АТГ7

АТГ7
Идентификаторы
Псевдонимы	ATG7 , APG7-LIKE, APG7L, GSA7, связанный с аутофагией 7, SCAR31
Внешние идентификаторы	Опустить : 608760 ; МГИ : 1921494 ; Гомологен : 4662 ; Генные карты : ATG7 ; ОМА : ATG7 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	11,557,665 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 6 (mouse)
End	114,837,575 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	monocyte; ; Achilles tendon; ; oocyte; ; islet of Langerhans; ; epithelium of colon; ; testicle; ; granulocyte; ; blood; ; buccal mucosa cell; ; rectum;
	Top expressed in
	lumbar spinal ganglion; ; granulocyte; ; spermatocyte; ; morula; ; morula; ; spermatid; ; genital tubercle; ; tail of embryo; ; zygote; ; left lobe of liver;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein homodimerization activity; transcription factor binding; ubiquitin activating enzyme activity; protein binding; ubiquitin-like modifier activating enzyme activity; Atg12 activating enzyme activity; Atg8 activating enzyme activity;
Cellular component	cytoplasm; axoneme; extracellular region; axon; secretory granule lumen; ficolin-1-rich granule lumen; cytosol; phagophore assembly site;
Biological process	positive regulation of protein catabolic process; cellular response to hyperoxia; cellular response to starvation; membrane fusion; defense response to virus; positive regulation of protein modification process; positive regulation of apoptotic process; protein transport; protein lipidation; suppression by virus of host autophagy; protein ubiquitination; autophagy; human ageing; response to glucose; macroautophagy; response to nutrient levels; neutrophil degranulation; negative regulation of cell death; cellular response to morphine; negative regulation of mitochondrial DNA replication; regulation of neuron death; response to fluoride; negative regulation of oxidative stress-induced neuron death; autophagy of mitochondrion; autophagosome assembly; C-terminal protein lipidation; cellular response to nitrogen starvation; piecemeal microautophagy of the nucleus; late nucleophagy; positive regulation of autophagy; regulation of circadian rhythm; chaperone-mediated autophagy; protein modification by small protein conjugation; rhythmic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10533
	74244
	ENSG00000197548
	ENSMUSG00000030314
	О95352
	Q9D906
showНМ_001136031 ; НМ_001144912 ; НМ_006395 ; НМ_001349232 ; НМ_001349233 ;
	NM_001349234; NM_001349235; NM_001349236; NM_001349237; NM_001349238
	НМ_001253717 ; НМ_001253718 ; НМ_028835 ; НМ_001379130
showНП_001129503 ; НП_001138384 ; НП_006386 ; НП_001336161 ; НП_001336162 ;
	NP_001336163; NP_001336164; NP_001336165; NP_001336166; NP_001336167
	НП_001240646 ; НП_001240647 ; НП_083111 ; НП_001366059
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Связанный с аутофагией 7 — это белок человека, кодируемый ATG7 геном . ^[5]^[6] Относится к GSA7; АПГ7Л; APG7-ЛИК. ^[6]

растений, так и животных ATG 7, присутствующий как в геномах , действует как необходимый белок для деградации клеток и их переработки. ^[7]^[8] Эта последовательность связана с системой убиквитин-протеасома, UPS , необходимой для уникального развития аутофагосомной мембраны и слияния внутри клеток. ^[9]

ATG7 был идентифицирован на основании гомологии с дрожжевыми клетками Pichia Pastoris GSA7 и Saccharomyces cerevisiae APG7. Белок, по-видимому, необходим для слияния пероксисомальных и вакуолярных мембран. ^[10]

Аутофагия — важный клеточный процесс, который помогает поддерживать гомеостаз. Он проходит через разрушение и переработку цитоплазматических органелл и макромолекул. Во время инициации аутофагии ATG7 действует как фермент E-1 для убиквитиноподобных белков (UBL), таких как ATG12 и ATG8. ATG7 помогает этим белкам UBL нацеливаться на их молекулы, связываясь с ними и активируя их передачу ферменту E-2. Роль ATG7 в обеих этих специфичных для аутофагии системах UBL делает его важным регулятором сборки аутофагосом. ^[11]

Гомологичный АТФ-связывающим и каталитическим сайтам белков-активаторов E1, ATG7 использует свой остаток цистеина для создания тиол-эфирной связи со свободными молекулами убиквитина. ^[9]^[12] Через UPS убиквитин будет продолжать связываться с другими белками, связанными с аутофагией, белками конъюгации E2 и протеинлигазами E3, чтобы прикрепить убиквитины к целевому субстрату и вызвать аутофагию. ^[13]

ATG 7 часто связан с секвенированным каскадом убиквитинирования ATG12 / ATG5 . А также при наличии путей клеточного цикла p53 в стрессовых и бедных питательными веществами средах. ^[14]^[15]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000197548 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030314 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Юань В., Стромхауг П.Е., Данн В.А. (май 1999 г.). «Глюкозо-индуцированная аутофагия пероксисом у Pichia Pastoris требует уникального E1-подобного белка» . Молекулярная биология клетки . 10 (5): 1353–66. дои : 10.1091/mbc.10.5.1353 . ПМК 25277 . ПМИД 10233149 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: ATG7 ATG7, связанный с аутофагией 7 гомолог (S. cerevisiae)» .
^ Интернет-менделевское наследование у человека (OMIM): АУТОФАГИЯ 7, S. CEREVISIAE, ГОМОЛОГ; АТГ7 - 608760
^ «Механизмы аутофагии: Нобелевская премия по физиологии и медицине 2016 г.» . ScienceDaily . Проверено 20 октября 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б Лилиенбаум А (март 2013 г.). «Связь между протеасомной системой и аутофагией» . Международный журнал биохимии и молекулярной биологии . 4 (1): 1–26. ПМК 3627065 . ПМИД 23638318 .
^ Юань В., Стромхауг П.Е., Данн В.А. (май 1999 г.). «Глюкозо-индуцированная аутофагия пероксисом у Pichia Pastoris требует уникального E1-подобного белка» . Молекулярная биология клетки . 10 (5): 1353–66. дои : 10.1091/mbc.10.5.1353 . ПМК 25277 . ПМИД 10233149 .
^ Сюн Дж (октябрь 2015 г.). «Atg7 в развитии и болезни: панацея или ящик Пандоры?» . Белок и клетка . 6 (10): 722–34. дои : 10.1007/s13238-015-0195-8 . ПМЦ 4598325 . ПМИД 26404030 .
^ Лекер С.Х., Голдберг А.Л., Митч В.Е. (июль 2006 г.). «Деградация белка по пути убиквитин-протеасома в норме и при заболеваниях» . Журнал Американского общества нефрологов . 17 (7): 1807–19. дои : 10.1681/ASN.2006010083 . ПМИД 16738015 .
^ Мён Дж, Ким КБ, Crews CM (июль 2001 г.). «Убиквитин-протеасомный путь и ингибиторы протеасом» . Обзоры медицинских исследований . 21 (4): 245–73. дои : 10.1002/med.1009.abs . ПМЦ 2556558 . ПМИД 11410931 .
^ Ли И.Х., Каваи Ю., Фергюссон М.М., Ровира II, Бишоп А.Дж., Мотояма Н., Цао Л., Финкель Т. (апрель 2012 г.). «Atg7 модулирует активность р53, регулируя клеточный цикл и выживаемость во время метаболического стресса» . Наука . 336 (6078): 225–8. Бибкод : 2012Sci...336..225L . дои : 10.1126/science.1218395 . ПМЦ 4721513 . ПМИД 22499945 .
^ Дас С (февраль 2018 г.). «Разгадка CNOT: новый игрок в связи смерти аутофагии и клеток». Научная сигнализация . 11 (516): eaar6364. doi : 10.1126/scisignal.aar6364 . ПМИД 29438015 . S2CID 3325931 .

Дальнейшее чтение

Танида И, Танида-Мияке Э, Комацу М, Уэно Т, Коминами Э (апрель 2002 г.). «Человеческий гомолог Apg3p/Aut1p является подлинным ферментом E2 для нескольких субстратов, GATE-16, GABARAP и MAP-LC3, и способствует конъюгации hApg12p с hApg5p» . Журнал биологической химии . 277 (16): 13739–44. дои : 10.1074/jbc.M200385200 . ПМИД 11825910 .
Танида И, Танида-Мияке Э, Нишитани Т, Комацу М, Ямазаки Х, Уэно Т, Коминами Е (март 2002 г.). «Мышиный Apg12p отдает предпочтение субстрату мышиного Apg7p перед тремя гомологами Apg8p». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 292 (1): 256–62. дои : 10.1006/bbrc.2002.6645 . ПМИД 11890701 .
Мизушима Н., Ёсимори Т., Осуми Ю. (декабрь 2002 г.). «Мышиный Apg10 как фермент, конъюгирующий Apg12: анализ с помощью двухгибридного метода дрожжей, опосредованного конъюгацией». Письма ФЭБС . 532 (3): 450–4. дои : 10.1016/S0014-5793(02)03739-0 . ПМИД 12482611 . S2CID 37247321 .
Немото Т., Танида И., Танида-Мияке Е., Минемацу-Икегути Н., Ёкота М., Осуми М., Уэно Т., Коминами Е. (октябрь 2003 г.). «Мышиный гомолог APG10, E2-подобный фермент конъюгации Apg12p, облегчает модификацию MAP-LC3» . Журнал биологической химии . 278 (41): 39517–26. дои : 10.1074/jbc.m300550200 . ПМИД 12890687 .
Оцуки Т, Ота Т, Нисикава Т, Хаяси К, Судзуки Ю, Ямамото Дж, Вакамацу А, Кимура К, Сакамото К, Хатано Н, Кавай Ю, Исии С, Сайто К, Кодзима С, Сугияма Т, Оно Т, Окано К , Ёсикава И., Аоцука С., Сасаки Н., Хаттори А., Окумура К., Нагай К., Сугано С., Исогай Т. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевых слов in silico для отбора полноразмерных кДНК человека, кодирующих секреторные или мембранные белки из библиотек кДНК с олигокепками» . Исследования ДНК . 12 (2): 117–26. дои : 10.1093/dnares/12.2.117 . ПМИД 16303743 .
Танида И., Соу Ю.С., Минемацу-Икегути Н., Уэно Т., Коминами Э. (июнь 2006 г.). «Atg8L/Apg8L является четвертым модификатором конъюгации Atg8 млекопитающих, опосредованной человеческими Atg4B, Atg7 и Atg3» . Журнал ФЭБС . 273 (11): 2553–62. дои : 10.1111/j.1742-4658.2006.05260.x . ПМИД 16704426 . S2CID 11899126 .

Внешние ссылки

человека ATG7 Расположение генома и страница сведений о гене ATG7 в браузере генома UCSC .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000197548 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030314 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10233149-5] Юань В., Стромхауг П.Е., Данн В.А. (май 1999 г.). «Глюкозо-индуцированная аутофагия пероксисом у Pichia Pastoris требует уникального E1-подобного белка» . Молекулярная биология клетки . 10 (5): 1353–66. дои : 10.1091/mbc.10.5.1353 . ПМК 25277 . ПМИД 10233149 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: ATG7 ATG7, связанный с аутофагией 7 гомолог (S. cerevisiae)» .

[7] Интернет-менделевское наследование у человека (OMIM): АУТОФАГИЯ 7, S. CEREVISIAE, ГОМОЛОГ; АТГ7 - 608760

[8] «Механизмы аутофагии: Нобелевская премия по физиологии и медицине 2016 г.» . ScienceDaily . Проверено 20 октября 2017 г.

[:0-9] Jump up to: ^а ^б Лилиенбаум А (март 2013 г.). «Связь между протеасомной системой и аутофагией» . Международный журнал биохимии и молекулярной биологии . 4 (1): 1–26. ПМК 3627065 . ПМИД 23638318 .

[ReferenceA-10] Юань В., Стромхауг П.Е., Данн В.А. (май 1999 г.). «Глюкозо-индуцированная аутофагия пероксисом у Pichia Pastoris требует уникального E1-подобного белка» . Молекулярная биология клетки . 10 (5): 1353–66. дои : 10.1091/mbc.10.5.1353 . ПМК 25277 . ПМИД 10233149 .

[pmid26404030-11] Сюн Дж (октябрь 2015 г.). «Atg7 в развитии и болезни: панацея или ящик Пандоры?» . Белок и клетка . 6 (10): 722–34. дои : 10.1007/s13238-015-0195-8 . ПМЦ 4598325 . ПМИД 26404030 .

[12] Лекер С.Х., Голдберг А.Л., Митч В.Е. (июль 2006 г.). «Деградация белка по пути убиквитин-протеасома в норме и при заболеваниях» . Журнал Американского общества нефрологов . 17 (7): 1807–19. дои : 10.1681/ASN.2006010083 . ПМИД 16738015 .

[13] Мён Дж, Ким КБ, Crews CM (июль 2001 г.). «Убиквитин-протеасомный путь и ингибиторы протеасом» . Обзоры медицинских исследований . 21 (4): 245–73. дои : 10.1002/med.1009.abs . ПМЦ 2556558 . ПМИД 11410931 .

[Lee_IH_p53-14] Ли И.Х., Каваи Ю., Фергюссон М.М., Ровира II, Бишоп А.Дж., Мотояма Н., Цао Л., Финкель Т. (апрель 2012 г.). «Atg7 модулирует активность р53, регулируя клеточный цикл и выживаемость во время метаболического стресса» . Наука . 336 (6078): 225–8. Бибкод : 2012Sci...336..225L . дои : 10.1126/science.1218395 . ПМЦ 4721513 . ПМИД 22499945 .

[Das_2018-15] Дас С (февраль 2018 г.). «Разгадка CNOT: новый игрок в связи смерти аутофагии и клеток». Научная сигнализация . 11 (516): eaar6364. doi : 10.1126/scisignal.aar6364 . ПМИД 29438015 . S2CID 3325931 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]