ПЦРА
PcrA , что означает уменьшенная копия плазмиды, представляет собой хеликазу , которая была первоначально обнаружена при скрининге хромосомно-кодируемых генов, которые влияют на репликацию плазмиды по катящемуся кругу у грамположительного патогена Staphylococcus aureus .
Биологические функции
[ редактировать ]Генетические и биохимические исследования показали, что геликаза необходима для репликации плазмид по принципу катящегося круга и восстановления повреждений ДНК, вызванных воздействием ультрафиолетового излучения. Он катализирует раскручивание двухцепочечной плазмидной ДНК, которая была разорвана в месте начала репликации белком инициации репликации. Генетические и биохимические исследования также показали, что геликаза играет важную роль в выживании клеток, регулируя уровни рекомбинации, опосредованной RecA, у грамположительных бактерий.
Биохимические свойства
[ редактировать ]Хеликаза представляет собой мономерную транслоказу и использует АТФ для раскручивания ДНК. Предпочтительными субстратами являются одноцепочечные ДНК, содержащие 3'-концы. Процессивность PcrA увеличивается в присутствии белка инициации репликации плазмиды.
Кристаллическая структура
[ редактировать ]Структура геликазы была решена с высоким разрешением и указывает на «червяк» как механизм транслокации одноцепочечной ДНК. Была предложена модель мексиканской волны, основанная на изменениях конформации геликазы, наблюдаемых в комплексе продукт-субстрат.
Классификация
[ редактировать ]PcrA принадлежит к суперсемейству геликаз SF1, в которое также входят геликазы UvrD и Rep E. coli и эукариотическая геликаза Srs2.
Литература
[ редактировать ]- Иорданеску, С. (октябрь 1993 г.). «Характеристика хромосомного гена pcrA золотистого стафилококка , выявленного по мутациям, влияющим на репликацию плазмиды pT181». Мол Ген Генет . 241 (1–2): 185–92. дои : 10.1007/BF00280216 . ПМИД 8232203 . S2CID 685186 .
- Пети, Массачусетс; Дервин, Э; Роуз, М; Энтиан, К.Д.; Макговерн, С; Эрлих, С.Д.; Брюанд, К. (июль 1998 г.). «PcrA представляет собой незаменимую ДНК-хеликазу Bacillus subtilis, выполняющую функции как репарации, так и репликации по вращающемуся кругу» . Мол Микробиол . 29 (1): 261–73. дои : 10.1046/j.1365-2958.1998.00927.x . ПМИД 9701819 . S2CID 39193812 .
- Пети, Массачусетс; Эрлих, Д. (июнь 2002 г.). «Незаменимые бактериальные хеликазы, противодействующие токсичности рекомбинантных белков» . ЭМБО Дж . 21 (12): 3137–47. дои : 10.1093/emboj/cdf317 . ПМК 126070 . ПМИД 12065426 .
- Чанг, TL; Накви, А; Ананд, СП; Крамер, МГ; Мунши, Р; Хан, С.А. (ноябрь 2002 г.). «Биохимическая характеристика хеликазы Staphylococcus aureus PcrA и ее роли в репликации плазмиды по катящемуся кругу» . J Биол Хим . 277 (48): 45880–6. дои : 10.1074/jbc.m207383200 . ПМИД 12244110 .
- Ананд, СП; Чжэн, Х; Бьянко, PR; Леуба, С.Х.; Хан, Ю.А. (июнь 2007 г.). «ДНК-хеликазная активность PcrA не требуется для вытеснения белка RecA из ДНК или ингибирования опосредованного RecA обмена цепей» . J Бактериол . 189 (12): 4502–9. дои : 10.1128/jb.00376-07 . ЧВК 1913354 . ПМИД 17449621 .
- Султанас, П; Диллингем, штат Массачусетс; Пападопулос, Ф; Филлипс, ЮВ; Томас, CD; Вигли, Д.Б. (март 1999 г.). «Белок-инициатор репликации плазмиды RepD увеличивает процессивность ДНК-хеликазы PcrA» . Нуклеиновые кислоты Рез . 27 (6): 1421–8. дои : 10.1093/нар/27.6.1421 . ПМК 148333 . ПМИД 10037801 .
- Веланкар, СС; Султанас, П; Диллингем, штат Массачусетс; Субраманья, Х.С.; Вигли, Д.Б. (апрель 1999 г.). «Кристаллические структуры комплексов ДНК-хеликазы PcrA с ДНК-субстратом указывают на механизм дюймового червя» . Клетка . 97 (1): 75–84. дои : 10.1016/s0092-8674(00)80716-3 . ПМИД 10199404 .
