Jump to content

УБЭ2Л3

УБЭ2Л3
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы UBE2L3 , E2-F1, L-UBC, UBCH7, UbcM4, фермент, конъюгирующий убиквитин E2 L3
Внешние идентификаторы Опустить : 603721 ; МГИ : 109240 ; Гомологен : 43226 ; Генные карты : UBE2L3 ; OMA : UBE2L3 — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_001256355
НМ_001256356
НМ_003347
НМ_198157

НМ_009456

RefSeq (белок)

НП_001243284
НП_001243285
НП_003338
НП_003338.1

НП_033482

Местоположение (UCSC) Чр 22: 21,55 – 21,62 Мб Чр 16: 16.97 – 17.02 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Убиквитин-конъюгирующий фермент E2 L3 (UBE2L3), также называемый UBCH7, представляет собой белок , который у человека кодируется UBE2L3 геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Как фермент E2, UBE2L3 участвует в убиквитинировании белков-мишеней для деградации. [ 7 ] Роль UBE2L3 в убиквитинировании предшественника NF-κB предполагает его участие в различных основных аутоиммунных заболеваниях, включая ревматоидный артрит (РА), целиакию , болезнь Крона (БК) и системную красную волчанку . [ 8 ]

Структура

[ редактировать ]

Ген UBE2L3 расположен на хромосоме 22q 11.21 и состоит из 6 экзонов . Для этого гена были обнаружены два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. [ 7 ]

У человека имеется 38 ферментов Е2. [ 9 ] Все они содержат консервативный каталитический основной домен , который взаимодействует с E1 и E3, а многие E2 обладают дополнительными N- и/или C-концевыми белковыми последовательностями. [ 10 ] [ 11 ] В отличие от других E2, остатки, необходимые для реакционной способности лизина , отсутствуют: остатки D87 и D117 (в нумерации UBCH5C ) заменены остатками Pro и His . [ 12 ]

Модификация белков убиквитином является важным клеточным механизмом направленного воздействия на аномальные или короткоживущие белки для деградации . В убиквитинировании участвуют как минимум три класса ферментов: убиквитин-активирующие ферменты (E1s), убиквитин-конъюгирующие ферменты (E2s) и убиквитин-белковые лигазы (E3s). E2 играют ключевую роль во всем пути передачи убиквитина (Ub) и отвечают за передачу клеточных сигналов Ub . В отличие от многих E2, которые переносят Ub с помощью RING, UBE2L3 обладает E3-независимой реактивностью с лизином. [ 12 ] Показано, что этот фермент участвует в убиквитинировании p53 , c-Fos и предшественника NF-κB p105 in vitro. UBE2L3 прежде всего известен своей ролью в клеточном цикле . В частности, UBE2L3 управляет уровнями регуляторных белков клеточного цикла посредством протеолитического пути убиквитина (UPP) во время перехода G1/S и во время фактической S-фазы . [ 13 ]

Клиническое значение

[ редактировать ]

По данным полногеномных ассоциативных исследований (GWAS), UBE2L3 был связан с несколькими аутоиммунными заболеваниями, включая РА , целиакию , БК и СКВ , посредством убиквитинирования предшественника NK-κB. [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] Эта ассоциация наблюдалась в европейском, азиатском и афроамериканском населении. [ 13 ] UBE2L3 связан с цитотоксической функцией естественных клеток-киллеров, а высокие уровни UBE2L3 способствуют излечению хронической инфекции HBV. [ 8 ] [ 15 ] UBE2L3 контролирует стабильность белка 53BP1 и определяет выбор способа восстановления двухцепочечного разрыва ДНК . Потеря UBE2L3 стабилизирует 53BP1 и заставляет клетки выбирать NHEJ для восстановления двухцепочечного разрыва ДНК. Восстановление с помощью NHEJ приводит к радиальным хромосомам и гибели клеток. [ 16 ] [ 17 ] Истощение UBE2L3 может стать новой стратегией усиления эффекта противораковой терапии. [ 18 ] гаплотип гена UBE2L3 Сообщается также, что связан с тиреоидитом Хашимото у китайской популяции хань. [ 19 ] (27094594)

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что UBE2L3 взаимодействует с:

  1. ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000185651 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038965 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Мойнихан Т.П., Ардли ХК, Лик Дж.П., Томпсон Дж., Бриндл Н.С., Маркхэм А.Ф., Робинсон П.А. (октябрь 1996 г.). «Характеристика гена человеческого убиквитин-конъюгирующего фермента UBE2L3». Мамм. Геном . 7 (7): 520–5. дои : 10.1007/s003359900155 . ПМИД   8672131 . S2CID   36212813 .
  6. ^ Мойнихан Т.П., Коул К.Г., Данэм И., О'Нил Л., Маркхэм А.Ф., Робинсон П.А. (сентябрь 1998 г.). «Точное картирование, геномная организация и анализ транскриптов гена человеческого убиквитин-конъюгирующего фермента UBE2L3». Геномика . 51 (1): 124–7. дои : 10.1006/geno.1998.5257 . ПМИД   9693040 .
  7. ^ Jump up to: а б с «Ген Энтреза: убиквитин-конъюгирующий фермент UBE2L3 E2L 3» .
  8. ^ Jump up to: а б Ху З, Лю Ю, Чжай Икс, Дай Дж, Цзинь Г, Ван Л и др. (декабрь 2013 г.). «Новые локусы, связанные с хронической инфекцией вируса гепатита В у ханьцев». Природная генетика . 45 (12): 1499–503. дои : 10.1038/ng.2809 . ПМИД   24162738 . S2CID   23028494 .
  9. ^ Деше Р.Дж., Жоазейро, Калифорния (2009). «Убиквитинлигазы домена RING E3». Ежегодный обзор биохимии . 78 : 399–434. doi : 10.1146/annurev.biochem.78.101807.093809 . ПМИД   19489725 . S2CID   35042803 .
  10. ^ Элетр З.М., Хуанг Д.Т., Дуда Д.М., Шульман Б.А., Кульман Б. (октябрь 2005 г.). «Ферменты, конъюгирующие E2, должны отделиться от своих ферментов E1 перед E3-зависимым убиквитином и убиквитиноподобным переносом». Структурная и молекулярная биология природы . 12 (10): 933–4. дои : 10.1038/nsmb984 . ПМИД   16142244 . S2CID   40700043 .
  11. ^ Венцель Д.М., Столл К.Е., Клевит Р.Э. (январь 2011 г.). «E2s: структурно экономичный и функционально насыщенный» . Биохимический журнал . 433 (1): 31–42. дои : 10.1042/BJ20100985 . ПМК   3118098 . ПМИД   21158740 .
  12. ^ Jump up to: а б Венцель Д.М., Лисунов А., Бжович П.С., Клевит Р.Э. (июнь 2011 г.). «Профиль реактивности UBCH7 показывает, что паркин и HHARI являются гибридами RING/HECT» . Природа . 474 (7349): 105–8. дои : 10.1038/nature09966 . ПМЦ   3444301 . ПМИД   21532592 .
  13. ^ Jump up to: а б с Ван С., Адрианто И., Уайли ГБ, Лессард С.Дж., Келли Дж.А., Адлер А.Дж. и др. (июль 2012 г.). «Функциональный гаплотип UBE2L3 повышает риск системной красной волчанки» . Гены и иммунитет . 13 (5): 380–7. дои : 10.1038/gen.2012.6 . ПМЦ   3411915 . ПМИД   22476155 .
  14. ^ Jump up to: а б с д Цзо XB, Шэн YJ, Ху SJ, Гао JP, Ли Y, Тан HY, Тан XF, Ченг Х, Инь XY, Вэнь ЛЛ, Сунь ЛД, Ян С, Цуй Ю, Чжан XJ (2014). «Варианты TNFSF4, TNFAIP3, TNIP1, BLK, SLC15A4 и UBE2L3 взаимодействуют, повышая риск системной красной волчанки у населения Китая». Ревматол Int . 34 (4): 459–64. дои : 10.1007/s00296-013-2864-3 . ПМИД   24091983 . S2CID   22804352 .
  15. ^ Jump up to: а б Франсен К., Висчедейк MC, ван Зоммерен С., Фу Дж.Й., Франке Л., Фестен Е.А., Стоккерс ПК, ван Бодегравен А.А., Крузиус Дж.Б., Хоммес Д.В., Занен П., де Йонг DJ, Вейменга К., ван Димен CC, Веерсма Р.К. (сентябрь) 2010). «Анализ SNP, влияющих на экспрессию генов, идентифицирует UBE2L3 и BCL3 как потенциальные новые гены риска болезни Крона» . Молекулярная генетика человека . 19 (17): 3482–8. дои : 10.1093/hmg/ddq264 . ПМИД   20601676 .
  16. ^ Бауман П., Эли А., Эсканделл Дж. М., Питерс М., Барткова Дж., Ван дер Гулден Х., Хиддинг С., Танасула М., Кулкарни А., Ян К., Хаффти Б. Г., Томмиска Дж., Бломквист С., Драпкин Р., Адамс DJ., Неванлинна Х. Бартек Дж., Тарсунас М., Ганесан С., Джонкерс Дж. (июнь 2010 г.). «Потеря 53BP1 спасает дефицит BRCA1 и связана с тройным негативным раком молочной железы и раком молочной железы с мутацией BRCA» . Структурная и молекулярная биология природы . 17 (6): 688–95. дои : 10.1038/nsmb.1831 . ПМЦ   2912507 . ПМИД   20453858 .
  17. ^ Цао Л., Сюй X, Бантинг С.Ф., Лю Дж., Ван Р.Х., Цао Л.Л., Ву Дж.Дж., Пэн Т.Н., Чен Дж., Нуссенцвейг А., Дэн С.Х., Финкель Т. (август 2009 г.). «Селективная потребность в 53BP1 в биологическом ответе на геномную нестабильность, вызванную дефицитом Brca1» . Молекулярная клетка . 35 (4): 534–41. doi : 10.1016/j.molcel.2009.06.037 . ПМК   3392030 . ПМИД   19716796 .
  18. ^ Митчелл LJ, Муди CJ (ноябрь 2014 г.). «Солнечное фотохимическое окисление спиртов с использованием каталитического гидрохинона и наночастиц меди в присутствии кислорода: окислительное расщепление моделей лигнина». Журнал органической химии . 79 (22): 11091–100. дои : 10.1021/jo5020917 . ПМИД   25322456 .
  19. ^ Ван Ю, Чжу Ю. Ф., Ван Ц, Сюй Дж, Ян Н, Сюй Дж, Ши Л. Ф., Хэ С. Т., Чжан Цз А (19 апреля 2016 г.). «Гаплотип гена UBE2L3 связан с тиреоидитом Хашимото у китайской популяции хань» . Эндокринные заболевания BMC . 16:18 . дои : 10.1186/s12902-016-0098-6 . ПМЦ   4837539 . ПМИД   27094594 .
  20. ^ Тан Н.Г., Ардли ХК, Скотт ГБ, Роуз С.А., Маркхэм А.Ф., Робинсон П.А. (ноябрь 2003 г.). «Человеческий гомолог ариадны способствует убиквитилированию белка, гомологичного фактору инициации трансляции 4E, 4EHP» . ФЭБС Летт . 554 (3): 501–4. дои : 10.1016/s0014-5793(03)01235-3 . ПМИД   14623119 .
  21. ^ Мойнихан Т.П., Ардли ХК, Нубер Ю, Роуз С.А., Джонс П.Ф., Маркхэм А.Ф., Шеффнер М., Робинсон П.А. (октябрь 1999 г.). «Убиквитин-конъюгирующие ферменты UbcH7 и UbcH8 взаимодействуют с доменами HHARI и H7-AP1, содержащими мотив RING Finger/IBR» . Ж. Биол. Хим . 274 (43): 30963–8. дои : 10.1074/jbc.274.43.30963 . ПМИД   10521492 .
  22. ^ Ардли ХК, Тан Н.Г., Роуз С.А., Маркхэм А.Ф., Робинсон П.А. (июнь 2001 г.). «Особенности паркин/ариадноподобной убиквитинлигазы HHARI, которые регулируют ее взаимодействие с убиквитин-конъюгирующим ферментом Ubch7» . Ж. Биол. Хим . 276 (22): 19640–7. дои : 10.1074/jbc.M011028200 . ПМИД   11278816 .
  23. ^ Jump up to: а б с д и ж Уиткомб Э.А., Дудек Э.Дж., Лю К., Тейлор А. (январь 2009 г.). «Новый контроль S-фазы клеточного цикла с помощью убиквитин-конъюгирующего фермента H7» . Молекулярная биология клетки . 20 (1): 1–9. дои : 10.1091/mbc.E08-01-0036 . ПМК   2613108 . ПМИД   18946090 .
  24. ^ Ёкоучи М., Кондо Т., Хоутон А., Барткевич М., Хорн В.К., Чжан Х., Йошимура А., Барон Р. (октябрь 1999 г.). «Индуцированное лигандом убиквитинирование рецептора эпидермального фактора роста включает взаимодействие RING-пальца c-Cbl и UbcH7» . Ж. Биол. Хим . 274 (44): 31707–12. дои : 10.1074/jbc.274.44.31707 . ПМИД   10531381 .
  25. ^ Чжэн Н., Ван П., Джеффри П.Д., Павлетич Н.П. (август 2000 г.). «Структура комплекса c-Cbl-UbcH7: функция домена RING в убиквитин-белковых лигазах» . Клетка . 102 (4): 533–9. дои : 10.1016/S0092-8674(00)00057-X . ПМИД   10966114 .
  26. ^ Вонг ES, Фонг CW, Лим Дж, Юсофф П., Лоу BC, Лэнгдон Вайоминг, Гай GR (сентябрь 2002 г.). «Sprouty2 ослабляет убиквитилирование и эндоцитоз рецептора эпидермального фактора роста и, следовательно, усиливает передачу сигналов Ras/ERK» . ЭМБО Дж . 21 (18): 4796–808. дои : 10.1093/emboj/cdf493 . ПМК   126289 . ПМИД   12234920 .
  27. ^ Jump up to: а б Анан Т., Нагата Ю., Кога Х., Хонда Ю., Ябуки Н., Миямото С., Кувано А., Мацуда И., Эндо Ф., Сая Х., Накао М. (ноябрь 1998 г.). «Человеческая убиквитин-белковая лигаза Nedd4: экспрессия, субклеточная локализация и избирательное взаимодействие с убиквитин-конъюгирующими ферментами». Генные клетки . 3 (11): 751–63. дои : 10.1046/j.1365-2443.1998.00227.x . ПМИД   9990509 . S2CID   1653536 .
  28. ^ Брюс М.К., Канелис В., Фуладку Ф., Дебонневиль А., Стауб О., Ротин Д. (октябрь 2008 г.). «Регуляция самоубиквитинирования и стабильности Nedd4-2 с помощью мотива PY, расположенного внутри его HECT-домена». Биохим. Дж . 415 (1): 155–63. дои : 10.1042/BJ20071708 . ПМИД   18498246 .
  29. ^ Нубер У, Шварц С., Кайзер П., Шнайдер Р., Шеффнер М. (февраль 1996 г.). «Клонирование человеческих убиквитин-конъюгирующих ферментов UbcH6 и UbcH7 (E2-F1) и характеристика их взаимодействия с E6-AP и RSP5» . Ж. Биол. Хим . 271 (5): 2795–800. дои : 10.1074/jbc.271.5.2795 . ПМИД   8576257 .
  30. ^ Хуанг Л., Киннукан Э., Ван Г., Боденон С., Хоули П.М., Хуибрегце Дж.М., Павлетич Н.П. (ноябрь 1999 г.). «Структура комплекса E6AP-UbcH7: понимание убиквитинирования ферментным каскадом E2-E3». Наука . 286 (5443): 1321–6. дои : 10.1126/science.286.5443.1321 . ПМИД   10558980 .
  31. ^ Принга Э., Мартинес-Ноэль Г., Мюллер У., Харберс К. (июнь 2001 г.). «Взаимодействие U-бокс-мотива белка ядерной точки, связанного с безымянным пальцем, с ферментами, конъюгирующими убиквитин» . Ж. Биол. Хим . 276 (22): 19617–23. дои : 10.1074/jbc.M100192200 . ПМИД   11274149 .
[ редактировать ]
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P68036 (убиквитин-конъюгирующий фермент E2 L3) на PDBe-KB .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 6b795d1acd56aa71a70325ba5f59ee06__1698278820
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/6b/06/6b795d1acd56aa71a70325ba5f59ee06.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
UBE2L3 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)