Открытый фонд биоинформатики
Фонд открытой биоинформатики — это некоммерческая организация, управляемая волонтерами и занимающаяся поддержкой программ с открытым исходным кодом в области биоинформатики . [1] Миссия фонда — поддерживать разработку наборов инструментов с открытым исходным кодом для биоинформатики, организовывать хакатоны , ориентированные на разработчиков , и в целом оказывать помощь в разработке и продвижении разработки программного обеспечения с открытым исходным кодом в области наук о жизни. Фонд также организует и проводит ежегодную конференцию по биоинформатике с открытым исходным кодом , сопутствующую конференцию «Интеллектуальные системы для молекулярной биологии» . [2] Фонд участвует в Google Summer of Code , выступая в качестве головной организации для отдельных проектов, связанных с биоинформатикой. [3] [4]
Фонд открытой биоинформатики был основан в 2001 году на основе проектов BioJava , BioPerl и BioPython . Официальное членство в фонде было создано в 2005 году. [1] В октябре 2012 года фонд начал сотрудничество с Software in the Public Interest (SPI), американской некоммерческой организацией, которая помогает другим организациям в создании и распространении бесплатного программного обеспечения с открытым исходным кодом . Ассоциация с SPI позволяет делать финансовые пожертвования в фонд (в США они освобождены от налогов по статье 501(c)3). [1] [5]
Фондом управляет совет директоров, представляющий различные проекты Bio*. По состоянию на 2019 год президентом OBF является Питер Кок ( BioPython ). [6] Предыдущими президентами OBF были Юэн Бирни и Хилмар Лапп ( NESCent ), предыдущими членами Совета директоров был Стивен Э. Бреннер . [7]
Проекты
[ редактировать ]Фонд размещает серверы для списков рассылки, веб-сайты и репозитории кода для ряда проектов с открытым исходным кодом, связанных с биоинформатикой, в том числе: [8]
- BioJava – набор инструментов Java
- BioMOBY – выполнение данных и приложений через веб-сервисы
- BioPerl — набор инструментов Perl.
- BioPython — набор инструментов Python
- BioRuby — набор инструментов Ruby
- БиоPHP
- EMBOSS – набор инструментов для анализа последовательностей.
См. также
[ редактировать ]- Список программного обеспечения для биоинформатики с открытым исходным кодом
- База данных типовых модельных организмов
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с «Фонд открытой биоинформатики» . Проверено 1 сентября 2014 г.
- ^ «BOSC – Открытый фонд биоинформатики» . Проверено 1 сентября 2014 г.
- ^ «Google Summer of Code – Фонд открытой биоинформатики» . Проверено 1 сентября 2014 г.
- ^ «Фонд открытой биоинформатики» . google-melange.com . Проверено 1 сентября 2014 г.
- ^ "обф" . spi-inc.org . Проверено 1 сентября 2014 г.
- ^ «Выборы правления – Фонд открытой биоинформатики» . Проверено 15 декабря 2020 г.
- ^ «Правление – Открытый Фонд Биоинформатики» . Проверено 1 сентября 2014 г.
- ^ «Проекты — Фонд Открытой Биоинформатики» . Проверено 1 сентября 2014 г.