Стефан Шустер

Стефан Шустер
Стефан Шустер
Рожденный	7 ноября 1961 г. (62 года) ; Мейсен , Германия
Национальность	немецкий
Альма-матер	Берлинский университет Гумбольдта
Известный	метаболизм , сигнальная трансдукция , анализ метаболического контроля , эволюционная теория игр
	Научная карьера
Учреждения	Йенский университет
Диссертация	Теоретические исследования взаимосвязи временной иерархии в ферментативных реакционных системах и принципов оптимизации
Научные консультанты	Рейнхарт Генрих

Стефан Шустер (родился 7 ноября 1961 года в Мейсене ) — немецкий биофизик. Он является профессором биоинформатики в Йенском университете .

Жизнь

Стефан Шустер изучал биофизику в Университете Гумбольдта в Берлине и написал докторскую диссертацию под руководством профессора Рейнхарта Генриха на кафедре теоретической биофизики Университета Гумбольдта в Берлине (Название: « Теоретические исследования взаимосвязи между временной иерархией в ферментативных реакционных системах и принципы оптимизации »). В 2003 году получил должность профессора кафедры биоинформатики Йенского университета имени Фридриха Шиллера.

Стефан Шустер — один из представителей Йенского центра биоинформатики (JCB).

Стефан Шустер в настоящее время является редактором Elsevier журнала BioSystems .

Его младший брат — режиссер Роберт Шустер .

Исследовать

Исследования системной Стефана Шустера охватывают широкий спектр тем биоинформатики и биологии . К ним относятся, среди прочего:

Стефан Шустер внес значительный вклад в развитие анализа элементарных мод . ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} С тех пор этот метод широко использовался для определения метаболических путей и различных приложений в биотехнологии, таких как расчет оптимальных молярных выходов . Шустер и его коллеги использовали этот метод, например, для анализа пенициллина. выработки ^{[ 9 ]} и НАД ⁺ обмен веществ ^{[ 10 ]} а также для прогнозирования жизнеспособности мутантов Escherichia coli . ^{[ 11 ]} Он внес вклад в разработку программного обеспечения для анализа метаболических путей. ^{[ 12 ]}

Большой биохимический интерес вызывает вопрос, могут ли люди и другие высшие животные превращать жирные кислоты в сахар . Хотя знания из учебников по биохимии говорят, что это невозможно, in silico, анализ проведенный Кристофом Калетой , Стефаном Шустером и его коллегами, показал, что в принципе существует несколько запутанных путей, по которым глюконеогенез возможен из жирных кислот. Это теоретическое предсказание привлекло значительное внимание в интернет- статьях . ^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}

Исследования метаболических путей включают анализ баланса потоков , который используется, например, для объяснения эффекта Варбурга . ^{[ 15 ]}

Книга Рейнхарда Генриха и Стефана Шустера « Регуляция клеточных систем » ^{[ 16 ]} был рассмотрен Ателем Корниш-Боуденом . ^{[ 17 ]} Он писал: «Для обычных читателей было бы большим достижением, если бы такие книги, как эта, могли помочь опровергнуть идеи о мерах, ограничивающих скорость, которые так долго сбивали с толку биохимическую концепцию метаболизма, мешая биотехнологии реализовать многие из целей. которые были обещаны, когда генная инженерия впервые стала возможной. Для специалистов, уже занимающихся кинетическим поведением мультиферментных систем, эта книга просто необходима» .

Ссылки

^ Пфайффер, Т.; Шустер, С. (2005). «Теоретико-игровые подходы к изучению эволюции биохимических систем». Тенденции биохимических наук . 30 (1): 20–25. дои : 10.1016/j.tibs.2004.11.006 . ПМИД 15653322 .
^ Шустер, С. (1996). «Анализ управления с точки зрения обобщенных переменных, характеризующих метаболические системы». Журнал теоретической биологии . 182 (3): 259–268. Бибкод : 1996JThBi.182..259S . дои : 10.1006/jtbi.1996.0163 . ПМИД 8944157 .
^ Шустер, С.; Марл, М.; Хефер, Т. (2002). «Моделирование простых и сложных колебаний кальция: от ответов отдельных клеток до межклеточной передачи сигналов». Европейский журнал биохимии . 269 (5): 1333–1355. дои : 10.1046/j.0014-2956.2001.02720.x . ПМИД 11874447 .
^ Боденштейн, К.; Хейланд, И.; Шустер, С. (2012). «Температурная компенсация и вовлечение в циркадные ритмы». Физическая биология . 9 (3): 036011. Бибкод : 2012PhBio...9c6011B . дои : 10.1088/1478-3975/9/3/036011 . ISSN 1478-3967 . ПМИД 22683844 . S2CID 22888493 .
^ Шустер, С.; де Фигейредо, LF; Шретер, А.; Калета, К. (2011). «Сочетание анализа метаболических путей с эволюционной теорией игр. Объяснение возникновения малопродуктивных путей с помощью подхода аналитической оптимизации». Биосистемы . 105 (2): 147–153. Бибкод : 2011BiSys.105..147S . doi : 10.1016/j.biosystems.2011.05.007 . ПМИД 21620931 .
^ Шустер, С.; Хильгетаг, К.; Вудс, Дж. Х.; Фелл, Д.А. (2002). «Маршруты реакций в биохимических реакционных системах: алгебраические свойства, проверенная процедура расчета и пример метаболизма нуклеотидов». Журнал математической биологии . 45 (2): 153–181. дои : 10.1007/s002850200143 . ISSN 0303-6812 . ПМИД 12181603 . S2CID 18109186 .
^ Шустер, С; Дандекар, Т; Фелл, Д.А. (1999). «Обнаружение элементарных режимов потока в биохимических сетях: многообещающий инструмент для анализа путей и метаболической инженерии». Тенденции в биотехнологии . 17 (2): 53–60. дои : 10.1016/S0167-7799(98)01290-6 . ПМИД 10087604 .
^ Шустер, С.; Фелл, Д.А.; Дандекар, Т. (2000). «Общее определение метаболических путей, полезное для систематической организации и анализа сложных метаболических сетей». Природная биотехнология . 18 (3): 326–332. дои : 10.1038/73786 . ISSN 1087-0156 . ПМИД 10700151 . S2CID 7742485 .
^ Прауссе, MTE; Шойбле, С.; Гутке, Р.; Шустер, С. (2016). «Расчет различных путей синтеза пенициллина и их молярных выходов». Биотехнология и биоинженерия . 113 (1): 173–181. дои : 10.1002/бит.25694 . ПМИД 26134880 . S2CID 31216001 .
^ де Фигейредо, LF; Госсманн, Техас; Зиглер, М.; Шустер, С. (2011). «Анализ путей метаболизма НАД +» (PDF) . Биохимический журнал . 439 (2): 341–348. дои : 10.1042/BJ20110320 . ISSN 0264-6021 . ПМИД 21729004 .
^ Стеллинг, Дж.; Кламт, С.; Беттенброк, К.; Шустер, С.; Жиль, ЭД (2002). «Структура метаболической сети определяет ключевые аспекты функциональности и регуляции». Природа . 420 (6912): 190–193. Бибкод : 2002Natur.420..190S . дои : 10.1038/nature01166 . ISSN 0028-0836 . ПМИД 12432396 . S2CID 4301741 .
^ Камп, А. фон; Шустер, С. (2006). «Metatool 5.0: быстрый и гибкий анализ элементарных режимов» . Биоинформатика . 22 (15): 1930–1931. doi : 10.1093/биоинформатика/btl267 . ISSN 1367-4803 . ПМИД 16731697 .
^ Служба научной информации
^ Ärztezeitung 2011
^ Шустер, С.; Боли, Д.; Моллер, П.; Старк, Х.; Калета, К. (2015). «Математические модели для объяснения эффекта Варбурга: обзор, посвященный производству АТФ и биомассы». Труды Биохимического общества . 43 (6): 1187–1194. дои : 10.1042/BST20150153 . ISSN 0300-5127 . ПМИД 26614659 .
^ Генрих Р.; Шустер, С. (1996). Регуляция клеточных систем . Бостон, Массачусетс: Springer US. ISBN 9781461311614 . OCLC 840281317 .
^ Корниш-Боуден, А. (1998). «Регулирование клеточных систем», Рейнхарт Генрих и Стефан Шустер, Чепмен и Холл, Нью-Йорк, 1996. 372 стр. Бюллетень математической биологии . 59 (5): 1027–1028. дои : 10.1016/S0092-8240(97)00050-5 .

Внешние ссылки

Домашняя страница Кафедра биоинформатики

[1] Пфайффер, Т.; Шустер, С. (2005). «Теоретико-игровые подходы к изучению эволюции биохимических систем». Тенденции биохимических наук . 30 (1): 20–25. дои : 10.1016/j.tibs.2004.11.006 . ПМИД 15653322 .

[2] Шустер, С. (1996). «Анализ управления с точки зрения обобщенных переменных, характеризующих метаболические системы». Журнал теоретической биологии . 182 (3): 259–268. Бибкод : 1996JThBi.182..259S . дои : 10.1006/jtbi.1996.0163 . ПМИД 8944157 .

[3] Шустер, С.; Марл, М.; Хефер, Т. (2002). «Моделирование простых и сложных колебаний кальция: от ответов отдельных клеток до межклеточной передачи сигналов». Европейский журнал биохимии . 269 (5): 1333–1355. дои : 10.1046/j.0014-2956.2001.02720.x . ПМИД 11874447 .

[4] Боденштейн, К.; Хейланд, И.; Шустер, С. (2012). «Температурная компенсация и вовлечение в циркадные ритмы». Физическая биология . 9 (3): 036011. Бибкод : 2012PhBio...9c6011B . дои : 10.1088/1478-3975/9/3/036011 . ISSN 1478-3967 . ПМИД 22683844 . S2CID 22888493 .

[5] Шустер, С.; де Фигейредо, LF; Шретер, А.; Калета, К. (2011). «Сочетание анализа метаболических путей с эволюционной теорией игр. Объяснение возникновения малопродуктивных путей с помощью подхода аналитической оптимизации». Биосистемы . 105 (2): 147–153. Бибкод : 2011BiSys.105..147S . doi : 10.1016/j.biosystems.2011.05.007 . ПМИД 21620931 .

[6] Шустер, С.; Хильгетаг, К.; Вудс, Дж. Х.; Фелл, Д.А. (2002). «Маршруты реакций в биохимических реакционных системах: алгебраические свойства, проверенная процедура расчета и пример метаболизма нуклеотидов». Журнал математической биологии . 45 (2): 153–181. дои : 10.1007/s002850200143 . ISSN 0303-6812 . ПМИД 12181603 . S2CID 18109186 .

[7] Шустер, С; Дандекар, Т; Фелл, Д.А. (1999). «Обнаружение элементарных режимов потока в биохимических сетях: многообещающий инструмент для анализа путей и метаболической инженерии». Тенденции в биотехнологии . 17 (2): 53–60. дои : 10.1016/S0167-7799(98)01290-6 . ПМИД 10087604 .

[8] Шустер, С.; Фелл, Д.А.; Дандекар, Т. (2000). «Общее определение метаболических путей, полезное для систематической организации и анализа сложных метаболических сетей». Природная биотехнология . 18 (3): 326–332. дои : 10.1038/73786 . ISSN 1087-0156 . ПМИД 10700151 . S2CID 7742485 .

[9] Прауссе, MTE; Шойбле, С.; Гутке, Р.; Шустер, С. (2016). «Расчет различных путей синтеза пенициллина и их молярных выходов». Биотехнология и биоинженерия . 113 (1): 173–181. дои : 10.1002/бит.25694 . ПМИД 26134880 . S2CID 31216001 .

[10] де Фигейредо, LF; Госсманн, Техас; Зиглер, М.; Шустер, С. (2011). «Анализ путей метаболизма НАД +» (PDF) . Биохимический журнал . 439 (2): 341–348. дои : 10.1042/BJ20110320 . ISSN 0264-6021 . ПМИД 21729004 .

[11] Стеллинг, Дж.; Кламт, С.; Беттенброк, К.; Шустер, С.; Жиль, ЭД (2002). «Структура метаболической сети определяет ключевые аспекты функциональности и регуляции». Природа . 420 (6912): 190–193. Бибкод : 2002Natur.420..190S . дои : 10.1038/nature01166 . ISSN 0028-0836 . ПМИД 12432396 . S2CID 4301741 .

[12] Камп, А. фон; Шустер, С. (2006). «Metatool 5.0: быстрый и гибкий анализ элементарных режимов» . Биоинформатика . 22 (15): 1930–1931. doi : 10.1093/биоинформатика/btl267 . ISSN 1367-4803 . ПМИД 16731697 .

[13] Служба научной информации

[14] Ärztezeitung 2011

[15] Шустер, С.; Боли, Д.; Моллер, П.; Старк, Х.; Калета, К. (2015). «Математические модели для объяснения эффекта Варбурга: обзор, посвященный производству АТФ и биомассы». Труды Биохимического общества . 43 (6): 1187–1194. дои : 10.1042/BST20150153 . ISSN 0300-5127 . ПМИД 26614659 .

[16] Генрих Р.; Шустер, С. (1996). Регуляция клеточных систем . Бостон, Массачусетс: Springer US. ISBN 9781461311614 . OCLC 840281317 .

[17] Корниш-Боуден, А. (1998). «Регулирование клеточных систем», Рейнхарт Генрих и Стефан Шустер, Чепмен и Холл, Нью-Йорк, 1996. 372 стр. Бюллетень математической биологии . 59 (5): 1027–1028. дои : 10.1016/S0092-8240(97)00050-5 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

Базы данных авторитетного контроля
Международный	ЯВЛЯЮТСЯ ВИАФ WorldCat
Национальный	Германия Израиль Соединенные Штаты
академики	Google Академика