УБЭ2Д2

УБЭ2Д2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1UR6, 1W4U, 2CLW, 2ESK, 2ESO, 2ESP, 2ESQ, 3A33, 3JVZ, 3JW0, 3L1Y, 3TGD, 3ZNI, 4A49, 4A4B, 4A4C, 4AUQ, 4DDG, 4LDT, 4V3K, 4V3L, 4WZ3, 5D1L, 5D1K, 5D0M, 5D0K, 5D1M, 5EDV
Идентификаторы
Псевдонимы	UBE2D2 , E2(17)KB2, PUBC1, UBC4, UBC4/5, UBCH4, UBCH5B, фермент, конъюгирующий убиквитин E2 D2
Внешние идентификаторы	Опустить : 602962 ; МГИ : 1930715 ; Гомологен : 2506 ; Генные карты : UBE2D2 ; OMA : UBE2D2 — ортологи
Номер ЕС	2.3.2.24
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	139,628,434 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	35,942,547 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; right testis; ; left testis; ; right uterine tube; ; gastrocnemius muscle; ; granulocyte; ; sperm; ; rectum; ; tibial arteries;
	Top expressed in
	Gonadal ridge; ; ventral tegmental area; ; external carotid artery; ; dorsomedial hypothalamic nucleus; ; pineal gland; ; mammillary body; ; paraventricular nucleus of hypothalamus; ; human fetus; ; median eminence; ; dorsal tegmental nucleus;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	transferase activity; nucleotide binding; ubiquitin-protein transferase activity; protein binding; ATP binding; ubiquitin conjugating enzyme activity; ubiquitin protein ligase binding;
Cellular component	cytosol; ubiquitin ligase complex; nucleoplasm; extracellular exosome; protein-containing complex;
Biological process	ubiquitin-dependent protein catabolic process; protein polyubiquitination; stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway; Fc-epsilon receptor signaling pathway; protein K48-linked ubiquitination; regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia; T cell receptor signaling pathway; protein autoubiquitination; protein ubiquitination; MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway; protein targeting to peroxisome; protein K11-linked ubiquitination;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	7322
	56550
	ENSG00000131508
	ENSMUSG00000091896
	P62837
	P62838
	НМ_003339 ; НМ_181838
	НМ_019912
	НП_003330 ; НП_862821
	НП_064296
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Убиквитин-конъюгирующий фермент E2 D2 представляет собой белок , который у человека кодируется UBE2D2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Модификация белков убиквитином является важным клеточным механизмом направленной деградации аномальных или короткоживущих белков. В убиквитинировании участвуют по крайней мере три класса ферментов: ферменты, активирующие убиквитин, или E1, ферменты, конъюгирующие убиквитин, или E2, и убиквитин-белковые лигазы, или E3. Этот ген кодирует члена семейства ферментов, конъюгирующих убиквитин Е2. Этот фермент участвует в убиквитинировании белка-супрессора опухолей p53, который индуцируется убиквитин-белковой лигазой E3. Для этого гена были обнаружены два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, которые кодируют разные изоформы. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что UBE2D2 взаимодействует с:

Бакуловирусный белок 3, содержащий повтор IAP , ^{[ 7 ]}
НЭДД4 , ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}
ПЖА1 , ^{[ 10 ]}
ПЖА2 , ^{[ 10 ]} и
УБЭ3А . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000131508 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000091896 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Дженсен Дж.П., Бейтс П.В., Ян М., Виерстра Р.Д., Вайсман А.М. (декабрь 1995 г.). «Идентификация семейства близкородственных ферментов, конъюгирующих убиквитин человека» . Журнал биологической химии . 270 (51): 30408–14. дои : 10.1074/jbc.270.51.30408 . ПМИД 8530467 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: убиквитин-конъюгирующий фермент E2D 2 UBE2D2 (гомолог UBC4/5, дрожжи)» .
^ Мейс П.Д., Линке К., Фелтэм Р., Шумахер Ф.Р., Смит К.А., Во Д.Л., Силке Дж., Дэй CL (ноябрь 2008 г.). «Структуры домена cIAP2 RING обнаруживают конформационные изменения, связанные с рекрутированием убиквитин-конъюгирующего фермента (E2)» . Журнал биологической химии . 283 (46): 31633–40. дои : 10.1074/jbc.M804753200 . ПМИД 18784070 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Анан Т., Нагата Ю., Кога Х., Хонда Ю., Ябуки Н., Миямото С., Кувано А., Мацуда И., Эндо Ф., Сая Х., Накао М. (ноябрь 1998 г.). «Человеческая убиквитин-белковая лигаза Nedd4: экспрессия, субклеточная локализация и избирательное взаимодействие с убиквитин-конъюгирующими ферментами». Гены в клетки . 3 (11): 751–63. дои : 10.1046/j.1365-2443.1998.00227.x . ПМИД 9990509 . S2CID 1653536 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Хатакеяма С., Дженсен Дж. П., Вайсман А. М. (июнь 1997 г.). «Субклеточная локализация и взаимодействие убиквитин-конъюгирующих ферментов (E2) убиквитиновых протеинлигаз семейства HECT млекопитающих» . Журнал биологической химии . 272 (24): 15085–92. дои : 10.1074/jbc.272.24.15085 . ПМИД 9182527 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Ю П, Чен Ю, Тагле Д.А., Цай Т (июнь 2002 г.). «PJA1, кодирующий убиквитинлигазу пальца RING-H2, представляет собой новый ген Х-хромосомы человека, обильно экспрессирующийся в мозге» . Геномика . 79 (6): 869–74. дои : 10.1006/geno.2002.6770 . ПМИД 12036302 .

Дальнейшее чтение

Рольф М., Бир-Ромеро П., Гласс С., Экстайн Дж., Бердо И., Теодорас А., Пагано М., Дрэтта Г. (апрель 1995 г.). «Восстановление реакций p53-убиквитинилирования из очищенных компонентов: роль человеческого убиквитин-конъюгирующего фермента UBC4 и E6-ассоциированного белка (E6AP)» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (8): 3264–8. Бибкод : 1995PNAS...92.3264R . дои : 10.1073/pnas.92.8.3264 . ПМК 42146 . ПМИД 7724550 .
Шеффнер М., Хуибрегце Дж. М., Хоули П. М. (сентябрь 1994 г.). «Идентификация человеческого убиквитин-конъюгирующего фермента, который опосредует E6-AP-зависимое убиквитинирование р53» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (19): 8797–801. Бибкод : 1994PNAS...91.8797S . дои : 10.1073/pnas.91.19.8797 . ПМК 44693 . ПМИД 8090726 .
Хатакеяма С., Дженсен Дж. П., Вайсман А. М. (июнь 1997 г.). «Субклеточная локализация и взаимодействие убиквитин-конъюгирующих ферментов (E2) убиквитиновых протеинлигаз семейства HECT млекопитающих» . Журнал биологической химии . 272 (24): 15085–92. дои : 10.1074/jbc.272.24.15085 . ПМИД 9182527 .
Анан Т., Нагата Ю., Кога Х., Хонда Ю., Ябуки Н., Миямото С., Кувано А., Мацуда И., Эндо Ф., Сая Х., Накао М. (ноябрь 1998 г.). «Человеческая убиквитин-белковая лигаза Nedd4: экспрессия, субклеточная локализация и избирательное взаимодействие с убиквитин-конъюгирующими ферментами». Гены в клетки . 3 (11): 751–63. дои : 10.1046/j.1365-2443.1998.00227.x . ПМИД 9990509 . S2CID 1653536 .
Гонен Х., Беркович Б., Ориан А., Каррано А., Такизава С., Яманака К., Пагано М., Иваи К., Чехановер А. (май 1999 г.). «Идентификация белков-переносчиков убиквитина, E2, участвующих в сигнально-индуцированной конъюгации и последующей деградации IkappaBalpha» . Журнал биологической химии . 274 (21): 14823–30. дои : 10.1074/jbc.274.21.14823 . ПМИД 10329681 .
Жоазейро, Калифорния, Винг СС, Хуан Х, Леверсон Дж.Д., Хантер Т., Лю Ю.К. (октябрь 1999 г.). «Отрицательный регулятор тирозинкиназы c-Cbl как E2-зависимая убиквитин-белковая лигаза RING-типа». Наука . 286 (5438): 309–12. дои : 10.1126/science.286.5438.309 . ПМИД 10514377 .
Тонгаонкар П., Чен Л., Ламбертсон Д., Ко Б., Мадура К. (июль 2000 г.). «Доказательства взаимодействия между ферментами, конъюгирующими убиквитин, и протеасомой 26S» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (13): 4691–8. дои : 10.1128/MCB.20.13.4691-4698.2000 . ПМЦ 85887 . ПМИД 10848595 .
Страк П., Калиджури М., Пеллетье М., Буасклер М., Теодорас А., Бир-Ромеро П., Гласс С., Парсонс Т., Коупленд Р.А., Огер К.Р., Бенфилд П., Брисуэла Л., Рольф М. (июль 2000 г.). «SCF (бета-TRCP) и зависимое от фосфорилирования убиквитинирование I каппа B альфа, катализируемое Ubc3 и Ubc4». Онкоген . 19 (31): 3529–36. дои : 10.1038/sj.onc.1203647 . ПМИД 10918611 . S2CID 24267499 .
Фанг С., Ферроне М., Ян С., Дженсен Дж.П., Тивари С., Вайсман А.М. (декабрь 2001 г.). «Рецептор опухолевого аутокринного фактора подвижности, gp78, представляет собой убиквитиновую протеинлигазу, участвующую в деградации эндоплазматического ретикулума» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (25): 14422–7. Бибкод : 2001PNAS...9814422F . дои : 10.1073/pnas.251401598 . ПМК 64697 . ПМИД 11724934 .
Ю П, Чен Ю, Тагле Д.А., Цай Т (июнь 2002 г.). «PJA1, кодирующий убиквитинлигазу пальца RING-H2, представляет собой новый ген Х-хромосомы человека, обильно экспрессирующийся в мозге» . Геномика . 79 (6): 869–74. дои : 10.1006/geno.2002.6770 . ПМИД 12036302 .
Ся Ю, Пао ГМ, Чен Х.В., Верма И.М., Хантер Т. (февраль 2003 г.). «Усиление активности убиквитинлигазы BRCA1 E3 за счет прямого взаимодействия с белком BARD1» . Журнал биологической химии . 278 (7): 5255–63. дои : 10.1074/jbc.M204591200 . ПМИД 12431996 .
Такеяма К., Агиар Р.К., Гу Л., Хе С., Фриман Г.Дж., Куток Дж.Л., Астер Дж.К., Шипп М.А. (июнь 2003 г.). «БАЛ-связывающий белок BBAP и родственные ему члены семейства Deltex проявляют активность изопептид-лигазы убиквитин-белок» . Журнал биологической химии . 278 (24): 21930–7. дои : 10.1074/jbc.M301157200 . ПМИД 12670957 .
Сюй Л., Ян Л., Мойтра П.К., Хашимото К., Раллабханди П., Каул С., Мерони Дж., Дженсен Дж.П., Вайсман А.М., Д'Арпа П. (август 2003 г.). «BTBD1 и BTBD2 колокализуются в цитоплазматических тельцах с белком RBCC/трехчастного мотива, TRIM5delta». Экспериментальные исследования клеток . 288 (1): 84–93. дои : 10.1016/S0014-4827(03)00187-3 . ПМИД 12878161 .
Субраманиам В., Ли Х., Вонг М., Китчинг Р., Аттисано Л., Врана Дж., Зубовиц Дж., Бургер А.М., Сет А. (октябрь 2003 г.). «Белок RING-H2 RNF11 сверхэкспрессируется при раке молочной железы и является мишенью лигазы E3 Smurf2» . Британский журнал рака . 89 (8): 1538–44. дои : 10.1038/sj.bjc.6601301 . ПМК 2394340 . ПМИД 14562029 .
Шимура Х., Шварц Д., Гиги С.П., Косик К.С. (февраль 2004 г.). «Комплекс CHIP-Hsc70 убиквитинирует фосфорилированный тау и повышает выживаемость клеток» . Журнал биологической химии . 279 (6): 4869–76. дои : 10.1074/jbc.M305838200 . ПМИД 14612456 .
Ленер Б., Семпл Дж.И., Браун С.Э., Адвокат Д., Кэмпбелл Р.Д., Сандерсон К.М. (январь 2004 г.). «Анализ высокопроизводительной дрожжевой двухгибридной системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика . 83 (1): 153–67. дои : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . ПМИД 14667819 .
Винклер Г.С., Альберт Т.К., Домингес С., Легтенберг Ю.И., Боеленс Р., Тиммерс Х.Т. (март 2004 г.). «Пара убиквитин-конъюгирующий фермент/убиквитин-белковая лигаза с измененной специфичностью». Журнал молекулярной биологии . 337 (1): 157–65. дои : 10.1016/j.jmb.2004.01.031 . ПМИД 15001359 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 5 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000131508 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000091896 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8530467-5] Дженсен Дж.П., Бейтс П.В., Ян М., Виерстра Р.Д., Вайсман А.М. (декабрь 1995 г.). «Идентификация семейства близкородственных ферментов, конъюгирующих убиквитин человека» . Журнал биологической химии . 270 (51): 30408–14. дои : 10.1074/jbc.270.51.30408 . ПМИД 8530467 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: убиквитин-конъюгирующий фермент E2D 2 UBE2D2 (гомолог UBC4/5, дрожжи)» .

[pmid18784070-7] Мейс П.Д., Линке К., Фелтэм Р., Шумахер Ф.Р., Смит К.А., Во Д.Л., Силке Дж., Дэй CL (ноябрь 2008 г.). «Структуры домена cIAP2 RING обнаруживают конформационные изменения, связанные с рекрутированием убиквитин-конъюгирующего фермента (E2)» . Журнал биологической химии . 283 (46): 31633–40. дои : 10.1074/jbc.M804753200 . ПМИД 18784070 .

[pmid9990509-8] Перейти обратно: ^а ^б Анан Т., Нагата Ю., Кога Х., Хонда Ю., Ябуки Н., Миямото С., Кувано А., Мацуда И., Эндо Ф., Сая Х., Накао М. (ноябрь 1998 г.). «Человеческая убиквитин-белковая лигаза Nedd4: экспрессия, субклеточная локализация и избирательное взаимодействие с убиквитин-конъюгирующими ферментами». Гены в клетки . 3 (11): 751–63. дои : 10.1046/j.1365-2443.1998.00227.x . ПМИД 9990509 . S2CID 1653536 .

[pmid9182527-9] Перейти обратно: ^а ^б Хатакеяма С., Дженсен Дж. П., Вайсман А. М. (июнь 1997 г.). «Субклеточная локализация и взаимодействие убиквитин-конъюгирующих ферментов (E2) убиквитиновых протеинлигаз семейства HECT млекопитающих» . Журнал биологической химии . 272 (24): 15085–92. дои : 10.1074/jbc.272.24.15085 . ПМИД 9182527 .

[pmid12036302-10] Перейти обратно: ^а ^б Ю П, Чен Ю, Тагле Д.А., Цай Т (июнь 2002 г.). «PJA1, кодирующий убиквитинлигазу пальца RING-H2, представляет собой новый ген Х-хромосомы человека, обильно экспрессирующийся в мозге» . Геномика . 79 (6): 869–74. дои : 10.1006/geno.2002.6770 . ПМИД 12036302 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]