УРМ1
| Urm1 (модификатор, связанный с убиквитином) | |||
|---|---|---|---|
 Модификатор-1, связанный с убиквитином (2qjl) . В центре белка расположена β-складка. Кроме того, карбокси-концевой глицин в ди-глициновом мотиве отмечен синим цветом, а ионы Mg представлены черными сферами. | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | УРМ1 | ||
| Пфам | PF09138 | ||
| ИнтерПро | ИПР015221 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | д.15.3.3 / ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ / СУПФАМ | ||
| |||
Модификатор-1, связанный с убиквитином (URM1), представляет собой убиквитиноподобный белок , который модифицирует белки в дрожжевом убиквитиноподобном пути урмилирования . [ 1 ] Структурные сравнения и филогенетический анализ суперсемейства убиквитинов показали, что Urm1 обладает наиболее консервативными структурными и последовательностными особенностями общего предка всего суперсемейства. [ 2 ] [ 3 ]
Urm1 характеризуется основной складкой β-захвата и незаменимым карбокси-концевым глицином внутри ди-глицинового мотива. Известно, что Urm1 конъюгируется с пероксиредоксином Ahp1 , ATPBD3 и CTU2 и человеческим MOCS3 посредством механизма, включающего E1-подобный белок Uba4 через остатки лизина. [ 4 ] Подобно убиквитинированию, урмилирование требует промежуточного тиоэфира и образует изопептидные связи между Urm1 и его субстратами. Более того, процесс урмилирования может быть значительно усилен окислительным стрессом. [ 5 ] Функционирует как белковая метка, участвуя в распознавании питательных веществ и реакции на окислительный стресс.
Недавно было продемонстрировано, что Urm1 может действовать как переносчик серы при тиолировании эукариотической тРНК посредством механизма, который требует образования тиокарбоксилированного Urm1. [ 6 ] URM1 участвует в тиолировании цитоплазматических тРНК; получает серу от Е1-подобного фермента Uba4 и переносит ее на тРНК. Исследования последовательности и структурной гомологии показывают, что Urm1 может быть более тесно связан с прокариотическими белками-переносчиками серы, ThiS и MoaD, которые можно рассматривать как прокариотические аналоги эукариотических UBls. [ 7 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Геринг А.С., Риверс Д.М., Спраг Г.Ф. (ноябрь 2003 г.). «Урмилирование: убиквитиноподобный путь, который функционирует во время инвазивного роста и почкования у дрожжей» . Молекулярная биология клетки . 14 (11): 4329–41. дои : 10.1091/mbc.E03-02-0079 . ПМК 266754 . ПМИД 14551258 .
- ^ Сюй Дж, Чжан Дж, Ван Л, Чжоу Дж, Хуан Х, Ву Дж, Чжун Ю, Ши Ю (август 2006 г.). «Структура раствора Urm1 и ее значение для происхождения белковых модификаторов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (31): 11625–30. Бибкод : 2006PNAS..10311625X . дои : 10.1073/pnas.0604876103 . ПМЦ 1518799 . ПМИД 16864801 .
- ^ Геринг А.С., Риверс Д.М., Спраг Г.Ф. (ноябрь 2003 г.). «Урмилирование: убиквитиноподобный путь, который функционирует во время инвазивного роста и почкования у дрожжей» . Молекулярная биология клетки . 14 (11): 4329–41. дои : 10.1091/mbc.E03-02-0079 . ПМК 266754 . ПМИД 14551258 .
- ^ Ван дер Вин А.Г., Шорпп К., Шликер С., Бути Л., Дэймон Дж.Р., Спунер Э., Плох Х.Л., Йентч С. (февраль 2011 г.). «Роль убиквитиноподобного белка Urm1 как неканонического модификатора белка, направленного на лизин» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (5): 1763–70. дои : 10.1073/pnas.1014402108 . ПМЦ 3033243 . ПМИД 21209336 .
- ^ Ван Ф., Лю М., Цю Р., Цзи С. (август 2011 г.). «Двойная роль убиквитиноподобного белка Urm1 как модификатора белка и переносчика серы» . Белок и клетка . 2 (8): 612–9. дои : 10.1007/s13238-011-1074-6 . ПМЦ 4875326 . ПМИД 21904977 .
- ^ Петроски, доктор медицинских наук, Салвесен Г.С., Вольф Д.А. (февраль 2011 г.). «Urm1 связывает перенос серы с функцией убиквитиноподобного белка при окислительном стрессе» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (5): 1749–50. Бибкод : 2011PNAS..108.1749P . дои : 10.1073/pnas.1019043108 . ПМК 3033263 . ПМИД 21245332 .
- ^ Педриоли П.Г., Лейдель С., Хофманн К. (декабрь 2008 г.). «Urm1 на перекрестке модификаций. Серия обзоров «Модификации белка: за пределами обычных подозреваемых»» . Отчеты ЭМБО . 9 (12): 1196–202. дои : 10.1038/embor.2008.209 . ПМК 2603462 . ПМИД 19047990 .