Атаксин 3

АТХН3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1YZB, 2AGA, 2DOS, 2JRI, 2KLZ, 4WTH, 4YS9
Идентификаторы
Псевдонимы	ATXN3 , AT3, ATX3, JOS, MJD, MJD1, SCA3, атаксин 3
Внешние идентификаторы	Опустить : 607047 ; МГИ : 1099442 ; Гомологен : 3658 ; Генные карты : ATXN3 ; OMA : ATXN3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 14 (human)
End	92,106,621 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 12 (mouse)
End	101,958,246 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	Achilles tendon; ; epithelium of colon; ; tendon of biceps brachii; ; gonad; ; endothelial cell; ; testicle; ; sural nerve; ; monocyte; ; pericardium; ; right uterine tube;
	Top expressed in
	spermatid; ; morula; ; superior cervical ganglion; ; aortic valve; ; ascending aorta; ; interventricular septum; ; cumulus cell; ; spermatocyte; ; mesenteric lymph nodes; ; epithelium of small intestine;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	Lys63-specific deubiquitinase activity; cysteine-type peptidase activity; ATPase binding; Lys48-specific deubiquitinase activity; peptidase activity; protein binding; identical protein binding; hydrolase activity; thiol-dependent deubiquitinase; ubiquitin protein ligase binding; histone deacetylase activity;
Cellular component	endoplasmic reticulum membrane; nuclear matrix; nucleoplasm; nucleus; nucleolus; cytosol; plasma membrane; cytoplasm; mitochondrial matrix; mitochondrial membranes; nuclear inclusion body;
Biological process	nucleotide-excision repair; regulation of transcription, DNA-templated; protein K48-linked deubiquitination; positive regulation of ERAD pathway; transcription, DNA-templated; nervous system development; proteolysis; protein K63-linked deubiquitination; intermediate filament cytoskeleton organization; protein localization to cytosolic proteasome complex involved in ERAD pathway; microtubule cytoskeleton organization; actin cytoskeleton organization; chemical synaptic transmission; protein deubiquitination; ubiquitin-dependent protein catabolic process; protein quality control for misfolded or incompletely synthesized proteins; regulation of cell-substrate adhesion; cellular response to heat; monoubiquitinated protein deubiquitination; proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; cellular response to misfolded protein; exploration behavior; histone H3 deacetylation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	4287
	110616
	ENSG00000066427
	ENSMUSG00000021189
	P54252 ; Q4VBR4
	Q9CVD2
showНМ_001024631 ; НМ_001127696 ; НМ_001127697 ; НМ_001164774 ; НМ_001164776 ;
	NM_001164777; NM_001164778; NM_001164779; NM_001164780; NM_001164781; NM_001164782; NM_004993; NM_030660
	НМ_001167914 ; НМ_029705
showНП_001121168 ; НП_001121169 ; НП_001158246 ; НП_001158248 ; НП_001158249 ;
	NP_001158250; NP_001158251; NP_001158252; NP_001158253; NP_001158254; NP_004984; NP_109376
	НП_001161386 ; НП_083981
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Атаксин-3 — это белок , который у человека кодируется ATXN3 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Клиническое значение

Болезнь Мачадо-Джозефа , также известная как спиноцеребеллярная атаксия-3, является аутосомно-доминантным неврологическим заболеванием. Белок, кодируемый геном ATXN3 , содержит CAG-повторы в кодирующей области, и расширение этих повторов с нормальных 13-36 до 68-79 является причиной болезни Мачадо-Джозефа. Таким образом, это заболевание представляет собой нарушение тринуклеотидных повторов типа I, известное как полиглутаминовая (PolyQ) болезнь . Существует обратная корреляция между возрастом начала заболевания и количеством повторов CAG. Для этого гена были описаны альтернативно сплайсированные варианты транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что атаксин 3 взаимодействует с:

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000066427 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021189 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Такаяма Ю, Нисидзава М, Танака Х, Кавасима С, Сакамото Х, Карубе Ю, Симадзаки Х, Соутоме М, Эндо К, Ота С (июль 1993 г.). «Ген болезни Мачадо-Джозефа картирован на хромосоме 14q человека». Природная генетика . 4 (3): 300–4. дои : 10.1038/ng0793-300 . ПМИД 8358439 . S2CID 27424416 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: атаксин 3 ATXN3» .
^ Jump up to: ^а ^б Ван Г., Савай Н., Котлярова С., Канадзава И., Нукина Н. (июль 2000 г.). «Атаксин-3, продукт гена MJD1, взаимодействует с двумя человеческими гомологами белка репарации дрожжевой ДНК RAD23, HHR23A и HHR23B». Молекулярная генетика человека . 9 (12): 1795–803. дои : 10.1093/hmg/9.12.1795 . ПМИД 10915768 .
^ Досс-Пепе Э.В., Стенроос Э.С., Джонсон В.Г., Мадура К. (сентябрь 2003 г.). «Взаимодействие атаксина-3 с rad23 и валозинсодержащим белком и его ассоциации с цепями убиквитина и протеасомой согласуются с его ролью в убиквитин-опосредованном протеолизе» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (18): 6469–83. дои : 10.1128/MCB.23.18.6469-6483.2003 . ЧВК 193705 . ПМИД 12944474 .
^ Ван Ц, Ли Л, Йе Ю (март 2008 г.). «Ингибирование p97-зависимой деградации белка с помощью ееарестатина I» . Журнал биологической химии . 283 (12): 7445–54. дои : 10.1074/jbc.M708347200 . ПМК 2276333 . ПМИД 18199748 .

Дальнейшее чтение

Гото Дж., Ватанабэ М., Итикава Ю., Йи С.Б., Ихара Н., Эндо К., Игараси С., Такаяма Ю., Гаспар С., Масиэль П., Цудзи С., Руло Г.А., Канадзава I (август 1997 г.). «Продукты гена болезни Мачадо-Джозефа, несущие разные карбоксильные концы». Неврологические исследования . 28 (4): 373–7. дои : 10.1016/S0168-0102(97)00056-4 . ПМИД 9274833 . S2CID 27241785 .
Шёлс Л., Виейра-Зекер А.М., Шёлс С., Прзунтек Х., Эпплен Дж.Т., Рисс О. (июнь 1995 г.). «Экспансия тринуклеотидов в гене MJD1 клинически проявляется как спиноцеребеллярная атаксия и чаще всего встречается у немецких пациентов со СЦА». Молекулярная генетика человека . 4 (6): 1001–5. дои : 10.1093/hmg/4.6.1001 . ПМИД 7655453 .
Стеванин Г., Кансел Г., Дюрр А., Хнейвайс Х., Дюбур О., Вайссенбах Дж., Канн Х.М., Агид Ю., Брайс А. (январь 1995 г.). «Ген спинально-мозжечковой атаксии 3 (SCA3) расположен в районе примерно 3 см на хромосоме 14q24.3-q32.2» . Американский журнал генетики человека . 56 (1): 193–201. ПМК 1801316 . ПМИД 7825578 .
Кавагути Ю, Окамото Т, Таниваки М, Айзава М, Иноуэ М, Катаяма С, Каваками Х, Накамура С, Нисимура М, Акигути И (ноябрь 1994 г.). «Расширения CAG в новом гене болезни Мачадо-Джозефа на хромосоме 14q32.1». Природная генетика . 8 (3): 221–8. дои : 10.1038/ng1194-221 . ПМИД 7874163 . S2CID 29188685 .
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Икеда Х., Ямагути М., Сугай С., Азе Ю., Нарумия С., Какизука А. (июнь 1996 г.). «Расширенный полиглутамин в белке болезни Мачадо-Джозефа вызывает гибель клеток in vitro и in vivo». Природная генетика . 13 (2): 196–202. дои : 10.1038/ng0696-196 . ПМИД 8640226 . S2CID 21966287 .
Полсон Х.Л., Дас СС, Крино П.Б., Перес М.К., Патель С.С., Готсдинер Д., Фишбек К.Х., Питтман Р.Н. (апрель 1997 г.). «Продукт гена болезни Мачадо-Джозефа представляет собой цитоплазматический белок, широко экспрессируемый в мозге». Анналы неврологии . 41 (4): 453–62. дои : 10.1002/ana.410410408 . ПМИД 9124802 . S2CID 43460483 .
Сузуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Веллингтон К.Л., Эллерби Л.М., Хакам А.С., Марголис Р.Л., Трифиро М.А., Сингараджа Р., Маккатчеон К., Салвесен Г.С., Пропп С.С., Бромм М., Роуланд К.Дж., Чжан Т., Распер Д., Рой С., Торнберри Н., Пински Л., Какизука А. , Росс К.А., Николсон Д.В., Бредесен Д.Е., Хайден М.Р. (апрель 1998 г.). «Расщепление каспазой генных продуктов, связанных с нарушениями триплетной экспансии, приводит к образованию укороченных фрагментов, содержащих полиглутаминовый тракт» . Журнал биологической химии . 273 (15): 9158–67. дои : 10.1074/jbc.273.15.9158 . ПМИД 9535906 .
Тейт Д., Риччио М., Ситтлер А., Шерзингер Э., Санти С., Огнибене А., Маральди Н.М., Лерах Х., Ванкер Э.Э. (июнь 1998 г.). «Атаксин-3 транспортируется в ядро и связывается с ядерным матриксом» . Молекулярная генетика человека . 7 (6): 991–7. CiteSeerX 10.1.1.588.3970 . дои : 10.1093/hmg/7.6.991 . ПМИД 9580663 .
Ван Г., Савай Н., Котлярова С., Канадзава И., Нукина Н. (июль 2000 г.). «Атаксин-3, продукт гена MJD1, взаимодействует с двумя человеческими гомологами белка репарации дрожжевой ДНК RAD23, HHR23A и HHR23B». Молекулярная генетика человека . 9 (12): 1795–803. дои : 10.1093/hmg/9.12.1795 . ПМИД 10915768 .
Итикава Ю, Гото Дж, Хаттори М, Тойода А, Исии К, Чон СЮ, Хашида Х, Масуда Н, Огата К, Касаи Ф, Хираи М, Масиэль П, Руло Г.А., Сакаки Ю, Канадзава И (2001). «Геномная структура и экспрессия MJD, гена болезни Мачадо-Джозефа» . Журнал генетики человека . 46 (7): 413–22. дои : 10.1007/s100380170060 . ПМИД 11450850 .
Чай Ю., Шао Дж., Миллер В.М., Уильямс А., Полсон Х.Л. (июль 2002 г.). «Визуализация живых клеток выявляет различную внутриклеточную динамику белков полиглутаминовой болезни и подтверждает модель секвестрации патогенеза» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (14): 9310–5. Бибкод : 2002PNAS...99.9310C . дои : 10.1073/pnas.152101299 . ПМЦ 123137 . ПМИД 12084819 .
Ёсида Х, Ёсидзава Т, Сибасаки Ф, Сёдзи С, Канадзава I (июль 2002 г.). «Химические шапероны уменьшают образование агрегатов и гибель клеток, вызванную усеченным продуктом гена болезни Мачадо-Джозефа с расширенным полиглутаминовым удлинением» . Нейробиология болезней . 10 (2): 88–99. дои : 10.1006/nbdi.2002.0502 . ПМИД 12127147 . S2CID 25183307 .
Ли Ф., Макфарлан Т., Питтман Р.Н., Чакраварти Д. (ноябрь 2002 г.). «Атаксин-3 представляет собой гистонсвязывающий белок с двумя независимыми корепрессорными транскрипционными активностями» . Журнал биологической химии . 277 (47): 45004–12. дои : 10.1074/jbc.M205259200 . ПМИД 12297501 .
Альбрехт М., Хоффманн Д., Эверт Б.О., Шмитт И., Вюлльнер Ю., Ленгауэр Т. (февраль 2003 г.). «Структурное моделирование атаксина-3 обнаруживает отдаленную гомологию с адаптинами». Белки . 50 (2): 355–70. дои : 10.1002/прот.10280 . ПМИД 12486728 . S2CID 25660172 .
Маршал С., Шехи Э., Харрикейн М.С., Фуси П., Хейтц Ф., Тортора П., Ланге Р. (август 2003 г.). «Структурная нестабильность и фибриллярная агрегация нерасширенного человеческого атаксина-3, выявленная при высоком давлении и температуре» . Журнал биологической химии . 278 (34): 31554–63. дои : 10.1074/jbc.M304205200 . ПМИД 12766160 .

Внешние ссылки

Запись GeneReviews/NCBI/NIH/UW о спиноцеребеллярной атаксии типа 3
Расположение генома человека ATXN3 и страница сведений о гене ATXN3 в браузере генома UCSC .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000066427 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021189 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8358439-5] Такаяма Ю, Нисидзава М, Танака Х, Кавасима С, Сакамото Х, Карубе Ю, Симадзаки Х, Соутоме М, Эндо К, Ота С (июль 1993 г.). «Ген болезни Мачадо-Джозефа картирован на хромосоме 14q человека». Природная генетика . 4 (3): 300–4. дои : 10.1038/ng0793-300 . ПМИД 8358439 . S2CID 27424416 .

[EntrezGene-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: атаксин 3 ATXN3» .

[pmid10915768-7] Jump up to: ^а ^б Ван Г., Савай Н., Котлярова С., Канадзава И., Нукина Н. (июль 2000 г.). «Атаксин-3, продукт гена MJD1, взаимодействует с двумя человеческими гомологами белка репарации дрожжевой ДНК RAD23, HHR23A и HHR23B». Молекулярная генетика человека . 9 (12): 1795–803. дои : 10.1093/hmg/9.12.1795 . ПМИД 10915768 .

[pmid12944474-8] Досс-Пепе Э.В., Стенроос Э.С., Джонсон В.Г., Мадура К. (сентябрь 2003 г.). «Взаимодействие атаксина-3 с rad23 и валозинсодержащим белком и его ассоциации с цепями убиквитина и протеасомой согласуются с его ролью в убиквитин-опосредованном протеолизе» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (18): 6469–83. дои : 10.1128/MCB.23.18.6469-6483.2003 . ЧВК 193705 . ПМИД 12944474 .

[pmid18199748-9] Ван Ц, Ли Л, Йе Ю (март 2008 г.). «Ингибирование p97-зависимой деградации белка с помощью ееарестатина I» . Журнал биологической химии . 283 (12): 7445–54. дои : 10.1074/jbc.M708347200 . ПМК 2276333 . ПМИД 18199748 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]