УБЭ2В1

УБЭ2В1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 2A4D, 2C2V, 2HLW
Идентификаторы
Псевдонимы	UBE2V1 , CIR1, CROC-1, CROC1, UBE2V, UEV-1, UEV1, UEV1A, фермент, конъюгирующий убиквитин E2 V1
Внешние идентификаторы	Опустить : 602995 ; МГИ : 1913839 ; Гомологен : 81888 ; Генные карты : UBE2V1 ; OMA : UBE2V1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 20 (human) Band 20q13.13 Start 50,081,124 bp End 50,115,959 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 2 (mouse) Band 2 H3|2 87.44 cM Start 167,449,558 bp End 167,474,015 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in epithelium of colon superior frontal gyrus tonsil smooth muscle tissue placenta ganglionic eminence primary visual cortex bone marrow cells skin of leg monocyte Top expressed in tail of embryo epiblast Cortex of frontal lobe dentate gyrus of hippocampal formation granule cell superior frontal gyrus striatum of neuraxis neural tube urinary bladder ventricular zone primary visual cortex More reference expression data BioGPS n/a
showГенная онтология Molecular function protein binding ubiquitin protein ligase activity ubiquitin protein ligase binding ubiquitin conjugating enzyme activity Cellular component cytoplasm cytosol ubiquitin conjugating enzyme complex UBC13-UEV1A complex ubiquitin ligase complex extracellular exosome nucleus nucleoplasm protein-containing complex Biological process protein polyubiquitination Fc-epsilon receptor signaling pathway protein K63-linked ubiquitination nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway positive regulation of transcription, DNA-templated stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway regulation of DNA repair regulation of transcription, DNA-templated T cell receptor signaling pathway cell differentiation postreplication repair positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling JNK cascade positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity interleukin-1-mediated signaling pathway Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 7335 66589 Вместе ENSG00000244687 ENSMUSG00000078923 ЮниПрот Q13404 Q9CZY3 RefSeq (мРНК) showНМ_001032288 НМ_001257393 НМ_001257394 НМ_001257395 НМ_001257396 NM_001257397 NM_001257398 NM_001257399 NM_001282575 NM_001282576 NM_001282577 NM_001282578 NM_001282579 NM_001282580 NM_021988 NM_022442 NM_199144 НМ_023230 НМ_001311131 НМ_001311146 RefSeq (белок) showНП_001027459 НП_001244322 НП_001244323 НП_001244324 НП_001244325 NP_001244326 NP_001244327 NP_001244328 NP_001269504 NP_001269505 NP_001269506 NP_001269507 NP_001269508 NP_001269509 NP_068823 NP_071887 NP_954595 NP_954673 НП_001298060 НП_001298075 НП_075719 Местоположение (UCSC) Чр 20: 50.08 – 50.12 Мб Chr 2: 167,45 – 167,47 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Убиквитин-конъюгирующий фермент Е2 вариант 1 представляет собой белок , который у человека кодируется UBE2V1 геном .

Функция

Варианты белков фермента E2, конъюгирующие с убиквитином, составляют отдельное подсемейство в семействе белков E2. Они имеют сходство последовательности с другими ферментами, конъюгирующими убиквитин, но лишены консервативного остатка цистеина, который имеет решающее значение для каталитической активности E2. Белок, кодируемый этим геном, расположен в ядре и может вызывать активацию транскрипции протоонкогена FOS человека. Считается, что он участвует в контроле дифференцировки путем изменения поведения клеточного цикла. Для этого гена описано множество альтернативно сплайсированных транскриптов, кодирующих разные изоформы. Был идентифицирован псевдоген, который также расположен на хромосоме 20. Совместная транскрипция этого гена и соседнего вышестоящего гена генерирует редкий транскрипт (Kua-UEV), который кодирует слитый белок, состоящий из последовательностей, разделяющих идентичность с каждым отдельным генным продуктом.

Взаимодействия

Было показано, что UBE2V1 взаимодействует с UBE2N .

Дальнейшее чтение

• Лонг М (2001). «Новая функция возникла в результате слияния генов» . Геном Рез . 10 (11): 1655–7. дои : 10.1101/гр.165700 . ПМИД   11076848 .
• Томсон Т.М., Халид Х., Лосано Дж.Дж., Санчо Э., Ариньо Дж. (1998). «Роль UEV-1A, гомолога белка-супрессора опухоли TSG101, в защите от повреждения ДНК». ФЭБС Летт . 423 (1): 49–52. Бибкод : 1998FEBSL.423...49T . дои : 10.1016/S0014-5793(98)00060-X . ПМИД   9580084 . S2CID   28536857 .
• Сяо В., Линь С.Л., Брумфилд С., Чоу Б.Л., Вэй Ю.Ф. (1998). «Продукты дрожжевого MMS2 и двух человеческих гомологов (hMMS2 и CROC-1) образуют структурно и функционально консервативное семейство Ubc-подобных белков» . Нуклеиновые кислоты Рез . 26 (17): 3908–14. дои : 10.1093/нар/26.17.3908 . ПМК   147796 . ПМИД   9705497 .
• Ма Л., Брумфилд С., Лавери С., Лин С.Л., Сяо В., Баккетти С. (1998). «Повышение экспрессии CIR1/CROC1 при иммортализации клеток и в клеточных линиях человека, полученных из опухолей». Онкоген . 17 (10): 1321–6. дои : 10.1038/sj.onc.1202058 . ПМИД   9771976 . S2CID   9281963 .
• Хофманн Р.М., Пиккарт К.М. (1999). «Неканонический фермент, кодирующий убиквитин, кодируемый MMS2, участвует в сборке новых полиубиквитиновых цепей для репарации ДНК» . Клетка . 96 (5): 645–53. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80575-9 . ПМИД   10089880 . S2CID   17117789 .
• Дэн Л., Ван С., Спенсер Э., Ян Л., Браун А., Ю Дж., Слотер С., Пиккарт С., Чен З.Дж. (2000). «Активация киназного комплекса IkappaB с помощью TRAF6 требует наличия димерного убиквитин-конъюгирующего ферментного комплекса и уникальной полиубиквитиновой цепи» . Клетка . 103 (2): 351–61. дои : 10.1016/S0092-8674(00)00126-4 . ПМИД   11057907 . S2CID   18154645 .
• Томсон Т.М., Лосано Дж.Дж., Лукили Н., Каррио Р., Серрас Ф., Корманд Б., Валери М., Диас В.М., Абриль Дж., Берсет М., Мерино Дж., Макайя А., Короминас М., Гиго Р. (2001). «Слияние человеческого гена коэффектора полиубиквитинирования UEV1 с недавно идентифицированным геном Kua» . ГеномРес . 10 (11): 1743–56. дои : 10.1101/gr.GR-1405R . ПМК   310942 . PMID   11076860 .
• Ито М., Ситидзё С., Цуда Н., Очи М., Харашима Н., Сайто Н., Ито К. (2001). «Молекулярные основы опосредованного Т-клетками распознавания клеток рака поджелудочной железы». Рак Рез . 61 (5): 2038–46. ПМИД   11280764 .
• Андерсен П.Л., Чжоу Х., Пастушок Л., Мораес Т., Маккенна С., Зиола Б., Эллисон М.Дж., Диксит В.М., Сяо В. (2005). «Четкая регуляция функций Ubc13 с помощью двух вариантов убиквитин-конъюгирующих ферментов Mms2 и Uev1A» . Дж. Клеточная Биол . 170 (5): 745–55. дои : 10.1083/jcb.200502113 . ПМК   2171356 . ПМИД   16129784 .
• Хау Д.Д., Льюис М.Дж., Салтибус Л.Ф., Пастушок Л., Сяо В., Спиракопулос Л. (2006). «Структура и взаимодействие варианта убиквитин-конъюгирующего фермента человека Uev1a: значение для ферментативного синтеза полиубиквитиновых цепей». Биохимия . 45 (32): 9866–77. дои : 10.1021/bi060631r . ПМИД   16893187 .
• Сайед Н.А., Андерсен П.Л., Уоррингтон Р.К., Сяо В. (2007). «Uev1A, вариант фермента, конъюгирующего убиквитин, ингибирует вызванный стрессом апоптоз посредством активации NF-каппаВ». Апоптоз . 11 (12): 2147–57. дои : 10.1007/s10495-006-0197-3 . ПМИД   17041755 . S2CID   6078250 .
• Петроски, доктор медицины, Чжоу X, Донг Г, Дэниел-Иссакани С, Паян Д.Г., Хуан Дж (2007). «Модификация субстрата с помощью лизин-63-связанных цепей убиквитина посредством фермента, конъюгирующего убиквитин UBC13-UEV1A» . Ж. Биол. Хим . 282 (41): 29936–45. дои : 10.1074/jbc.M703911200 . ПМИД   17709375 .