SOS ящик

SOS-бокс — это оператор , с которым LexA связывается репрессор , подавляющий транскрипцию SOS-индуцированных белков. SOS-боксы находятся рядом с промоторами различных генов . ^{[ 1 ]}

LexA связывается с SOS-боксом при отсутствии повреждений ДНК . При наличии повреждения ДНК связывание LexA инактивируется RecA активатором . SOS-боксы различаются последовательностями ДНК и аффинностью связывания с LexA от организма к организму. ^{[ 2 ]} Более того, SOS-боксы могут присутствовать двойным образом, что указывает на то, что в одном промоторе может находиться более одного SOS-бокса. ^{[ 3 ]}

Примеры


Филогенетическая клада	Последовательность	Ссылка
Альфапротеобактерии	ГААК(Н) ₇ ГААК GTTC(N) ₇ GTTC	^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}
Бетапротеобактерии Гаммапротеобактерии	КТГТ(Н) ₈ АКАГ	^{[ 6 ]}
Дельтапротеобактерии	CTRHAMRYBYGTTCAGS	^{[ 7 ]}
Грамположительные бактерии	CGAACRNRYGTTYC	^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}
Цианобактерии	RGTAC(N) ₃ DGTWCB	^{[ 10 ]}

См. Номенклатуру нуклеиновых кислот для объяснения букв нуклеотидов, не относящихся к GATC.

См. также

SOS-ответ

Ссылки

^ Хенкин, Тина М.; Питерс, Джозеф Э. (2020). Молекулярная генетика бактерий Снайдера и Чампнесса (Пятое изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Вашингтон, округ Колумбия: John Wiley & Sons, Inc. 409. ИСБН 9781555819750 .
^ Уокер, Грэм К. (октябрь 1995 г.). «SOS-регулируемые белки в синтезе ДНК и мутагенезе транслейкоза». Тенденции биохимических наук . 20 (10): 416–20. дои : 10.1016/s0968-0004(00)89091-x . ПМИД 8533155 .
^ Гиллор, Оснат; Вризен, Ян AC; Райли, Маргарет А. (июнь 2008 г.). «Роль SOS-боксов в регуляции кишечных бактериоцинов» . Микробиология . 154 (6): 1783–1792. дои : 10.1099/mic.0.2007/016139-0 . ПМК 2729051 . ПМИД 18524933 .
^ Фернандес де Хенестроса, Антонио Р.; Ривера, Эусеби; Тапиас, Ангелы; Барбе, Жорди (июнь 1998 г.). «Идентификация SOS-бокса Rhodobacter sphaeroides» . Молекулярная микробиология . 28 (5): 991–1003. дои : 10.1046/j.1365-2958.1998.00860.x . ПМИД 9663685 .
^ Тапиас, А.; Барбе, Дж. (август 1999 г.). «Регуляция дивергентной транскрипции с промоторов uvrA-ssb у Sinorhizobium meliloti ». Молекулярная и общая генетика МГГ . 262 (1): 121–130. дои : 10.1007/s004380051066 . ПМИД 10503543 . S2CID 2373618 .
^ Эрилл, Иван; Писец, Марк; Кампой, Сусана; Барбе, Жорди (22 ноября 2003 г.). «Анализ in silico выявил существенную изменчивость содержания генов гамма-протеобактерий LexA-regulon» . Биоинформатика . 19 (17): 2225–2236. doi : 10.1093/биоинформатика/btg303 . ПМИД 14630651 .
^ Кампой, Сусана; Фонтес, Марта; Падманабхан, С.; Кортес, Пилар; Льягостера, Монтсеррат; Барбе, Жорди (август 2003 г.). опосредованная повреждением ДНК «LexA-независимая индукция экспрессии генов у Myxococcus xanthus, ». Молекулярная микробиология . 49 (3): 769–781. дои : 10.1046/j.1365-2958.2003.03592.x . ПМИД 12864858 .
^ Винтерлинг, Кевин В.; Чафин, Дэвид; Хейс, Джеффри Дж.; Сунь, Цзи; Левин, Артур С.; Ясбин, Рональд Э.; Вудгейт, Роджер (15 апреля 1998 г.). « Сайт связывания DinR Bacillus subtilis : новое определение консенсусной последовательности» . Журнал бактериологии . 180 (8): 2201–2211. дои : 10.1128/JB.180.8.2201-2211.1998 . ПМЦ 107149 . ПМИД 9555905 .
^ Дэвис, Элейн О.; Дуллаган, Эдит М.; Рэнд, Люсинда (15 июня 2002 г.). «Определение микобактериального SOS-бокса и его использование для идентификации генов, регулируемых LexA, в микобактериях туберкулеза » . Журнал бактериологии . 184 (12): 3287–3295. дои : 10.1128/JB.184.12.3287-3295.2002 . ПМК 135081 . ПМИД 12029045 .
^ Мэйзон, Г.; Лусена, Дж. М.; Кампой, С.; Фернандес де Хенестроса, Арканзас; Кандау, П.; Барбе, Дж. (февраль 2004 г.). «Последовательности LexA-связывания у грамположительных и цианобактерий тесно связаны». Молекулярная генетика и геномика . 271 (1): 40–49. дои : 10.1007/s00438-003-0952-x . ПМИД 14652736 . S2CID 9219764 .

Эта о генетике статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Хенкин, Тина М.; Питерс, Джозеф Э. (2020). Молекулярная генетика бактерий Снайдера и Чампнесса (Пятое изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Вашингтон, округ Колумбия: John Wiley & Sons, Inc. 409. ИСБН 9781555819750 .

[2] Уокер, Грэм К. (октябрь 1995 г.). «SOS-регулируемые белки в синтезе ДНК и мутагенезе транслейкоза». Тенденции биохимических наук . 20 (10): 416–20. дои : 10.1016/s0968-0004(00)89091-x . ПМИД 8533155 .

[3] Гиллор, Оснат; Вризен, Ян AC; Райли, Маргарет А. (июнь 2008 г.). «Роль SOS-боксов в регуляции кишечных бактериоцинов» . Микробиология . 154 (6): 1783–1792. дои : 10.1099/mic.0.2007/016139-0 . ПМК 2729051 . ПМИД 18524933 .

[4] Фернандес де Хенестроса, Антонио Р.; Ривера, Эусеби; Тапиас, Ангелы; Барбе, Жорди (июнь 1998 г.). «Идентификация SOS-бокса Rhodobacter sphaeroides» . Молекулярная микробиология . 28 (5): 991–1003. дои : 10.1046/j.1365-2958.1998.00860.x . ПМИД 9663685 .

[5] Тапиас, А.; Барбе, Дж. (август 1999 г.). «Регуляция дивергентной транскрипции с промоторов uvrA-ssb у Sinorhizobium meliloti ». Молекулярная и общая генетика МГГ . 262 (1): 121–130. дои : 10.1007/s004380051066 . ПМИД 10503543 . S2CID 2373618 .

[6] Эрилл, Иван; Писец, Марк; Кампой, Сусана; Барбе, Жорди (22 ноября 2003 г.). «Анализ in silico выявил существенную изменчивость содержания генов гамма-протеобактерий LexA-regulon» . Биоинформатика . 19 (17): 2225–2236. doi : 10.1093/биоинформатика/btg303 . ПМИД 14630651 .

[7] Кампой, Сусана; Фонтес, Марта; Падманабхан, С.; Кортес, Пилар; Льягостера, Монтсеррат; Барбе, Жорди (август 2003 г.). опосредованная повреждением ДНК «LexA-независимая индукция экспрессии генов у Myxococcus xanthus, ». Молекулярная микробиология . 49 (3): 769–781. дои : 10.1046/j.1365-2958.2003.03592.x . ПМИД 12864858 .

[8] Винтерлинг, Кевин В.; Чафин, Дэвид; Хейс, Джеффри Дж.; Сунь, Цзи; Левин, Артур С.; Ясбин, Рональд Э.; Вудгейт, Роджер (15 апреля 1998 г.). « Сайт связывания DinR Bacillus subtilis : новое определение консенсусной последовательности» . Журнал бактериологии . 180 (8): 2201–2211. дои : 10.1128/JB.180.8.2201-2211.1998 . ПМЦ 107149 . ПМИД 9555905 .

[9] Дэвис, Элейн О.; Дуллаган, Эдит М.; Рэнд, Люсинда (15 июня 2002 г.). «Определение микобактериального SOS-бокса и его использование для идентификации генов, регулируемых LexA, в микобактериях туберкулеза » . Журнал бактериологии . 184 (12): 3287–3295. дои : 10.1128/JB.184.12.3287-3295.2002 . ПМК 135081 . ПМИД 12029045 .

[10] Мэйзон, Г.; Лусена, Дж. М.; Кампой, С.; Фернандес де Хенестроса, Арканзас; Кандау, П.; Барбе, Дж. (февраль 2004 г.). «Последовательности LexA-связывания у грамположительных и цианобактерий тесно связаны». Молекулярная генетика и геномика . 271 (1): 40–49. дои : 10.1007/s00438-003-0952-x . ПМИД 14652736 . S2CID 9219764 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

v т и восстановление ДНК
Эксцизионное восстановление	База эксцизионного ремонта / сайт AP ДНК-гликозилаза Урацил-ДНК-гликозилаза Поли-АДФ-рибозо-полимераза Эксцизионная нуклеотидная репарация / ERCC XPA XPB XPC XPD/ERCC2 XPE/DDB1 XPF/DDB1 XPG/ERCC5 ЭРСС1 РПА РАД23А РАД23Б Эксцинуклеаза Исправление несоответствия ДНК МЛХ1 МШ2
Гомологичная рекомбинация	РекА RecBCD Путь RecF RecQ-геликаза РАД51 Sgs1 Slx4 ЛексА
Другие пути	Транскрипционно-связанная репарация ERCC6 ERCC8 Гомологическая направленная репарация негомологичное соединение концов К Соединение концов, опосредованное микрогомологией Пострепликационная репарация Фотолиаза CRY1 CRY2
Регулирование	SOS ящик SOS-ответ
Другое/несгруппировано	август ПЦРА Ядерный антиген пролиферирующих клеток 8-оксогуанин Адаптивный ответ Контрольная точка мейотической рекомбинации ДНК-геликаза : BLM WRN Белки FANC : основной белковый комплекс Фэнтези ФАНЦБ ФАНКК ФАНС ФАНКФ ФАНКГ ФАНКЛ ФАНКМ ФАНКД1 ФАНКД2 ТОЧКА ФАНКЖ ФАНЦН
Категория