Омнибус экспрессии генов

Омнибус экспрессии генов
Содержание
Описание	База данных профилирования экспрессии генов и метилирования РНК
Контакт
Исследовательский центр	Национальный центр биотехнологической информации
Первичное цитирование	Эдгар Р. и др. (2002)
Доступ
Веб-сайт	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds/?term=

Gene Expression Omnibus ( GEO ) — это база данных для профилирования экспрессии генов и профилирования метилирования РНК , управляемая Национальным центром биотехнологической информации (NCBI). ^[1] Эти данные высокопроизводительного скрининга геномики получены на основе экспериментальных данных микрочипов или RNA-Seq . ^[2] Эти данные должны соответствовать формату минимальной информации об эксперименте на микрочипах (MIAME). ^[3]

Глоссарий [ править ]


Аббревиатура	Описание
ГДС	Присоединение к набору данных
лицензия GPL	Присоединение к платформе
Высшая школа экономики	Присоединение к серии
GSM	Образец присоединения

Ссылки [ править ]

^ Jump up to: Перейти обратно: ^а ^б Эдгар, Р; Домрачев М; Лэш, А.Е. (1 января 2002 г.). «Омнибус экспрессии генов: хранилище данных экспрессии генов NCBI и массива гибридизации» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (1): 207–10. дои : 10.1093/нар/30.1.207 . ПМК 99122 . ПМИД 11752295 .
^ Барретт, Т; Уилхайт, SE; Леду, П; Евангелиста, К; Ким, ИФ; Томашевский М; Маршалл, Калифорния; Филиппи, КХ; Шерман, премьер-министр; Холко, М; Ефанов А; Ли, Х; Чжан, Н; Робертсон, CL; Серова, Н; Дэвис, С; Соболева, А (январь 2013 г.). «NCBI GEO: архив наборов данных функциональной геномики - обновление» . Исследования нуклеиновых кислот . 41 (Проблема с базой данных): D991-5. дои : 10.1093/nar/gks1193 . ПМК 3531084 . ПМИД 23193258 .
^ Бразма, А; Хингамп, П; Квакенбуш, Дж; Шерлок, Дж; Спеллман, П; Стокерт, К; Аах, Дж; Ансорж, В; Болл, Калифорния; Костон, ХК; Гастерланд, Т; Глениссон, П; Хольстеге, ФК; Ким, ИФ; Марковиц, В.; Матезе, Дж. К.; Паркинсон, Х; Робинсон, А; Сарканс, У; Шульце-Кремер, С; Стюарт, Дж; Тейлор, Р; Вило, Дж; Вингрон, М. (декабрь 2001 г.). «Минимальная информация об эксперименте с микрочипами (MIAME) - к стандартам данных о микрочипах» . Природная генетика . 29 (4): 365–71. дои : 10.1038/ng1201-365 . ПМИД 11726920 . S2CID 6994467 .

Эта биологическим базам данных статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid11752295-1] Jump up to: Перейти обратно: ^а ^б Эдгар, Р; Домрачев М; Лэш, А.Е. (1 января 2002 г.). «Омнибус экспрессии генов: хранилище данных экспрессии генов NCBI и массива гибридизации» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (1): 207–10. дои : 10.1093/нар/30.1.207 . ПМК 99122 . ПМИД 11752295 .

[2] Барретт, Т; Уилхайт, SE; Леду, П; Евангелиста, К; Ким, ИФ; Томашевский М; Маршалл, Калифорния; Филиппи, КХ; Шерман, премьер-министр; Холко, М; Ефанов А; Ли, Х; Чжан, Н; Робертсон, CL; Серова, Н; Дэвис, С; Соболева, А (январь 2013 г.). «NCBI GEO: архив наборов данных функциональной геномики - обновление» . Исследования нуклеиновых кислот . 41 (Проблема с базой данных): D991-5. дои : 10.1093/nar/gks1193 . ПМК 3531084 . ПМИД 23193258 .

[3] Бразма, А; Хингамп, П; Квакенбуш, Дж; Шерлок, Дж; Спеллман, П; Стокерт, К; Аах, Дж; Ансорж, В; Болл, Калифорния; Костон, ХК; Гастерланд, Т; Глениссон, П; Хольстеге, ФК; Ким, ИФ; Марковиц, В.; Матезе, Дж. К.; Паркинсон, Х; Робинсон, А; Сарканс, У; Шульце-Кремер, С; Стюарт, Дж; Тейлор, Р; Вило, Дж; Вингрон, М. (декабрь 2001 г.). «Минимальная информация об эксперименте с микрочипами (MIAME) - к стандартам данных о микрочипах» . Природная генетика . 29 (4): 365–71. дои : 10.1038/ng1201-365 . ПМИД 11726920 . S2CID 6994467 .

[1]

[2]

[3]

v т и Национальный центр биотехнологической информации
Базы данных	GenBank , PubMed , PubMed Central , База данных консервативных доменов , dbSNP , База данных гистонов , Онлайн-менделевское наследование у человека , База данных молекулярного моделирования , GenBank , Эпигеномика NCBI , Entrez , RefSeq , Univec , Омнибус экспрессии генов
люди	Юджин Кунин , Дэвид Ландсман, Стивен Альтшул , Ким Д. Прюитт