XPC (ген)
| XPC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | XPC , RAD4, XP3, XPCC, p125, пигментная ксеродерма, группа комплементации C, субъединица комплекса XPC, фактор распознавания и репарации повреждений ДНК | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 613208 ; МГИ : 103557 ; Гомологен : 3401 ; Генные карты : XPC ; ОМА : XPC – ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Пигментная ксеродерма, группа комплементации C , также известная как XPC , представляет собой белок , который у человека кодируется XPC геном . XPC участвует в распознавании объемистых аддуктов ДНК при эксцизионной репарации нуклеотидов . [ 4 ] Он расположен на хромосоме 3. [ 5 ]
Функция
[ редактировать ]Этот ген кодирует компонент пути эксцизионной репарации нуклеотидов (NER). В пути NER участвует множество компонентов, в том числе пигментная ксеродерма (XP) AG и V, синдром Коккейна (CS) A и B, трихотиодистрофия (TTD) группы A и т. д. Этот компонент, XPC, играет важную роль в ранние этапы глобального генома NER, особенно в распознавании повреждений, образовании открытых комплексов и формировании комплексов репарирующих белков. [ 4 ]
Комплекс XPC-RAD23B является начальным фактором распознавания повреждений при глобальной эксцизионной репарации геномных нуклеотидов (GG-NER). [ 6 ] XPC-RAD23B распознает широкий спектр повреждений, которые термодинамически дестабилизируют дуплексы ДНК, включая фотопродукты, индуцированные УФ-излучением (димеры циклопиримидина и фотопродукты 6-4), аддукты, образованные мутагенами окружающей среды, такими как бензо[а]пирен или различные ароматические амины, некоторые окислительные эндогенные поражения, такие как циклопурины и аддукты, образованные противораковыми химиотерапевтическими препаратами, такими как цисплатин. Присутствие XPC-RAD23B необходимо для сборки других основных факторов NER и продвижения по пути NER как in vitro, так и in vivo. [ 7 ] Хотя большинство исследований было проведено с XPC-RAD23B, он является частью тримерного комплекса с центрином-2, кальцийсвязывающим белком семейства кальмодулина. [ 7 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]Мутации в этом гене или некоторых других компонентах NER приводят к пигментной ксеродерма , редкому аутосомно-рецессивному заболеванию, характеризующемуся повышенной чувствительностью к солнечному свету с развитием карциномы в раннем возрасте. [ 4 ]
Рак
[ редактировать ]Повреждение ДНК, по-видимому, является основной причиной рака. [ 8 ] а дефицит генов репарации ДНК, вероятно, лежит в основе многих форм рака. [ 9 ] [ 10 ] Если репарация ДНК недостаточна, повреждения ДНК имеют тенденцию накапливаться. Такое избыточное повреждение ДНК может увеличить количество мутаций из-за склонного к ошибкам синтеза транслезий . Чрезмерное повреждение ДНК может также усилить эпигенетические изменения из-за ошибок во время репарации ДНК. [ 11 ] [ 12 ] Такие мутации и эпигенетические изменения могут привести к раку .
Снижение экспрессии генов репарации ДНК (обычно вызванное эпигенетическими изменениями, такими как гиперметилирование промотора) очень распространено при раке и обычно встречается гораздо чаще, чем мутационные дефекты генов репарации ДНК при раке. [ нужна ссылка ] В таблице ниже показано, что экспрессия XPC часто эпигенетически снижается при раке мочевого пузыря, а также при немелкоклеточном раке легкого, а также показывает, что экспрессия XPC чаще снижается на более поздних стадиях этих видов рака.
| Рак | Частота | Ссылка. |
|---|---|---|
| Рак мочевого пузыря | 50% | [ 13 ] |
| Папиллярное уротелиальное новообразование низкого злокачественного потенциала. | 35% | [ 13 ] |
| Папиллярный рак мочевого пузыря низкой степени злокачественности | 42% | [ 13 ] |
| Папиллярный рак мочевого пузыря высокой степени злокачественности | 65% | [ 13 ] |
| Немелкоклеточный рак легкого (НМРЛ) | 70% | [ 14 ] |
| НМРЛ I стадии | 62% | [ 14 ] |
| НМРЛ стадий II-III | 77% | [ 14 ] |
Хотя было показано, что эпигенетическое гиперметилирование промоторной области гена XPC связано с низкой экспрессией XPC, [ 13 ] другой способ эпигенетической репрессии XPC также может происходить за счет сверхэкспрессии микроРНК миР-890. [ 15 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что XPC (ген) взаимодействует с ABCA1 , [ 16 ] ЦЕТН2 [ 17 ] и XPB . [ 18 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030094 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Перейти обратно: а б с «Ген Энтреза: пигментная ксеродерма XPC, группа комплементации C» .
- ^ «Запись OMIM - # 278720 - XERODERMA PIGMENTOSUM, ГРУППА КОМПЛЕМЕНТАЦИИ C; XPC» . Проверено 12 декабря 2014 г.
- ^ Сугасава К., Нг Дж.М., Масутани С., Иваи С., ван дер Спек П.Дж., Экер А.П., Ханаока Ф., Бутсма Д., Хоймейкерс Дж.Х. (1998). «Белковый комплекс группы C пигментной ксеродерма является инициатором эксцизионной репарации нуклеотидов глобального генома» . Мол. Клетка . 2 (2): 223–32. дои : 10.1016/s1097-2765(00)80132-x . ПМИД 9734359 .
- ^ Перейти обратно: а б Шерер О.Д. (октябрь 2013 г.). «Репарация нуклеотидов у эукариот» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 5 (10): а012609. doi : 10.1101/cshperspect.a012609 . ПМЦ 3783044 . ПМИД 24086042 .
- ^ Кастан М.Б. (2008). «Реакция на повреждение ДНК: механизмы и роль в заболеваниях человека: лекция на премию Мемориала ГСГ Клоуза 2007 г.» . Мол. Рак Рез . 6 (4): 517–24. дои : 10.1158/1541-7786.MCR-08-0020 . ПМИД 18403632 .
- ^ Харпер Дж.В., Элледж С.Дж. (2007). «Реакция на повреждение ДНК: десять лет спустя» . Мол. Клетка . 28 (5): 739–45. doi : 10.1016/j.molcel.2007.11.015 . ПМИД 18082599 .
- ^ Дитляйн Ф, Рейнхардт ХК (2014). «Молекулярные пути: использование опухолеспецифичных молекулярных дефектов в путях восстановления ДНК для точной терапии рака» . Клин. Рак Рез . 20 (23): 5882–7. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-14-1165 . ПМИД 25451105 .
- ^ О'Хаган Х.М., Мохаммад Х.П., Бэйлин С.Б. (2008). «Двухнитевые разрывы могут инициировать молчание генов и SIRT1-зависимое начало метилирования ДНК на экзогенном промоторном острове CpG» . ПЛОС Генетика . 4 (8): е1000155. дои : 10.1371/journal.pgen.1000155 . ПМЦ 2491723 . ПМИД 18704159 .
- ^ Куоццо С, Порчеллини А, Ангризано Т, Морано А, Ли Б, Ди Пардо А, Мессина С, Юлиано Р, Фуско А, Сантильо М.Р., Мюллер М.Т., Кьяриотти Л., Готтесман М.Е., Авведименто Э.В. (июль 2007 г.). «Повреждение ДНК, репарация, направленная на гомологию, и метилирование ДНК» . ПЛОС Генетика . 3 (7): е110. дои : 10.1371/journal.pgen.0030110 . ЧВК 1913100 . ПМИД 17616978 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Ян Дж, Сюй З, Ли Дж, Чжан Р, Чжан Г, Цзи Х, Сун Б, Чен З (2010). «Эпигенетическое молчание XPC в сочетании с изменением р53 оказывает значительное влияние на исход рака мочевого пузыря». Дж. Урол . 184 (1): 336–43. дои : 10.1016/j.juro.2010.03.044 . ПМИД 20488473 .
- ^ Перейти обратно: а б с Йе КТ, Ву Ю.Х., Ли MC, Ван Л., Ли CT, Чен CY, Ли Х (2012). «Уровень мРНК XPC может предсказать рецидив немелкоклеточного рака легких у никогда не куривших». Энн. Хирург. Онкол . 19 (3): 734–42. дои : 10.1245/s10434-011-1992-9 . ПМИД 21861227 . S2CID 19154489 .
- ^ Хатано К., Кумар Б., Чжан Ю., Коултер Дж.Б., Хедаяти М., Мирс Б., Ни Х, Кудролли Т.А., Чоудхури В.Х., Родригес Р., ДеВиз Т.Л., Лупольд С.Е. (2015). «Функциональный скрининг выявляет микроРНК, которые ингибируют репарацию ДНК и повышают чувствительность клеток рака простаты к ионизирующему излучению» . Нуклеиновые кислоты Рез . 43 (8): 4075–86. дои : 10.1093/nar/gkv273 . ПМК 4417178 . ПМИД 25845598 .
- ^ Симидзу И., Иваи С., Ханаока Ф., Сугасава К. (январь 2003 г.). «Белок группы C пигментной ксеродерма физически и функционально взаимодействует с тимин-ДНК-гликозилазой» . ЭМБО Дж . 22 (1): 164–73. дои : 10.1093/emboj/cdg016 . ПМК 140069 . ПМИД 12505994 .
- ^ Араки М., Масутани С., Такемура М., Учида А., Сугасава К., Кондо Дж., Окума Ю., Ханаока Ф. (июнь 2001 г.). «Центросомный белок центрин 2/кальтрактин 1 является частью комплекса пигментной ксеродермы группы C, который инициирует глобальную эксцизионную репарацию нуклеотидов генома» . Ж. Биол. Хим . 276 (22): 18665–72. дои : 10.1074/jbc.M100855200 . ПМИД 11279143 .
- ^ Ёкои М., Масутани С., Маекава Т., Сугасава К., Окума Ю., Ханаока Ф. (март 2000 г.). «Белковый комплекс группы C пигментной ксеродермы XPC-HR23B играет важную роль в привлечении транскрипционного фактора IIH к поврежденной ДНК» . Ж. Биол. Хим . 275 (13): 9870–5. дои : 10.1074/jbc.275.13.9870 . ПМИД 10734143 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Кливер Дж. Э., Томпсон Л. Х., Ричардсон А. С., Стейтс Дж. К. (1999). «Краткий обзор мутаций заболеваний, чувствительных к УФ-излучению: пигментной ксеродерма, синдрома Кокейна и трихотиодистрофии» . Хм. Мутат . 14 (1): 9–22. doi : 10.1002/(SICI)1098-1004(1999)14:1<9::AID-HUMU2>3.0.CO;2-6 . ПМИД 10447254 . S2CID 24148589 .
- Эль-Дейри WS (2003). «Трансактивация генов репарации с помощью BRCA1» . Рак Биол. Там . 1 (5): 490–1. дои : 10.4161/cbt.1.5.162 . ПМИД 12496474 .
- Сугасава К. (2007). «Индуцированное УФ-излучением убиквитилирование комплекса XPC, комплекса УФ-DDB-убиквитинлигазы и репарация ДНК». Дж. Мол. Гистол . 37 (5–7): 189–202. дои : 10.1007/s10735-006-9044-7 . ПМИД 16858626 . S2CID 817898 .
- Легерски Р., Петерсон С. (1993). «Экспрессионное клонирование гена репарации ДНК человека, участвующего в пигментной ксеродермии группы C» . Природа . 360 (6404): 610. дои : 10.1038/360610b0 . ПМИД 1461286 .
- Легерски Р., Петерсон С. (1992). «Экспрессионное клонирование гена репарации ДНК человека, участвующего в пигментной ксеродермии группы C». Природа . 359 (6390): 70–3. Бибкод : 1992Natur.359...70L . дои : 10.1038/359070a0 . ПМИД 1522891 . S2CID 34276965 .
- Легерски Р.Дж., Лю П., Ли Л., Петерсон К.А., Чжао Ю., Лич Р.Дж., Нейлор С.Л., Сицилиано М.Дж. (1994). «Присвоение гена пигментной группы C ксеродерма (XPC) хромосоме 3p25». Геномика . 21 (1): 266–9. дои : 10.1006/geno.1994.1256 . ПМИД 8088800 .
- Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
- Масутани С., Сугасава К., Янагисава Дж., Сонояма Т., Уи М., Эномото Т., Такио К., Танака К., ван дер Спек П.Дж., Бутсма Д. (1994). «Очистка и клонирование эксцизионно-восстановительного комплекса нуклеотидов, включающего белок группы C пигментной ксеродерма и человеческий гомолог дрожжей RAD23» . ЭМБО Дж. 13 (8): 1831–43. дои : 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06452.x . ПМК 395023 . ПМИД 8168482 .
- Ли Л., Бэйлс Э.С., Петерсон К.А., Легерски Р.Дж. (1994). «Характеристика молекулярных дефектов пигментной ксеродермы группы С». Нат. Жене . 5 (4): 413–7. дои : 10.1038/ng1293-413 . ПМИД 8298653 . S2CID 24923699 .
- Ли Л., Петерсон С., Легерски Р. (1996). «Последовательность кДНК мышиного XPC и геномная структура человеческого гена XPC» . Нуклеиновые кислоты Рез . 24 (6): 1026–8. дои : 10.1093/нар/24.6.1026 . ПМК 145764 . ПМИД 8604333 .
- ван дер Спек П.Дж., Экер А., Радемакерс С., Виссер С., Сугасава К., Масутани С., Ханаока Ф., Бутсма Д., Хоймейкерс Дж.Х. (1996). «XPC и человеческие гомологи RAD23: внутриклеточная локализация и связь с другими комплексами эксцизионной репарации нуклеотидов» . Нуклеиновые кислоты Рез . 24 (13): 2551–9. дои : 10.1093/нар/24.13.2551 . ПМК 145966 . ПМИД 8692695 .
- Ли Л, Лу Х, Петерсон С, Легерски Р (1997). «XPC взаимодействует как с HHR23B, так и с HHR23A in vivo». Мутат. Рез . 383 (3): 197–203. дои : 10.1016/s0921-8777(97)00002-5 . ПМИД 9164480 .
- Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
- Цзэн Л., Квиллиет Икс, Шевалье-Лажент О, Эвено Э, Сарасин А, Меззина М (1998). «Перенос генов, опосредованный ретровирусом, корректирует дефект репарации ДНК клеток пигментной ксеродермы групп комплементации A, B и C» . Джин Тер . 4 (10): 1077–84. дои : 10.1038/sj.gt.3300495 . ПМИД 9415314 .
- Хан С.Г., Леви Х.Л., Легерски Р., Квакенбуш Э., Рирдон Дж.Т., Эммерт С., Санкар А., Ли Л., Шнайдер Т.Д., Кливер Дж.Е., Кремер К.Х. (1998). «Пигментная ксеродерма сплайсинговая мутация группы C, связанная с аутизмом и гипоглицинемией» . Дж. Инвест. Дерматол . 111 (5): 791–6. дои : 10.1046/j.1523-1747.1998.00391.x . ПМИД 9804340 .
- Ёкои М, Масутани С, Маекава Т, Сугасава К, Окума Й, Ханаока Ф (2000). «Белковый комплекс группы C пигментной ксеродермы XPC-HR23B играет важную роль в привлечении транскрипционного фактора IIH к поврежденной ДНК» . Ж. Биол. Хим . 275 (13): 9870–5. дои : 10.1074/jbc.275.13.9870 . ПМИД 10734143 .
- Бэтти Д., Рапич-Отрин В., Левин А.С., Вуд Р.Д. (2000). «Стабильное связывание комплекса XPC человека с облученной ДНК обеспечивает четкое распознавание поврежденных участков». Дж. Мол. Биол . 300 (2): 275–90. дои : 10.1006/jmbi.2000.3857 . ПМИД 10873465 .
- Араужо С.Дж., Нигг Э.А., Вуд Р.Д. (2001). «Сильные функциональные взаимодействия TFIIH с XPC и XPG при эксцизионной репарации нуклеотидов ДНК человека без предварительно собранной репаросомы» . Мол. Клетка. Биол . 21 (7): 2281–91. дои : 10.1128/MCB.21.7.2281-2291.2001 . ПМК 86862 . ПМИД 11259578 .
- Араки М, Масутани С, Такемура М, Учида А, Сугасава К, Кондо Дж, Окума Ю, Ханаока Ф (2001). «Центросомный белок центрин 2/кальтрактин 1 является частью комплекса пигментной ксеродермы группы C, который инициирует глобальную эксцизионную репарацию нуклеотидов генома» . Ж. Биол. Хим . 276 (22): 18665–72. дои : 10.1074/jbc.M100855200 . ПМИД 11279143 .
