Protein-coding gene in the species Homo sapiens
Убиквитин-конъюгирующий фермент E2 D1 представляет собой белок , который у человека кодируется UBE2D1 геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
Модификация белков убиквитином является важным клеточным механизмом направленной деградации аномальных или короткоживущих белков. В убиквитинировании участвуют по крайней мере три класса ферментов: ферменты, активирующие убиквитин, или E1, ферменты, конъюгирующие убиквитин, или E2, и убиквитин-белковые лигазы, или E3. Этот ген кодирует члена семейства ферментов, конъюгирующих убиквитин Е2. Этот фермент тесно связан со стимулятором транспорта железа (SFT), и его активность повышается при наследственном гемохроматозе. Он также участвует в убиквитинировании белка-супрессора опухолей p53 и индуцируемого гипоксией транскрипционного фактора HIF1alpha путем взаимодействия с ферментом, активирующим убиквитин E1, и убиквитин-белковыми лигазами E3. [ 7 ]
Было показано, что UBE2D1 взаимодействует с:
^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000072401 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019927 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Робинсон П.А., Лик Дж.П., Ардли Х.К., Томпсон Дж., Роуз С.А., Маркхэм А.Ф. (март 1999 г.). «Отнесение UBE2D1 к полосам хромосом человека 10q11.2 → q21 путем гибридизации in situ». Цитогенетический клеточный генетик . 83 (3–4): 247–8. дои : 10.1159/000015195 . ПМИД 10072594 . S2CID 3059748 .
^ Дженсен Дж.П., Бейтс П.В., Ян М., Виерстра Р.Д., Вайсман А.М. (январь 1996 г.). «Идентификация семейства близкородственных ферментов, конъюгирующих убиквитин человека» . J Биол Хим . 270 (51): 30408–14. дои : 10.1074/jbc.270.51.30408 . ПМИД 8530467 .
^ Перейти обратно: а б «Ген Энтреза: убиквитин-конъюгирующий фермент E2D 1 UBE2D1 (гомолог UBC4/5, дрожжи)» .
^ Перейти обратно: а б Маллери Д.Л., Ванденберг С.Дж., Хиом К. (декабрь 2002 г.). «Активация функции лигазы Е3 комплекса BRCA1/BARD1 полиубиквитиновыми цепями» . ЭМБО Дж . 21 (24): 6755–62. дои : 10.1093/emboj/cdf691 . ПМК 139111 . ПМИД 12485996 .
^ Перейти обратно: а б Кенцис А., Гордон Р.Э., Борден К.Л. (ноябрь 2002 г.). «Контроль биохимических реакций посредством самосборки супрамолекулярного домена RING» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (24): 15404–9. Бибкод : 2002PNAS...9915404K . дои : 10.1073/pnas.202608799 . ПМК 137729 . ПМИД 12438698 .
^ Перейти обратно: а б Чен А., Клейман Ф.Е., Мэнли Дж.Л., Оучи Т., Пан ZQ (июнь 2002 г.). «Аутоубиквитинирование убиквитинлигазы BRCA1*BARD1 RING» . Ж. Биол. Хим . 277 (24): 22085–92. дои : 10.1074/jbc.M201252200 . ПМИД 11927591 .
^ Перейти обратно: а б Донг Ю, Хакими М.А., Чен Х, Кумарасвами Э, Куч Н.С., Годвин А.К., Шихаттар Р. (ноябрь 2003 г.). «Регуляция BRCC, голоферментного комплекса, содержащего BRCA1 и BRCA2, с помощью сигналосомоподобной субъединицы и ее роль в репарации ДНК» . Мол. Клетка . 12 (5): 1087–99. дои : 10.1016/s1097-2765(03)00424-6 . ПМИД 14636569 .
^ Перейти обратно: а б Сато К., Хаями Р., Ву В, Нисикава Т., Нисикава Х., Окуда Ю., Огата Х., Фукуда М., Ота Т. (июль 2004 г.). «Нуклеофосмин/B23 является кандидатом на субстрат для убиквитинлигазы BRCA1-BARD1» . Ж. Биол. Хим . 279 (30): 30919–22. дои : 10.1074/jbc.C400169200 . ПМИД 15184379 .
^ Перейти обратно: а б Ву-Баер Ф., Лаграсон К., Юань В., Баер Р. (сентябрь 2003 г.). «Гетеродимер BRCA1/BARD1 собирает полиубиквитиновые цепи посредством нетрадиционной связи с участием остатка лизина K6 убиквитина» . Ж. Биол. Хим . 278 (37): 34743–6. дои : 10.1074/jbc.C300249200 . ПМИД 12890688 .
^ Перейти обратно: а б Ванденберг С.Дж., Гергели Ф., Онг С.И., Пейс П., Маллери Д.Л., Хиом К., Патель К.Дж. (июль 2003 г.). «BRCA1-независимое убиквитинирование FANCD2» . Мол. Клетка . 12 (1): 247–54. дои : 10.1016/s1097-2765(03)00281-8 . ПМИД 12887909 .
^ Перейти обратно: а б Хасидзуме Р., Фукуда М., Маэда И., Нисикава Х., Ояке Д., Ябуки Ю., Огата Х., Охта Т. (май 2001 г.). «Гетеродимер RING BRCA1-BARD1 представляет собой убиквитинлигазу, инактивированную мутацией, вызванной раком молочной железы» . Ж. Биол. Хим . 276 (18): 14537–40. дои : 10.1074/jbc.C000881200 . ПМИД 11278247 .
^ Бржович П.С., Киф Дж.Р., Нисикава Х., Миямото К., Фокс Д., Фукуда М., Охта Т., Клевит Р. (май 2003 г.). «Связывание и распознавание при сборке активного комплекса убиквитин-лигазы BRCA1/BARD1» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (10): 5646–51. Бибкод : 2003PNAS..100.5646B . дои : 10.1073/pnas.0836054100 . ПМК 156255 . ПМИД 12732733 .
^ Нисикава Х., Оока С., Сато К., Арима К., Окамото Дж., Клевит Р.Э., Фукуда М., Охта Т. (февраль 2004 г.). «Масс-спектрометрический и мутационный анализы выявляют Lys-6-связанные полиубиквитиновые цепи, катализируемые убиквитинлигазой BRCA1-BARD1» . Ж. Биол. Хим . 279 (6): 3916–24. дои : 10.1074/jbc.M308540200 . ПМИД 14638690 .
^ Нубер У, Шварц С., Кайзер П., Шнайдер Р., Шеффнер М. (февраль 1996 г.). «Клонирование человеческих убиквитин-конъюгирующих ферментов UbcH6 и UbcH7 (E2-F1) и характеристика их взаимодействия с E6-AP и RSP5» . Ж. Биол. Хим . 271 (5): 2795–800. дои : 10.1074/jbc.271.5.2795 . ПМИД 8576257 .
^ Нубер У, Шеффнер М (март 1999 г.). «Идентификация детерминант ферментов, конъюгирующих убиквитин E2, необходимых для взаимодействия убиквитин-белок-лигазы hect E3» . Ж. Биол. Хим . 274 (11): 7576–82. дои : 10.1074/jbc.274.11.7576 . ПМИД 10066826 .
Шеффнер М., Хуибрегце Дж.М., Хоули П.М. (1994). «Идентификация человеческого убиквитин-конъюгирующего фермента, который опосредует E6-AP-зависимое убиквитинирование р53» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 91 (19): 8797–801. Бибкод : 1994PNAS...91.8797S . дои : 10.1073/pnas.91.19.8797 . ПМК 44693 . ПМИД 8090726 .
Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соареш М.Б. (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геном Рез . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
Хатакеяма С., Дженсен Дж.П., Вайсман А.М. (1997). «Субклеточная локализация и взаимодействие убиквитин-конъюгирующих ферментов (E2) убиквитиновых протеинлигаз семейства HECT млекопитающих» . Ж. Биол. Хим . 272 (24): 15085–92. дои : 10.1074/jbc.272.24.15085 . ПМИД 9182527 .
Гутьеррес Х.А., Ю Дж., Ривера С., Весслинг-Резник М. (1997). «Клонирование функциональной экспрессии и характеристика SFT, стимулятора транспорта железа» . Дж. Клеточная Биол . 139 (4): 895–905. дои : 10.1083/jcb.139.4.895 . ПМК 2139974 . ПМИД 9362508 .
Гутьеррес Х.А., Ю Дж., Весслинг-Ресник М. (1999). «Характеристика и хромосомное картирование человеческого гена SFT, стимулятора транспорта Fe». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 253 (3): 739–42. дои : 10.1006/bbrc.1998.9836 . ПМИД 9918797 .
Нубер У, Шеффнер М (1999). «Идентификация детерминант ферментов, конъюгирующих убиквитин E2, необходимых для взаимодействия убиквитин-белок-лигазы hect E3» . Ж. Биол. Хим . 274 (11): 7576–82. дои : 10.1074/jbc.274.11.7576 . ПМИД 10066826 .
Камура Т., Сато С., Иваи К., Чижик-Кржеска М., Конэвей Р.К., Конавей Дж.В. (2000). «Активация убиквитинирования HIF1α восстановленным опухолевым супрессорным комплексом фон Хиппеля-Линдау (VHL)» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (19): 10430–5. Бибкод : 2000PNAS...9710430K . дои : 10.1073/pnas.190332597 . ПМК 27041 . ПМИД 10973499 .
Принга Э., Мартинес-Ноэль Г., Мюллер У., Харберс К. (2001). «Взаимодействие U-бокс-мотива белка ядерной точки, связанного с безымянным пальцем, с ферментами, конъюгирующими убиквитин» . Ж. Биол. Хим . 276 (22): 19617–23. дои : 10.1074/jbc.M100192200 . ПМИД 11274149 .
Хасидзуме Р., Фукуда М., Маэда И., Нисикава Х., Ояке Д., Ябуки Ю., Огата Х., Охта Т. (2001). «Гетеродимер RING BRCA1-BARD1 представляет собой убиквитинлигазу, инактивированную мутацией, вызванной раком молочной железы» . Ж. Биол. Хим . 276 (18): 14537–40. дои : 10.1074/jbc.C000881200 . ПМИД 11278247 .
Мацудзава С.И., Рид Дж.К. (2001). «Siah-1, SIP и Ebi сотрудничают в новом пути деградации бета-катенина, связанном с ответами p53» . Мол. Клетка . 7 (5): 915–26. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00242-8 . ПМИД 11389839 .
Цзян Дж., Баллинджер К.А., Ву Ю, Дай К., Сир Д.М., Хофельд Дж., Паттерсон С. (2001). «CHIP представляет собой U-бокс-зависимую убиквитинлигазу E3: идентификация Hsc70 как мишени для убиквитинирования» . Ж. Биол. Хим . 276 (46): 42938–44. дои : 10.1074/jbc.M101968200 . ПМИД 11557750 .
Чен А., Клейман Ф.Е., Мэнли Дж.Л., Оучи Т., Пан ZQ (2002). «Аутоубиквитинирование убиквитинлигазы BRCA1*BARD1 RING» . Ж. Биол. Хим . 277 (24): 22085–92. дои : 10.1074/jbc.M201252200 . ПМИД 11927591 .
Бадсионг Дж.К., Хаас А.Л. (2003). «MdmX представляет собой убиквитинлигазу RING-пальца, способную синергически усиливать убиквитинирование Mdm2» . Ж. Биол. Хим . 277 (51): 49668–75. дои : 10.1074/jbc.M208593200 . ПМИД 12393902 .
Кенцис А., Гордон Р.Э., Борден К.Л. (2003). «Контроль биохимических реакций посредством самосборки супрамолекулярного домена RING» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (24): 15404–9. Бибкод : 2002PNAS...9915404K . дои : 10.1073/pnas.202608799 . ПМК 137729 . ПМИД 12438698 .
Герке С.Г., Ридель Х.Д., Херрманн Т., Хадащик Б., Бентс К., Вельткамп С., Штреммель В. (2003). «UbcH5A, член человеческого фермента, конъюгирующего убиквитин E2, тесно связан с SFT, стимулятором транспорта железа, и его активность повышается при наследственном гемохроматозе» . Кровь . 101 (8): 3288–93. дои : 10.1182/кровь-2002-07-2192 . ПМИД 12480712 .
Маллери Д.Л., Ванденберг С.Дж., Хиом К. (2004). «Активация функции лигазы Е3 комплекса BRCA1/BARD1 полиубиквитиновыми цепями» . ЭМБО Дж . 21 (24): 6755–62. дои : 10.1093/emboj/cdf691 . ПМК 139111 . ПМИД 12485996 .
Такеяма К., Агиар Р.К., Гу Л., Хе С., Фриман Г.Дж., Куток Дж.Л., Астер Дж.К., Шипп М.А. (2003). «БАЛ-связывающий белок BBAP и родственные ему члены семейства Deltex проявляют активность изопептид-лигазы убиквитин-белок» . Ж. Биол. Хим . 278 (24): 21930–7. дои : 10.1074/jbc.M301157200 . ПМИД 12670957 .