АТГ12

АТГ12
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	4GDK, 4GDL, 4NAW
Идентификаторы
Псевдонимы	ATG12 , APG12, APG12L, FBR93, HAPG12, связанные с аутофагией 12
Внешние идентификаторы	Опустить : 609608 ; МГИ : 1914776 ; Гомологен : 37953 ; Генные карты : ATG12 ; ОМА : ATG12 – ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	115,841,837 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	46,874,647 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	Achilles tendon; ; pericardium; ; pars reticulata; ; pons; ; lateral nuclear group of thalamus; ; corpus callosum; ; Pars compacta; ; external globus pallidus; ; subthalamic nucleus; ; visceral pleura;
	Top expressed in
	blood; ; cumulus cell; ; trigeminal ganglion; ; primary oocyte; ; lumbar spinal ganglion; ; perirhinal cortex; ; entorhinal cortex; ; retinal pigment epithelium; ; choroid plexus; ; spermatocyte;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	protein binding; Atg8 ligase activity;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; phagophore assembly site membrane; phagocytic vesicle membrane; Atg12-Atg5-Atg16 complex; membrane; autophagosome; protein-containing complex;
Biological process	autophagy; autophagy of nucleus; C-terminal protein lipidation; autophagy of mitochondrion; macroautophagy; autophagosome assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	9140
	67526
	ENSG00000145782
	ENSMUSG00000032905
	О94817
	Q9CQY1
	НМ_001277783 ; НМ_004707
	НМ_026217
	НП_001264712 ; НП_004698
	НП_080493
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Связанный с аутофагией 12 — это белок , который у людей кодируется ATG12 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Аутофагия — это процесс массовой деградации белков, при котором цитоплазматические компоненты, включая органеллы, заключаются в двухмембранные структуры, называемые аутофагосомами, и доставляются в лизосомы или вакуоли для деградации. ATG12 является человеческим гомологом дрожжевого белка, участвующего в аутофагии (Mizushima et al., 1998). [предоставлено OMIM] ^{[ 6 ]}

Аутофагия требует ковалентного присоединения белка Atg12 к ATG5 через убиквитин -подобную систему конъюгации. Конъюгат Atg12-Atg5 затем способствует конъюгации ATG8 с липидом фосфатидилэтаноламином . ^{[ 7 ]}

Было обнаружено, что Atg12 участвует в апоптозе . Этот белок способствует апоптозу посредством взаимодействия с антиапоптотическими членами семейства Bcl-2 . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000145782 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032905 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Мизусима Н., Сугита Х., Ёсимори Т., Осуми Ю. (январь 1999 г.). «Новая система конъюгации белков у человека. Аналог дрожжевой системы конъюгации Apg12p, необходимый для аутофагии» . J Биол Хим . 273 (51): 33889–33892. дои : 10.1074/jbc.273.51.33889 . ПМИД 9852036 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: ATG12 ATG12, связанный с аутофагией 12 гомолог (S. cerevisiae)» .
^ Дж. Генг и DJ Клионски, «Убиквитиноподобные системы конъюгации Atg8 и Atg12 в макроаутофагии». «Модификации белка: серия обзоров за пределами обычных подозреваемых», EMBO Rep, 9 (2008), 859-64.
^ А. Д. Рубинштейн, М. Эйзенштейн, Ю. Бер, С. Бялик и А. Кимчи, «Белок аутофагии Atg12 связывается с антиапоптотическими членами семейства Bcl-2, способствуя митохондриальному апоптозу», Mol Cell, 44 (2011), 698- 709

Внешние ссылки

человека ATG12 Расположение генома ATG12 и страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Приджионе А., Кортопасси Дж. (2007). «Делеции митохондриальной ДНК и лечение хлорамфениколом стимулируют аутофагический транскрипт ATG12» . Аутофагия . 3 (4): 377–80. дои : 10.4161/авто.4239 . ПМИД 17457038 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–1178. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А., Шенмен С.М., Граус Л.Х., Шулер Г. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–2127. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нишикава Т., Оцуки Т., Сугияма Т., Ири Р. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–45. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Мизушима Н., Кума А., Кобаяши Ю., Ямамото А., Мацубаэ М., Такао Т. и др. (2004). «Мышиный Apg16L, новый белок с WD-повторами, нацелен на мембрану аутофагической изоляции с помощью конъюгата Apg12-Apg5» . Дж. Клеточная наука . 116 (Часть 9): 1679–1688. дои : 10.1242/jcs.00381 . ПМИД 12665549 .
Мизусима Н., Ёсимори Т., Осуми Ю. (2003). «Мышиный Apg10 как фермент, конъюгирующий Apg12: анализ с помощью двухгибридного метода дрожжей, опосредованного конъюгацией» . ФЭБС Летт . 532 (3): 450–454. дои : 10.1016/S0014-5793(02)03739-0 . ПМИД 12482611 . S2CID 37247321 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х., Дерге Дж.Г., Клаузнер Р.Д., Коллинз Ф.С. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–16903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Танида И., Нишитани Т., Немото Т., Уэно Т., Коминами Е. (2002). «Apg12p млекопитающих, но не конъюгат Apg12p.Apg5p, облегчает обработку LC3». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 296 (5): 1164–1170. дои : 10.1016/S0006-291X(02)02057-0 . ПМИД 12207896 .
Танида И., Танида-Мияке Э., Нишитани Т., Комацу М., Ямадзаки Х., Уэно Т. и др. (2002). «Мышиный Apg12p отдает предпочтение субстрату мышиного Apg7p перед тремя гомологами Apg8p». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 292 (1): 256–262. дои : 10.1006/bbrc.2002.6645 . ПМИД 11890701 .
Танида И, Танида-Мияке Э, Комацу М, Уэно Т, Коминами Э (2002). «Человеческий гомолог Apg3p/Aut1p является подлинным ферментом E2 для нескольких субстратов, GATE-16, GABARAP и MAP-LC3, и способствует конъюгации hApg12p с hApg5p» . Ж. Биол. Хим . 277 (16): 13739–13744. дои : 10.1074/jbc.M200385200 . ПМИД 11825910 .
Уэно К., Кумагай Т., Кидзима Т., Кишимото Т., Хосоэ С. (1998). «Клонирование и тканевая экспрессия кДНК хромосомы 5q21-22, которая часто удаляется при распространенном раке легких». Хм. Жене . 102 (1): 63–68. дои : 10.1007/s004390050655 . ПМИД 9490301 . S2CID 36201527 .
Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соареш М.Б. (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геном Рез . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 5 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000145782 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032905 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9852036-5] Мизусима Н., Сугита Х., Ёсимори Т., Осуми Ю. (январь 1999 г.). «Новая система конъюгации белков у человека. Аналог дрожжевой системы конъюгации Apg12p, необходимый для аутофагии» . J Биол Хим . 273 (51): 33889–33892. дои : 10.1074/jbc.273.51.33889 . ПМИД 9852036 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: ATG12 ATG12, связанный с аутофагией 12 гомолог (S. cerevisiae)» .

[7] Дж. Генг и DJ Клионски, «Убиквитиноподобные системы конъюгации Atg8 и Atg12 в макроаутофагии». «Модификации белка: серия обзоров за пределами обычных подозреваемых», EMBO Rep, 9 (2008), 859-64.

[8] А. Д. Рубинштейн, М. Эйзенштейн, Ю. Бер, С. Бялик и А. Кимчи, «Белок аутофагии Atg12 связывается с антиапоптотическими членами семейства Bcl-2, способствуя митохондриальному апоптозу», Mol Cell, 44 (2011), 698- 709

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]