Международный координационный центр нейроинформатики
 | Эта статья включает список общих ссылок , но в ней отсутствуют достаточные соответствующие встроенные цитаты . ( сентябрь 2017 г. ) |
 | |
| Аббревиатура | ИНФФ |
|---|---|
| Формирование | 2005 г [1] |
| Штаб-квартира | Секретариат ИНФФ |
| Расположение | |
| Координаты | 59 ° 20'54,46 "с.ш. 18 ° 1'25,78" в.д. / 59,3484611 ° с.ш. 18,0238278 ° в.д. |
Председатель Правления | Мэриэнн Мартоне [2] |
| Веб-сайт | вкл. |
Международный координационный центр нейроинформатики ( INCF ) — международная некоммерческая организация, миссией которой является [3] разрабатывать, оценивать и одобрять стандарты и лучшие практики, которые охватывают принципы открытости, честности, [4] и Цитируемая нейробиология. INCF также проводит обучение тому, как стандарты и лучшие практики способствуют воспроизводимости и позволяют публиковать все результаты исследований, включая данные и коды. INCF был создан в 2005 году по рекомендации рабочей группы Глобального научного форума ОЭСР . [5] INCF проводится Каролинским институтом в Стокгольме , Швеция . [6] Сеть INCF объединяет учреждения, организации, компании и частных лиц, занимающихся нейроинформатикой, нейробиологией, наукой о данных, технологиями, научной политикой и издательской деятельностью. Сеть состоит из руководящих органов и рабочих групп, которые координируют различные категории глобальной нейроинформатической деятельности, направляют и контролируют разработку и одобрение стандартов и передового опыта, а также проводят обучение тому, как стандарты и передовой опыт способствуют воспроизводимости и позволяют публиковать результаты. весь результат исследования, включая данные и код. [7] Нынешние директора — Мэтью Абрамс и Хелена Ледмир. [8] а председателем правления является Мэриэнн Мартоне.
Цель сети INCF [9] продвигать применение вычислительных подходов к пониманию работы мозга и развивать инфраструктуру, необходимую для использования вычислительных методов для интеграции и анализа разнообразных данных в разных масштабах, методах и видах, чтобы понять мозг и положительно повлиять на здоровье и благополучие общества.
Фон
[ редактировать ]Ключевым элементом успешного понимания нервной системы является интеграция нейробиологии с информатикой . Область, изучающая нервную систему, нейробиология, ответила на фантастическую задачу понимания того, как работает наш мозг, с использованием самых сложных технологий, от исследований генома до визуализации поведения человека и других биологических видов. различных функциональных состояниях и на всех промежуточных аналитических уровнях. Результатом этих усилий стали большие объемы данных, которые постоянно растут на более высоких уровнях сложности. Полученные данные разнородны и получены на разных уровнях исследования и в разных методах анализа. Чтобы справиться с этой задачей интеграции и обеспечить эффективное и максимальное использование этих данных, теперь необходимо разработать и создать эти общие ресурсы:
- базы данных нейробиологии и знаний;
- инструменты анализа и моделирования; и
- вычислительные модели.
Эта задача решается путем слияния нейробиологии с информатикой – областью нейроинформатики.
История
[ редактировать ]Бытие
[ редактировать ]Рекомендация координировать международные усилия в новой области нейроинформатики впервые была сделана в отчете по биоинформатике , разработанном под эгидой тогдашнего Форума меганауки ОЭСР в 1998 году. [10] После обширных обсуждений в рабочей группе по нейроинформатике Глобального научного форума под председательством доктора Стивена Х. Козлоу в 2002 году было представлено предложение о создании Международного координационного совета по нейроинформатике и системы грантового финансирования исследований в области нейроинформатики. [11] Этот проект был одобрен министрами науки ОЭСР на их встрече в январе 2004 года. Шестнадцать стран (Австралия, Канада, Китай, Чехия, Дания, Финляндия, Франция, Германия, Индия, Италия, Япония, Нидерланды, Норвегия, Швеция, Швейцария) (Великобритания, США и Виктория, Австралия), а также Европейская комиссия затем разработали рабочие документы, которые составляют правовую основу для INCF и Программы по международной нейроинформатике (PIN). [12]
Учреждение
[ редактировать ]Условия создания INCF [13] были встречены в июле 2005 года, семь стран (Чехия, Финляндия, Германия, Норвегия, Швеция, Швейцария и США) подписали документ о взаимопонимании и пообещали свой финансовый вклад. Была подана заявка на размещение Секретариата INCF. Было получено два предложения, и по поручению Управляющего совета ОЭСР 3 ноября [14] созвал группу экспертов для рассмотрения и ранжирования предложений. Комиссия присвоила шведскому предложению более высокий рейтинг, и эта рекомендация была одобрена Советом управляющих INCF на заседании в штаб-квартире ОЭСР 28 ноября. После обширных международных обсуждений в феврале 2007 года было официально открыто INCF со штаб-квартирой в Каролинской Институт в Стокгольме.
INCF способствует сотрудничеству в области нейроинформатики и воспроизводимости исследований мозга.
- обеспечение координации глобальной нейробиологической инфраструктуры посредством разработки и одобрения стандартов и передового опыта в поддержку открытой и FAIR (находимой, доступной, интероперабельной, многоразовой) нейробиологии ( данные FAIR ) [15]
- обучение исследователей, администраторов и студентов тому, как нейроинформатика способствует строгости и воспроизводимости, открытой и справедливой науке, а также публикации всех результатов их исследований: повествования, данных и кода. [16]
- поощрение нейронауки как дисциплины к движению к FORCE (FAIR, открытая, основанная на исследовательских объектах и цитируемая экосистема)
- содействие продвижению и дальнейшему развитию нейроинформатики как научной дисциплины
Ключевые результаты программы
[ редактировать ]включать
- Ваксхольм Спейс (WHS), [17] координатно-ориентированное пространство мозга грызунов
- Масштабируемый атлас мозга, [18] веб-система отображения атласов мозга, данных изображений и топологий
- девятьмл, [19] общий язык описания модели
- Координатор мультисимуляции (МУЗЫКА), [20] который позволяет крупномасштабным симуляторам нейронов и другим приложениям взаимодействовать во время выполнения.
- Модель данных нейровизуализации и информатики (NI-DM), [21] структура для создания, хранения и запроса метаданных, включая информацию о происхождении
- Пространство Знаний, [22] общественная энциклопедия, которая связывает концепции исследований мозга с данными, моделями и литературой со всего мира.
- ОбучениеПространство, [23] онлайн-хранилище, объединяющее учебные ресурсы по нейроинформатике, разработанные INCF, нашими партнерами и существующими ресурсами сообщества.
См. также
[ редактировать ]- Структура данных визуализации мозга (BIDS)
- Проект Голубого Мозга
- Будапештский эталонный коннектом
- Проект человеческого коннектома
- Список баз данных нейробиологии
- Информационная система нейронауки
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «История» . КИ.се. Проверено 9 октября 2019 г.
- ^ Перейти обратно: а б "Контакт" . ИНФФ . Проверено 9 октября 2019 г.
- ^ «Миссия | INCF» . www.incf.org . Проверено 9 октября 2019 г.
- ^ Хагстром, Стефани (3 сентября 2014 г.). «Принципы FAIR данных» . СИЛА11 . Проверено 4 декабря 2017 г.
- ^ "О" . Консорциум экспертной оценки нейробиологии . Проверено 19 сентября 2017 г.
- ^ «Местоположение | INCF» . www.incf.org . Проверено 9 октября 2019 г.
- ^ «Сеть ИНФФ | ИНФФ» . www.incf.org . Проверено 9 октября 2019 г.
- ^ «Ключевые персональные | ИНФФ» . www.incf.org . Проверено 8 октября 2019 г.
- ^ «Что мы делаем | INCF» . www.incf.org . Проверено 4 декабря 2017 г.
- ^ Рабочая группа Форума меганауки по биологической информатике (январь 1999 г.). Итоговый отчет (Отчет). Организация экономического сотрудничества и развития. стр. 3–4, 49–50, 70–72 . Проверено 19 сентября 2017 г. - через INCF ownCloud.
- ^ Рабочая группа по нейроинформатике Глобального научного форума (июнь 2002 г.). Доклад по Нейроинформатике (Доклад). Организация экономического сотрудничества и развития. стр. 5, 11–15, 46 . Проверено 19 сентября 2017 г. - через ICNF ownCloud.
- ^ «Ланч проекта | INCF» . www.OECD.org . Проверено 9 октября 2019 г.
- ^ «Инкф | ИНКФ» . www.incf.org . Проверено 4 декабря 2017 г.
- ^ «OECD.org – ОЭСР» . www.oecd.org . Проверено 4 декабря 2017 г.
- ^ Уилкинсон М., Дюмонтье М., Ольберсберг И. и др. (март 2016 г.). «Руководящие принципы FAIR по управлению и рациональному использованию научных данных» . Научные данные . 3 (160018): 160018. Бибкод : 2016NatSD...360018W . дои : 10.1038/sdata.2016.18 . ПМЦ 4792175 . ПМИД 26978244 .
- ^ Бриз Дж.Л., Полин Дж.Б., Кеннеди Д.Н. (июль 2012 г.). «Обмен и публикация данных в области нейровизуализации» . ГигаСайенс . 1 (9): 9. дои : 10.1186/2047-217x-1-9 . ПМЦ 3626511 . ПМИД 23587272 .
- ^ Джонсон Г.А., Бадеа А., Бранденбург Дж., Кофер Г., Фубара Б., Лю С., Ниссанов Дж. (ноябрь 2010 г.). «Пространство Ваксхольма: справочник на основе изображений для координации исследований мозга мышей» . НейроИмидж . 53 (2): 365–372. doi : 10.1016/j.neuroimage.2010.06.067 . ПМК 2930145 . ПМИД 20600960 .
- ^ «Масштабируемый атлас мозга — нейроанатомия у вас под рукой» . scalablebrainatlas.incf.org . Проверено 4 декабря 2017 г.
- ^ «ДевятьМЛ» . Проверено 4 декабря 2017 г.
- ^ MUSIC, координатор MultiSimulation , Международный координационный центр нейроинформатики (INCF), 14 ноября 2017 г. , получено 4 декабря 2017 г.
- ^ «- Модель данных нейровизуализации» . Проверено 4 декабря 2017 г.
- ^ «Пространство Знаний – Дом» . знание-пространство.org . Проверено 4 декабря 2017 г.
- ^ «TrainingSpace — Домой» . Training.incf.org . Проверено 24 апреля 2018 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Официальный сайт
- Конгресс Нейроинформатики – 2019 (Варшава, Польша); 2018 г. (Монреаль, Канада); 2017 ; 2016 ; 2015 ; 2014 г .; 2013 год ; 2012 ; 2011 год ; 2010 г .; 2009 год ; 2008 год
- Консорциум экспертной оценки нейробиологии
- Ван Эссен, Дэвид (весна 2007 г.). «Послание президента SfN Дэвида Ван Эссена» . Ежеквартальный журнал по неврологии . Архивировано из оригинала 13 июля 2007 года.
