дНаМ
 | |
| Имена | |
|---|---|
| Название ИЮПАК (1 R )-1,4-Ангидро-2-дезокси-1-(3-метоксинафталин-2-ил)-D - эритро - пентитол | |
| Систематическое название ИЮПАК ( 2R , 3S ,5R ) -2-(Гидроксиметил)-5-(3-метоксинафталин-2-ил)оксолан-3-ол | |
| Идентификаторы | |
3D model ( JSmol ) | |
| ХимическийПаук | |
ПабХим CID | |
Панель управления CompTox ( EPA ) | |
Если не указано иное, данные приведены для материалов в стандартном состоянии (при 25 °C [77 °F], 100 кПа). | |
dNaM представляет собой искусственное азотистое основание, содержащее 3-метокси-2-нафтильную группу вместо природного основания.
Когда он был первоначально успешно введен в ДНК для репликации в E. coli полусинтетическом организме , его соединили с d5SICS . Для краткости он называется X , а d5SICS — Y. [1] d5SICS был заменен на dTPT3 в пересмотренных версиях из-за его улучшенной способности реплицироваться в более широком диапазоне контекстов последовательностей. [2] X образует пары с Y с использованием гидрофобных и упаковочных взаимодействий вместо водородных связей, которые возникают в природных парах оснований. Внутри полусинтетического организма путь исправления несоответствий, направленный на метил ( MMR ), фактически исправляет неестественные и естественные неправильные пары, тогда как рекомбинационная репарация фактически исключает неестественные. [3] Полусинтетическому организму E. coli удалось удерживать новое основание в течение длительного времени как на плазмиде, так и при хранении в хромосоме. [4] [5] В свободной ДНК кольца d5SICS и dNaM расположены в параллельных плоскостях, а не в одной плоскости, но находясь внутри ДНК-полимеразы, они спариваются, используя конформацию «край к краю». [6] dNaM и dTPT3 также могут шаблонизировать транскрипцию мРНК и тРНК с помощью РНК-полимеразы T7, которая обладает способностью декодировать рибосому E. coli для производства белков с неприродными аминокислотами, расширяя генетический код . [7]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Сара Каплан (29 ноября 2017 г.). «Клетки с ДНК, созданные в лаборатории, ведут к «Святому Граалю» синтетической биологии» . Вашингтон Пост .
- ^ Чжан, Йорк; Лэмб, Брайан М.; Фельдман, Аарон В.; Чжоу, Энн Сяочжоу; Лавернь, Томас; Ли, Линцзюнь; Ромесберг, Флойд Э. (23 января 2017 г.). «Полусинтетический организм, созданный для стабильного расширения генетического алфавита» . Труды Национальной академии наук . 114 (6): 1317–1322. Бибкод : 2017PNAS..114.1317Z . дои : 10.1073/pnas.1616443114 . ISSN 0027-8424 . ПМЦ 5307467 . ПМИД 28115716 .
- ^ Ледбеттер, Майкл П.; Карадима, Ребекка Дж.; Ромесберг, Флойд Э. (17 января 2018 г.). «Перепрограммирование реплисомы полусинтетического организма для расширения генетического алфавита» . Журнал Американского химического общества . 140 (2): 758–765. дои : 10.1021/jacs.7b11488 . ISSN 0002-7863 . ПМЦ 5793209 . ПМИД 29309130 .
- ^ «Бактерия выживает при трансплантации неестественной ДНК» . Rsc.org . Проверено 29 июля 2015 г.
- ^ Малышев Денис А.; Дхами, Кирандип; Куах, Генри Т.; Лавернь, Томас; Ордуханян, Филипп; Торкамани, Али; Ромесберг, Флойд Э. (2012). «Эффективная и независимая от последовательности репликация ДНК, содержащей третью пару оснований, создает функциональный шестибуквенный генетический алфавит» . Труды Национальной академии наук . 109 (30): 12005–12010. Бибкод : 2012PNAS..10912005M . дои : 10.1073/pnas.1205176109 . ПМК 3409741 . ПМИД 22773812 . S2CID 26653524 .
- ^ Бетц, Карин; и др. (2013). «Структурное понимание репликации ДНК без водородных связей» . J Am Chem Soc . 135 (49): 18637–43. дои : 10.1021/ja409609j . ПМЦ 3982147 . ПМИД 24283923 .
- ^ Чжан, Йорк; Птацин, Джерод Л.; Фишер, Эмиль К.; Эрни, Ханс Р.; Каффаро, Каролина Э.; Сан-Хосе, Кристина; Фельдман, Аарон В.; Тернер, Корт Р.; Ромесберг, Флойд Э. (ноябрь 2017 г.). «Полусинтетический организм, который хранит и извлекает увеличенную генетическую информацию» . Природа . 551 (7682): 644–647. Бибкод : 2017Natur.551..644Z . дои : 10.1038/nature24659 . ISSN 1476-4687 . ПМЦ 5796663 . ПМИД 29189780 .
 | Эта по молекулярной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |