ФАНКФ
| ФАНКФ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | FANCF , FAF, группа F комплементации анемии Фанкони, группа F комплементации FA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 613897 ; МГИ : 3689889 ; Гомологен : 75185 ; GeneCards : FANCF ; ОМА : FANCF – ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Белок группы F анемии Фанкони представляет собой белок , который у человека кодируется FANCF геном . [5] [6]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что FANCF взаимодействует с анемией Фанкони, группой комплементации C , [7] [8] ФАНЧГ , [7] [8] [9] [10] Фэнтези [7] [8] [11] и ФАНС . [7] [12]
Функция
[ редактировать ]FANCF — это адаптерный белок, который играет ключевую роль в правильной сборке основного комплекса FA. [7] Основной комплекс ЖК состоит из восьми белков (FANCA, -B, -C, -E, -F, -G, -L и -M). [13] [14] FANCF стабилизирует взаимодействие между подкомплексом FANCC/FANCE и подкомплексом FANCA/FANCG и фиксирует весь основной комплекс FA в конформации, которая необходима для выполнения его функции при репарации ДНК. [7]
Коровый комплекс FA представляет собой ядерный коровый комплекс, который необходим для моноубиквитинирования FANCD2, и эта модифицированная форма FANCD2 колокализуется с BRCA1, RAD51 и PCNA в очагах, которые также содержат другие белки репарации ДНК. [7] Все эти белки функционируют вместе, облегчая восстановление межцепочечных поперечных связей ДНК. Они также участвуют в других процессах восстановления поврежденной ДНК, включая восстановление и стабилизацию остановленных вилок репликации. [14] Белок FoxF1 также взаимодействует с ядром белка FA и индуцирует его связывание с хроматином, способствуя восстановлению ДНК. [14]
Рак
[ редактировать ]Повреждение ДНК, по-видимому, является основной причиной рака. [15] а дефицит экспрессии генов репарации ДНК, по-видимому, лежит в основе многих форм рака. [16] [17] Если репарация ДНК недостаточна, повреждения ДНК имеют тенденцию накапливаться. Такое избыточное повреждение ДНК может увеличить мутации из-за склонного к ошибкам синтеза транслейкоза . Чрезмерное повреждение ДНК может также усилить эпигенетические изменения из-за ошибок во время репарации ДНК. [18] [19] Такие мутации и эпигенетические изменения могут привести к раку .
Снижение экспрессии генов репарации ДНК (обычно вызванное эпигенетическими изменениями) очень распространено при раке и чаще всего встречается гораздо чаще, чем мутационные дефекты генов репарации ДНК при раке. [ нужна ссылка ] (Также см. Частоты эпимутаций в генах репарации ДНК .)
Метилирование промоторной области гена FANCF приводит к снижению экспрессии белка FANCF. [20]
Частоты метилирования промотора FANCF при нескольких различных видах рака указаны в таблице.
| Рак | Частота | Ссылка. |
|---|---|---|
| Эпителиальный рак яичников | 32% | [21] |
| Рак шейки матки | 30% | [22] |
| Рак яичников | 21%-28% | [20] [23] |
| Плоскоклеточный рак головы и шеи | 15% | [24] |
| Немелкоклеточный рак легкого | 14% | [24] [25] |
| Мужская герминогенная опухоль | 6% | [26] |
При инвазивном раке молочной железы количество микроРНК -210 (миР-210) было увеличено наряду со снижением экспрессии FANCF, где FANCF был одной из вероятных мишеней миР-210. [27]
Хотя мутации в FANCF обычно не наблюдаются в опухолях человека, мышиная модель с дефицитом FANCF была склонна к раку яичников. [28]
FANCF , по-видимому, является одним из примерно 26 генов репарации ДНК, которые эпигенетически репрессируются при различных видах рака (см. Эпигенетика рака ).
Бесплодие
[ редактировать ]Гонады мутантных мышей FANCF функционируют аномально, нарушая развитие фолликулов и сперматогенез, как это наблюдалось на других с анемией Фанкони моделях мышей и у пациентов с анемией Фанкони . [28] Гистологическое исследование семенников мышей с дефицитом FANCF показало, что семенные канальцы лишены половых клеток . В возрасте 14 недель самки мышей с дефицитом FANCF были почти или полностью лишены примордиальных фолликулов . Был сделан вывод, что у мышей с дефицитом FANCF наблюдается быстрое истощение примордиальных фолликулов в молодом возрасте, что приводит к ускоренному старению яичников . [28]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000183161 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000092118 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Йоэнье Х., Остра А.Б., Вейкер М., ди Сумма Ф.М., ван Беркель К.Г., Ройманс М.А., Эбелл В., ван Вил М., Пронк Дж.К., Бухвальд М., Арверт Ф. (октябрь 1997 г.). «Доказательства существования как минимум восьми генов анемии Фанкони» . Американский журнал генетики человека . 61 (4): 940–4. дои : 10.1086/514881 . ПМК 1715980 . ПМИД 9382107 .
- ^ «Ген Энтрез: FANCF, анемия Фанкони, группа комплементации F» .
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г Левей Ф., Блом Э., Медхерст А.Л., Бир П., Лагмани эль Х., Джонсон М., Ройманс М.А., Собек А., Вайсфис К., Арверт Ф., Патель К.Дж., Хоатлин М.Е., Джоэнже Х., де Винтер Дж.П. (сентябрь 2004 г.). «Продукт гена анемии Фанкони FANCF представляет собой гибкий адаптерный белок» . Журнал биологической химии . 279 (38): 39421–30. дои : 10.1074/jbc.M407034200 . ПМИД 15262960 .
- ^ Перейти обратно: а б с де Винтер Дж.П., ван дер Вель Л., де Гроот Дж., Стоун С., Вайсфис К., Арверт Ф., Шепер Р.Дж., Круйт Ф.А., Хоатлин М.Э., Йоэнье Х. (ноябрь 2000 г.). «Белок анемии Фанкони FANCF образует ядерный комплекс с FANCA, FANCC и FANCG» . Молекулярная генетика человека . 9 (18): 2665–74. дои : 10.1093/hmg/9.18.2665 . ПМИД 11063725 .
- ^ Гордон С.М., Бухвальд М. (июль 2003 г.). «Белковый комплекс анемии Фанкони: картирование белковых взаимодействий в 2- и 3-гибридных системах дрожжей». Кровь . 102 (1): 136–41. дои : 10.1182/кровь-2002-11-3517 . ПМИД 12649160 .
- ^ Медхерст А.Л., Хубер П.А., Вайсфис К., де Винтер Дж.П., Мэтью К.Г. (февраль 2001 г.). «Прямое взаимодействие пяти известных белков анемии Фанкони предполагает наличие общего функционального пути» . Молекулярная генетика человека . 10 (4): 423–9. дои : 10.1093/хмг/10.4.423 . ПМИД 11157805 .
- ^ Встречайте А.Р., де Винтер Дж.П., Медхерст А.Л., Уоллиш М., Вайсфиш К., ван де Вругт Х.Дж., Остра А.Б., Ян З., Линг С., Бишоп К.Э., Хоатлин М.Э., Йоэндже Х., Ван В. (октябрь 2003 г.). «Новая убиквитинлигаза недостаточна при анемии Фанкони». Природная генетика . 35 (2): 165–70. дои : 10.1038/ng1241 . ПМИД 12973351 . S2CID 10149290 .
- ^ Пейс П., Джонсон М., Тан В.М., Моздейл Г., Снг С., Хоатлин М., де Винтер Дж., Джоэнже Х., Гергели Ф., Патель К.Дж. (июль 2002 г.). «FANCE: связь между сборкой и активностью комплекса анемии Фанкони» . Журнал ЭМБО . 21 (13): 3414–23. дои : 10.1093/emboj/cdf355 . ПМК 125396 . ПМИД 12093742 .
- ^ Коттеманн MC, Смогожевска А (январь 2013 г.). «Анемия Фанкони и восстановление перекрестных связей ДНК Уотсона и Крика» . Природа . 493 (7432): 356–63. Бибкод : 2013Natur.493..356K . дои : 10.1038/nature11863 . ПМК 3700363 . ПМИД 23325218 .
- ^ Перейти обратно: а б с Прадхан А., Устиян В., Чжан Й., Калин Т.В., Калиниченко В.В. (январь 2016 г.). «Фактор транскрипции Forkhead FoxF1 взаимодействует с белковыми комплексами анемии Фанкони, способствуя реакции на повреждение ДНК» . Онкотаргет . 7 (2): 1912–26. дои : 10.18632/oncotarget.6422 . ПМЦ 4811506 . ПМИД 26625197 .
- ^ Кастан М.Б. (апрель 2008 г.). «Реакция на повреждение ДНК: механизмы и роль в заболеваниях человека: лекция на премию Мемориала ГСГ Клоуза 2007 г.» . Молекулярные исследования рака . 6 (4): 517–24. дои : 10.1158/1541-7786.MCR-08-0020 . ПМИД 18403632 .
- ^ Харпер Дж.В., Элледж С.Дж. (декабрь 2007 г.). «Реакция на повреждение ДНК: десять лет спустя» . Молекулярная клетка . 28 (5): 739–45. doi : 10.1016/j.molcel.2007.11.015 . ПМИД 18082599 .
- ^ Дитляйн Ф, Рейнхардт ХК (декабрь 2014 г.). «Молекулярные пути: использование опухолеспецифичных молекулярных дефектов в путях восстановления ДНК для точной терапии рака». Клинические исследования рака . 20 (23): 5882–7. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-14-1165 . ПМИД 25451105 . S2CID 16005088 .
- ^ О'Хаган Х.М., Мохаммад Х.П., Бэйлин С.Б. (2008). «Двухнитевые разрывы могут инициировать молчание генов и SIRT1-зависимое начало метилирования ДНК на экзогенном промоторном острове CpG» . ПЛОС Генетика . 4 (8): е1000155. дои : 10.1371/journal.pgen.1000155 . ПМЦ 2491723 . ПМИД 18704159 .
- ^ Куоццо С, Порчеллини А, Ангрисано Т, Морано А, Ли Б, Ди Пардо А, Мессина С, Юлиано Р, Фуско А, Сантильо М.Р., Мюллер М.Т., Кьяриотти Л., Готтесман М.Е., Авведименто Э.В. (июль 2007 г.). «Повреждение ДНК, репарация, направленная на гомологию, и метилирование ДНК» . ПЛОС Генетика . 3 (7): е110. дои : 10.1371/journal.pgen.0030110 . ЧВК 1913100 . ПМИД 17616978 .
- ^ Перейти обратно: а б Танигучи Т., Тишковитц М., Амезиан Н., Ходжсон С.В., Мэтью К.Г., Йоэнье Х., Мок С.К., Д'Андреа А.Д. (май 2003 г.). «Нарушение пути анемии Фанкони-BRCA в цисплатин-чувствительных опухолях яичников». Природная медицина . 9 (5): 568–74. дои : 10.1038/nm852 . ПМИД 12692539 . S2CID 22912496 .
- ^ Дин JJ, Ван Джи, Ши WX, Чжоу Х.Х., Чжао Э.Ф. (январь 2016 г.). «Гиперметилирование промотора FANCF, восприимчивость и прогноз эпителиального рака яичников» . Репродуктивные науки . 23 (1): 24–30. дои : 10.1177/1933719115612136 . ПМИД 26507869 . S2CID 21461736 .
- ^ Нараян Г., Ариас-Пулидо Х., Нандула С.В., Бассо К., Сугиртарай Д.Д., Варгас Х., Мансухани М., Виллелла Дж., Мейер Л., Шнайдер А., Гиссманн Л., Дюрст М., Потури Б., Мурти В.В. (май 2004 г.). «Гиперметилирование промотора FANCF: нарушение пути анемии Фанкони-BRCA при раке шейки матки» . Исследования рака . 64 (9): 2994–7. дои : 10.1158/0008-5472.can-04-0245 . ПМИД 15126331 .
- ^ Ван З, Ли М, Лу С, Чжан Ю, Ван Х (март 2006 г.). «Гиперметилирование промотора FANCF играет важную роль в возникновении рака яичников, нарушая путь анемии Фанкони-BRCA» . Биология и терапия рака . 5 (3): 256–60. дои : 10.4161/cbt.5.3.2380 . ПМИД 16418574 .
- ^ Перейти обратно: а б Марсит С.Дж., Лю М., Нельсон Х.Х., Познер М., Сузуки М., Келси К.Т. (январь 2004 г.). «Инактивация пути анемии Фанкони/BRCA при раке легких и полости рта: значение для лечения и выживания». Онкоген . 23 (4): 1000–4. дои : 10.1038/sj.onc.1207256 . ПМИД 14647419 . S2CID 23932665 .
- ^ Го М., Алумкал Дж., Драчова Т., Гао Д., Марина С.С., Джен Дж., Герман Дж.Г. (март 2015 г.). «Метилирование CHFR сильно коррелирует с метилированием генов репарации повреждений ДНК и пути апоптоза при немелкоклеточном раке легкого». Медицина открытий . 19 (104): 151–8. ПМИД 25828518 .
- ^ Коул С., Маккирнан Дж.М., Нараян Г., Хоулдсворт Дж., Бачик Дж., Добжински Д.Л., Ассаад А.М., Мансухани М., Рейтер В.Е., Босл Г.Дж., Чаганти Р.С., Мурти В.В. (май 2004 г.). «Роль гиперметилирования промотора в ответе на лечение цисплатином опухолей мужских половых клеток» . Молекулярный рак . 3:16 . дои : 10.1186/1476-4598-3-16 . ПМК 420487 . ПМИД 15149548 .
- ^ Волиния С., Галассо М., Сана М.Э., Уайз Т.Ф., Палатини Дж., Хюбнер К., Кроче К.М. (февраль 2012 г.). «Признаки инвазивности и прогноза рака молочной железы, определенные с помощью глубокого секвенирования микроРНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (8): 3024–9. Бибкод : 2012PNAS..109.3024V . дои : 10.1073/pnas.1200010109 . ПМК 3286983 . ПМИД 22315424 .
- ^ Перейти обратно: а б с Баккер С.Т., ван де Вругт Х.Дж., Виссер Дж.А., Дельзенн-Гетте Э., ван дер Валк А., Бернс М.А., ван де Вен М., Остра А.Б., де Врис С., Крамер П., Арверт Ф., ван дер Валк М., де Винтер Дж.П. , в Riele H (январь 2012 г.). «Мыши с дефицитом Fancf склонны к развитию опухолей яичников». Журнал патологии . 226 (1): 28–39. дои : 10.1002/путь.2992 . ПМИД 21915857 . S2CID 26239010 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
- Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
- де Винтер Дж.П., Ройманс М.А., ван дер Вель Л., ван Беркель К.Г., Алон Н., Босноян-Коллинз Л., де Гроот Дж., Чжи Й., Вайсфис К., Пронк Дж.К., Арверт Ф., Мэтью К.Г., Шепер Р.Дж., Хоатлин М.Э., Бухвальд М., Йоэнье Х. (январь 2000 г.). «Ген анемии Фанкони FANCF кодирует новый белок, гомологичный ROM». Природная генетика . 24 (1): 15–6. дои : 10.1038/71626 . ПМИД 10615118 . S2CID 26394122 .
- де Винтер Дж.П., ван дер Вель Л., де Гроот Дж., Стоун С., Вайсфис К., Арверт Ф., Шепер Р.Дж., Круйт Ф.А., Хоатлин М.Э., Йоэнье Х. (ноябрь 2000 г.). «Белок анемии Фанкони FANCF образует ядерный комплекс с FANCA, FANCC и FANCG» . Молекулярная генетика человека . 9 (18): 2665–74. дои : 10.1093/hmg/9.18.2665 . ПМИД 11063725 .
- Медхерст А.Л., Хубер П.А., Вайсфис К., де Винтер Дж.П., Мэтью К.Г. (февраль 2001 г.). «Прямое взаимодействие пяти известных белков анемии Фанкони предполагает наличие общего функционального пути» . Молекулярная генетика человека . 10 (4): 423–9. дои : 10.1093/хмг/10.4.423 . ПМИД 11157805 .
- Пейс П., Джонсон М., Тан В.М., Моздейл Г., Снг С., Хоатлин М., де Винтер Дж., Джоэнже Х., Гергели Ф., Патель К.Дж. (июль 2002 г.). «FANCE: связь между сборкой и активностью комплекса анемии Фанкони» . Журнал ЭМБО . 21 (13): 3414–23. дои : 10.1093/emboj/cdf355 . ПМК 125396 . ПМИД 12093742 .
- Танигучи Т., Д'Андреа А.Д. (октябрь 2002 г.). «Белок анемии Фанкони, FANCE, способствует накоплению FANCC в ядре». Кровь . 100 (7): 2457–62. дои : 10.1182/blood-2002-03-0860 . ПМИД 12239156 . S2CID 71381 .
- Гордон С.М., Бухвальд М. (июль 2003 г.). «Белковый комплекс анемии Фанкони: картирование белковых взаимодействий в 2- и 3-гибридных системах дрожжей». Кровь . 102 (1): 136–41. дои : 10.1182/кровь-2002-11-3517 . ПМИД 12649160 .
- Встречайте А.Р., Сечи С., Валлиш М., Ян Д., Янг М.К., Йоэндже Х., Хоатлин М.Э., Ван В. (май 2003 г.). «Мультипротеиновый ядерный комплекс соединяет анемию Фанкони и синдром Блума» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (10): 3417–26. дои : 10.1128/MCB.23.10.3417-3426.2003 . ПМЦ 164758 . ПМИД 12724401 .
- Встречайте А.Р., де Винтер Дж.П., Медхерст А.Л., Уоллиш М., Вайсфиш К., ван де Вругт Х.Дж., Остра А.Б., Ян З., Линг С., Бишоп К.Э., Хоатлин М.Э., Йоэндже Х., Ван В. (октябрь 2003 г.). «Новая убиквитинлигаза недостаточна при анемии Фанкони». Природная генетика . 35 (2): 165–70. дои : 10.1038/ng1241 . ПМИД 12973351 . S2CID 10149290 .
- Марсит С.Дж., Лю М., Нельсон Х.Х., Познер М., Сузуки М., Келси К.Т. (январь 2004 г.). «Инактивация пути анемии Фанкони/BRCA при раке легких и полости рта: значение для лечения и выживания». Онкоген . 23 (4): 1000–4. дои : 10.1038/sj.onc.1207256 . ПМИД 14647419 . S2CID 23932665 .
- Цуцуми С., Камата Н., Вокес Т.Дж., Маруока И., Накакуки К., Эномото С., Омура К., Амагаса Т., Нагаяма М., Сайто-Охара Ф., Инадзава Дж., Моритани М., Ямаока Т., Иноуэ Х., Итакура М. (июнь 2004 г.) . «Новый ген, кодирующий предполагаемый трансмембранный белок, мутирует при гнатодиафизарной дисплазии (ГДД)» . Американский журнал генетики человека . 74 (6): 1255–61. дои : 10.1086/421527 . ПМЦ 1182089 . ПМИД 15124103 .
- Нараян Г., Ариас-Пулидо Х., Нандула С.В., Бассо К., Сугиртарай Д.Д., Варгас Х., Мансухани М., Виллелла Дж., Мейер Л., Шнайдер А., Гиссманн Л., Дюрст М., Потури Б., Мурти В.В. (май 2004 г.). «Гиперметилирование промотора FANCF: нарушение пути анемии Фанкони-BRCA при раке шейки матки» . Исследования рака . 64 (9): 2994–7. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-04-0245 . ПМИД 15126331 .
- Левей Ф., Блом Э., Медхерст А.Л., Бир П., Лагмани эль Х., Джонсон М., Ройманс М.А., Собек А., Вайсфис К., Арверт Ф., Патель К.Дж., Хоатлин М.Е., Джоэнже Х., де Винтер Дж.П. (сентябрь 2004 г.). «Продукт гена анемии Фанкони FANCF представляет собой гибкий адаптерный белок» . Журнал биологической химии . 279 (38): 39421–30. дои : 10.1074/jbc.M407034200 . ПМИД 15262960 .
- Митей А.Р., Левитус М., Сюэ Ю., Медхерст А.Л., Зваан М., Линг С., Ройманс М.А., Бир П., Хоатлин М., Палс Г., де Винтер Дж.П., Ван В., Йоэндже Х. (ноябрь 2004 г.). «Х-сцепленное наследование группы B комплементации анемии Фанкони» . Природная генетика . 36 (11): 1219–24. дои : 10.1038/ng1458 . ПМИД 15502827 .
- Метей А.Р., Медхерст А.Л., Линг С., Сюэ Ю., Сингх Т.Р., Бир П., Стелтенпул Дж., Стоун С., Докал И., Мэтью К.Г., Хоатлин М., Джоэнже Х., де Винтер Дж.П., Ван В. (сентябрь 2005 г.). «Человеческий ортолог белка репарации ДНК архей Hef дефектен в группе M комплементации анемии Фанкони» . Природная генетика . 37 (9): 958–63. дои : 10.1038/ng1626 . ПМК 2704909 . ПМИД 16116422 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
галерея PDB |
|---|
