Ауксилин

ДНКJC6
Идентификаторы
Псевдонимы	DNAJC6 , DJC6, PARK19, ауксилин, член C6 семейства белков теплового шока DnaJ (Hsp40)
Внешние идентификаторы	Опустить : 608375 ; МГИ : 1919935 ; Гомологен : 8865 ; Генные карты : DNAJC6 ; OMA : DNAJC6 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	65,415,871 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	101,499,996 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	endothelial cell; ; Brodmann area 23; ; Pars compacta; ; pars reticulata; ; orbitofrontal cortex; ; middle temporal gyrus; ; lateral nuclear group of thalamus; ; pons; ; inferior olivary nucleus; ; Brodmann area 46;
	Top expressed in
	medial dorsal nucleus; ; dorsomedial hypothalamic nucleus; ; ventral tegmental area; ; pontine nuclei; ; medial geniculate nucleus; ; paraventricular nucleus of hypothalamus; ; lateral geniculate nucleus; ; piriform cortex; ; primary motor cortex; ; central gray substance of midbrain;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	protein tyrosine phosphatase activity; SH3 domain binding; phosphoprotein phosphatase activity; hydrolase activity; clathrin binding;
Cellular component	cytosol; synapse; vesicle; postsynaptic density; cytoplasm; intracellular membrane-bounded organelle; presynapse;
Biological process	peptidyl-tyrosine dephosphorylation; regulation of clathrin-dependent endocytosis; protein dephosphorylation; clathrin coat disassembly; receptor-mediated endocytosis; membrane organization; synaptic vesicle uncoating; clathrin-dependent endocytosis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9829
	72685
	ENSG00000116675
	ENSMUSG00000028528
	О75061
	Q80TZ3
	НМ_001256864 ; НМ_001256865 ; НМ_014787
showНМ_001164583 ; НМ_001164584 ; НМ_001164585 ; НМ_198412 ; НМ_001355179 ;
	NM_001355180
	НП_001243793 ; НП_001243794 ; НП_055602
showНП_001158055 ; НП_001158056 ; НП_001158057 ; НП_940804 ; НП_001342108 ;
	NP_001342109
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Предполагаемая тирозин-протеинфосфатаза ауксилин представляет собой фермент , который у человека кодируется DNAJC6 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

DNAJC6 принадлежит к эволюционно консервативному семейству белков DNAJ/HSP40, которые регулируют активность молекулярных шаперонов путем стимуляции активности АТФазы. Белки DNAJ могут иметь до 3 различных доменов: консервативный J-домен из 70 аминокислот, обычно на N-конце, область, богатую глицином/фенилаланином (G/F), и домен, богатый цистеином, содержащий 4 мотива, напоминающие цинковый домен. -домен пальца (Оцука и Хата, 2000). ^{[ 7 ]}

Структура

Домен протеинтирозинфосфатазы и пара доменов C2 ауксилина, расположенные вблизи N-конца полипептида, составляют супердомен, тандемное расположение двух или более номинально неродственных доменов, которые образуют единую наследственную единицу. ^{[ 8 ]} Домен фосфатазы принадлежит к подсемейству ауксилиновых липидных фосфатаз и, по прогнозам, является каталитически неактивным. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000116675 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028528 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Секи Н., Охира М., Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н., Накадзима Д., Номура Н., Охара О (октябрь 1997 г.). «Характеристика клонов кДНК в фракционированных по размеру библиотеках кДНК из мозга человека» . Исследования ДНК . 4 (5): 345–9. дои : 10.1093/dnares/4.5.345 . ПМИД 9455484 .
^ Оцука К., Хата М. (апрель 2000 г.). «Гомологи HSP40/DNAJ млекопитающих: клонирование новых кДНК и предложение по их классификации и номенклатуре» . Клеточные стрессы и шапероны . 5 (2): 98–112. doi : 10.1379/1466-1268(2000)005<0098:mhdhco>2.0.co;2 (неактивен 12 марта 2024 г.). ПМК 312896 . ПМИД 11147971 . {{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на март 2024 г. ( ссылка )
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: гомолог DNAJC6 DnaJ (Hsp40), подсемейство C, член 6» .
^ Хейни Д.Т., Сюэ Б. (май 2015 г.). «Супердомены в иерархии структуры белков: случай PTP-C2» . Белковая наука . 24 (5): 874–82. дои : 10.1002/pro.2664 . ПМЦ 4420535 . ПМИД 25694109 .
^ «Подсемейство фосфатаз ауксилин — PhosphataseWiki» . phosphatome.net .
^ Чен М.Дж., Диксон Дж.Э., Мэннинг Дж. (апрель 2017 г.). «Геномика и эволюция протеинфосфатаз». Научная сигнализация . 10 (474): eaag1796. doi : 10.1126/scisignal.aag1796 . ПМИД 28400531 . S2CID 41041971 .

Внешние ссылки

Местоположение генома человека DNAJC6 и DNAJC6 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Сузуки Ю, Ямасита Р, Широта М, Сакакибара Ю, Тиба Дж, Мидзусима-Сугано Дж, Накаи К, Сугано С (сентябрь 2004 г.). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши обнаруживает гомологичную блочную структуру в областях промотора» . Геномные исследования . 14 (9): 1711–8. дои : 10.1101/гр.2435604 . ПМК 515316 . ПМИД 15342556 .
Шееле У., Алвес Дж., Франк Р., Дювель М., Калтофф К., Унгевикелл Э. (июль 2003 г.). «Молекулярная и функциональная характеристика детерминант, связывающих клатрин и AP-2, в неупорядоченном домене ауксилина» . Журнал биологической химии . 278 (28): 25357–68. дои : 10.1074/jbc.M303738200 . ПМИД 12732633 .
Шееле У., Калтхофф К., Унгевикелл Э. (сентябрь 2001 г.). «Множественные взаимодействия ауксилина 1 с клатрином и адаптерным комплексом AP-2» . Журнал биологической химии . 276 (39): 36131–8. дои : 10.1074/jbc.M106511200 . ПМИД 11470803 .
Исикава К., Нагасе Т., Накадзима Д., Секи Н., Охира М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (октябрь 1997 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. VIII. 78 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследования ДНК . 4 (5): 307–13. дои : 10.1093/dnares/4.5.307 . ПМИД 9455477 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000116675 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028528 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9455484-5] Секи Н., Охира М., Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н., Накадзима Д., Номура Н., Охара О (октябрь 1997 г.). «Характеристика клонов кДНК в фракционированных по размеру библиотеках кДНК из мозга человека» . Исследования ДНК . 4 (5): 345–9. дои : 10.1093/dnares/4.5.345 . ПМИД 9455484 .

[pmid11147971-6] Оцука К., Хата М. (апрель 2000 г.). «Гомологи HSP40/DNAJ млекопитающих: клонирование новых кДНК и предложение по их классификации и номенклатуре» . Клеточные стрессы и шапероны . 5 (2): 98–112. doi : 10.1379/1466-1268(2000)005<0098:mhdhco>2.0.co;2 (неактивен 12 марта 2024 г.). ПМК 312896 . ПМИД 11147971 . {{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на март 2024 г. ( ссылка )

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: гомолог DNAJC6 DnaJ (Hsp40), подсемейство C, член 6» .

[8] Хейни Д.Т., Сюэ Б. (май 2015 г.). «Супердомены в иерархии структуры белков: случай PTP-C2» . Белковая наука . 24 (5): 874–82. дои : 10.1002/pro.2664 . ПМЦ 4420535 . ПМИД 25694109 .

[9] «Подсемейство фосфатаз ауксилин — PhosphataseWiki» . phosphatome.net .

[10] Чен М.Дж., Диксон Дж.Э., Мэннинг Дж. (апрель 2017 г.). «Геномика и эволюция протеинфосфатаз». Научная сигнализация . 10 (474): eaag1796. doi : 10.1126/scisignal.aag1796 . ПМИД 28400531 . S2CID 41041971 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]