Просто еще один сэмплер Гиббса
| Оригинальный автор(ы) | Мартин Пламмер |
|---|---|
| Первоначальный выпуск | 11 декабря 2007 г. |
| Стабильная версия | 4.3.2 [1]  / 4 марта 2023 г |
| Репозиторий | |
| Написано в | С++ |
| Операционная система | Unix-подобный , Microsoft Windows , Mac OS X |
| Платформа | Intel x86 — 32-разрядный , x64 |
| Размер | 1,7 МБ |
| Тип | Статистический пакет |
| Лицензия | Стандартная общественная лицензия GNU |
| Веб-сайт | mcmc-зазубрины |
Просто еще один сэмплер Гиббса ( JAGS ) — это программа для моделирования байесовских иерархических моделей с использованием цепи Маркова Монте-Карло (MCMC), разработанная Мартином Пламмером. JAGS использовался для статистических работ во многих областях, например, в экологии, менеджменте и генетике. [2] [3] [4]
JAGS стремится обеспечить совместимость с WinBUGS / OpenBUGS за счет использования диалекта того же языка моделирования (неформально BUGS), но он не предоставляет графического интерфейса для построения моделей и постобработки образцов MCMC, поэтому их необходимо рассматривать в отдельной программе (например, вызов JAGS из R через такую библиотеку, как rjags, и постобработка вывода MCMC в R). [5]
Основным преимуществом JAGS по сравнению с членами исходного семейства BUGS ( WinBUGS и OpenBUGS ) является независимость от платформы. Он написан на C++, а семейство BUGS — на Component Pascal , менее известном языке программирования. [6] [7] Кроме того, JAGS уже является частью многих репозиториев дистрибутивов Linux, таких как Ubuntu. Его также можно скомпилировать как 64-битное приложение на 64-битных платформах, что делает все доступное пространство доступным для моделей BUGS.
JAGS можно использовать через командную строку или запускать в пакетном режиме через файлы сценариев. Это означает, что нет необходимости повторять настройки при каждом запуске и что программу можно вызывать и управлять ею из другой программы (например, из R через rjags, как описано выше).
JAGS распространяется по лицензии GNU General Public License .
См. также [ править ]
Ссылки [ править ]
- ^ «ЯГС» . 4 марта 2023 г. Проверено 24 февраля 2024 г.
- ^ Семменс, БХ; Уорд, Э.Дж.; Мур, Дж.В.; Даримонт, Коннектикут (2009). Гетц, Уэйн М. (ред.). «Количественная оценка изменчивости ниш между и внутри популяций с использованием иерархических байесовских моделей смешивания стабильных изотопов» . ПЛОС ОДИН . 4 (7): е6187. Бибкод : 2009PLoSO...4.6187S . дои : 10.1371/journal.pone.0006187 . ПМК 2704373 . ПМИД 19587790 .
- ^ Джонсон, ТР; Кун, К.М. (2013). «Байесовские модели Терстона для ранжирования данных с использованием JAGS». Методы исследования поведения . 45 (3): 857–872. дои : 10.3758/s13428-012-0300-3 . ПМИД 23539504 . S2CID 42660145 .
- ^ Маккейг, премьер-министр; Кэмпбелл, Х.; Уайлд, С.; Витарт, В.; Хейворд, К.; Рудан, И.; Райт, А. Ф.; Уилсон, Дж. Ф. (2010). «Байесовские методы анализа инструментальных переменных с помощью генетических инструментов («Менделевская рандомизация»): пример с транспортером уратов SLC2A9 в качестве инструментальной переменной для влияния уровней уратов на метаболический синдром» . Международный журнал эпидемиологии . 39 (3): 907–918. дои : 10.1093/ije/dyp397 . ПМЦ 2878456 . ПМИД 20348110 .
- ^ Мартин Пламмер (2003). JAGS: Программа анализа байесовских графических моделей с использованием выборки Гиббса , Материалы 3-го международного семинара по распределенным статистическим вычислениям (DSC 2003), 20–22 марта, Вена, Австрия. ISSN 1609-395Х.
- ^ Ланн, Дэвид; Шпигельхальтер, Дэвид; Томас, Эндрю; Лучший, Ники (2009). «Проект BUGS: эволюция, критика и будущие направления» (PDF) . Статистика в медицине . 28 (25): 3049–3067. дои : 10.1002/сим.3680 . ПМИД 19630097 . Архивировано из оригинала (PDF) 15 сентября 2012 г.
- ^ Саймон Джекман (2009). Байесовский анализ для социальных наук . Серия Уайли по вероятности и статистике, том 845. Джон Уайли и сыновья. ISBN 978-0-470-01154-6 .
Внешние ссылки [ править ]
- JAGS , SourceForge страница
- JAGS , FreshPorts страница
- rjags , R (язык программирования) Страница