УБР1

УБР1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 3NY1
Идентификаторы
Псевдонимы	UBR1 , JBS, компонент убиквитинпротеинлигазы E3, n-распознаватель 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 605981 ; МГИ : 1277977 ; Гомологен : 7582 ; Генные карты : UBR1 ; ОМА : UBR1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 15 (human) Band 15q15.2 Start 42,942,897 bp End 43,106,113 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 2 (mouse) Band 2 E5|2 60.37 cM Start 120,690,750 bp End 120,801,196 bp
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in pancreatic epithelial cell germinal epithelium visceral pleura endothelial cell parietal pleura Brodmann area 23 thymus pancreatic ductal cell epithelium of nasopharynx tibia Top expressed in ascending aorta aortic valve supraoptic nucleus retinal pigment epithelium ciliary body pineal gland cumulus cell iris genital tubercle tail of embryo More reference expression data BioGPS n/a
показывать Генная онтология Molecular function ubiquitin-protein transferase activity zinc ion binding leucine binding metal ion binding ubiquitin protein ligase activity transferase activity protein binding Cellular component cytoplasm proteasome complex cytosol ubiquitin ligase complex Biological process negative regulation of TOR signaling cellular response to leucine ubiquitin-dependent protein catabolic process via the N-end rule pathway protein catabolic process protein ubiquitination ubiquitin-dependent protein catabolic process Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 197131 22222 Вместе ENSG00000159459 ENSMUSG00000027272 ЮниПрот Q8IWV7 О70481 RefSeq (мРНК) НМ_174916 НМ_009461 RefSeq (белок) НП_777576 НП_033487 Местоположение (UCSC) Чр 15: 42,94 – 43,11 Мб Chr 2: 120,69 – 120,8 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Человеческий ген UBR1 кодирует фермент убиквитин-протеинлигазу Е3, компонент н-рекогнин 1 .

Путь правила N-конца является одним из протеолитических путей убиквитиновой системы. Компонент узнавания этого пути, кодируемый этим геном, связывается с дестабилизирующим N-концевым остатком белка-субстрата и участвует в формировании связанной с субстратом мультиубиквитиновой цепи. Это приводит к возможной деградации белка-субстрата. Белок, описанный в этой записи, имеет цинковый палец типа RING и цинковый палец типа UBR. Мутации в этом гене связаны с синдромом Йохансона-Близзарда .

Дальнейшее чтение

• Варшавский А (1996). «Правило N-конца: функции, тайны, использование» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (22): 12142–9. Бибкод : 1996PNAS...9312142V . дои : 10.1073/pnas.93.22.12142 . ПМК   37957 . ПМИД   8901547 .
• Чианнилкулчай Н., Пастурауд П., Ричард И. и др. (1995). «Карта первичной экспрессии области хромосомы 15q15, содержащей рецессивную форму гена поясно- конечностной мышечной дистрофии (LGMD2A)». Хм. Мол. Жене . 4 (4): 717–25. дои : 10.1093/hmg/4.4.717 . ПМИД   7633422 .
• Дгани О., Авидан Н., Делоне Дж. и др. (2003). «Врожденная дизеритропоэтическая анемия I типа вызвана мутациями коданина-1» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 71 (6): 1467–74. дои : 10.1086/344781 . ПМЦ   378595 . ПМИД   12434312 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД   14702039 .
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК   514446 . ПМИД   15302935 .
• Инь Дж., Квон Ю.Т., Варшавский А., Ван В. (2005). «RECQL4, мутировавший при синдромах Ротмунда-Томсона и RAPADILINO, взаимодействует с убиквитинлигазами UBR1 и UBR2 пути правила N-конца» . Хм. Мол. Жене . 13 (20): 2421–30. дои : 10.1093/hmg/ddh269 . ПМИД   15317757 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Квак К.С., Чжоу X, Соломон В. и др. (2005). «Регуляция катаболизма белков с помощью специфической для мышц и цитокин-индуцируемой убиквитинлигазы E3альфа-II во время раковой кахексии». Рак Рез . 64 (22): 8193–8. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-04-2102 . ПМИД   15548684 . S2CID   20424565 .
• Тасаки Т., Малдер Л.С., Ивамацу А. и др. (2005). «Семейство убиквитин-лигаз E3 млекопитающих, которые содержат мотив UBR Box и распознают N-дегроны» . Мол. Клетка. Биол . 25 (16): 7120–36. дои : 10.1128/MCB.25.16.7120-7136.2005 . ПМК   1190250 . ПМИД   16055722 .
• Стельзл Ю., Ворм Ю., Лаловски М. и др. (2005). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД   16169070 . S2CID   8235923 .
• Ценкер М., Майерле Дж., Лерх М.М. и др. (2006). «Дефицит UBR1, убиквитинлигазы пути правила N-конца, вызывает дисфункцию поджелудочной железы, пороки развития и умственную отсталость (синдром Йохансона-Близзарда)» (PDF) . Нат. Жене . 37 (12): 1345–50. дои : 10.1038/ng1681 . ПМИД   16311597 . S2CID   23050042 .
• Сасаки Т., Кодзима Х., Кисимото Р. и др. (2006). «Пространственно-временная регуляция c-Fos с помощью ERK5 и убиквитинлигазы E3 UBR1 и ее биологическая роль» . Мол. Клетка . 24 (1): 63–75. doi : 10.1016/j.molcel.2006.08.005 . ПМИД   17018293 .
• Цзоу В, Ван Дж, Чжан ДЭ (2007). «Негативная регуляция лигазы E3 ISG15 EFP посредством ее аутоISGylation» . Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 354 (1): 321–7. дои : 10.1016/j.bbrc.2006.12.210 . ПМЦ   1858649 . ПМИД   17222803 .
• Сакане А., Хатакеяма С., Сасаки Т. (2007). «Участие Rabring7 в деградации рецептора EGF как лигазы E3». Биохим. Биофиз. Рез. Коммуна 357 (4): 1058–64. дои : 10.1016/j.bbrc.2007.04.052 . ПМИД   17462600 .
• Вэй С., Линь Л.Ф., Ян CC и др. (2007). «Тиазолидиндионы модулируют экспрессию бета-катенина и других белков, регулирующих клеточный цикл, воздействуя на белки F-бокса убиквитинлигазы белка Skp1-Cul1-F-box E3 независимо от гамма-рецептора, активируемого пролифератором пероксисомы» (PDF) . Мол. Фармакол . 72 (3): 725–33. дои : 10.1124/моль.107.035287 . ПМИД   17569795 . S2CID   38439682 .