РАД23Б
| РАД23Б | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | RAD23B , HHR23B, HR23B, P58, гомолог B RAD23, белок эксцизионной репарации нуклеотидов | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 600062 ; МГИ : 105128 ; Гомологен : 37704 ; Генные карты : RAD23B ; ОМА : RAD23B — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Белок эксцизионной репарации УФ-излучения RAD23, гомолог B, представляет собой белок , который у человека кодируется RAD23B геном . [ 5 ] [ 6 ]
Функция
[ редактировать ]Белок, кодируемый этим геном, является одним из двух человеческих гомологов Saccharomyces cerevisiae Rad23, белка, участвующего в эксцизионной репарации нуклеотидов (NER). Было обнаружено, что этот белок является компонентом белкового комплекса, который специфически компенсирует дефект NER экстрактов клеток пигментной группы C ксеродермы (XP-c) in vitro. Также было показано, что этот белок взаимодействует с 3-метиладенин-ДНК-гликозилазой (MPG) и повышает активность вырезания нуклеотидов, что предполагает его роль в распознавании повреждений ДНК в репарации вырезаемых оснований. Этот белок содержит N-концевой убиквитиноподобный домен, который, как сообщается, взаимодействует с 26S протеасомой, и, таким образом, этот белок может участвовать в опосредованном убиквитином протеолитическом пути в клетках. [ 7 ]
Роль в восстановлении ДНК
[ редактировать ]Комплекс XPC-RAD23B является начальным фактором распознавания повреждений при глобальной эксцизионной репарации геномных нуклеотидов (GG-NER). XPC-RAD23B распознает широкий спектр повреждений, которые термодинамически дестабилизируют дуплексы ДНК, включая фотопродукты, индуцированные УФ-излучением (димеры циклопиримидина и фотопродукты 6-4), аддукты, образованные мутагенами окружающей среды, такими как бензо[а]пирен или различные ароматические амины, некоторые окислительные эндогенные поражения, такие как циклопурины и аддукты, образованные противораковыми химиотерапевтическими препаратами, такими как цисплатин. Присутствие XPC-RAD23B необходимо для сборки других основных факторов NER и продвижения по пути NER как in vitro, так и in vivo. [ 8 ] Хотя большинство исследований было проведено с XPC-RAD23B, он является частью тримерного комплекса с центрином-2, кальцийсвязывающим белком семейства кальмодулина. [ 8 ]
Эпигенетическая репрессия
[ редактировать ]Уровень экспрессии белка RAD23B может быть эпигенетически репрессирован либо путем метилирования промотора гена RAD23B, либо путем метилирования промотора гена RAD23B. [ 9 ] [ 10 ] или любой из двух микроРНК (миР-744-3p [ 11 ] или миР-373 [ 12 ] ).
Дефицит RAD23B при раке
[ редактировать ]Дефицит экспрессии гена репарации ДНК увеличивает риск развития рака (см. Дефицит репарации ДНК при канцерогенезе ). Экспрессия RAD23B снижается в опухолевой ткани женщин с раком молочной железы. [ 13 ] Также наблюдался низкий процент RAD23B-положительных ядер при раке молочной железы высокой степени злокачественности. [ 14 ]
Уровень RAD23B был существенно снижен за счет метилирования промотора в линии клеток, полученной из множественной миеломы. [ 9 ] и снижается за счет метилирования промотора в небольшой части опухолей немелкоклеточного рака легких (НМРЛ). [ 10 ]
RAD23B, по-видимому, является одним из 26 генов репарации ДНК, которые эпигенетически репрессируются при различных видах рака (см. Эпигенетика рака ).
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что RAD23B взаимодействует с PSMD4. [ 15 ] и Атаксин 3 . [ 16 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000119318 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028426 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ ван дер Спек П.Дж., Смит Э.М., Беверлоо Х.Б., Сугасава К., Масутани С., Ханаока Ф., Хоймейкерс Дж.Х., Хагемейер А. (октябрь 1994 г.). «Хромосомная локализация трех генов репарации: гена пигментной ксеродерма группы C и двух человеческих гомологов дрожжевого RAD23» . Геномика . 23 (3): 651–8. дои : 10.1006/geno.1994.1554 . hdl : 1765/3069 . ПМИД 7851894 .
- ^ Масутани С., Сугасава К., Янагисава Дж., Сонояма Т., Уи М., Эномото Т., Такио К., Танака К., ван дер Спек П.Дж., Бутсма Д. (апрель 1994 г.). «Очистка и клонирование эксцизионно-восстановительного комплекса нуклеотидов, включающего белок группы C пигментной ксеродерма и человеческий гомолог дрожжей RAD23» . Журнал ЭМБО . 13 (8): 1831–43. дои : 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06452.x . ПМК 395023 . ПМИД 8168482 .
- ^ «Ген Энтреза: RAD23B, гомолог B RAD23 (S. cerevisiae)» .
- ^ Jump up to: а б Шерер О.Д. (октябрь 2013 г.). «Репарация нуклеотидов у эукариот» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 5 (10): а012609. doi : 10.1101/cshperspect.a012609 . ПМЦ 3783044 . ПМИД 24086042 .
- ^ Jump up to: а б Пэн Б., Ходж Д.Р., Томас С.Б., Черри Дж.М., Манро DJ, Помпея С., Сяо В., Фаррар В.Л. (февраль 2005 г.). «Эпигенетическое молчание гена эксцизионной репарации нуклеотидов человека, hHR23B, в клетках множественной миеломы KAS-6/1, чувствительных к интерлейкину-6» . Журнал биологической химии . 280 (6): 4182–7. дои : 10.1074/jbc.M412566200 . ПМИД 15550378 .
- ^ Jump up to: а б До Х., Вонг Н.К., Муроне С., Джон Т., Соломон Б., Митчелл П.Л., Добрович А. (2014). «Критическая переоценка метилирования промотора гена репарации ДНК при немелкоклеточной карциноме легкого» . Научные отчеты . 4 : 4186. Бибкод : 2014NatSR...4E4186D . дои : 10.1038/srep04186 . ПМЦ 3935198 . ПМИД 24569633 .
- ^ Хатано К., Кумар Б., Чжан Й., Коултер Дж.Б., Хедаяти М., Мирс Б., Ни Х, Кудролли Т.А., Чоудхури В.Х., Родригес Р., ДеВиз Т.Л., Лупольд С.Е. (апрель 2015 г.). «Функциональный скрининг выявляет микроРНК, которые ингибируют репарацию ДНК и повышают чувствительность клеток рака простаты к ионизирующему излучению» . Исследования нуклеиновых кислот . 43 (8): 4075–86. дои : 10.1093/nar/gkv273 . ПМК 4417178 . ПМИД 25845598 .
- ^ Кросби М.Э., Кулшрешта Р., Иван М., Глейзер П.М. (февраль 2009 г.). «Регуляция микроРНК экспрессии генов репарации ДНК при гипоксическом стрессе» . Исследования рака . 69 (3): 1221–9. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-08-2516 . ПМК 2997438 . ПМИД 19141645 .
- ^ Матта Дж., Моралес Л., Дутил Дж., Байона М., Альварес К., Суарес Э. (февраль 2013 г.). «Дифференциальная экспрессия генов репарации ДНК у латиноамериканских женщин с раком молочной железы» . Молекулярная биология рака . 1 (1): 54. doi : 10.9777/mcb.2013.10006 (неактивен 31 января 2024 г.). ПМК 4189824 . ПМИД 25309843 .
{{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на январь 2024 г. ( ссылка ) - ^ Линге А., Маурья П., Фридрих К., Бареттон ГБ, Келли С., Генри М., Клайнс М., Ларкин А., Мелиди П. (июль 2014 г.). «Идентификация и функциональная проверка RAD23B как потенциального белка в прогрессировании рака молочной железы человека». Журнал исследований протеома . 13 (7): 3212–22. дои : 10.1021/pr4012156 . ПМИД 24897598 .
- ^ Хияма Х., Ёкои М., Масутани К., Сугасава К., Маэкава Т., Танака К., Хойджмейкерс Дж.Х., Ханаока Ф. (сентябрь 1999 г.). «Взаимодействие hHR23 с S5a. Убиквитиноподобный домен hHR23 опосредует взаимодействие с субъединицей S5a 26 S-протеасомы» (PDF) . Журнал биологической химии . 274 (39): 28019–25. дои : 10.1074/jbc.274.39.28019 . ПМИД 10488153 . S2CID 1757366 .
- ^ Ван Г., Савай Н., Котлярова С., Канадзава И., Нукина Н. (июль 2000 г.). «Атаксин-3, продукт гена MJD1, взаимодействует с двумя человеческими гомологами белка репарации дрожжевой ДНК RAD23, HHR23A и HHR23B». Молекулярная генетика человека . 9 (12): 1795–803. дои : 10.1093/hmg/9.12.1795 . ПМИД 10915768 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
- ван дер Спек П.Дж., Экер А., Радемакерс С., Виссер С., Сугасава К., Масутани С., Ханаока Ф., Бутсма Д., Хоймейкерс Дж.Х. (июль 1996 г.). «XPC и человеческие гомологи RAD23: внутриклеточная локализация и связь с другими комплексами эксцизионной репарации нуклеотидов» . Исследования нуклеиновых кислот . 24 (13): 2551–9. дои : 10.1093/нар/24.13.2551 . ПМК 145966 . ПМИД 8692695 .
- Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
- Сугасава К., Нг Дж.М., Масутани С., Иваи С., ван дер Спек П.Дж., Экер А.П., Ханаока Ф., Бутсма Д., Хоймейкерс Дж.Х. (август 1998 г.). «Белковый комплекс группы C пигментной ксеродерма является инициатором эксцизионной репарации нуклеотидов глобального генома» . Молекулярная клетка . 2 (2): 223–32. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80132-X . ПМИД 9734359 .
- Хияма Х., Ёкои М., Масутани К., Сугасава К., Маэкава Т., Танака К., Хойджмейкерс Дж.Х., Ханаока Ф. (сентябрь 1999 г.). «Взаимодействие hHR23 с S5a. Убиквитиноподобный домен hHR23 опосредует взаимодействие с субъединицей S5a 26 S-протеасомы» (PDF) . Журнал биологической химии . 274 (39): 28019–25. дои : 10.1074/jbc.274.39.28019 . ПМИД 10488153 . S2CID 1757366 .
- Мяо Ф, Бузиан М, Дамманн Р, Масутани С, Ханаока Ф, Пфайфер Дж, О'Коннор Т.Р. (сентябрь 2000 г.). «3-Метиладенин-ДНК-гликозилаза (белок MPG) взаимодействует с белками RAD23 человека» . Журнал биологической химии . 275 (37): 28433–8. дои : 10.1074/jbc.M001064200 . ПМИД 10854423 .
- Ван Г., Савай Н., Котлярова С., Канадзава И., Нукина Н. (июль 2000 г.). «Атаксин-3, продукт гена MJD1, взаимодействует с двумя человеческими гомологами белка репарации дрожжевой ДНК RAD23, HHR23A и HHR23B». Молекулярная генетика человека . 9 (12): 1795–803. дои : 10.1093/hmg/9.12.1795 . ПМИД 10915768 .
- Араужо С.Дж., Нигг Э.А., Вуд Р.Д. (апрель 2001 г.). «Сильные функциональные взаимодействия TFIIH с XPC и XPG при эксцизионной репарации нуклеотидов ДНК человека без предварительно собранной репаросомы» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (7): 2281–91. дои : 10.1128/MCB.21.7.2281-2291.2001 . ПМК 86862 . ПМИД 11259578 .
- Араки М., Масутани С., Такемура М., Учида А., Сугасава К., Кондо Дж., Окума Ю., Ханаока Ф. (июнь 2001 г.). «Центросомный белок центрин 2/кальтрактин 1 является частью комплекса пигментной ксеродермы группы C, который инициирует глобальную эксцизионную репарацию нуклеотидов генома» . Журнал биологической химии . 276 (22): 18665–72. дои : 10.1074/jbc.M100855200 . ПМИД 11279143 .
- Пак Х., Сузуки Т., Леннарц В.Дж. (сентябрь 2001 г.). «Идентификация белков, которые взаимодействуют с пептидом млекопитающих: N-гликаназой и вовлекают эту гидролазу в протеасомно-зависимый путь деградации белка» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (20): 11163–8. Бибкод : 2001PNAS...9811163P . дои : 10.1073/pnas.201393498 . ПМК 58701 . ПМИД 11562482 .
- Уолтерс К.Дж., Кляйнен М.Ф., Го А.М., Вагнер Дж., Хоули П.М. (февраль 2002 г.). «Структурные исследования взаимодействия белков семейства убиквитинов и субъединицы S5a протеасомы» . Биохимия . 41 (6): 1767–77. дои : 10.1021/bi011892y . ПМИД 11827521 .
- Ли С.М., Ли М.Л., Цзе Ю.К., Люнг С.К., Ли М.М., Цуй С.К., Фунг К.П., Ли С.И., Вэй М.М. (сентябрь 2002 г.). «Paeoniae Radix, экстракт китайских трав, ингибирует рост клеток гепатомы, индуцируя апоптоз по независимому пути p53». Науки о жизни . 71 (19): 2267–77. дои : 10.1016/S0024-3205(02)01962-8 . ПМИД 12215374 .
- Симидзу И., Иваи С., Ханаока Ф., Сугасава К. (январь 2003 г.). «Белок группы C пигментной ксеродерма физически и функционально взаимодействует с тимин-ДНК-гликозилазой» . Журнал ЭМБО . 22 (1): 164–73. дои : 10.1093/emboj/cdg016 . ПМК 140069 . ПМИД 12505994 .
- Нг Дж.М., Вермюлен В., ван дер Хорст Г.Т., Бергинк С., Сугасава К., Врилинг Х., Хоймейкерс Дж.Х. (июль 2003 г.). «Новый механизм регуляции восстановления ДНК путем индуцированной повреждением и RAD23-зависимой стабилизации белка группы C пигментной ксеродермы» . Гены и развитие . 17 (13): 1630–45. дои : 10.1101/gad.260003 . ЧВК 196135 . ПМИД 12815074 .
- Рю К.С., Ли К.Дж., Пэ Ш., Ким Б.К., Ким К.А., Чхве Б.С. (сентябрь 2003 г.). «Картирование поверхности связывания внутри- и междоменных взаимодействий между hHR23B, убиквитином и сайтом связывания полиубиквитина 2 S5a» . Журнал биологической химии . 278 (38): 36621–7. дои : 10.1074/jbc.M304628200 . ПМИД 12832454 .
- Фудзивара К., Тэнно Т., Сугасава К., Джи Дж.Г., Оки И., Кодзима С., Тотио Х., Хироаки Х., Ханаока Ф., Сиракава М. (февраль 2004 г.). «Структура взаимодействующего с убиквитином мотива S5a, связанного с убиквитин-подобным доменом HR23B» . Журнал биологической химии . 279 (6): 4760–7. дои : 10.1074/jbc.M309448200 . ПМИД 14585839 .
- Глокзин С., Оги FX, Хенгстерманн А., Шеффнер М., Блаттнер С. (декабрь 2003 г.). «Участие белка репарации ДНК hHR23 в деградации p53» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (24): 8960–9. дои : 10.1128/MCB.23.24.8960-8969.2003 . ПМК 309646 . ПМИД 14645509 .
галерея PDB |
|---|
