RNF40

RNF40
Идентификаторы
Псевдонимы	RNF40 , BRE1B, RBP95, уставившийся, белок на ринге 40
Внешние идентификаторы	Омим : 607700 ; MGI : 2142048 ; Гомологен : 8856 ; GeneCards : RNF40 ; OMA : RNF40 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 16 (human)
End	30,776,307 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	127,203,971 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	ventricular zone; ; left testis; ; right testis; ; ganglionic eminence; ; mucosa of transverse colon; ; islet of Langerhans; ; right lobe of thyroid gland; ; granulocyte; ; sural nerve; ; right hemisphere of cerebellum;
	Top expressed in
	granulocyte; ; spermatid; ; spermatocyte; ; neural layer of retina; ; zygote; ; ventricular zone; ; lip; ; muscle of thigh; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; esophagus;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	metal ion binding; protein-containing complex binding; ubiquitin conjugating enzyme binding; syntaxin-1 binding; protein homodimerization activity; mRNA 3'-UTR binding; ubiquitin protein ligase binding; protein binding; ubiquitin-protein transferase activity; transferase activity;
Cellular component	axon terminus; cytosol; membrane; HULC complex; extrinsic component of membrane; ubiquitin ligase complex; nucleus; neuron projection; nucleoplasm; protein-containing complex;
Biological process	negative regulation of mRNA polyadenylation; histone H2B ubiquitination; positive regulation of proteasomal protein catabolic process; response to peptide hormone; regulation of mitotic cell cycle; positive regulation of protein polyubiquitination; histone monoubiquitination; ubiquitin-dependent protein catabolic process; positive regulation of histone H2B ubiquitination; protein ubiquitination; chromatin organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9810
	233900
	ENSG00000103549
	Ensmusg0000000030816
	O75150
	Q3U319
	NM_001207033 ; NM_001207034 ; NM_001286572 ; NM_014771 ; NM_194352
	NM_172281 ; NM_001360883
	NP_001193962 ; NP_001193963 ; NP_001273501 ; NP_055586
	NP_758485 ; NP_001347812
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

E3 убиквитин-белок-лигаза BRE1B -это фермент , который у людей кодируется RNF40 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, содержит безымянный палец, мотив, который, как известно, участвует во взаимодействиях белка и белковой ДНК. Сообщалось, что этот белок взаимодействует с белком -супрессором опухоли RB1. Исследования аналога крысы показали, что этот белок может функционировать как убиквитин-белковая лигаза E3 и облегчать убиквитинирование и деградацию синтаксина 1, который является важным компонентом механизма высвобождения нейротрансмиттера. ^{[ 8 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RNF40 взаимодействует с STX1A . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000103549 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg0000000030816 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Ишикава К., Нагасе Т., Суяма М., Мияджима Н., Танака А., Котани Х, Номура Н., Охара О (декабрь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать для крупных белков in vitro» . ДНК Res . 5 (3): 169–76. doi : 10.1093/dnares/5.3.169 . PMID 9734811 .
^ Wen H, AO S (сентябрь 2000). «RBP95, новый белок лейциновой молнии, связывается с белком ретинобластомы». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 275 (1): 141–8. doi : 10.1006/bbrc.2000.3242 . PMID 10944455 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Чин Л.С., Вавалле Дж.П., Ли Л. (сентябрь 2002). «Глядя, новая лигаза убиквитин-белка E3, которая нацелена на синтаксин 1 для деградации» . Дж. Биол. Химический 277 (38): 35071–9. doi : 10.1074/jbc.m203300200 . PMID 12121982 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} "Entrez Gene: RNF40 Bing Pinger Bletin 40" .

Дальнейшее чтение

Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005Natur.437.1173R. doi:10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, Hayashi K, Suzuki Y, Yamamoto J, Wakamatsu A, Kimura K, Sakamoto K, Hatano N, Kawai Y, Ishii S, Saito K, Kojima S, Sugiyama T, Ono T, Okano K, Yoshikawa Y, Aotsuka S, Sasaki N, Hattori A, Okumura K, Nagai K, Sugano S, Isogai T (2005). "Signal sequence and keyword trap in silico for selection of full-length human cDNAs encoding secretion or membrane proteins from oligo-capped cDNA libraries". DNA Res. 12 (2): 117–26. doi:10.1093/dnares/12.2.117. PMID 16303743.
Zhu B, Zheng Y, Pham AD, Mandal SS, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (2005). "Monoubiquitination of human histone H2B: the factors involved and their roles in HOX gene regulation". Mol. Cell. 20 (4): 601–11. doi:10.1016/j.molcel.2005.09.025. PMID 16307923.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). "Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks". Cell. 127 (3): 635–48. doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

This article on a gene on human chromosome 16 is a stub. You can help Wikipedia by expanding it.

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000103549 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg0000000030816 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid9734811-5] Ишикава К., Нагасе Т., Суяма М., Мияджима Н., Танака А., Котани Х, Номура Н., Охара О (декабрь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать для крупных белков in vitro» . ДНК Res . 5 (3): 169–76. doi : 10.1093/dnares/5.3.169 . PMID 9734811 .

[pmid10944455-6] Wen H, AO S (сентябрь 2000). «RBP95, новый белок лейциновой молнии, связывается с белком ретинобластомы». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 275 (1): 141–8. doi : 10.1006/bbrc.2000.3242 . PMID 10944455 .

[pmid12121982-7] Jump up to: ^а ^{беременный} Чин Л.С., Вавалле Дж.П., Ли Л. (сентябрь 2002). «Глядя, новая лигаза убиквитин-белка E3, которая нацелена на синтаксин 1 для деградации» . Дж. Биол. Химический 277 (38): 35071–9. doi : 10.1074/jbc.m203300200 . PMID 12121982 .

[entrez-8] Jump up to: ^а ^{беременный} "Entrez Gene: RNF40 Bing Pinger Bletin 40" .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]