ПКМТ1

ПКМТ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1I1N, 1KR5
Идентификаторы
Псевдонимы	PCMT1 , PIMT, белок-L-изоаспартат (D-аспартат)-О-метилтрансфераза
Внешние идентификаторы	Опустить : 176851 ; МГИ : 97502 ; Гомологен : 55895 ; GeneCards : PCMT1 ; ОМА : PCMT1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	149,811,420 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	7,681,136 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	endothelial cell; ; Brodmann area 23; ; middle temporal gyrus; ; pons; ; frontal pole; ; spinal ganglia; ; prefrontal cortex; ; orbitofrontal cortex; ; trigeminal ganglion; ; superior vestibular nucleus;
	Top expressed in
	spermatocyte; ; hypothalamus; ; testicle; ; lens; ; quadriceps femoris muscle; ; primary visual cortex; ; superior frontal gyrus; ; neural tube; ; hippocampus proper; ; cerebellar cortex;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	methyltransferase activity; transferase activity; protein binding; protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase activity; cadherin binding;
Cellular component	extracellular vesicle; extracellular exosome; cytoplasm; cytosol;
Biological process	methylation; protein repair; protein methylation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5110
	18537
	ENSG00000120265
	ENSMUSG00000019795
	P22061
	P23506
showНМ_001252049 ; НМ_001252050 ; НМ_001252051 ; НМ_001252052 ; НМ_001252053 ;
	NM_005389; NM_001360452; NM_001360456
showНМ_008786 ; НМ_001347228 ; НМ_001358647 ; НМ_001358649 ; НМ_001358651 ;
	NM_001358652; NM_001358653; NM_001358654; NM_001358657
showНП_001238978 ; НП_001238979 ; НП_001238980 ; НП_001238981 ; НП_001238982 ;
	NP_005380; NP_001347381; NP_001347385
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок-L-изоаспартат(D-аспартат)-О-метилтрансфераза представляет собой фермент , который у человека кодируется PCMT1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

три класса протеинкарбоксилметилтрансфераз , обнаружено В прокариотических и эукариотических клетках отличающихся своей специфичностью к метил-акцепторному субстрату. Фермент типа II катализирует перенос метильной группы от S-аденозил-L-метионина к свободным карбоксильным группам остатков D-аспартила и L-изоаспартила. Эти метил-акцепторные остатки возникают в результате спонтанного дезамидирования, изомеризации и рацемизации нормальных остатков L-аспартила и L-аспарагинила и представляют собой участки ковалентного повреждения стареющих белков. PCMT1 (EC 2.1.1.77) представляет собой фермент репарации белков, который инициирует преобразование аномальных остатков D-аспартила и L-изоаспартила в нормальную форму L-аспартила. [предоставлено OMIM] ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000120265 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019795 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Макларен, округ Колумбия, О'Коннор СМ, Ся Ю.Р., Мехрабиан М., Клисак И., Спаркс Р.С., Кларк С., Лусис А.Дж. (февраль 1993 г.). «Ген L-изоаспартил/D-аспартилпротеин-метилтрансферазы (PCMT1) картируется на хромосоме человека 6q22.3-6q24 и синтенной области мышиной хромосомы 10». Геномика . 14 (4): 852–6. дои : 10.1016/S0888-7543(05)80104-1 . ПМИД 1478665 .
^ ДеВри К.Г., Кларк С. (июнь 1999 г.). «Отнесение гена белка L-изоаспартат (D-аспартат) О-метилтрансферазы (PCMT1) к полосам хромосомы человека 6q24 → q25 с помощью радиационного гибридного картирования». Цитогенетический клеточный генетик . 84 (1–2): 130–1. дои : 10.1159/000015239 . ПМИД 10343128 . S2CID 38976877 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: белок PCMT1-L-изоаспартат (D-аспартат) O-метилтрансфераза» .

Дальнейшее чтение

Макларен, округ Колумбия, Каган Р.М., Кларк С. (1992). «Альтернативный сплайсинг РНК изоаспартилпротеина карбоксилметилтрансферазы человека приводит к образованию С-концевой последовательности -RDEL в изозиме II». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 185 (1): 277–83. дои : 10.1016/S0006-291X(05)80987-8 . ПМИД 1339271 .
Ингроссо Д., Каган Р.М., Кларк С. (1991). «Отличные С-концевые последовательности изозимов I и II L-изоаспартил/D-аспартилпротеин-метилтрансферазы эритроцитов человека». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 175 (1): 351–8. дои : 10.1016/S0006-291X(05)81242-2 . ПМИД 1998518 .
Ингроссо Д., Фаулер А.В., Блейбаум Дж., Кларк С. (1989). «Последовательность D-аспартил/L-изоаспартилпротеин-метилтрансферазы из эритроцитов человека. Общие мотивы последовательности для белка, ДНК, РНК и небольших молекул S-аденозилметионин-зависимых метилтрансфераз» . Ж. Биол. Хим . 264 (33): 20131–9. дои : 10.1016/S0021-9258(19)47228-1 . ПМИД 2684970 .
Гилберт Дж. М., Фаулер А., Блейбаум Дж., Кларк С. (1988). «Очистка гомологичных изоферментов протеинкарбоксилметилтрансферазы из эритроцитов человека и быка». Биохимия . 27 (14): 5227–33. дои : 10.1021/bi00414a042 . ПМИД 3167043 .
Ота И.М., Гилберт Дж.М., Кларк С. (1988). «Два основных изофермента белка D-аспартил/L-изоаспартилметилтрансферазы из эритроцитов человека». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 151 (3): 1136–43. дои : 10.1016/S0006-291X(88)80484-4 . ПМИД 3355545 .
Такеда Р., Мизобути М., Мурао К. и др. (1995). «Характеристика трех кДНК, кодирующих два изофермента изоаспартилпротеинкарбоксилметилтрансферазы из клеток эритроидного лейкоза человека» . Дж. Биохим . 117 (4): 683–5. дои : 10.1093/jb/117.2.267 . ПМИД 7592526 .
Цай В., Кларк С. (1994). «Аминокислотный полиморфизм человеческой L-изоаспартил/D-аспартилметилтрансферазы, участвующей в репарации белков». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 203 (1): 491–7. дои : 10.1006/bbrc.1994.2209 . ПМИД 8074695 .
ДеВри К.Г., Цай В., Кларк С. (1997). «Структура человеческого гена, кодирующего белок репарации L-изоаспартил (D-аспартил) О-метилтрансферазы». Арх. Биохим. Биофиз . 335 (2): 321–32. CiteSeerX 10.1.1.630.8527 . дои : 10.1006/abbi.1996.0513 . ПМИД 8914929 .
ДеВри К.Г., Кларк С. (1999). «Полиморфные формы белка L-изоаспартат (D-аспартат) О-метилтрансферазы, участвующие в восстановлении белков, поврежденных возрастом» . Дж. Хум. Жене . 44 (5): 275–88. дои : 10.1007/s100380050161 . ПМИД 10496068 .
Риттерсгаард С., Гриффит С.К., Савайя М.Р. и др. (2002). «Кристаллическая структура L-изоаспартилметилтрансферазы человека» . Ж. Биол. Хим . 277 (12): 10642–6. дои : 10.1074/jbc.M200229200 . ПМИД 11792715 .
Смит С.Д., Карсон М., Фридман А.М. и др. (2002). «Кристаллическая структура человеческой L-изоаспартил-О-метилтрансферазы с S-аденозилгомоцистеином с разрешением 1,6 Å и моделирование изоаспартилсодержащего пептида в активном центре» . Белковая наука . 11 (3): 625–35. дои : 10.1110/ps.37802 . ПМЦ 2373461 . ПМИД 11847284 .
Мисра П., Ци С., Ю С. и др. (2002). «Взаимодействие PIMT с коактиваторами транскрипции CBP, p300 и дифференциальной ролью PBP в регуляции транскрипции» . Ж. Биол. Хим . 277 (22): 20011–9. дои : 10.1074/jbc.M201739200 . ПМИД 11912212 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Энюнлю I, Папай Г, Цсерпан I и др. (2003). «Различные изоформы PRIP-взаимодействующего белка с доменом метилтрансферазы/триметилгуанозинсинтазы локализуются в цитоплазме и ядре». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 309 (1): 44–51. дои : 10.1016/S0006-291X(03)01514-6 . ПМИД 12943661 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Чжу Х., Ян В., Лу В. и др. (2006). «Известный функциональный полиморфизм (Ile120Val) гена PCMT1 человека и риск расщелины позвоночника» . Мол. Жене. Метаб . 87 (1): 66–70. дои : 10.1016/j.ymgme.2005.09.008 . ПМЦ 2947858 . ПМИД 16256389 .
Лантье Дж., Дерозье Р.Р. (2007). «Регуляция белка L-изоаспартилметилтрансферазы путем взаимодействия клетки с матриксом: участие интегрина альфавбета3, PI 3-киназы и протеасомы». Биохим. Клеточная Биол . 84 (5): 684–94. дои : 10.1139/o06-055 . ПМИД 17167531 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 6 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000120265 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019795 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1478665-5] Макларен, округ Колумбия, О'Коннор СМ, Ся Ю.Р., Мехрабиан М., Клисак И., Спаркс Р.С., Кларк С., Лусис А.Дж. (февраль 1993 г.). «Ген L-изоаспартил/D-аспартилпротеин-метилтрансферазы (PCMT1) картируется на хромосоме человека 6q22.3-6q24 и синтенной области мышиной хромосомы 10». Геномика . 14 (4): 852–6. дои : 10.1016/S0888-7543(05)80104-1 . ПМИД 1478665 .

[pmid10343128-6] ДеВри К.Г., Кларк С. (июнь 1999 г.). «Отнесение гена белка L-изоаспартат (D-аспартат) О-метилтрансферазы (PCMT1) к полосам хромосомы человека 6q24 → q25 с помощью радиационного гибридного картирования». Цитогенетический клеточный генетик . 84 (1–2): 130–1. дои : 10.1159/000015239 . ПМИД 10343128 . S2CID 38976877 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: белок PCMT1-L-изоаспартат (D-аспартат) O-метилтрансфераза» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]