РАНГАП1

РАНГАП1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 1Z5S, 2GRN, 2GRO, 2GRP, 2GRQ, 2GRR, 2IY0, 3UIN, 3UIO, 3UIP, 5D2M, 2IO2, 2IO3
Идентификаторы
Псевдонимы	RANGAP1 , Fug1, RANGAP, SD, Ran белок 1, активирующий ГТФазу
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 602362 ; МГИ : 103071 ; Гомологен : 55700 ; Генные карты : RANGAP1 ; RUN : RANGAP1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 22 (human) Band 22q13.2 Start 41,244,779 bp End 41,286,187 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 15 (mouse) Band 15 E1|15 38.21 cM Start 81,588,449 bp End 81,629,731 bp
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in left testis right testis Brodmann area 10 right frontal lobe cingulate gyrus anterior cingulate cortex skin of abdomen Brodmann area 9 skin of leg middle frontal gyrus Top expressed in dentate gyrus of hippocampal formation granule cell superior surface of tongue spermatid yolk sac visual cortex superior frontal gyrus seminiferous tubule gallbladder primary visual cortex epiblast More reference expression data BioGPS More reference expression data
показывать Генная онтология Molecular function protein binding cadherin binding RNA binding GTPase activator activity ubiquitin protein ligase binding Cellular component intracellular membrane-bounded organelle cytoplasmic periphery of the nuclear pore complex nuclear pore chromosome dendrite nuclear pore cytoplasmic filaments mitotic spindle chromosome, centromeric region cytoskeleton nucleus kinetochore axon cytoplasm cytoplasm cytosol aggresome perinuclear region of cytoplasm nuclear envelope nucleoplasm spindle nuclear membrane Biological process cellular response to vasopressin protein sumoylation cellular response to peptide hormone stimulus negative regulation of protein export from nucleus response to axon injury signal transduction sister chromatid cohesion activation of GTPase activity Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 5905 19387 Вместе ENSG00000100401 ENSMUSG00000022391 ЮниПрот P46060 P46061 RefSeq (мРНК) НМ_001278651 НМ_002883 НМ_001317930 НМ_001146174 НМ_011241 НМ_001358622 RefSeq (белок) НП_001265580 НП_001304859 НП_002874 НП_001139646 НП_035371 НП_001345551 Местоположение (UCSC) Чр 22: 41,24 – 41,29 Мб Чр 15: 81,59 – 81,63 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Дополнительная информация о белках RanGAP у видов, отличных от человека: RanGAP.

Белок 1, активирующий Ran-ГТФазу, представляет собой фермент , который у человека кодируется RANGAP1 геном .

Функция

RanGAP1 представляет собой гомодимерный полипептид массой 65 кДа, который специфически индуцирует ГТФазы активность RAN , но не RAS, более чем в 1000 раз. RanGAP1 является непосредственным антагонистом RCC1 , молекулы-регулятора, которая поддерживает RAN в активном, GTP -связанном состоянии. Ген RANGAP1 кодирует полипептид из 587 аминокислот. Эта последовательность не связана с последовательностью активаторов ГТФазы для других белков, связанных с RAS , но на 88% идентична Rangap1 (Fug1), мышиному гомологу дрожжевого Rna1p. RanGAP1 и RCC1 контролируют RAN-зависимый транспорт между ядром и цитоплазмой. RanGAP1 является ключевым регулятором цикла RAN GTP/GDP .

Взаимодействия

RanGAP1 — это транспортный белок, который помогает транспортировать другие белки из цитоплазмы в ядро. Небольшой модификатор, связанный с убиквитином, должен быть связан с ним, прежде чем он сможет локализоваться в ядерной поре.

Было показано, что RANGAP1 взаимодействует с:

• Ран , и
• БЭ2И .

Дальнейшее чтение

• Беккер Дж., Мельхиор Ф., Герке В., Бишофф Ф.Р., Понстингл Х., Виттингхофер А. (1995). «РНК1 кодирует белок, активирующий ГТФазу, специфичный для Gsp1p, гомолога Ran/TC4 Saccharomyces cerevisiae» . Ж. Биол. Хим . 270 (20): 11860–5. дои : 10.1074/jbc.270.20.11860 . ПМИД   7744835 .
• Бишофф Ф.Р., Клебе С., Кречмер Дж., Виттингхофер А., Понстингл Х. (1994). «RanGAP1 индуцирует ГТФазную активность ядерного Ras-связанного Ran» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 91 (7): 2587–91. Бибкод : 1994PNAS...91.2587B . дои : 10.1073/pnas.91.7.2587 . ПМК   43414 . ПМИД   8146159 .
• Креббер Х., Понстингл Х. (1997). «Повсеместная экспрессия и специфическое для семенников альтернативное полиаденилирование мРНК активатора Ran GTPase человека RanGAP1». Джин . 180 (1–2): 7–11. дои : 10.1016/S0378-1119(96)00389-7 . ПМИД   8973340 .
• Матунис М.Ю., Кутавас Э., Блобель Г. (1997). «Новая убиквитиноподобная модификация модулирует распределение активирующего Ran-GTPase белка RanGAP1 между цитозолем и комплексом ядерных пор» . Дж. Клеточная Биол . 135 (6, ч. 1): 1457–70. дои : 10.1083/jcb.135.6.1457 . ПМК   2133973 . ПМИД   8978815 .
• Махаджан Р., Дельфин С., Гуан Т., Джераче Л., Мельхиор Ф. (1997). «Небольшой родственный убиквитину полипептид, участвующий в нацеливании RanGAP1 на белок RanBP2 комплекса ядерных пор» . Клетка . 88 (1): 97–107. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81862-0 . ПМИД   9019411 .
• Гёрлих Д., Дабровски М., Бишофф Ф.Р., Кутай У., Борк П., Хартманн Е., Прен С., Изаурральде Е. (1997). «Новый класс RanGTP-связывающих белков» . Дж. Клеточная Биол . 138 (1): 65–80. дои : 10.1083/jcb.138.1.65 . ПМК   2139951 . ПМИД   9214382 .
• Шеффзек К., Ахмадиан М.Р., Кабш В., Висмюллер Л., Лаутвейн А., Шмитц Ф., Виттингхофер А. (1998). «Комплекс Ras-RasGAP: структурная основа активации ГТФазы и ее потери у онкогенных мутантов Ras». Наука . 277 (5324): 333–8. дои : 10.1126/science.277.5324.333 . ПМИД   9219684 .
• Махаджан Р., Джераче Л., Мельхиор Ф (1998). «Молекулярная характеристика модификации SUMO-1 RanGAP1 и ее роль в ассоциации ядерной оболочки» . Дж. Клеточная Биол . 140 (2): 259–70. дои : 10.1083/jcb.140.2.259 . ПМК   2132567 . ПМИД   9442102 .
• Камитани Т., Кито К., Нгуен Х.П., Фукуда-Камитани Т., Йе Э.Т. (1998). «Характеристика второго члена семейства сентринов убиквитиноподобных белков» . Ж. Биол. Хим . 273 (18): 11349–53. дои : 10.1074/jbc.273.18.11349 . ПМИД   9556629 .
• Окума Т., Хонда Р., Итикава Г., Цумагари Н., Ясуда Х. (1999). «Модификация SUMO-1 in vitro требует двух ферментативных стадий: E1 и E2». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 254 (3): 693–8. дои : 10.1006/bbrc.1998.9995 . ПМИД   9920803 .
• Хиллиг Р.С., Рено Л., Веттер И.Р., Дрелл Т., Виттингхофер А., Беккер Дж. (1999). «Кристаллическая структура rna1p: новая складка белка, активирующего ГТФазу» . Мол. Клетка . 3 (6): 781–91. дои : 10.1016/S1097-2765(01)80010-1 . ПМИД   10394366 .
• Данхэм И, Симидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж.Э., Брускевич Р., Беар Д.М., Клэмп М., Сминк Л.Дж., Эйнскоу Р., Алмейда Дж.П., Бэббидж А., Бэггули С., Бэйли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бизли О, Бёрд С.П., Блейки С., Бриджмен А.М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл WD, О'Брайен КП (1999). «Последовательность ДНК 22 хромосомы человека» . Природа . 402 (6761): 489–95. Бибкод : 1999Natur.402..489D . дои : 10.1038/990031 . ПМИД   10591208 .
• Нагасе Т., Накаяма М., Накадзима Д., Кикуно Р., Охара О (2001). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют крупные белки in vitro» . ДНК Рез . 8 (2): 85–95. дои : 10.1093/dnares/8.2.85 . ПМИД   11347906 .
• Бернье-Вилламор В., Сэмпсон Д.А., Матунис М.Д., Лима КД (2002). «Структурная основа E2-опосредованной конъюгации SUMO, выявленная комплексом между убиквитин-конъюгирующим ферментом Ubc9 и RanGAP1» . Клетка . 108 (3): 345–56. дои : 10.1016/S0092-8674(02)00630-X . ПМИД   11853669 .
• Джозеф Дж., Тан С.Х., Карпова Т.С., МакНелли Дж.Г., Дассо М. (2002). «SUMO-1 нацеливает RanGAP1 на кинетохоры и митотические веретена» . Дж. Клеточная Биол . 156 (4): 595–602. дои : 10.1083/jcb.200110109 . ПМК   2174074 . ПМИД   11854305 .
• Чжан Х., Сайто Х., Матунис М.Дж. (2002). «Ферменты пути модификации SUMO локализуются в нитях комплекса ядерных пор» . Мол. Клетка. Биол . 22 (18): 6498–508. дои : 10.1128/MCB.22.18.6498-6508.2002 . ПМК   135644 . ПМИД   12192048 .
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж.Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кэнтли Л.К., Гиги С.П. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК   514446 . ПМИД   15302935 .
• Маколи М.С., Эррингтон В.Дж., Окон М., Шерпф М., Маккерет К.Д., Шульман Б.А., Макинтош Л.П. (2005). «Структурная и динамическая независимость связанных с изопептидами RanGAP1 и SUMO-1» . Ж. Биол. Хим . 279 (47): 49131–7. дои : 10.1074/jbc.M408705200 . ПМИД   15355965 .