БАБА 5

БАБА 5
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3GUC, 3H8V, 5HKH
Идентификаторы
Псевдонимы	UBA5 , THIFP1, UBE1DC1, убиквитиноподобный модификатор, активирующий фермент 5, SCAR24, EIEE44, DEE44
Внешние идентификаторы	Опустить : 610552 ; МГИ : 1913913 ; Гомологен : 11738 ; Генные карты : UBA5 ; ОМА : UBA5 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	132,679,794 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	103,940,333 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	body of pancreas; ; right adrenal gland; ; right adrenal cortex; ; left adrenal gland; ; left adrenal cortex; ; parotid gland; ; anterior pituitary; ; Achilles tendon; ; minor salivary glands; ; secondary oocyte;
	Top expressed in
	lacrimal gland; ; Ileal epithelium; ; parotid gland; ; seminal vesicula; ; fossa; ; islet of Langerhans; ; supraoptic nucleus; ; facial motor nucleus; ; substantia nigra; ; median eminence;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	nucleotide binding; protein binding; ubiquitin-like modifier activating enzyme activity; ATP binding; metal ion binding; UFM1 activating enzyme activity;
Cellular component	cytoplasm; intracellular membrane-bounded organelle; nucleus; cytosol; Golgi apparatus;
Biological process	regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway; protein K69-linked ufmylation; response to endoplasmic reticulum stress; protein ufmylation; neuromuscular process; protein modification by small protein conjugation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	79876
	66663
	ENSG00000081307
	ENSMUSG00000032557
	Q9GZZ9
	Q8VE47
	НМ_024818 ; НМ_198329 ; НМ_001320210 ; НМ_001321238 ; НМ_001321239
	НМ_025692
	НП_001307139 ; НП_001308167 ; НП_001308168 ; НП_079094 ; НП_938143
	НП_079968
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фермент 5, активирующий убиквитин-подобный модификатор, представляет собой белок , который у человека кодируется UBA5 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Этот ген кодирует члена семейства E1-подобных активирующих ферментов. Для этого гена были обнаружены два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000081307 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032557 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Виман С, Вейль Б, Велленройтер Р, Гассенхубер Дж, Глассль С, Ансорж В, Бохер М, Блокер Х, Бауэрсахс С, Блюм Х, Лаубер Дж, Дастерхофт А, Бейер А, Корер К, Штрак Н, Мьюз Х.В., Оттенвальдер Б , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных кДНК человека, кодирующих белки» . Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
^ Комацу М., Чиба Т., Тацуми К., Иемура С., Танида И., Окадзаки Н., Уэно Т., Коминами Е., Нацуме Т., Танака К. (май 2004 г.). «Новая система конъюгации белков для Ufm1, модификатора убиквитиновой складки» . ЭМБО Дж . 23 (9): 1977–86. дои : 10.1038/sj.emboj.7600205 . ПМК 404325 . ПМИД 15071506 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: UBE1DC1, активирующий убиквитин фермент E1-домен, содержащий 1» .

Дальнейшее чтение

Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соареш М.Б. (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геном Рез . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геном Рез . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Симпсон Дж.К., Велленройтер Р., Пустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, выявленная с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . Представитель ЭМБО . 1 (3): 287–92. дои : 10.1093/embo-reports/kvd058 . ПМЦ 1083732 . ПМИД 11256614 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Виман С., Арлт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геном Рез . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Доу Т., Гу С., Лю Дж. и др. (2006). «Выделение и характеристика убиквитин-активирующего фермента E1-домена, содержащего 1, UBE1DC1». Мол. Биол. Представитель . 32 (4): 265–71. дои : 10.1007/s11033-005-4822-y . ПМИД 16328888 . S2CID 24569517 .
Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Геном Рез . 16 (1): 55–65. дои : 10.1101/гр.4039406 . ПМЦ 1356129 . ПМИД 16344560 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (Проблема с базой данных): D415–8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9GZZ9 (человеческий убиквитиноподобный модификатор, активирующий фермент 5 (UBE1DC1)) в PDBe-KB .

статья о гене на хромосоме 3 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000081307 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032557 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11230166-5] Виман С, Вейль Б, Велленройтер Р, Гассенхубер Дж, Глассль С, Ансорж В, Бохер М, Блокер Х, Бауэрсахс С, Блюм Х, Лаубер Дж, Дастерхофт А, Бейер А, Корер К, Штрак Н, Мьюз Х.В., Оттенвальдер Б , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных кДНК человека, кодирующих белки» . Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .

[pmid15071506-6] Комацу М., Чиба Т., Тацуми К., Иемура С., Танида И., Окадзаки Н., Уэно Т., Коминами Е., Нацуме Т., Танака К. (май 2004 г.). «Новая система конъюгации белков для Ufm1, модификатора убиквитиновой складки» . ЭМБО Дж . 23 (9): 1977–86. дои : 10.1038/sj.emboj.7600205 . ПМК 404325 . ПМИД 15071506 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: UBE1DC1, активирующий убиквитин фермент E1-домен, содержащий 1» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]