Суперсемейство галокислотдегидрогеназ
| Гидролаза_3 | |||
|---|---|---|---|
 кристаллическая структура ида-подобной фосфатазы yida из e. палочка | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Гидролаза_3 | ||
| Пфам | PF08282 | ||
| Пфам Клан | CL0137 | ||
| ЭКОД | 2006.1.1 | ||
| |||
Суперсемейство галогенкислотных дегидрогеназ (суперсемейство HAD) представляет собой суперсемейство ферментов , которые включают фосфатазы , фосфоназы , АТФазы P-типа , бета-фосфоглюкомутазы , фосфманномутазы и дегалогеназы и участвуют во множестве клеточных процессов, начиная от аминокислот биосинтеза до детоксикации . [ 1 ]
Примеры
[ редактировать ]HAD Домен обнаружен в нескольких различных белках, включая:
- Фосфолипид-транслоцирующая АТФаза EC 3.6.3.1 , предполагаемый фермент, переворачивающий липиды, участвующий в холодовой толерантности у арабидопсиса. [ 2 ]
- 3-дезокси-D-маннооктулозонат (КДО) 8-фосфатфосфатаза ( КФ 3.1.3.45 ), катализирующая финальную стадию биосинтеза КДО - компонента липополисахарида у грамотрицательных бактерий. [ 3 ]
- Маннозил-3-фосфоглицератфосфатаза ( EC 3.1.3.70 ), которая гидролизует маннозил-3-фосфоглицерат с образованием осмолита маннозилглицерата. [ 4 ]
- Фосфогликолатфосфатаза ( EC 3.1.3.18 ), катализирующая дефосфорилирование 2-фосфогликолята. [ 5 ]
- 5´-Нуклеотидаза (EC 3.1.3.5), которая либо катализирует гидролиз ИМФ. или IMP и GMP
- Гипотетические белки
Гены человека, кодирующие белки, содержащие этот домен, включают:
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Кунин Е.В., Татусов Р.Л. (ноябрь 1994 г.). «Компьютерный анализ дегалогеназ бактериальных галогенкислот определяет большое суперсемейство гидролаз с разнообразной специфичностью. Применение итеративного подхода к поиску в базе данных» . Журнал молекулярной биологии . 244 (1): 125–32. дои : 10.1006/jmbi.1994.1711 . ПМИД 7966317 .
- ^ Гомес Э., Якобсен М.К., Аксельсен К.Б., Гейслер М., Палмгрен М.Г. (декабрь 2000 г.). «Толерантность к холоду у Arabidopsis связана с ALA1, членом нового семейства предполагаемых аминофосфолипидных транслоказ» . Растительная клетка . 12 (12): 2441–2454. дои : 10.2307/3871240 . JSTOR 3871240 . ПМЦ 102229 . ПМИД 11148289 .
- ^ Ву Дж, Вудард Р.В. (май 2003 г.). «Escherichia coli YrbI представляет собой 3-дезокси-D-маннооктулозонат-8-фосфатфосфатазу» . Журнал биологической химии . 278 (20): 18117–23. дои : 10.1074/jbc.M301983200 . ПМИД 12639950 .
- ^ Эмпадиньяс Н., Маругг Дж.Д., Борхес Н., Сантос Х., да Коста М.С. (ноябрь 2001 г.). «Путь синтеза маннозилглицерата у гипертермофильных архей Pyrococcus horikoshii. Биохимическая и генетическая характеристика ключевых ферментов» . Журнал биологической химии . 276 (47): 43580–8. дои : 10.1074/jbc.M108054200 . ПМИД 11562374 .
- ^ Ким Ю, Якунин А.Ф., Кузнецова Е, Сюй X, Пенникук М, Гу Дж, Ченг Ф, Праудфут М, Эрроусмит Ч., Джоамиак А, Эдвардс А.М., Кристендат Д. (январь 2004 г.). «Структурно-функциональная характеристика новой фосфогликолатфосфатазы из Thermoplasma acidophilum» . Журнал биологической химии . 279 (1): 517–26. дои : 10.1074/jbc.M306054200 . ПМЦ 2795321 . ПМИД 14555659 .