Protein-coding gene in the species Homo sapiens
Белок эксцизионной репарации УФ-излучения, гомолог A RAD23, представляет собой белок , который у человека кодируется RAD23A геном . [ 5 ]
Белок, кодируемый этим геном, является одним из двух человеческих гомологов Saccharomyces cerevisiae Rad23, белка, участвующего в эксцизионной репарации нуклеотидов (NER). (MPG) и повышает активность вырезания нуклеотидов Было показано, что этот белок взаимодействует с 3-метиладенин-ДНК-гликозилазой , что предполагает его роль в распознавании повреждений ДНК при репарации вырезаемых оснований . Этот белок содержит N-концевой убиквитин-подобный домен, который, как сообщается, взаимодействует с 26S протеасомой , а также с убиквитинпротеинлигазой E6AP , и, таким образом, позволяет предположить, что этот белок может участвовать в убиквитин-опосредованном протеолитическом пути в клетках. [ 6 ]
Было показано, что RAD23A взаимодействует с:
^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000179262 – Ensembl , май 2017 г. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003813 – Ensembl , май 2017 г. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ ван дер Спек П.Дж., Смит Э.М., Беверлоо Х.Б., Сугасава К., Масутани С., Ханаока Ф., Хоймейкерс Дж.Х., Хагемейер А. (март 1995 г.). «Хромосомная локализация трех генов репарации: гена пигментной ксеродерма группы C и двух человеческих гомологов дрожжевого RAD23» . Геномика . 23 (3): 651–658. дои : 10.1006/geno.1994.1554 . hdl : 1765/3069 ПМИД 7851894 . ^ «Ген Энтреза: RAD23A гомолог A RAD23 (S. cerevisiae)» . ^ Ван Г., Савай Н., Котлярова С., Канадзава И., Нукина Н. (июль 2000 г.). «Атаксин-3, продукт гена MJD1, взаимодействует с двумя человеческими гомологами белка репарации дрожжевой ДНК RAD23, HHR23A и HHR23B» . Хм. Мол. Жене . 9 (12): 1795–803. дои : 10.1093/hmg/9.12.1795 ПМИД 10915768 . ^ Хияма Х., Ёкои М., Масутани К., Сугасава К., Маекава Т., Танака К., Хойеймейкерс Дж.Х., Ханаока Ф. (сентябрь 1999 г.). «Взаимодействие hHR23 с S5a. Убиквитиноподобный домен hHR23 опосредует взаимодействие с субъединицей S5a 26 S протеасомы» . Ж. Биол. Хим . 274 (39): 28019–25. дои : 10.1074/jbc.274.39.28019 hdl : 1765/9166 ПМИД 10488153 . ^ Мюллер Т.Д., Фейгон Дж. (сентябрь 2003 г.). «Структурные детерминанты связывания убиквитиноподобных доменов с протеасомой» . ЭМБО Дж . 22 (18): 4634–45. дои : 10.1093/emboj/cdg467 . ПМК 212733 ПМИД 12970176 . ^ Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Эйхбаум QG, Битти Д.В., Паркер М.И. (1994). «Идентификация сердечных аутоантигенов в библиотеках кДНК сердца человека с использованием сывороток острой ревматической лихорадки». Дж. Аутоиммун . 7 (2): 243–261. дои : 10.1006/jaut.1994.1019 . ПМИД 8037842 . Масутани С., Сугасава К., Янагисава Дж., Сонояма Т., Уи М., Эномото Т., Такио К., Танака К., ван дер Спек П.Дж., Бутсма Д. (1994). «Очистка и клонирование эксцизионно-восстановительного комплекса нуклеотидов, включающего белок группы C пигментной ксеродерма и человеческий гомолог дрожжей RAD23» . ЭМБО Дж. 13 (8): 1831–43. дои : 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06452.x . ПМК 395023 ПМИД 8168482 . ван дер Спек П.Дж., Экер А., Радемакерс С., Виссер С., Сугасава К., Масутани С., Ханаока Ф., Бутсма Д., Хоймейкерс Дж.Х. (1996). «XPC и человеческие гомологи RAD23: внутриклеточная локализация и связь с другими комплексами эксцизионной репарации нуклеотидов» . Нуклеиновые кислоты Рез . 24 (13): 2551–2559. дои : 10.1093/нар/24.13.2551 . ПМК 145966 ПМИД 8692695 . ван дер Спек П.Дж., Виссер К.Э., Ханаока Ф., Смит Б., Хагемейер А., Бутсма Д., Хоймейкерс Дж.Х. (1996). «Клонирование, сравнительное картирование и экспрессия РНК мышиных гомологов гена эксцизионной репарации нуклеотидов Saccharomyces cerevisiae RAD23» . Геномика . 31 (1): 20–27. дои : 10.1006/geno.1996.0004 . hdl : 1765/3097 ПМИД 8808275 . Ли Л, Лу Х, Петерсон С, Легерски Р (1997). «XPC взаимодействует как с HHR23B, так и с HHR23A in vivo». Мутат. Рез . 383 (3): 197–203. дои : 10.1016/s0921-8777(97)00002-5 . ПМИД 9164480 . Уизерс-Уорд Э.С., Джоуэтт Дж.Б., Стюарт С.А., Се Ю.М., Гарфинкель А., Шибагаки Ю., Чоу С.А., Шах Н., Ханаока Ф., Савиц Д.Г., Армстронг Р.В., Соуза Л.М., Чен И.С. (1997). «Вирус иммунодефицита человека типа 1 Vpr взаимодействует с HHR23A, клеточным белком, участвующим в эксцизионной репарации ДНК» . Дж. Вирол . 71 (12): 9732–42. doi : 10.1128/JVI.71.12.9732-9742.1997 . ПМК 230283 ПМИД 9371639 . Шаубер С, Чен Л, Тонгаонкар П, Вега И, Ламбертсон Д, Поттс В, Мадура К (1998). «Rad23 связывает репарацию ДНК с путем убиквитин/протеасома». Природа . 391 (6668): 715–718. Бибкод : 1998Natur.391..715S . дои : 10.1038/35661 . ПМИД 9490418 . S2CID 4417020 . Грагеров А, Кино Т, Ильина-Грагерова Г, Хрусос ГП, Павлакис ГН (1998). «HHR23A, человеческий гомолог дрожжевого белка репарации RAD23, специфически взаимодействует с белком Vpr и предотвращает остановку клеточного цикла, но не транскрипционные эффекты Vpr» . Вирусология . 245 (2): 323–330. дои : 10.1006/виро.1998.9138 ПМИД 9636371 . Дикманн Т., Уизерс-Уорд Э.С., Яросинский М.А., Лю К.Ф., Чен И.С., Фейгон Дж. (1998). «Структура домена UBA белка репарации ДНК человека, который взаимодействует с Vpr ВИЧ-1». Нат. Структура. Биол . 5 (12): 1042–1047. дои : 10.1038/4220 . ПМИД 9846873 . S2CID 30478711 . Кумар С., Талис А.Л., Хоули П.М. (1999). «Идентификация HHR23A как субстрата для убиквитинирования, опосредованного белком E6» . Ж. Биол. Хим . 274 (26): 18785–18792. дои : 10.1074/jbc.274.26.18785 ПМИД 10373495 . Хияма Х, Ёкои М, Масутани С, Сугасава К, Маекава Т, Танака К, Хойджмейкерс Дж. Х., Ханаока Ф (1999). «Взаимодействие hHR23 с S5a. Убиквитиноподобный домен hHR23 опосредует взаимодействие с субъединицей S5a 26 S протеасомы» . Ж. Биол. Хим . 274 (39): 28019–28025. дои : 10.1074/jbc.274.39.28019 hdl : 1765/9166 ПМИД 10488153 . Мяо Ф., Бузиан М., Дамманн Р., Масутани С., Ханаока Ф., Пфайфер Г., О'Коннор Т.Р. (2000). «3-Метиладенин-ДНК-гликозилаза (белок MPG) взаимодействует с белками RAD23 человека» . Ж. Биол. Хим . 275 (37): 28433–28438. дои : 10.1074/jbc.M001064200 ПМИД 10854423 . Ван Г., Савай Н., Котлярова С., Канадзава И., Нукина Н. (2000). «Атаксин-3, продукт гена MJD1, взаимодействует с двумя человеческими гомологами белка репарации дрожжевой ДНК RAD23, HHR23A и HHR23B» . Хм. Мол. Жене . 9 (12): 1795–1803. дои : 10.1093/hmg/9.12.1795 ПМИД 10915768 . Уизерс-Уорд Э.С., Мюллер Т.Д., Чен И.С., Фейгон Дж. (2001). «Биохимический и структурный анализ взаимодействия домена UBA(2) белка репарации ДНК HHR23A и Vpr ВИЧ-1». Биохимия . 39 (46): 14103–14112. дои : 10.1021/bi0017071 . ПМИД 11087358 . Чжу Ц, Вани Г, Вани М.А., Вани А.А. (2001). «Человеческий гомолог дрожжевого белка А Rad23 взаимодействует с белком, связывающим p300/циклический AMP-чувствительный элемент (CREB), подавляя транскрипционную активность p53». Рак Рез . 61 (1): 64–70. ПМИД 11196199 . Манский Л.М., Преверал С., Ле Рузик Э., Бернар Л.К., Селиг Л., Депьен К., Бенарус Р., Бенишу С. (2001). «Взаимодействие Vpr вируса иммунодефицита человека типа 1 с белком репарации ДНК HHR23A не коррелирует с многочисленными биологическими функциями Vpr» . Вирусология . 282 (1): 176–185. дои : 10.1006/виро.2000.0791 ПМИД 11259200 . Гейнор Э.М., Чен И.С. (2001). «Анализ апоптоза, индуцированного Vpr ВИЧ-1, и изучение возможной роли белка hHR23A». Эксп. Сотовый Res . 267 (2): 243–257. дои : 10.1006/excr.2001.5247 . ПМИД 11426943 . Чен Л., Шинде У, Ортолан Т.Г., Мадура К. (2002). «Убиквитин-ассоциированные (UBA) домены в Rad23 связывают убиквитин и способствуют ингибированию сборки мультиубиквитиновой цепи» . Представитель ЭМБО . 2 (10): 933–938. doi : 10.1093/embo-reports/kve203 . ПМЦ 1084081 ПМИД 11571271 . Старейшина RT, Сонг XQ, Чен М., Хопкинс К.М., Либерман Х.Б., Чжао Ю (2002). «Участие rhp23, гомолога Schizosaccharomyces pombe генов эксцизионной репарации нуклеотидов HHR23A человека и Saccharomyces cerevisiae RAD23, в контроле клеточного цикла и убиквитинировании белков» . Нуклеиновые кислоты Рез . 30 (2): 581–591. дои : 10.1093/нар/30.2.581 . ПМК 99819 ПМИД 11788722 .
показывать галерея PDB
1dv0 : Refined NMR solution structure of the C-terminal UBA domain of the human homologue of RAD23A (HHR23A)
1f4i : SOLUTION STRUCTURE OF THE HHR23A UBA(2) MUTANT P333E, DEFICIENT IN BINDING THE HIV-1 ACCESSORY PROTEIN VPR
1ify : Solution Structure of the Internal UBA Domain of HHR23A
1oqy : Structure of the DNA repair protein hHR23a
1p98 : High-resolution NMR structure of the Ubl-domain of HHR23A
1p9d : High-resolution structure of the complex of HHR23A ubiquitin-like domain and the C-terminal ubiquitin-interacting motif of proteasome subunit S5a
1qze : HHR23a protein structure based on residual dipolar coupling data
1tp4 : Solution structure of the XPC binding domain of hHR23A protein
