УБЭ2Л6

УБЭ2Л6
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 1WZV, 1WZW, 2KJH
Идентификаторы
Псевдонимы	UBE2L6 , RIG-B, UBCH8, фермент, конъюгирующий убиквитин E2 L6
Внешние идентификаторы	Опустить : 603890 ; МГИ : 1914500 ; Гомологен : 3112 ; Генные карты : UBE2L6 ; OMA : UBE2L6 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 11 (human) Band 11q12.1 Start 57,551,656 bp End 57,568,284 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 2 (mouse) Band 2|2 D Start 84,629,172 bp End 84,640,679 bp
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in granulocyte monocyte tendon of biceps brachii palpebral conjunctiva ganglionic eminence lymph node spleen appendix gallbladder stromal cell of endometrium Top expressed in blood blastocyst granulocyte fetal liver hematopoietic progenitor cell yolk sac tibiofemoral joint spleen embryo lumbar spinal ganglion duodenum More reference expression data BioGPS More reference expression data
показывать Генная онтология Molecular function ubiquitin-like protein transferase activity transferase activity ISG15 transferase activity protein binding ubiquitin-protein transferase activity ubiquitin binding ubiquitin protein ligase binding ubiquitin conjugating enzyme activity Cellular component cytosol nucleoplasm ubiquitin ligase complex Biological process ISG15-protein conjugation translesion synthesis negative regulation of type I interferon production modification-dependent protein catabolic process protein ubiquitination ubiquitin-dependent protein catabolic process Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 9246 56791 Вместе ENSG00000156587 ENSMUSG00000027078 ЮниПрот О14933 Q9QZU9 RefSeq (мРНК) НМ_198183 НМ_004223 НМ_019949 RefSeq (белок) НП_004214 НП_937826 НП_064333 Местоположение (UCSC) Чр 11: 57,55 – 57,57 Мб Chr 2: 84,63 – 84,64 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Фермент E2 L6, конъюгирующий убиквитин/ISG15, представляет собой белок , который у человека кодируется UBE2L6 геном .

Модификация белков убиквитином является важным клеточным механизмом направленной деградации аномальных или короткоживущих белков. В убиквитинировании участвуют как минимум три класса ферментов : убиквитин-активирующие ферменты ( E1S ), убиквитин-конъюгирующие ферменты ( E2S ) и убиквитин-белковые лигазы (E3s). Этот ген кодирует члена семейства ферментов, конъюгирующих убиквитин Е2.

Этот фермент по первичной структуре очень похож на фермент, кодируемый геном UBE2L3 . два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы . Для этого гена были обнаружены

Дальнейшее чтение

• Кан ХИ, Йе С., Фудзимото Н., Чанг С. (1999). «Клонирование и характеристика коактиватора простаты человека ARA54, нового белка, который связывается с андрогенным рецептором» . Ж. Биол. Хим . 274 (13): 8570–6. дои : 10.1074/jbc.274.13.8570 . ПМИД   10085091 .
• Мойнихан Т.П., Ардли Х.К., Нубер У. и др. (1999). «Убиквитин-конъюгирующие ферменты UbcH7 и UbcH8 взаимодействуют с доменами HHARI и H7-AP1, содержащими мотив RING Finger/IBR» . Ж. Биол. Хим . 274 (43): 30963–8. дои : 10.1074/jbc.274.43.30963 . ПМИД   10521492 .
• Хуан Л., Киннукан Э., Ван Г. и др. (1999). «Структура комплекса E6AP-UbcH7: понимание убиквитинирования ферментативным каскадом E2-E3». Наука . 286 (5443): 1321–6. дои : 10.1126/science.286.5443.1321 . ПМИД   10558980 .
• Найман Т.А., Матикайнен С., Саренева Т. и др. (2000). «Анализ протеома показывает, что убиквитин-конъюгирующие ферменты представляют собой новое семейство генов, регулируемых интерфероном-альфа» . Евро. Дж. Биохим . 267 (13): 4011–9. дои : 10.1046/j.1432-1327.2000.01433.x . PMID   10866800 .
• Ардли Х.К., Роуз С.А., Тан Н. и др. (2000). «Геномная организация гена человеческого убиквитин-конъюгирующего фермента UBE2L6 на хромосоме 11q12». Цитогенет. Клеточная генетика . 89 (1–2): 137–40. дои : 10.1159/000015593 . ПМИД   10894956 . S2CID   502452 .
• Чжан Ю, Гао Дж, Чунг К.К. и др. (2001). «Паркин действует как E2-зависимая убиквитин-протеин-лигаза и способствует деградации белка, ассоциированного с синаптическими пузырьками, CDCrel-1» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (24): 13354–9. дои : 10.1073/pnas.240347797 . ПМК   27228 . ПМИД   11078524 .
• Нива Дж., Исигаки С., Дою М. и др. (2001). «Новый центросомальный белок безымянного пальца, дорфин, опосредует активность убиквитинлигазы». Биохим. Биофиз. Рез. Общий . 281 (3): 706–13. дои : 10.1006/bbrc.2001.4414 . ПМИД   11237715 .
• Уиллер Т.С., Чин Л.С., Ли Ю и др. (2002). «Регуляция деградации синаптофизина гомологами семи млекопитающих заочно» . Ж. Биол. Хим . 277 (12): 10273–82. дои : 10.1074/jbc.M107857200 . ПМИД   11786535 .
• Урано Т., Сайто Т., Цукуи Т. и др. (2002). «Efp нацелен на сигму 14-3-3 для протеолиза и способствует росту опухоли молочной железы». Природа . 417 (6891): 871–5. Бибкод : 2002Natur.417..871U . дои : 10.1038/nature00826 . ПМИД   12075357 . S2CID   4348545 .
• Чин Л.С., Вавалле Дж.П., Ли Л. (2002). «Смотрю, новая убиквитин-белковая лигаза E3, которая нацелена на деградацию синтаксина 1» . Ж. Биол. Хим . 277 (38): 35071–9. дои : 10.1074/jbc.M203300200 . ПМИД   12121982 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД   14702039 .
• Чуанг Т.Х., Улевич Р.Дж. (2004). «Triad3A, убиквитин-белковая лигаза E3, регулирующая Toll-подобные рецепторы». Нат. Иммунол . 5 (5): 495–502. дои : 10.1038/ni1066 . ПМИД   15107846 . S2CID   39773935 .
• Чжао С., Боденон С.Л., Келли М.Л. и др. (2004). «Фермент убиквитина E2 UbcH8 также является ферментом E2 для ISG15, IFN-альфа/бета-индуцированного убиквитиноподобного белка» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (20): 7578–82. Бибкод : 2004PNAS..101.7578Z . дои : 10.1073/pnas.0402528101 . ПМК   419648 . ПМИД   15131269 .
• Трипати М.К., Чаудхури Дж. (2005). «Понижение уровня регуляции UCRP и UBE2L6 в клетках молочной железы человека, ноктуированных BRCA2» . Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 328 (1): 43–8. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.12.142 . ПМК   3085986 . ПМИД   15670748 .
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД   16189514 . S2CID   4427026 .
• Ли Дж., Ван Дж., Ян X и др. (2007). «Гомолог Spen Msx2, взаимодействующий с ядерным мишеневым белком, взаимодействует с убиквитин-конъюгирующим ферментом E2 UbcH8». Мол. Клетка. Биохим . 288 (1–2): 151–7. дои : 10.1007/s11010-006-9131-9 . ПМИД   16583136 . S2CID   24935755 .