитинирования в пути анемии Фанкони» . Молекулярная клетка . 65 (2): 247–259. дои : 10.1016/j.molcel.2016.11.005 . hdl : 2434/618936 . ISSN 1097-4164 . ПМИД 27986371 .

[pmid26149689-16] Майлз Дж.А., Фрост М.Г., Кэрролл Э., Роу М.Л., Ховард М.Дж., Сидху А., Чаугул В.К., Альпи А.Ф., Уолден Х (2015). «Путь восстановления ДНК анемии Фанкони регулируется взаимодействием между убиквитином и E2-подобным складчатым доменом FANCL» . Ж. Биол. Хим . 290 (34): 20995–1006. дои : 10.1074/jbc.M115.675835 . ПМЦ 4543658 . ПМИД 26149689 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]